① premiere中的无编号标记,序列标记,素材标记有什么区别
标记的素材类型不同罢了,只是为了辅助你的制作
② 怎么在序列中标注引物位置,有没有相应的软件的
Gene construction Kit
③ 如何在word文档中,对相同的内容进行序列标记例如查找@@,按顺序改为
在空白处,按下 CTRL+F9 组合键,键入“SEQ A” ,注意中间有个空格,按下 F9,更新域,其值为1,选中1(域结果) ,剪切。
然后打开替换对话框,查找:@@,替换为:@^c@,
(如果编号全部显示为 1,选中文档,按 F9 更新域。)
④ 如何找出序列中短重复片段并标注
基因组中由寡核苷酸串联,重复排列的DNA序列,构成数量可变的串联重复序列,其中,微卫星DNA又称为短串联重复片列,是一种可遗传的不稳定的且具有高度多态性的短核苷酸重复序列,具有种类多,分布广,高度多态性等特点,这种多态性标志已广泛用于遗传病及亲子鉴定等.
短序列比对中,一般常用的算法主要有三个:
(1) 空位种子片段索引法,如MAQ、ELAND等,首先将读段切分,并选取其中一段或几段作为种子建立搜索索引,再通过查找索引、延展匹配来实现读段定位,通过轮换种子考虑允许出现错配(mismatch)的各种可能的位置组合;
(2) Burrows Wheeler转换法,如Bowtie、BWA、SOAP2等,通过B-W转换将基因组序列按一定规则压缩并建立索引,再通过查找和回溯来定位读段,在查找时可通过碱基替代来实现允许的错配;
(3) Smith-Waterman动态规划算法,如BFAST,SHRiMP等,利用初始条件和迭代关系式计算两个序列的所有可能的比对分值,并将结果存放于一个矩阵中,利用动态规划的方法回溯寻找最优的比对结果。
⑤ 怎么用深度学习做序列标注问题的命名实体识别问题
没有时间序列的说法,只有时间轴的说法。
时间轴大体上由图层、帧和播放头三部分组成,还包括添加几个图层,可以用来组织文档中的插图。图层按照它在时间轴中出现的次序堆叠。因此,时间轴底部出现的对象在舞台上也是堆叠在底部。我们可以隐藏、显示、锁定或解锁图层。每个图层的帧都是唯一的,但是我们可以在同一图层上把它拖动到新位置,复制或移动到另一个图层。
图层就像堆叠在一起的几张幻灯胶片一样,每个图层都包含一个显示在舞台中的不同图像。在当前图层中绘制和编辑对象,并不会影响其它图层上的对象。
帧是动画中的单位时间。与胶片一样,Flash8把时长分为帧。没有内容的帧以空心圈显示,有内容的帧以实心圈显示。普通帧会延续前面关键帧的内容。帧频决定每个帧占用多长时间。
在时间轴里有一条比较细的红线,拖动这个红线上的红方块,可以观看红线所停留帧的详细内容,这条红线就是播放头。播放头指示到某帧,这一帧的内容就会展现到舞台上,这有助于用户编辑这一帧的内容。
希望我能帮助你解疑释惑。
⑥ EXCEL中重复序列号如何主动标注或改色
使用excel自带的条件格式
设定好重复的公式后
设定提醒颜色即可
⑦ 怎么给核酸序列标注颜色
建立个你想要的图层,把引线标注改成这个图层。
标题栏下面就有线型和颜色的选择,默认是黑色,选中引线标选择你要的颜色。
双击标注,里面也有线型和颜色选择,改成你想要的颜色</ol>
⑧ 人工智能与机器翻译 和 自然语言处理 哪个方向更火
一、课程介绍
斯坦福大学于2012年3月在Coursera启动了在线自然语言处理课程,由NLP领域大牛Dan Jurafsky 和 Chirs Manning教授授课:
https://class.coursera.org/nlp/
以下是本课程的学习笔记,以课程PPT/PDF为主,其他参考资料为辅,融入个人拓展、注解,抛砖引玉,欢迎大家在“我爱公开课”上一起探讨学习。
课件汇总下载地址:斯坦福大学自然语言处理公开课课件汇总
二、语言模型(Language Model)
1)N-gram介绍
在实际应用中,我们经常需要解决这样一类问题:如何计算一个句子的概率?如:
机器翻译:P(high winds tonite) > P(large winds tonite)
拼写纠错:P(about fifteen minutes from) > P(about fifteenminuets from)
语音识别:P(I saw a van) >> P(eyes awe of an)
音字转换:P(你现在干什么|nixianzaiganshenme) > P(你西安在干什么|nixianzaiganshenme)
自动文摘、问答系统、... ...
以上问题的形式化表示如下:
p(S)=p(w1,w2,w3,w4,w5,…,wn)
=p(w1)p(w2|w1)p(w3|w1,w2)...p(wn|w1,w2,...,wn-1)//链规则
p(S)被称为语言模型,即用来计算一个句子概率的模型。
那么,如何计算p(wi|w1,w2,...,wi-1)呢?最简单、直接的方法是直接计数做除法,如下:
p(wi|w1,w2,...,wi-1) = p(w1,w2,...,wi-1,wi) / p(w1,w2,...,wi-1)
但是,这里面临两个重要的问题:数据稀疏严重;参数空间过大,无法实用。
基于马尔科夫假设(Markov Assumption):下一个词的出现仅依赖于它前面的一个或几个词。
假设下一个词的出现依赖它前面的一个词,则有:
p(S)=p(w1)p(w2|w1)p(w3|w1,w2)...p(wn|w1,w2,...,wn-1)
=p(w1)p(w2|w1)p(w3|w2)...p(wn|wn-1) // bigram
假设下一个词的出现依赖它前面的两个词,则有:
p(S)=p(w1)p(w2|w1)p(w3|w1,w2)...p(wn|w1,w2,...,wn-1)
=p(w1)p(w2|w1)p(w3|w1,w2)...p(wn|wn-1,wn-2) // trigram
那么,我们在面临实际问题时,如何选择依赖词的个数,即n。
更大的n:对下一个词出现的约束信息更多,具有更大的辨别力;
更小的n:在训练语料库中出现的次数更多,具有更可靠的统计信息,具有更高的可靠性。
理论上,n越大越好,经验上,trigram用的最多,尽管如此,原则上,能用bigram解决,绝不使用trigram。
2)构造语言模型
通常,通过计算最大似然估计(Maximum Likelihood Estimate)构造语言模型,这是对训练数据的最佳估计,公式如下:
p(w1|wi-1) = count(wi1-, wi) / count(wi-1)
如给定句子集“<s> I am Sam </s>
<s> Sam I am </s>
<s> I do not like green eggs and ham </s>”
部分bigram语言模型如下所示:
c(wi)如下:
c(wi-1,wi)如下:
则bigram为:
那么,句子“<s> I want english food </s>”的概率为:
p(<s> I want english food </s>)=p(I|<s>)
× P(want|I)
× P(english|want)
× P(food|english)
× P(</s>|food)
= .000031
为了避免数据溢出、提高性能,通常会使用取log后使用加法运算替代乘法运算。
log(p1*p2*p3*p4) = log(p1) + log(p2) + log(p3) + log(p4)
推荐开源语言模型工具:
SRILM(http://www.speech.sri.com/projects/srilm/)
IRSTLM(http://hlt.fbk.eu/en/irstlm)
MITLM(http://code.google.com/p/mitlm/)
BerkeleyLM(http://code.google.com/p/berkeleylm/)
推荐开源n-gram数据集:
Google Web1T5-gram(http://googleresearch.blogspot.com/2006/08/all-our-n-gram-are-belong-to-you.html)
Total number of tokens: 1,306,807,412,486
Total number of sentences: 150,727,365,731
Total number of unigrams: 95,998,281
Total number of bigrams: 646,439,858
Total number of trigrams: 1,312,972,925
Total number of fourgrams: 1,396,154,236
Total number of fivegrams: 1,149,361,413
Total number of n-grams: 4,600,926,713
Google Book N-grams(http://books.google.com/ngrams/)
Chinese Web 5-gram(http://www.ldc.upenn.e/Catalog/catalogEntry.jsp?catalogId=LDC2010T06)
3)语言模型评价
语言模型构造完成后,如何确定好坏呢? 目前主要有两种评价方法:
实用方法:通过查看该模型在实际应用(如拼写检查、机器翻译)中的表现来评价,优点是直观、实用,缺点是缺乏针对性、不够客观;
理论方法:迷惑度/困惑度/混乱度(preplexity),其基本思想是给测试集赋予较高概率值的语言模型较好,公式如下:
由公式可知,迷惑度越小,句子概率越大,语言模型越好。使用《华尔街日报》训练数据规模为38million words构造n-gram语言模型,测试集规模为1.5million words,迷惑度如下表所示:
4)数据稀疏与平滑技术
大规模数据统计方法与有限的训练语料之间必然产生数据稀疏问题,导致零概率问题,符合经典的zip'f定律。如IBM, Brown:366M英语语料训练trigram,在测试语料中,有14.7%的trigram和2.2%的bigram在训练语料中未出现。
数据稀疏问题定义:“The problem of data sparseness, also known as the zero-frequency problem arises when analyses contain configurations that never occurred in the training corpus. Then it is not possible to estimate probabilities from observed frequencies, and some other estimation scheme that can generalize (that configurations) from the training data has to be used. —— Dagan”。
人们为理论模型实用化而进行了众多尝试与努力,诞生了一系列经典的平滑技术,它们的基本思想是“降低已出现n-gram条件概率分布,以使未出现的n-gram条件概率分布非零”,且经数据平滑后一定保证概率和为1,详细如下:
Add-one(Laplace) Smoothing
加一平滑法,又称拉普拉斯定律,其保证每个n-gram在训练语料中至少出现1次,以bigram为例,公式如下:
其中,V是所有bigram的个数。
承接上一节给的例子,经Add-one Smoothing后,c(wi-1, wi)如下所示:
则bigram为:
在V >> c(wi-1)时,即训练语料库中绝大部分n-gram未出现的情况(一般都是如此),Add-one Smoothing后有些“喧宾夺主”的现象,效果不佳。那么,可以对该方法扩展以缓解此问题,如Lidstone's Law,Jeffreys-Perks Law。
Good-Turing Smoothing
其基本思想是利用频率的类别信息对频率进行平滑。调整出现频率为c的n-gram频率为c*:
但是,当nr+1或者nr > nr+1时,使得模型质量变差,如下图所示:
直接的改进策略就是“对出现次数超过某个阈值的gram,不进行平滑,阈值一般取8~10”,其他方法请参见“Simple Good-Turing”。
Interpolation Smoothing
不管是Add-one,还是Good Turing平滑技术,对于未出现的n-gram都一视同仁,难免存在不合理(事件发生概率存在差别),所以这里再介绍一种线性插值平滑技术,其基本思想是将高阶模型和低阶模型作线性组合,利用低元n-gram模型对高元n-gram模型进行线性插值。因为在没有足够的数据对高元n-gram模型进行概率估计时,低元n-gram模型通常可以提供有用的信息。公式如下:
扩展方式(上下文相关)为:
λs可以通过EM算法来估计,具体步骤如下:
首先,确定三种数据:Training data、Held-out data和Test data;
然后,根据Training data构造初始的语言模型,并确定初始的λs(如均为1);
最后,基于EM算法迭代地优化λs,使得Held-out data概率(如下式)最大化。
Kneser-Ney Smoothing
Web-scale LMs
如Google N-gram语料库,压缩文件大小为27.9G,解压后1T左右,面对如此庞大的语料资源,使用前一般需要先剪枝(Pruning)处理,缩小规模,如仅使用出现频率大于threshold的n-gram,过滤高阶的n-gram(如仅使用n<=3的资源),基于熵值剪枝,等等。
另外,在存储优化方面也需要做一些优化,如使用trie数据结构存储,借助bloom filter辅助查询,把string映射为int类型处理(基于huffman编码、Varint等方法),float/double转成int类型(如概率值精确到小数点后6位,然后乘10E6,即可将浮点数转为整数)。
2007年Google Inc.的Brants et al.提出了针对大规模n-gram的平滑技术——“Stupid Backoff”,公式如下:
数据平滑技术是构造高鲁棒性语言模型的重要手段,且数据平滑的效果与训练语料库的规模有关。训练语料库规模越小,数据平滑的效果越显着;训练语料库规模越大,数据平滑的效果越不显着,甚至可以忽略不计——锦上添花。
5)语言模型变种
Class-based N-gram Model
该方法基于词类建立语言模型,以缓解数据稀疏问题,且可以方便融合部分语法信息。
Topic-based N-gram Model
该方法将训练集按主题划分成多个子集,并对每个子集分别建立N-gram语言模型,以解决语言模型的主题自适应问题。架构如下:
Cache-based N-gram Model
该方法利用cache缓存前一时刻的信息,以用于计算当前时刻概率,以解决语言模型动态自适应问题。
-People tends to use words as few as possible in the article.
-If a word has been used, it would possibly be used again in the future.
架构如下:
猜测这是目前QQ、搜狗、谷歌等智能拼音输入法所采用策略,即针对用户个性化输入日志建立基于cache的语言模型,用于对通用语言模型输出结果的调权,实现输入法的个性化、智能化。由于动态自适应模块的引入,产品越用越智能,越用越好用,越用越上瘾。
Skipping N-gram Model&Trigger-based N-gram Model
二者核心思想都是刻画远距离约束关系。
指数语言模型:最大熵模型MaxEnt、最大熵马尔科夫模型MEMM、条件随机域模型CRF
传统的n-gram语言模型,只是考虑了词形方面的特征,而没有词性以及语义层面上的知识,并且数据稀疏问题严重,经典的平滑技术也都是从统计学角度解决,未考虑语法、语义等语言学作用。
MaxEnt、MEMM、CRF可以更好的融入多种知识源,刻画语言序列特点,较好的用于解决序列标注问题。
⑨ cad怎么标注12345序列
cad怎么标注序列,操作方法如下。
设备:联想IdeaPad
系统:Windows10
软件:CAD2020
1、首先在cad菜单栏中选择标注-快速标注,或者直接使用快速标注快捷键DLI。
⑩ 如何用 Keras 调试LSTM超参数解决时间序列预测问题
就一个abcd作为一条样本即可,a b c d 的每一步都会计算loss的,所以拆开也没啥用 另外你这个不是序列标注,因为你是要预测下一个,而不是给整体一个最佳序列