1. 基因型分型的方法
基于分子杂交→基于DNA扩增→基于DNA测序
将DNA转移到硝酸纤维素膜上,利用DNA-DNA杂交检测特定DNA片段的方法。
通过设计不同的备埋指DNA探针可实现不同等位基因类型的区分。
探针设计是Southern Blot最为重要的环节之一。
又称DNA chip/DNA微矩阵(DNA microarray)
将一系列已知序列的DNA探针分子以高密度固定于支持物上,通过与标记的DNA样品分子进行杂交实现仿配DNA的序列分析。
优点:高通量、大规模、平行液塌化、集约化。
缺点:非特异性高。
以上内容参考中国大学MOOC网站复旦大学遗传学。
基因分型(Genotyping)是利用生物学检测方法测定个体基因型(Genotype)的技术。又称为基因型分析(Genotypic assay),使用技术包括聚合酶链反应(PCR)、DNA片段分析、寡核苷酸探针(ASO probes)、基因测序、核酸杂交、基因芯片技术等。
方法:
一些常用的基因分型技术有:限制性片段长度多态性(Restriction Fragment Length Polymorphism, RFLP)、末端限制性长度多态性(Terminal Restriction Fragment Length Polymorphism, t-RFLP)、扩增片段长度多态性(Amplified fragment length polymorphisms, AFLP)、多重连接探针扩增(multiplex ligation-dependent probe amplification, MLPA)等。
临床应用:
DNA片段分析能够诊断疾病导致的遗传变异,如微卫星序列不稳定(Microsatellite Instability, MSI)、三体型(Trisomy)、非整倍体(Aneuploidy)、杂合性缺失(loss of heterozygosity, LOH)等。微卫星序列不稳定和杂合性缺失与结肠癌、乳腺癌、子宫颈癌的肿瘤细胞基因型有关。第21号染色体的三体型是种常见的非整倍体,临床表现为先天愚型(Down Syndrome)。