A. pcr核酸检测是什么意思方法及步骤
核酸检测是目前全球用来对是否携带新冠病毒进行确定的一种有效方式。目前大家主要使用的是鼻拭子、咽拭子以及抗体血清lgm进行参考。但是根据最新的新加坡入境要求是进行pcr核酸检测,那么pcr核酸检测是什么意思呢?
PCR的意思是聚合酶链式反应,能够用来扩增DNA,从而将微量的DNA扩增到能够检测的程度。有些病毒的核酸是DNA,需要采用这个方法进行检测。所以PCR并不是进行的检查,而是检测DNA的一种方法。比如乙肝病毒DNA定量,用的就是这一种方法。检查DNA的目的,一方面是可以诊断疾病,如果连病原体的DNA都能检测到,就说明感染了这种病原体;另一方面是判断病毒复制的多少,从而判断病情严重程度或者治疗效果。
进行核酸检验,需要经过取样、留样、留存、核酸提取、上机检测五个步骤。
核酸检测的第一步就是采集人体分泌物,用鼻试子或咽试子擦拭鼻腔或咽后壁及双侧咽扁桃体处。
第二步医务人员进行留样,将试子头浸入细胞保存液中,折断尾部后立即旋紧管盖。
第三部要将样本放入密闭袋中,保存好并及时送检。
第四步将样本送进实验室,提取核酸。
第五步,将提取物进行荧光PCR扩增反应。
核酸(nucleicacid),是一类由核苷酸(nucleotide)构成的生物大分子,分为核糖核酸(ribonucleic
acid,宴前者RNA)和脱氧核糖核酸(deoxyribonucleic
acid,DNA)两类,其中RNA多为单链结构,DNA多为双链结构。除朊病毒(prion)外,核酸是构成生命所必需的生物大分子,其主要作用是构成生命体的遗传信息载体,除此之外,还有部分核酸可作为及参与构成具有生物活性的酶分子或晌薯其他分子机器
。
核酸检测顾名思义就是针对核酸开展检测。
核酸检测有何独特的优势呢?为何能作为新冠病毒确诊的“金标准”呢?
其实每一种检测方法都有其擅长的应用场景。以病毒检测为例,通常的免疫学检测方法(胶体金、ELISA、化学发光等)的检测对象是病毒的抗原或抗体,相当于“侧面描绘”。由于从感染到可检测存在一个时间窗口期,因此免疫学检测方法一般不合适作为早期诊断。
1、假阳性
假阳性通常比较少。一般实验室人员操作不当会导致样本间交叉污染或扩增产物的遗留污染,该种情况下可能会导致假阳性。
不过假阳性可以通过严格控制检测流程、以及执行若干个阴性样本随机参与检测的策略而有效规避。
2、假阴性
在这里需要说明的是,PCR检测的假阴性与临床的假阴性实际上不是一个概念。
以网络上激烈讨论的新冠病毒的诊断为例,临床假阴性是指临床症状和影像学高度疑似被感染、但PCR检测却多次或始终为阴性的情况;而PCR检测假阴性是指所采集样本中存在足够量的新型冠状病毒但却没有检出悔简的情况。
避免核酸检测的假阴性,主要需要解决:(1)被感染者的细胞中有足量的病毒、(2)采集样本中可以采集到含有病毒的细胞、以及(3)检测出样本中的病毒这三个环节。
其中PCR试剂盒的技术参数优劣主要影响第三个检测环节。
仅针对第三个检测环节,若样本中病毒数量低于一个程度(低于最低检测限),PCR试剂盒就无法检出。从这个角度看,PCR检测的假阴性是无法完全避免的。这也是为何需要补充开发病毒的特异抗体检测的原因所在。
实验室建设坚持高标准、严要求,严格按照国家《医学生物安全二级实验室建筑技术标准》进行建设,建设面积100余平方米,分为试剂贮存和准备区、标本制备与提取区、扩增和产物分析区三个区域。实验室内配置全自动核酸提取仪、实时荧光定量PCR仪、扩增仪、高压灭菌器、B2型生物安全柜、超净工作台、超低温冰箱等仪器,消毒和防护设施齐全,符合相关生物实验室安全标准。为防止实验室外的区域被污染,实验室的气压均为负压,有效降低感染风险。此外,实验室配备了污水处理系统,达到了废液的合理排放和处理。
*目前我国多地区建设了PCR核酸检测实验室用以进行新冠病毒核酸检测
B. 核酸检测是怎么检测是抽血吗
有些病毒的检查需要抽血进行的,那么像核酸检测是怎么检测,是抽血吗?
核酸检测可通过抽血检查,这也是诊断新冠状病毒性感染的主要依据,一般连续两次核酸检测阳性即可诊断新冠状病毒性感染。新冠状病毒的核酸检测也可以采用咽拭子或抽血的方法来检测,如果均为阳性,则可诊断为新冠状病毒。此外还可对新型冠状病毒肺炎患者进行肺部ct及血常规、c反应蛋白、凝血等检查。如有发热、干咳、乏力等症状,应及时到医院化验血常规及核酸检查,以明确是否有新的冠状病毒感染。
不过目前核酸检测的主要流程是采集咽拭子,目前新冠肺炎核酸检测主要是采取咽拭子的方法,也可以用吸痰的方法吸取气管内的分泌物。常用的咽拭子方法是通过一种长的棉棍从鼻孔或者口腔进入到咽后壁,刮取咽喉壁黏膜的分泌物做检测,所以一般会有相关的痰热淤积与喉咙部。
C. 核酸检验方法
核酸检测具体流程如下:
1. 核酸提取
使用硅胶柱离心、磁性硅胶颗粒分离方法以及自动化仪器等商品化试剂或设备并按说明书操作。提取RNA时应注意防止RNA降解。DNA应置于-20℃保存,RNA和需长期保存的DNA应置于-80℃保存。
2. 逆转录合成cDNA
逆转录cDNA合成反应需使用逆转录引物、dNTPs、逆转录酶、RNA酶抑制剂、DTT、缓冲液和适量无RNA/DNA酶的超纯水以及RNA模板。在扩增仪或水浴箱中,在规定的温度和时间下进行逆转录反应。建议使用商品化RT-PCR一步法试剂进行第一轮扩增反应。逆转录cDNA合成反应需使用逆转录引物、dNTPs、逆转录酶、RNA酶抑制剂、DTT、缓冲液和适量无RNA/DNA酶的超纯水以及RNA模板。在扩增仪或水浴箱中,在规定的温度和时间下进行逆转录反应。使用商品化RT-PCR一步法试剂进行第一轮扩增反应。
3. PCR扩增反应(使用二次扩增的套式PCR扩增方法)
PCR反应需使用引物、dNTPs、DNA聚合酶(如Taq酶等)、缓冲液、和适量无RNA/DNA酶超纯水、以及模板(DNA或cDNA)。在扩增仪中,按照设定的程序进行扩增。使用二次扩增的套式PCR扩增方法。
4. 扩增产物定性分析
扩增产物常用分析方法是琼脂糖凝胶电泳法,与分子量标准比较,判断扩增片段是否在预期的分子量范围内。其它扩增产物分析方法还有限制性内切酶酶切分析、特异性探针杂交分析以及DNA序列分析等。自动化核酸扩增仪使用酶联比色分析或荧光探针杂交等原理测定。
5.结果判定和完成报告单
(1)实验成立的条件:每一次检测需同时做两个阳性对照、两个阴性对照,只有阳性对照扩增出预期的片段、阴性对照没有扩增出任何片段、双份平行样品结果一致的情况下实验才成立,可以作出核酸阳性或阴性反应结果的判定。
(2)HIV核酸检测阳性:发现核酸阳性反应,应该重复采集样品进行复测,复测结果呈核酸阳性反应则判定为核酸阳性,复测结果为核酸阴性反应则判为不确定结果,需进一步随访检测。
(3)HIV核酸检测阴性:只可报告本次实验结果阴性。
(4)应在完成检测后5个工作日内发出检测报告。
D. 核酸几种方法
1.定磷法。简单快捷,灵敏度高,但易受蛋白质和核苷酸影响。
2.定糖法。灵敏度高,但特异性差,戊糖也会产生反应,容易产生干扰。
3.紫外线吸收法。适用于浓度大的核酸溶液,而人体感染新冠病毒后,咽部所含的病毒量极少,无法通过此种方法被检测。
4.荧光法。目前广泛被使用的是荧光定量RT-PCR检测法,通过对标本进行逆转录扩增、使病毒片段达到一定数量,可以被检测到,但是由于受采样标本、运输等多种因素影响,也有假阴性的可能。
E. 做核酸检测的正确方法
5月11日,武汉市新冠肺炎疫情防控指挥部涉疫大数据与流行病学调查组印发紧急通知,决定以10天为期,在武汉市范围内开展全员新冠病毒核酸筛查。而在全国各地也有一些朋友好奇,核酸检测到底检测哪个部位?鼻咽拭子和口咽拭子有何不同?做核酸检测时有哪些注意事项?
首都医科大学附属北京地坛医院感染中核酸检测标本可以采集深部痰液、鼻咽拭子和口咽拭子。其中口咽拭子和鼻咽拭子统称为咽拭子,经口的为口咽拭子,经鼻的就是鼻咽拭子。
口咽拭子
鼻咽拭子
做核酸检测时,我们需要注意什么呢?
在做核酸检测前2小时尽量避免进食,以免引起呕吐;
采样前30分钟不应吸烟、喝酒、咀嚼口香糖等;
检测者需要正确佩戴口罩,检测前取下口罩,检测后立即戴好,可准备一个备用口罩,污染后方便及时更换;
在采集鼻咽拭子前检测者应告知采集人员是否鼻中隔弯曲及鼻腔手术史,过程中可能出现鼻部酸痒感,刺激打喷嚏,可立即用纸巾或手肘遮挡;
鼻咽拭子采集后可能出现少量鼻腔出血,一般不需要特殊处理,如出血量较多请及时到医院进行处理;
在采集口咽拭子时检测者头后仰,张口发出“啊”音,有助于暴露咽喉,但过程中会出现刺激性干咳、恶心、呕吐等症状,检测者可配合采集人员尽量放松、深呼吸;
核酸检测前后都需要注意手部卫生,可使用免洗手消毒液或免洗酒精擦拭双手。
血清抗体检测不受饮食影响 无需空腹
一般感染新冠病毒7-10天后,人体会产生针对病毒的特异性抗体。最先出现的是IgM抗体,随后会出现IgG抗体,所以检测这些特异性抗体,可以判断人体是否感染过病毒,而检测方法就是血清抗体检测。
血清抗体需要抽取检测者2-4mL的静脉血液进行检测,检测结果不受饮食和药物影响,因此检测前不需要空腹。
为落实好新冠肺炎疫情常态化防控,全国各地陆续公布“核酸检测机构名单”,推动重点人群“应检尽检”、其他人群“愿检尽检”。目前国家卫生健康委推出“核酸检测机构查询”服务,在国务院客户端上线,目前已有北京、天津、河北、辽宁、黑龙江、上海、江苏、安徽、福建、山东、河南、湖北、湖南、广东、广西、海南、四川、贵州、云南、宁夏、新疆生产建设兵团上传的1226家检测机构。
F. 核酸检测方法
对于新型冠状病毒的核酸检测,首先根据试剂盒说明书”样本要求“部分进行样本采集,常规的样本类型包括咽拭子、鼻拭子、痰液、支气管灌洗液、肺泡灌洗液等。
获得患者样本后,需尽快进行检测,如无法立即检测需要转运的样本,应按照说明书的要求进行低温封装,并送到专门的检测机构进行检测。检测机构收到样本后,对样本进行核酸提取,核酸提取试剂应使用批准产品说明书中指定的核酸提取试剂盒。
病毒RNA需要首先逆转录为cDNA,再进行扩增检测。PCR扩增和检测应使用批准产品说明书中指定的荧光定量PCR仪,通过荧光定量PCR所得到的样本Ct值的大小,可以判断患者样本中是否含有新型冠状病毒。
(6)核酸血清检测方法扩展阅读
核酸检测原理
所有生物除朊病毒外都含有核酸,核酸包括脱氧核糖核酸(DNA)和核糖核酸(RNA),新型冠状病毒是一种仅含有RNA的病毒,病毒中特异性RNA序列是区分该病毒与其它病原体的标志物。新型冠状病毒出现后,我国科学家在极短的时间里完成了对新型冠状病毒全基因组序列的解析。
并通过与其它物种的基因组序列对比,发现了新型冠状病毒中的特异核酸序列。临床实验检测过程中,如果能在患者样本中检测到新型冠状病毒的特异核酸序列,应提示该患者可能被新型冠状病毒感染
G. 核酸检测的方式都有什么
核酸检测主要有酸检测试剂、抗体检测两种方法,第一种方法通常是通过咽拭子进行PCR检测,基因扩增,然后再进行核酸检测。 而抗体检测是选择抽血,抽血的方法得出结果看,观察其抗体滴度是否升高,这种情况常常是指在抽血前常出现不能产生抗体的情况。
核酸检测是一种“进行时”检测,通过聚合酶链反应等方法检测病毒基因组中特定的核酸序列,从而判断被检测者此刻是否感染了病毒。
与核酸检测不同,新冠病毒抗体检测显示的是哪些人曾经被感染。抗体检测又被称为血清学检测,目的是检测血液样本中的抗体。人体感染病毒后,会产生IgM或IgG抗体。
被感染初期,人体会迅速产生IgM抗体,以抗感染;相比之下,产生IgG抗体的速度更慢,但IgG抗体保留时间更长。抗体检测就是检测血清中是否有这些特异性抗体,以确定被测试者是否曾被感染。
(7)核酸血清检测方法扩展阅读:
六种人不宜做核酸检测
一、釆样前30分钟,对于有吸烟、喝酒、嚼口香糖等人群不宜做核酸检测,以免影响检测的准确度。
二、进食太饱的人不宜做核酸检测,否则容易发生恶心呕吐,影响采用结果的准确性。
三、核酸检测前有口服抗病毒和抗感染的药物的,应推迟做核酸检测,避免影响检测结果。
四、若是进行鼻拭子采样的话,对于鼻咽部有病症的急性期,如出血、水肿等人群可以暂不予检测。
五、刚进行核酸检测时出现恶心呕吐的人,应暂缓做核酸检测,需等检测者缓解后再予以进行。
六、被采样者用手或其他物品触及拭子采样冠、棉签的前端的不宜进行,否则容易造成污染,影响检测结果,需更换进行重做。