⑴ 核酸几种方法
1.定磷法。简单快捷,灵敏度高,但易受蛋白质和核苷酸影响。
2.定糖法。灵敏度高,但特异性差,戊糖也会产生反应,容易产生干扰。
3.紫外线吸收法。适用于浓度大的核酸溶液,而人体感染新冠病毒后,咽部所含的病毒量极少,无法通过此种方法被检测。
4.荧光法。目前广泛被使用的是荧光定量RT-PCR检测法,通过对标本进行逆转录扩增、使病毒片段达到一定数量,可以被检测到,但是由于受采样标本、运输等多种因素影响,也有假阴性的可能。
⑵ 核酸和蛋白质序列分析的内容和方法有哪些
核酸和蛋白质序列分析的内容和方法有哪些
蛋白质结构分析方法:X射线晶体衍射分析和核磁共振
x 射线衍射法的分辨率可达到原子的水平,使它可以测定亚基的空间结构、各亚基间的相对拓扑布局,还可清楚的描述配体存在与否对蛋白质的影响。多维核磁共振波谱技术已成为确定蛋白质和核酸等生物分子溶液三维结构的唯一有效手段。NM R技术最大的优点不在于它的分辨率,而在于它能对溶液中和非晶态的蛋白质进行测量。
蛋白质的序列结构测定:
1.到目前为止,最经典的蛋白质的氨基酸序列分析方法是,sarI等人基于Edman降解原理研制的液相蛋白质序列仪,及后来发展的固相和气相的蛋白质序列分析仪。
2.质谱:早期的质谱电离的方式主要是电子轰击电离(EI),它要求样品的挥发性好,一般与
气相色谱联用。但使用G C/M S分析,肽的长度受到限制,只能分析小的肽段。近年来,
在离子化的技术及仪器方面取得了突破性进展,使得质谱所能测定的分子量的范围大大超
出了10k u。因此,软离子化技术、基质辅助的激光解吸/离子化(MALDI)和电喷雾离子化(E SI)显得尤为有前途。通过串联质谱技术(MS/MS)和源后衰减基质辅助的激光解吸/离子化(PSD—MAIDI—MS),人们就可以从质谱分析中获得肽及蛋白质的结构信息。
⑶ 核酸检测的方法
核酸检测主要是鼻拭子或咽拭子法,经由鼻孔或口腔插入取得上呼吸道分泌物标本后送实验室检测。核酸检测主要是指目前对于新型冠状病毒肺炎的一种确诊的实验手段,核酸检测一般分为鼻拭子、咽拭子或者肺泡灌洗液以及痰液,通过呼吸道的标本,我们在实验室里可以检测2019新型冠状病毒的核酸,从而作为临床诊断的一个重要的依据。那临床上目前最常采用的检测方法是鼻拭子或者是咽拭子,操作的时候由医护人员采用特制的长柄取样的棉签,经由鼻孔或者经由口腔插入到鼻腔及咽腔中,在咽喉壁或者鼻腔的粘膜上进行涂抹,取得上呼吸道分泌物标本,这个标本取出之后再送到实验室进行相关的核酸检测。在做的过程中患者不用紧张,可能会有一些轻微的不适例如恶心,相信配合好医护人员的话,能够很快完成这个检查,不会给您带来很大的影响。
⑷ 检测核酸纯度方法
最近重新研读了分子克隆第三版,有一个有趣的小发现,好像过去没听人说过。一般测核酸浓度都是用260nm的光吸收值来决定,同时用260/280的比值来判断有无蛋白质污染。理想的比值是1.8~2.0左右。分子克隆第三版专门提到这种判断核酸纯度的办法是不可靠的。原因在于蛋白质在260nm的消光系数比核酸小很多,即使有相当多的蛋白质污染,这个比值还是接近于理想的比值。另外,260/280比值尤其不能用于评判寡聚核甘酸的纯度,因为嘌呤的消光系数比嘧啶大好多,寡聚核甘酸嘌呤嘧啶组成很可能不平均,所以很可能出现很纯的样品260/280比值却比较小的情况。
你所说的‘消光系数‘,是否就是吸光值的意思?如果你用连续波长测过核酸的吸光度时,就会发现,OD260,恰好是核酸吸光值最大的时候,从200-750,是一条曲线,260时是波峰,而280时,刚好是曲线下降到一半左右时的吸光值。而恰好280又是蛋白质的最佳吸收值。如果纯的核酸,那曲线就是标准的,260/280就是1.8-2.0之间,如果混有蛋白质,多肽,酚之类的杂质,那280时的吸收峰就变高了,曲线随之发生变形,而260时的吸收峰不变。就如你所说的“原因在 于蛋白质在260nm的消光系数比核酸小很多”,因此260的吸收峰几乎不变。但280时却不一样。这时相反,核酸的消化系数比蛋白质小的多,因此,一旦有污染,280上升很快。因此260/280在有污染的情况下就会变小。所以,用260/280的方法,还是比较可靠的。当然更可靠的,就是用200-750的波长,连续扫描。直接观察核酸的整条曲线,那比光靠260,280两个吸收值,肯定要准确很多。其实平时在我们检测时,我们也会检测230,320,两个值。至于这两值的作用,我稍后再说。其实有230,260,280,320,这四个点。基本上也能确定下这条曲线的该一段的形状了。
A 260 / A 280 的比值,用于评估样品的纯度,因为蛋白的吸收峰是 280 nm。纯净的样品,比值大于 1.8(DNA)或者 2.0(RNA)。如果比值低于 1.8 或者2.0,表示存在蛋白质或者酚类物质的影响。A 230 表示样品中存在一些污染物,如碳水化合物,多肽,苯酚等,较纯净的核酸 A 260 / A 230 的比值大于 2.0。A 320 检测溶液的混浊度和其他干扰因子。纯样品,A 320 一般是 0。(320差不多也就是那条曲线刚下降到0的时候)。所以,当我们检测260/280后,如果比值在1.8-2.0之间时,我们可以说其纯度可以,那OD260的值就有效。否则,OD260的值判为无效。你说的嘌噙与嘧啶的吸光值,确实没错。但一般情况下,我们测的都是基因组、tRNA,mRNA、cDNA,所以其CG含量都比较均匀。都适用于这种方法。然而,在测某些CG含量明显不均匀的情况下,比如人工合成的寡核苷酸、引物,在CG含量过大或者过小的情况下,我们就不能用260/280的方法了。不过一般自已合成的引物,都能保证纯度的,买来的引物,或者托公司合成的寡核苷酸,也不需要我们用OD值方法重新测一下。因为产品包装上写着多少个OD,序列长度,都非常详细,纯度也是有保证的。
当OD 260/ OD280值=1.8说明所提的DNA质粒的纯度比较高,所含的RNA或蛋白质污染很少,当 OD 260/ OD280值>1.8,说明有RNA污染,当OD 260/ OD280值<1.8时,说明所提的DNA中有蛋白质或者是抽提时用的苯酚未除净,楼主所体的质粒DNA的260/280在2.0左右,说明有一定的RNA污染,在提质粒DNA中,一般是在提完质粒后,加入TE溶液时加入一定量的RNA酶。抽提1.5ml大肠杆菌过夜菌液时,最后加入20ul的TE溶液时加入1.5ul浓度为10mg/ml的RNA酶,一般就可以完全去除质粒中所含的RNA污染
有关RNA的吸光度说明如下:260nm、320nm、230nm、280nm下的吸光度分别代表了核酸、背景(溶液浑浊度)、盐浓度和蛋白质等有机物的吸光度值。OD260/OD280(R)体现了RNA中的蛋白质等有机物的污染程度,质量较好的RNA的R值应在1.8~2.0之间,当R<1.8时,溶液中的蛋白质等有机物的污染比较明显;当R>2.2时,说明RNA已经被水解成了单核苷酸。在对核酸进行吸光度检测时,需要注意稀释液应使用TEBuffer。
⑸ 核酸检验方法
核酸检测具体流程如下:
1. 核酸提取
使用硅胶柱离心、磁性硅胶颗粒分离方法以及自动化仪器等商品化试剂或设备并按说明书操作。提取RNA时应注意防止RNA降解。DNA应置于-20℃保存,RNA和需长期保存的DNA应置于-80℃保存。
2. 逆转录合成cDNA
逆转录cDNA合成反应需使用逆转录引物、dNTPs、逆转录酶、RNA酶抑制剂、DTT、缓冲液和适量无RNA/DNA酶的超纯水以及RNA模板。在扩增仪或水浴箱中,在规定的温度和时间下进行逆转录反应。建议使用商品化RT-PCR一步法试剂进行第一轮扩增反应。逆转录cDNA合成反应需使用逆转录引物、dNTPs、逆转录酶、RNA酶抑制剂、DTT、缓冲液和适量无RNA/DNA酶的超纯水以及RNA模板。在扩增仪或水浴箱中,在规定的温度和时间下进行逆转录反应。使用商品化RT-PCR一步法试剂进行第一轮扩增反应。
3. PCR扩增反应(使用二次扩增的套式PCR扩增方法)
PCR反应需使用引物、dNTPs、DNA聚合酶(如Taq酶等)、缓冲液、和适量无RNA/DNA酶超纯水、以及模板(DNA或cDNA)。在扩增仪中,按照设定的程序进行扩增。使用二次扩增的套式PCR扩增方法。
4. 扩增产物定性分析
扩增产物常用分析方法是琼脂糖凝胶电泳法,与分子量标准比较,判断扩增片段是否在预期的分子量范围内。其它扩增产物分析方法还有限制性内切酶酶切分析、特异性探针杂交分析以及DNA序列分析等。自动化核酸扩增仪使用酶联比色分析或荧光探针杂交等原理测定。
5.结果判定和完成报告单
(1)实验成立的条件:每一次检测需同时做两个阳性对照、两个阴性对照,只有阳性对照扩增出预期的片段、阴性对照没有扩增出任何片段、双份平行样品结果一致的情况下实验才成立,可以作出核酸阳性或阴性反应结果的判定。
(2)HIV核酸检测阳性:发现核酸阳性反应,应该重复采集样品进行复测,复测结果呈核酸阳性反应则判定为核酸阳性,复测结果为核酸阴性反应则判为不确定结果,需进一步随访检测。
(3)HIV核酸检测阴性:只可报告本次实验结果阴性。
(4)应在完成检测后5个工作日内发出检测报告。
⑹ 在基因操作实践中有哪些检测核酸和蛋白质相对分子量的方法
最简单的就是电泳,核酸通过琼脂糖、聚丙烯酰胺凝胶电泳,蛋白质通过SDS-PAGE
⑺ 核酸含量的测定方法及原理都有哪些
核酸检测的主要原理其实是反转录和聚合酶链式扩增反应。也叫做RT-PCR。目前对新型冠状病毒进行的核酸检测也主要采用此种方式。简单来说就是采取患者鼻咽拭子、痰和其他下呼吸道分泌物、血液、粪便,检测人员通过。核酸提取试剂盒提取患者标本里边儿的核酸,然后把提取到的核酸放进检测试剂中进行复制扩增。然后再根据检测结果进行判断如果是阴性代表没有感染,如果是阳性代表有感染。目前对新型冠状病毒核酸检测会存在假阴性的可能,所以可以选择多次测量。如果连续两次核酸检测为阴性,同时没有临床症状可以排除感染,并且对已经感染了新型冠状病毒肺炎的患者,如果连续两次检测核酸为阴性,注意间隔时间必须大于一天,同时临床症状缓解,影像学好转也可以解除隔离。
⑻ 核酸蛋白检测仪步骤
核酸蛋白检测仪使用并不难,那么核酸蛋白检测仪步骤是什么呢?
在仪器使用前,首先连接好所需配套仪器:层析柱、恒流泵、自动部分收集器、记录仪(色谱工作站)。将各类插头与插座接妥(220v电源)。按下检测仪on电源开关,电源指示灯亮,说明整台仪器电源开始工作,然后观察光源指示灯,如果亮了,表示光源已开始工作,整台仪器可进入工作状态,将检测仪波长旋钮旋到所需波长刻度上,把量程旋钮拨到100%t档(仪器预热20分钟,待基线平直后可加样测试)。
接通记录仪电源开关,使电源开关拨到“通”指示灯亮。可根据记录仪说明书调换不同的纸速度,用户根据需要自行掌握,测量用10mv档。此时记录仪指针从零点开始向右移动某一刻度,调节检测仪“光量”旋钮使指针停腔穗竖留在记录仪大约中间位置5mv左右数字显示为50左右。
把检测分析仪器进样口聚乙烯塑料管接到恒流泵上,使凝胶层析柱中缓冲液流过检测仪(恒伍大流泵流量视凝胶层析柱大小选1-3ml/min)。用“调零”调整吸光度a值为0(量程开关拨到100%t调节光量旋族携钮,使记录仪指针在10mv数字显示为100,即透光率为100%。把量程开关拨到“0.0”档,缓慢调节a调零旋钮,使记录仪指示在“o”位,检测仪显示为“o”)。以上步骤结束,析系统平衡后即可用洗脱液开始洗脱样品,洗脱前再调一次吸光度0点。
⑼ 核酸检测的方式有几种
核酸定量常用方法如下:
1、光吸收法:核酸中碱基共轭结构在近紫外光波长260纳米处有最大吸收,吸收强度与核酸浓度成正比,因此可以用于核酸定量。
2、定P法:核酸中P含量约为0.095,因此可以通过测定样品中的有机P量来进行核酸定量。核酸简介:核酸是由许多核苷酸聚合成的生物大分子化合物,为生命的最基本物质之一。核酸广泛存在于所有动植物细胞、微生物体内,生物体内的核酸常与蛋白质结合形成核蛋白。不同的核酸,其化学组成、核苷酸排列顺序等不同。根据化学组成不同,核酸可分为核糖核酸和脱氧核糖核酸。DNA是储存、复制和传递遗传信息的主要物质基础。RNA在蛋白质合成过程中起着重要作用,其中转运核糖核酸,简称tRNA,起着携带和转移活化氨基酸的作用;信使核糖核酸,简称mRNA,是合成蛋白质的模板;核糖体的核糖核酸,简称rRNA,是细胞合成蛋白质的主要场所。
⑽ 核酸含量测定的方法和原理都有哪些
① 光吸收法:核酸中碱基共轭结构在近紫外光波长260nm处有最大吸收,吸收强度与核酸浓度成正比,因此可以用于核酸定量。
② 定P法:核酸中P含量约为9.5%,因此可以通过测定样品中的有机P量来进行核酸定量。
③ 核糖含量测定法:包括RNA的地衣酚法及DNA的二苯胺法。
④ 定量PCR法:定量PCR技术是指以外参或内参为标准,通过对PCR终产物的分析或PCR过程的监测,进行PCR起始模板量的定量。
⑤ 核酸杂交半定量法:通过探针与核酸在膜上杂交显色,与标准品显色进行比较从而进行半定量。