1. 抗体检测怎么检测（核酸、抗原、抗体检测）
自 2020 年新冠疫情爆发以来，“核酸检测”作为一项检测是否感染的重要指标，开始反复出现在我们的生活中。2022 年 3 月 10 日，国务院应对新型冠状病毒肺炎疫情联防联控机制综合组发布通知，决定推进“抗原筛查、核酸诊断”的检测模式，在核酸检测基础上增加抗原检测作为补充。
抗原检测是什么？和其他的检测手段有什么不同？这篇文章，我们以新型冠状病毒为例，讲讲常见的快速筛查手段，聊聊相关的原理以及适用范围。
想要对一种疾病或是一种物质进行筛查，我们首先要弄清楚的就是“从何下手”的问题，其次是“如何检测”，让微观世界的变化反映到我们眼前，帮助我们作出判断。
我们面对的是病毒。根据大家耳熟能详的中学生物课知识，病毒是一类由遗传物质和蛋白质外壳组成的类生命体 。如果想对病毒的感染情况进行探测，就需要从它的组分下手。接下来的内容，希望大家带着自己中学的生物知识阅读。
以目前正在困扰我们的 SARS-CoV-2 为例。它属于冠状病毒科下，冠状病毒亚科的乙型冠状病毒属，是已知的第七种能够感染人类的冠状病毒。所有的冠状病毒都是具有 包膜 的 正义单链 RNA 病毒 ，也就是说，它们的遗传物质是一条单独的 RNA 链，并且这条 RNA 链可以直接作为 mRNA（信使 RNA）参与翻译，指导蛋白质的合成。
编号为NPRC 2020.00002的毒种，图片由国家病原微生物资源库（中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所）提供。
我们现在的目的是检测标本中是否存在这种病毒，无论是检测它本身，还是检测病毒带来的产物，能够下手的方向也就是两种：蛋白质外壳（包膜）、遗传物质。
顺着这个逻辑，那最显而易见的方法就是检查它“能不能看到”，但病毒本体小得很，SARS-CoV-2 的直径在 80-120 nm，要想每个标本都拿电镜过一遍是不现实的，人力物力和财力都撑不住。那么更经济实惠的方法，就是通过某些措施，让 病毒的组分 ，或是因为病毒而出现的 某些特殊物质 积攒到一定数量级后发光、变色，出现 宏观表现 。
那么我们的问题就转化成了，选择一种可以观察到宏观尺度变化的方法，和病毒的组分、病毒引发的某种物质产生关联。我们能选择的物质也摆在台面上：病毒的遗传物质，在这里是它的 RNA；病毒的包膜，也就是蛋白质外壳；以及，如果你还记得一些基础的生物知识，人体的免疫系统会在感染病毒之后产生抗体以抵抗入侵，它也是不错的选材。
我们目前采用的几种检测方式，也就从这些物质（以及它们的相关物质）脱胎而来，分别为针对遗传物质的核酸检测，针对包膜的抗原检测，以及针对抗体的血清抗体检测。
作为病毒的遗传物质，核酸序列载写了能够鉴定病毒为某一特定种的基因特征，因此核酸阳性，也就意味着病毒在体内存在过。
我们目前进行的“核酸检测”其实分为两个部分。平常我们进行的“捅鼻子”“捅嗓子”取样和后续的定性是第一部分。在取得标本之后，因为病毒量太少，样本会在实验室中进行一定次数的扩增，并根据荧光反应结果来判定阳性阴性。
第二部分，确定为阳性的样本，还需要通过基因测序，确定样本病毒的分型，以便溯源。这一步已经不属于日常筛查的范畴，但在流行病学调查上具有重大意义，如果有兴趣了解，可以参看 Wikipedia 简要了解。
我们平常参与的作为 筛查 工具的核酸检测，指的就是采集到定性的第一部分。
在感染了 SARS-CoV-2 之后，咽拭子、痰、下呼吸道分泌物、血液等标本中均可发现病毒核酸。不同部分标本核酸检测的阳性率有一定差异，随着病程进展，各个部位的检出率也会发生变化。
我们习惯称呼的“鼻拭子”与“咽拭子”，其实都是采集咽腔后壁的分泌物与组织，前者采集鼻咽，后者采集口咽。也有采用其他标准的，比如唾液等亦可作为检测标本，本质上也是不同地区规定有差异
鼻（咽）拭子与（口）咽拭子已经是综合了阳性率与便利程度的考量。粪便和尿液等其实也可以作为标本采集的对象。而且根据一项对 31 例患者的研究，肛拭子的准确率要高于鼻咽与口咽采样，尤其病程后期，肛拭子确诊病例的鼻拭子阳性率不到 30%。 4 但显然，由于操作的限制，它无法作为早期筛查的首选手段。
接下来的工作，就是从获取的那一点点标本中提取核酸。由于样本中病毒的数量级很小，不足以拿来分析，还需要将其扩增并标记。需要用到的同样是高中学过的知识：聚合酶链式反应（PCR）——这一步看起来麻烦，但由于它的原理和工序已经研究成熟，实际操作中只需要加好试剂送机器，整个核酸检测的过程里最麻烦的还是让待测者安安分分弄来标本（笑）。
各地疾控机构或检测中心会采购合适的核酸 提取试剂盒 与核酸 检测试剂盒 。提取试剂盒负责将 RNA 从混杂的样本（细胞碎屑、分泌物、灰尘等杂质）中提取出来，常见的有磁珠法、离心柱法和释放剂法，不同提取方法可能对后期检测的准确度略有影响 。之后，提纯出的 RNA 就会移交给检测试剂盒（也有一些试剂盒将两者合一），进行之后的工序。
检测试剂盒带着样本在机器中进行的过程，就是这个检测中最主要的反应：RT-qPCR（实时定量逆转录聚合酶链反应）。
接下来需要你捡起高中生物的知识。一般的 PCR 反应有以下几步：
加热：让双链 DNA 解旋变形，成为两条单链； 退火：让混合的单链 DNA 与根据需要复制的片段而设计好的引物结合； 延伸：调整温度，让 DNA 聚合酶顺着引物开始工作，复制出新链，形成新的双链。在对病毒的探测中，我们要做的工作也无非上面几步，只是需要多出两样东西：
在第一次反应之前，使用 逆转录酶 （依赖 RNA 的 DNA 聚合酶），合成病毒单链 RNA 的互补链，组合成 cDNA ； 在退火与延伸的阶段，除了引物和所需的酶外，还需要 TaqMan 探针 。你可以把 TaqMan 探针这样理解：它的主体部分是一段寡核苷酸链，被设计成能和一小部分需要复制的基因片段配对成双链的样子；它一端接了一个荧光分子，另一端接了一个开关（淬灭基团），两者和探针相连时，荧光就会被淬灭基团压制，探测不到。退火时，这个探针会和引物一起结合在要复制的单链片段上。在延伸的过程中，DNA 聚合酶会把挡在面前的障碍物切碎，其中就包括这段探针，淬灭基团和荧光分子就这样分离，荧光就表现出来。
随着循环数的增多，扩增的 DNA 片段和荧光也越来越多。对比每个循环的荧光亮度和前若干次循环的基准亮度，我们就能得出目前的 DNA 片段量，也可以直接用循环数和荧光亮度做定性的判断。
那么具体复制哪一部分呢？既然要探测病毒，那我们就选取最有代表性的核酸片段。现行的标准中，ORF 基因与 N 基因是常用的检测位点。
检测试剂盒负责的就是将提取出的 RNA（样本）投入后，根据试剂盒上的程序说明，设定对应的 PCR 温度与时长，由机器控制完成扩增过程，在固定的环节收集荧光信号，记录对应的循环数（Ct 值）。判断阴性阳性 / 是否还具有传染力的标准，就是看荧光信号达到阈值时，目前循环数是多少。根据目前现行的《新型冠状病毒肺炎诊疗方案（试行第九版）》，解除隔离管理的标准为 Ct 值 ≥ 35 。和此前通行的 ≥40 标准相比，出院与解除隔离的时间会大大缩短 。
经 RT-PCR 的核酸检测到现在都是确诊的金标准，因为它在方法学的角度看来，（理论上）可以做到 100% 准确。但核酸检测耗时长、对环境与操作人员要求高，在环境条件达不到标准、物资与仪器不齐全等情况下，大批量的核酸检测会带来巨大人力与财力消耗。
在本次疫情中，我们采用的免疫测定包括了快速抗原检测与抗体检测，它以 抗原-抗体反应 为基本原理，旨在通过抗原与抗体快速的中和效应，以较少的时间成本探测样本中是否存在待测物。两者都属于免疫层析法的范畴。
以盒装方式出现、可以自行操作的抗原检测就很适合作为物资不足、自我测定等情况下的补充。
核酸检测检查的是病毒的（标志性）遗传物质，是病毒的“内里”。那么（快速）抗原检测检查的就是病毒的“外在”，直接检查完整的病毒颗粒。目前通过审批的抗原检测试剂盒包括三种类型：胶体金法、乳胶法、荧光免疫层析法。三者内在原理一致。但其中荧光免疫层析法试剂盒仍然需要专用的检测仪或紫外线手电，不适合家庭自测；胶体金法和乳胶法则都是将检查结果转化成肉眼可见的条带，差别在于用于标记上色的物质不同。
当然，抗原检测自然有它的劣势在，它的 假阴性率 （是阳性但显示阴性）要更高，可能导致漏检错检。但放在一杯茶就能出结果的时间优势面前，准确性上的差距在某些特定情况下可以暂时让步。
图源：How the SARS-CoV-2 EUA Antigen Tests Work | ASM.org
和核酸检测相比，抗原检测增加了“鼻拭子”这一采样途径，降低了个人自测的难度。拭子上的样本在缓冲液中洗脱，取液体滴加在加样孔后，液体会因为毛细作用，带着潜在的抗原，经过一片预载了抗体的区域（结合垫，conjugate pad）。
这片区域上的抗体，是抗目标抗原（SARS-CoV-2）的单克隆抗体，每一个抗体分子都和特别的标记结合，它们与样本中的抗原发生反应，形成抗原-抗体复合物，并随着毛细作用向下一条带流去。
紧接着经过的是检测线（T 线，test line），在检测线上附着的同样是抗目标抗原的单克隆抗体，你可以理解成这里的东西和结合垫上的一样，只是没带标记。此时，如果受测者已经感染了 SARS-CoV-2，他留在样本中的抗原形成的抗原-抗体复合物，会在此处与固定在线上的抗体再次结合。在这里，这些带着标记的复合物不断沉积，最终会显示出一条或深或浅的条带。条带的颜色来源，就是之前结合垫上的抗体分子附着的标记，在胶体金法中是胶体状态的金颗粒，在乳胶法中是上色的乳胶滴，在荧光法中是荧光分子。所以你在使用这类试纸时，会发现刚刚加样结束，液体刚开始扩散的时候，扩散的最前端会有一点点很淡的颜色不断推移，这就是还没有固定沉积的标记的颜色。
接下来，液体继续扩散，经过质控线（C 线，control line），在质控线上附着的是另一种抗体——‘抗“抗目标抗原的单克隆 抗体 ” 的 单克隆 抗体 ’，简称“ 二抗 ”。这种新的抗体是让上一种抗体在另一种动物的免疫系统中反应得来的，比如结合垫的抗体来自兔，那这里的抗体就来自羊，是羊抗兔的单克隆抗体。也就是说， 二抗的抗原是 之前在 结合垫上的抗体 。这条线就是为了检测液体有没有正常扩散、结合垫上的抗体有没有失效等等而存在的。此时，液体中剩余的大量来自结合垫的抗体就会作为抗原，与质控线上的二抗发生抗原抗体反应，形成复合物，显出一条明显的条带。
由于结合垫上的抗体非常充裕，这条质控线条带会出现得非常快、非常显色，而检测线由于抗原（病毒）数量不一定，显色速度会有差别，但一般在 15 分钟内就足够判断结果。所以不要看 C 线很明显，T 线隐隐约约就觉得“没事了”， T 线不管深浅，只要有，就是阳性 。
具体操作方面，可以参考医政医管局发布的 教学视频。目前国家也在逐步推广抗原自测试剂盒，在一定程度上可以减轻未来医疗与街道的压力。
除了前两种检测手段外，还有一种使用不太多，但同样重要的检测方法，就是同属免疫测定方法的“血清抗体检测”。
抗体检测采用的试剂盒与抗原检测非常接近，但标本的限制更大——由于检测的对象变成了抗体，标本就必须是明确有抗体存在的血液（或血浆、血清）。而且人体在初次感染病毒后，并不会第一时间内产生抗体。抗体能够明确达到被检测的数量级，一般是在初次感染（或接种疫苗）的一到两周之后。这些条件限制了抗体检测不能作为确诊性质的检查。目前，血清抗体检测仅作为一定情况下检查疫苗是否生效，或查验受测者近期是否感染过新冠病毒的方法。
在人体中有五种抗体，分别是 IgA、IgD、IgE、IgG 和 IgM。IgA 主要负责黏膜免疫。IgD 与免疫反应激活有关。IgE 抵御寄生虫，同时也参与过敏反应。剩下的 IgG 与 IgM 就是对抗病原体的过程中，免疫系统派出的主力军。
SARS-CoV-2 作为病原体，人体经刺激主要分泌的就是 IgG 与 IgM 两种。现有的抗体检测试剂盒，主要也是针对人体对 SARS-CoV-2 的 N 蛋白（核衣壳蛋白）或 S 蛋白（刺突蛋白）产生的 IgG 与 IgM。
抗体试剂盒的检测装置外观和抗原检测别无二致。二者的差别就是上文中提到的结合垫、检测线、质控线上附着的物质。
这次，加样孔中滴入的样本可能有对 SARS-CoV-2 的抗体。因此，结合垫上就应当是带了标记物的抗原——当然不可能放活病毒上来。一般这里使用的都是设计检测的抗原蛋白，比如前文提到的 N 蛋白或 S 蛋白，或是重组病毒，无论是哪种，它都必须包含受体结合域（RBD）作为抗体结合的靶点。在检测线上，附着的就是抗 IgM 或抗 IgG 抗体，以捕获结合了抗原的抗体蛋白。最后，质控线上附着抗原的特异性抗体，捕获剩余的游离抗原。
总的说来，三种检测方式针对的是不同的需求，互有优势，互相补充。核酸检测作为金标准，直接查验病毒的 RNA，负责看被检者带不带病毒；抗原检测作为快速检测方法，查的是病毒的蛋白质，但准确度不如核酸检测，对传染力强的感染者更有效；抗体检测查的是疫苗有没有生效、人近期有没有感染过病毒。
近期，新冠疫情在各地卷土重来。Omicron 变种与此前流行的 Delta 变种相比，虽然病死率与重症率明显下降，但潜伏期更短，病毒复制速度更快，传染力明显增强。希望大家在这样的环境中保持健康。
2. 关于非典的一个问题
概述
传染性非典型肺炎是一种急性的呼吸系统感染，世界卫生组织(WHO)于3月15日将其名称公布为严重急性呼吸道症候群(，SARS)。SARS是由一种新病原引起的，临床主要表现为肺炎，在家庭和医院有显着的聚集现象 ，目前在国内部分地区有病例发生。
非典型肺炎实际是与由细菌引起的所谓典型肺炎不同的一组肺炎,曾泛指细菌以外的病原体所致的肺炎。现在主要指由支原体、衣原体、军团菌、立克次体、腺病毒以及其他一些不明微生物引起的急性呼吸道感染伴肺炎。这些病原体亦称非典型病原体。非典型肺炎主要通过近距离空气飞沫和密切接触传播，是一种呼吸道急性传染病，有比较强的传染力。
病原
世界卫生组织宣布，正式确认冠状病毒的一个变种是引起非典型肺炎的病原体。科学家们说，变种冠状病毒与流感病毒有亲缘关系，但它非常独特，以前从未在人类身上发现，科学家将其命名为“SARS病毒”(SARS是“非典”学名的英文缩写)。香港卫生专家排除了它与甲型流感和乙型流感病毒有关的可能性，与1997年出现的H5N1禽流感病毒也没有联系。据香港卫生官员说，非典型肺炎通常由病毒引起，例如流感病毒、腺病毒和其他呼吸道病毒。非典型肺炎也可能由生物体引起。
传染性非典型肺炎是由变种冠状病毒（SARS病毒）引起的一种新的呼吸系统传染性疾病。“它中间是圆形，四周有灰色的阴影，最外围是一个个紧挨着的突起部分。”在电镜下清晰看到的一切，病毒的样子“有点像‘自由女神’头顶的帽子，称作‘日冕病毒’或者‘冠状病毒’。基本上确认它是这次非典型肺炎的病原体。”
病原学研究动态
将研磨后的肺标本切片提取液分别注入小鼠的大脑、鸡胚和体外培养的细胞中。”“鼠、鸡胚、细胞”是三种不同的病毒培植体。30个小时后，除鸡胚外，其他两个病原培植体已经发生了变化：“接种病毒的10只老鼠中有8只都出现致病反应，其中2只已死亡。”细胞的病变同样显着，“电镜下的细胞出现了病变的网状结构”。由于是第一次接种，各种变化都还没有表现出一定的规律性，接下来要不断地把致病小鼠的肺切片提取液再去感染更多的小鼠和细胞，以获得更稳定的病原体。7天后，在电镜中看到 了“冠状病毒”。
“冠状病毒并非全新的稀罕病毒，但现有从人类身体上发现的所有三种冠状病毒，都只会引致普通感冒、轻微咳嗽和发烧，绝少能引起肺炎并发症死亡，这些都和非典型性肺炎的高传染性和致死性是迥然不同的。
采集了30份非典型肺炎病人的血清，利用‘免疫荧光法’将分离病毒与这30份血清进行血清学检测，结果有23份反应呈阳性，这直接说明了冠状病毒与‘非典’病原有最密切的关系。而反转录PCR方法进行病毒的DNA序列测定显示，分离出的病原体与已知冠状病毒基因同源性达到64％，那么还有36％的不同是因为什么呢？这在基本确认非典型肺炎的病原体的同时，还说明这次的冠状病毒是基因变异后的全新品种。
根据这种冠状病毒侵入人体的特点，建议公众要勤洗手，这可能比戴口罩要更重要。因为这种病毒能在空气中存活4到5个小时，手会成为它们的依附体，而手又经常接触眼、口等身体部位，这些黏膜组织的外壳蛋白会成迷冠状病毒与人体细胞相结合的受体，进而成为病毒进入人体的通道。”
而这种基因的变化究竟又是如何发生？在4月11日的一次简单过夜实验中，通过替代一个基因将2月份分离出的对鼠致命的冠状病毒转化为感染猫细胞的病毒，这个结果支持了非典型肺炎的病原体可能是在动物和人类病毒相遇时，发生基因交换时而产生的推断。将分离出的冠状病毒导入猫冠状病毒的一个基因片段，这个基因编码一种外壳蛋白可以识别并帮助穿透猫细胞。几小时后，小鼠冠状病毒的一些病毒粒子的外壳蛋白基因变成了猫的外壳基因，因而可以感染猫细胞了，这证明了冠状病毒以这种方式改组基因能力实在不同寻常。冠状病毒通过基因改变能够轻易地改变感染宿主，非典型肺炎（SARS）病毒也很可能是现有动物交换感染给人类后突变成的一种更致命的形式。
接下是建立一个“动物实验模型”，为冠状病毒的最终确认提供结论性证据，完成病毒遗传序列测序的全部实验，真正弄清病原体的来龙去脉 。
中国公布“非典”元兇冠状病毒图
“非典型肺炎”元兇冠状病毒图
“非典型肺炎”元兇冠状病毒图
流行病学
SARS流行病学
SARS是中国广东省首先发现的一种新的疾病。最早的病例出现在2002年11月中旬。目前已有17个国家报告发现了SARS病例。
WHO对目前大范围流行的SARS进行调查研究，并将在适当时候发布确实信息以避免不真实信息。
卫生部门公布目前SARS累计病例达2781例，死亡111例。全球范围内可能SARS病例的死亡率为4％。
大多数SARS发生在青壮年。这种疾病传染模式反映了医护人员、他们的家人和有社会关系的接触者以及国际间旅行者多处于该年龄段。基于目前的数据，儿童较之成人更少受到SARS的传染威胁。
SARS的传染最常见于亲密接触的情况下，包括暴露于传染性的飞沫以及直接与传染性体液接触。
中国2月SARS发病为高峰，之后仍有新病例的报告。截至今天为止中国大陆SARS累计病例1290例，死亡55例。
香港特别行政区是仅次于中国大陆的SARS暴发最严重的地区，累计病例998例，死亡30例。期间发病的高峰是3月27日到4月1日于陶大花园住宅公寓发生的疾病的暴发。医护人员的感染仍有发生。香港的卫生权威人士正在加强感染的控制，以及相应的社区防范措施。
加拿大可能SARS病例有97例，死亡10例。截至今天暴发大部分局限于多伦多。所有病例的流行病学调查都显示有与一家医疗机构有关，或与确诊为SARS的病例有过亲密接触。加拿大疾病暴发显示年老且通常患有慢性疾病的病人的死亡率更高。
越南感染控制和公共卫生措施有效地实施使得河内疾病的暴发得到很好的控制。3月24日后疾病传染的新发病例就少有报告。自2月26日疾病暴发后死亡有4例。
新加坡3月中旬疾病暴发达到最高峰，此后新发病例逐渐下降，包括两家医院医护人员、住院病人和访客的群聚性暴发。截至4月10日累计病例126例，死亡9例。新加坡目前正在调查发生在新加坡综合医院的一起新的群聚性疾病暴发，这次暴发涉及52人，均来自两间病房57号和58号，其中包括19例可能病例和33例可疑病例。这次暴发的源头是3月24日在该医院治疗与SARS无关的慢性病的一名病人，由于该病人当时没有明显的SARS症状，因此没有根据相应的措施进行及时隔离。
美国的病例继续上升达到154例。美国的病例数包括可能和可疑病例。目前美国病人传染给医护工作者的病例很少发生。截至目前没有死亡病例“受影响”地区的定义每天根据最新病例数和疾病传播模式更新。流行病学数据显示所有新发的病例都可以追溯到曾经到过“受影响”地区或与确诊为SARS的病人有过直接接触。
传染性强，主要通过短距离飞沫传播、接触病人呼吸道分泌物及密切接触传播。人群普遍易感，医护人员是本病的高危人群。潜伏期约为二至十二天之间，通常在四到五天。传染性主要在急性期（发病早期），尤以刚发病时为强。当非典型肺炎病人被隔离及采取抗病毒、提高机体免疫力等治疗措施后，机体开始识别病毒并出现针对SARS的特异性免疫反应来抵抗和中和病毒。随着疾病的康复，SARS病毒逐渐被机体所清除，其传染性也随之消失。
传播途径
该病有一定的传染性，可通过短距离飞沫、接触呼吸道分泌物等途径传播。
诊断
1.流行病学史
1.1与发病者有密切接触史，或属受传染的群体发病者之一，或有明确传染他人的证据；
1.2发病前两周内曾到过或居住于报告有传染性非典型肺炎病人并出现继发感染病人的城市等条件被列为“非典”的流行病学诊断标准。
2.症状与体征
起病急，以发热为首发症状，体温一般＞38℃，偶有畏寒；可伴有头痛、关节酸痛、肌肉酸痛、乏力、腹泻；常无上呼吸道其他症状；可有咳嗽，多为干咳、少痰，偶有血丝痰；可有胸闷，严重者出现呼吸加速，气促，或明显呼吸窘迫。肺部体征不明显，部分病人可闻少许湿罗音，或有肺实变体征。
实验室检查发现“外周血白细胞计数一般不升高，或降低；常有淋巴细胞计数减少”的情况以及胸部 X线检查为“肺部有不同程度的片状、斑片状浸润性阴影或呈网状改变，部分病人进展迅速，呈大片状阴影；常为双侧改变，阴影吸收消散较慢。肺部阴影与症状体征可不一致”等情况应考虑为“非典”。若检查结果阴性，1－2天后应予复查。同时要注意抗菌药物治疗无明显效果。
卫生部除了给出疑似诊断标准和临床诊断标准外，还提示临床上要注意排除上感、流感、细菌性或真菌性肺炎、艾滋病合并肺部感染、军团病、肺结核、流行性出血热、肺部肿瘤、非感染性间质性疾病、肺水肿、肺不张、肺栓塞、肺嗜酸性粒细胞浸润症、肺血管炎等临床表现类似的呼吸系统疾患。
3.实验室检查 外周血白细胞计数一般不升高，或降低；常有淋巴细胞计数减少。
4.胸部X线检查
肺部有不同程度的片状、斑片状浸润性阴影或呈网状改变，部分病人进展迅速，呈大片状阴影；常为双侧改变，阴影吸收消散较慢。肺部阴影与症状体征可不一致。若检查结果阴性，1-2天后应予复查。
5.抗菌药物治疗无明显效果
疑似诊断标准：符合上述1+2+3条或2+3+4条。
临床诊断标准：符合上述1.1+2+4条及以上，或1.2+2+3+4或1.2+2+4+5条。
包括流行病学史、症状与体征、实验室检查、胸部 X线检查和抗菌药物治疗无明显效果等5个方面。
鉴别诊断：临床上要注意排除上感、流感、细菌性或真菌性肺炎、艾滋病合并肺部感染、军团病、肺结核、流行性出血热、肺部肿瘤、非感染性间质性疾病、肺水肿、肺不张、肺栓塞、肺嗜酸性粒细胞浸润症、肺血管炎等临床表现类似的呼吸系统疾患。
新诊断方法：包括使用PCR技术，PCR是一种体外基因复制技术，可在几十分钟内把基因扩增到数百万倍以上，使基因便于检测。
据悉，新的检验方法将不局限于对血样的监测，痰液、唾液和漱口液也可成为快速检测的依据。自从快速检验SARS的消息公布以来，已有多家军、地医院送来血样，要求军事医学科学院协助检测。
非典型肺炎出院诊断参考标准
同时具备下列三个条件：
1、未用退热药物，体温正常7天以上；
2、呼吸系统症状明显改善；
3、胸部影像学有明显吸收。
临床表现
■高烧
非典型肺炎的症状如下：
1.首先病人高烧（38度以上）、干咳、气短或呼吸困难发冷、头痛、食欲不振、身体不适、皮疹和腹泻。并没有一般流感的流涕、咽痛等症状，也没有通常感冒常见的白色或黄色痰液，偶有病人痰中带血丝，病人出现呼吸急促的现象，个别病人出现呼吸窘迫综合症；
2.非典型肺炎病人白细胞正常或下降；
3.X光胸片特点与临床状况分离，一般的肺炎先有很重的临床表现，后在X光胸片上可以看到肺部有阴影变化；但此次则是在临床症状还不严重时，X光片中已显示病人肺部有絮状阴影，并呈快速发展趋势；
4.通常时高烧患者应用抗生素都会有明显效果，但此病用抗生素大多无效。大多数非典型肺炎病人可自愈，个别病情恶化凶险，约有7%的病人需做人工呼吸。
■潜伏期
关于非典型肺炎的潜伏期有多种说法，一般认为是2-12天，通常在4-5天。卫生专家说，非典型肺炎的死亡率在3%-5%之间。患者可能引起并发症，最短在五天之内病情急剧恶化。男女之间发病无差别，从年龄看青壮年占70%。因最初起病时防护措施不够，医务人员属非典型肺炎高发人群，在家庭和医院有聚集现象。
■飞沫
打喷嚏或咳嗽的飞沫是非典型肺炎病原体传播的途径之一，通常在大约一米以内通过飞沫传播，直接接触患者分泌物也会受感染。这种病毒还可间接传播，它在离开人体后可存活三至六个小时。卫生专家没有排除病毒由空气传染的可能性。非典型肺炎患者应该隔离。医务工作者和探视者在与患者密切接触时应该戴有效的口罩、眼镜、围裙、头罩和手套。
■可疑病例
2003年2月1日后,表现有发热(＞38℃)和一项或更多的呼吸系统症状，包括咳嗽、气短或呼吸困难，有以下一项或多项行为：在发病前十天曾赴流行地区(根据WHO2003年3月16日修订资料，包括中国广东及香港、越南河内、新加坡和加拿大多伦多)；发病前10天内与已诊断为SARS病例有密切接触史，密切接触指护理过SARS病例、与SARS病例共同生活、直接接触过SARS病例的呼吸道分泌液和体液。
■可能病例
1.合乎可疑病例定义者，且经胸部X光摄片证实为肺炎表现或有呼吸窘迫综合症现象者；
2.任何原因无法解释的呼吸系统疾病导致的死亡病例，尸检结果显示呼吸窘迫综合症的病理改变并且没有明确病因；
3.除了发烧与呼吸道症状外，SARS尚可能伴随：头痛、肌肉僵硬、食欲不振、身体不适、意识紊乱、皮疹及腹泻等症状体征。
该病主要表现为急性起病，以发热为首发症状，偶有畏寒，同时伴有头痛、关节酸痛和全身酸痛、乏力。有明显的呼吸道症状：干咳、少痰，个别病人偶有血丝痰，部分病人出现呼吸加速、气促等上呼吸道病毒感染症状，多数病人症状较轻。
高烧38度以上、干咳少痰应该是‘非典’的必备症状
治疗方法
（一）一般性治疗：休息，适当补充液体及维生素，避免用力和剧烈咳嗽。密切观察病情变化（多数病人在发病后14天内都可能属于进展期）。定期复查胸片（早期复查间隔时间不超过3天）、心、肝、肾功能等。每天检测体表血氧饱和度。
（二）对症治疗：
1、有发热超过38.5℃者，全身酸痛明显者，可使用解热镇痛药。高热者给予冰敷、酒精擦浴等物理降温措施。
2、咳嗽、咳痰者给予镇咳、祛痰药。
3、有心、肝、肾等器官功能损害，应该作相应的处理。
4、气促明显、轻度低氧血症者应早给予持续鼻导管吸氧。
儿童忌用阿司匹林，因该药有可能引起Reye综合征。
（三）治疗上早期选用大环内脂类、氟喹诺酮类、β-内酰胺类、四环素类等，如果痰培养或临床上提示有耐药球菌感染，可选用（去甲）万古霉素等。
（四）糖皮质激素的应用：建议应用激素的指征为：①有严重中毒症状；②达到重症病例标准者。应有规律使用，具体剂量根据病情来调整。儿童慎用。
（五）可选用中药辅助治疗，治疗原则为：温病，卫、气、营血和三焦辨证论治。
（六）可选用抗病毒药物。
（七）可选用增强免疫功能的药物。
（八）重症病人的处理和治疗：
1、有明显呼吸困难或达到重症病例诊断标准要进行监护。
2、可使用无创正压通气首选鼻罩CPAP的方法。常用的压力水平为4-10cmH2O。应选择适当的罩，并应持续应用（包括睡眠时间），暂停时间不超过30分钟，直到病情缓解。推荐使用无创正压通气的标准：呼吸次数>30次/分；吸氧3-5升/分条件下，SaO2<93%；
3、严重呼吸困难和低氧血症，吸氧5升/分条件下SaO2<90%或氧合指数<200mmHg，经过无创正压通气治疗后无改善，或不能耐受无创正压通气治疗者，应该及时考虑进行有创的正压通气治疗。
4、一旦出现休克或MODS，应及时作相应的处理。如果处理有困难或条件不足，应及时请有关专家会诊。
中医治疗
非典型肺炎属于中医“热病”范畴，病因为感受疫毒时邪，病位在肺。其基本病机特点为：热毒痰瘀，壅阻肺络，热盛邪实，湿邪内蕴，耗气伤阴，甚则出现气急喘脱的危象。在此基础上，专家根据所针对的不同人群以及地区气候特点，分别对易感人群的预防、不同类型和不同病期患者的治疗提供了指导性意见。其预防方案是在实施“社区综合性预防措施(试行)”的基础上，建议参考使用以提高人群对非典型肺炎的抵抗力为目的，中医预防措施：
一般健康人群服用的中药处方一：鲜芦根二十克、银花十五克、连翘十五克、蝉衣十克、僵蚕十克、薄荷六克、生甘草五克，水煎代茶饮，连续服用七至十天。
处方二：苍术十二克、白术十五克、黄芪十五克、防风十克、藿香十二克、沙参十五克、银花二十克、贯众十二克，水煎服，一日两次，连续服服七至十天。
处方三：贯众十克、银花十克、连翘十克、大青叶十克、苏叶十克、葛根十克、藿香十克、苍术十克、太子参十五克、佩兰十克，水煎服，一日两次，连续服用七至十天。
与非典型肺炎病例或疑似病例有接触的健康人群在医生指导下服用的中药处方：生黄芪十五克、银花十五克、柴胡十克、黄芩十克板蓝根十五克、贯众十五克、苍术十克、生苡仁十五克、藿香十克、防风十克、生甘草五克。水煎服，一日两次，连续服用十至十四天。
治疗在卫生部疾病控制司制定的“非典型肺炎病例或疑似病例的推荐治疗方案和出院诊断参考标准(试行)”等防治技术方案的基础上，为进一步提高非典型肺炎的临床疗效，建议医生根据实际情况，参考使用以下中医药治疗方法，对非典型肺炎病例或疑似病例按照中医辨证论治的原则，因地制宜，分期分证，进行个体化治疗。同时还要根据病情变化，适时调整治法治则，随证加减。
早期：早期患者以热毒袭肺、湿遏热阻为病机特征。临床上分为热毒袭肺、湿热阻遏、表寒里热夹湿三种证候类型。属热毒袭肺证者，宜清热宣肺，疏表通络，可选用银翘散合麻杏石甘汤加减；属湿热阻遏证者，宜宣化湿热，透邪外达，可选用三仁汤合升降散加减，如湿重热轻，亦可选用霍朴夏苓汤；属表寒里热夹湿证者，宜解表清里，宣肺化湿，可选用麻杏石甘汤合升降散加减。
中期：中期患者以疫毒侵肺，表里热炽，湿热蕴毒，邪阻少阳，疫毒炽盛，充斥表里为病机特征。临床上分为疫毒侵肺、表里热炽，湿热蕴毒，湿热郁阻少阳，热毒炽盛四种证候类型。属疫毒侵肺、表里热炽证者，宜清热解毒、泻肺降逆，可选用清肺解毒汤；属湿热蕴毒证者，宜化湿辟秽、清热解毒，可选用甘露消毒丹加减；属湿热郁阻少阳证者，宜清泄少阳、分清湿热，可选用蒿芩清胆汤加减；属热毒炽盛证者，宜清热凉血、泻火解毒，可选用清瘟败毒加减。
极期：极期患者以热毒壅盛，邪盛正虚，气阴两伤，内闭外脱为病机特征。临床上分为痰湿瘀毒、壅阻肺络，湿热壅肺、气阴两伤，邪盛正虚、内闭喘脱三种证候类型。属痰湿瘀毒、壅阻肺络证者，宜益气解毒、化痰利湿、凉血通络，可选用活血泻肺汤；属湿热壅肺、气阴两伤证者，宜清热利湿、补气养阴，可选用益肺化浊汤；属邪盛正虚、内闭喘脱证者，宜益气固脱、通闭开窍，可选用参附汤加减。
恢复期：恢复期患者以气阴两伤，肺脾两虚，湿热瘀毒未尽为病机特征。临床上分为气阴两伤、余邪未尽，肺脾两虚两种证候类型。属气阴两伤、余邪未尽证者，宜益气养阴、化湿通络，可选用李氏清暑益气汤加减；属肺脾两虚证者，宜益气健脾，可选用参苓白术散合葛根芩连汤加减。
预防措施
专家提醒市民从五个方面做好预防保护措施避免被感染：
一是保持生活、工作环境的空气流通；
二是可用食用酸醋熏蒸消毒空气；
三是勤洗手；
四是凡与病人接触者需戴口罩，注意手的清洁和消毒；
五是根据天气变化，注意防寒保暖，多参加锻炼，增强自身抵抗疾病的能力，防止疾病的发生。
如出现上述类似症状时，应及时到医院就诊。
■空气消毒
每次开窗10－30分钟，使空气流通，病菌排出室外。有条件的还可以用一些经卫生行政部门批准的空气消毒剂，按照其使用说明进行喷雾或者熏蒸消毒。
■地面消毒
进行湿式清扫，以免尘土飞扬而将病菌带入空气中，同时应注意地面保持干燥。
■物体消毒
桌椅、热水瓶、把手、开关、地面、厕所、浴池等可用500mg/L 有效氯消毒剂喷洒或擦拭，像水龙头、厕所门把手以及比较潮湿的地方，病菌容易沾染和繁殖，要重点消毒。
■餐具消毒
可连同剩余食物一起煮沸10－20分钟。餐具可用500mg/L有效氯，或用0.5％过氧乙酸浸泡消毒0.5－1小时。餐具消毒时要全部浸入水中，消毒时间从煮沸时算起。
■手的消毒
经常用流动水肥皂洗手，在饭前、便后、接触污染品后最好用250－1000mg/L 1210消毒剂或250－1000mg/L 有效碘的碘伏或用经批准的市售手消毒剂消毒。
■衣被、毛巾等的消毒 棉布类与尿布等可煮沸消毒10－20分钟，或用0.5％过氧乙酸浸泡消毒0.5-1小时，对于一些化纤织物、绸缎等只能采用化学浸泡消毒方法。