⑴ 干货分享丨代谢组学问题集锦之进阶篇
在深入理解了基础代谢组学后，选择合适的检测方法、平台，以及质控和数据分析是关键。下面详细解析一些进阶问题：
代谢组学方法分为靶向、非靶向、拟靶向和代谢流。靶向侧重特定代谢物，适用于验证研究；非靶向全面分析，发现型研究常用；拟靶向结合两者优点；代谢流追踪代谢路径。
依据研究需求，如脂蛋白亚类用NMR，脂肪酸用GC-MS，神经递质用UPLC-QQQ-MS。非靶向研究常选NMR和QTOF-MS。
质控样用于监控系统稳定性和问题发现，平行样监控实验全程稳定性。定量限（LOQ）和检测限（LOD）是评估准确度和灵敏度的指标。
MRM针对性采集数据，基质效应源于样品离子化过程中的干扰，可通过前处理和选择策略来消除。
标准品是定量的必要条件，但需开发合适的方法。衍生化改善目标物响应性、稳定性和分离性。
TOF、QQQ、QTRAP和Orbitrap代表不同类型的质谱分析器，各有优缺点，适用于不同类型的代谢组学研究。
⑵ 做好代谢组学研究的关键在哪里
首先明确代谢组学的核心任务。对小分子代谢物的定性、定量分析并发现差异代谢物：（1）对生物体系中的内源性代谢物及其变化规律进行表征；（2）以差异代谢物作为核心对生命奥秘进行解析。而基于色谱/质谱联用的分离分析技术具有灵敏度高、选择性好、动态范围宽、信息丰富等优点，已成为代谢组学研究的主流技术平台。
其次明确代谢组学的研究方法。对于非靶向代谢组学而言，色谱与高分辨质谱的联用必不可少；而对于靶向代谢组学而言，基于多反应监测（MRM）模式的三重四极杆质谱被认为是质谱定量的 “金标准”。近年来，拟靶向技术由于结合了非靶向和靶向分析技术的双重优势，在代谢物分析的覆盖度上与非靶向方法接近，在灵敏度上与靶向分析一样，迅速发展成为代谢组学的主流研究方法。拟靶向代谢组学主要包括三个步骤：（1）基于四极杆飞行时间质谱的非靶向分析；（2）母离子/产物离子对的选择及检测参数优化；（3）使用三重四极杆或QTRAP质谱采用MRM模式（包括上述离子对）对样品进行分析。
关键点有哪些？代谢组学整个研究过程可以细分为20多个步骤，若每一步准确率为70%，最终结果的准确率不足0.1%，因此必须确保每一步（尤其是关键步骤）都规范、准确，才能保证研究结果准确、可靠。影响代谢组学研究质量的关键环节包括：（1）系统科学的研究方案；（2）样本收集、分组、储存、前处理、质量控制；（3）数据采集与质量控制；（4）数据处理、分析；（5）差异分子筛选与鉴定；（6）分类模型构建与验证；（7）数据库自建、管理与使用。这些环节受制因素较多，需要参考研究论文、技术规范、注意过程控制，采用专业的技术和工具支持才能获得高质量的研究结果。
为什么关键？围绕快速、有效地发现分子和标志物这一目的，精准和高通量正成为引领发展的方向。代谢组学研究需要满足生物医药、食品等行业的个性化分子智能识别需求，所以需要分子智能识别检测技术做支撑，需要自主知识产权的核心算法，才能保证专业化的组学、质谱数据处理、数据挖掘。
总结来说，在组学研究过程中，只有做好分子特征检测、差异分子筛选、差异分子鉴定、分类模型构建、数据库自建等关键步骤，才能得到最好的组学研究结果。
⑶ 代谢组学用色谱柱分离出的物质怎么检测其结构进行pca分析
靶向代谢组学新技术，区别于传统的非定向代谢组学，具有如下优势：
1.样品种类多：生物流体（血液、尿、唾液、肠道微生物）、环境样品、细胞、动植物组织、污水、药品、食品。
2.化合物涵盖广：包括脂类、维生素、核苷酸、神经递质等700种代谢产物，涵盖所有主要代谢途径。
3.分析时间短：我们的方法能在30min同时测定并准确鉴定出700种化合物。
4.复杂的数据处理：专业的数据处理方法和软件，能对所得数据进行PLS-DA,PCA,ANOVA,VIP,Biomarker等分析。