㈠ 读懂非编码RNA(ncRNA)
揭秘非编码RNA的奥秘:生命调控的隐形大师
在真核生物的基因宝库中,尽管只有约1-2%的基因承担着编码蛋白质的重任,但它们背后隐藏的非编码RNA(ncRNA)世界却更为壮观。ncRNA,这些沉默的主角,由基因组转录,却以别样的方式影响着生命的各个方面。它们大致可分为两大类:结构型ncRNA和调控型ncRNA,以长度划分,又可以分为小ncRNA(18-200nt)和长链ncRNA(>200nt)。
长链ncRNA:调控生命节律的秘密守护者
长链非编码RNA(lncRNAs),如超长链的指挥者,它们在表观遗传调控、细胞周期和分化过程中扮演着关键角色,如同生命的调色板,精准地调节着细胞的命运。
微调基因表达的小小舞者:microRNA
microRNA (miRNA) 是一支精巧的20-24nt分子舞者,源自转录本中的发夹结构pre-miRNA。它们通过与靶mRNA的3'端互补配对,就像指挥家调校乐团的音准,调控基因表达的无声旋律。
piRNA:生殖细胞中的沉默仲裁者
Piwi相互作用RNA (piRNA) 是24-31nt的小分子,与Piwi蛋白结合形成复合体,尤其在哺乳动物的生殖细胞和干细胞中发挥独特作用,它们通过piRNA复合物(piRC)来调控基因沉默的精密路径。
环形RNA:生命的螺旋结构与功能多样性
环形RNA (circRNAs) 是一种独特的非编码分子,它们以共价键构成,没有5'帽子和3'尾巴。作为miRNA海绵和转录调控者,circRNAs在生物学过程中的角色越来越被揭示,其功能的多样性和复杂性令人瞩目。
siRNA:双刃剑与非编码RNA的界限
虽然siRNA因其不编码蛋白而被视为非编码RNA,但其外源合成的属性使其在定义上有所区别。尽管siRNA通过RNA干扰(RNAi)机制参与转录后沉默,但它们的编码属性可能挑战我们对ncRNA传统的理解。
然而,随着对lncRNAs和circRNAs的研究深入,我们发现这些看似非编码的RNA可能具备编码功能,它们在生物学中的作用远超最初的认识。这提示我们,ncRNA的分类和命名可能需要更严谨的标准,以适应这些复杂的生命分子。
Esteller M.揭示ncRNA在疾病中的深远影响(Nat Rev Genet, 2011); Mattick JS, Makunin IV. 探索非编码RNA的全貌(Hum Mol Genet, 2006); Xu JZ, Zhang JL, Zhang WG. 抗义RNA:遗传研究中的新宠(J Zhejiang Univ Sci B, 2018)。这些研究文献揭示了ncRNA在生物学领域的广阔天地,等待我们进一步探索。