药物分子机制研究方法

A. 研究一个新蛋白功能及分子机制的主要方法和思路 请高手指点。

主要是生物信息学手段
先获得该蛋白序列或者编码它的核酸序列，然后去蛋白数据库中寻找同源蛋白，再去查看同源蛋白在相近物种中参与哪些代谢通路
最后再进行生物学实验验证

B. 药理学的研究方法有哪些

药理学
第六版
李端
人民卫生出版社
第2页
药理学是一门实验性学科。药理学研究常利用生物体（包括清醒动物、麻醉动物）、离体器官组织细胞或在分子水平、微生物培养等实验方法，严格控制实验条件，通过阴性对照（溶剂与赋形剂）、阳性对照（通常用某种公认的参比药物）或经自身前后对照作定性或定量的比较，观察药物的作用、副反应等。
抛砖引玉。

C. 网络药理学的研究思路与方法

目前，网络药理学的研究方法大致分为两类：一是根据公共数据库和公开发表的已有数据，建立特定药物作用机制网络预测模型，预测药物作用靶点，并从生物网络平衡的角度解析药物作用机制。如Cu J[12]等运用虚拟筛选和网络预测技术成功地预测了大黄二蒽酮A、大黄二蒽酮C、番泻苷C等几种从未报道过的具有抗2型糖尿病作用的成分。

D. 什么是药物的设计与研发如何将生理学的原理及研究方法应用于新药的设计与研发

药物设计是随着药物化学学科的诞生相应出现的。早在20世纪20年代以前，就开始进行天然有效成分的结构改造。直到1932年，欧兰梅耶发表了将有机化学的电子等排原理和环状结构等价概念用于药物设计，首次出现具有理论性的药物分子结构的修饰工作。随后，药物作用的受体理论、生化机制、药物在体内转运等药物设计的理论不断出现。在60年代初出现了构效关系的定量研究，1964年汉希和藤田稔夫提出定量构效关系的汉希分析。药物设计开始由定性进入定量研究阶段，为定量药物设计奠定理论和实践基础。药物设计逐渐形成一门独立的分支学科。70年代以后药物设计开始综合运用药物化学、分子生物学、量子化学、统计数学基础理论和当代科学技术以及电子计算机等手段，开辟了药物设计新局面。随着分子生物学的进展，对酶与受体的理解更趋深入，对有些酶的性质、酶反应历程、药物与酶复合物的精细结构得到阐明，模拟与受体相结合的药物活性构象的计算机分子图像技术在新药研究中已取得可喜的成果。运用这些新技术，从生化和受体两方面进行药物设计是新药设计的趋向。