A. 基因功能鉴定的方法有哪些
基因功能鉴定的方法
1、转基因技术
2、基因敲出技术
3、基因沉默技术
转基因技术是将外源基因导入受体细胞,室外源基因随即整合到受体细胞的染色体上,并随者受体细胞的分裂并将外源基因遗传给后代,从而获得携带外源基因的转基因生物方法。
基因敲出技术是采用动物胚胎肝细胞介导定向基因转移,使动物体内的特定基因丧失功能的技术。
基因沉默技术是针对mRNA的操作,旨在抑制基因表达产物的生成。
B. 新基因功能的研究方法
基因功能的研究思路主要包括:
1.基因的亚细胞定位和时空(发育期或梯度药物处理浓度, 不同组织/器官)表达谱;
2.基因在转录水平的调控(可以通过genome walking PCR或通过已有的资源库寻找该基因的启动子等转录调控区域, 通过单杂交或ChIP等技术, 寻找该基因的转录调控蛋白)
3.细胞生化水平的功能研究(也就是蛋白蛋白作用复合体的寻找验证,具体方法有酵母双杂交, GST pulldown, co-IP, BRET, FRET, BiFc等等,对该基因的表达产物做一个细胞信号转导通路的定位)
4.gain-of-function & loss-of-function: 也就是分别在细胞和个体水平,做该基因的超表达和knockdown(或knockout), 从表型分析该基因的功能.
功能研究应从完整的分子-细胞-个体三个层次研究, 综合分析.
关于基因的表达和定位,可以这样去做:
1. mRNA水平检测基因表达:选择表达目的基因的组织/细胞(发育不同时期、机体不同部位、加处理因素...),提取RNA,反转录,做RT-PCR或real time RT-PCR,检测基因的表达情况/变化。
(或者以northern blot、Rnase protection assay方法,检测基因的mRNA表达情况/变化。)
2. 蛋白质水平检测基因表达:选择相应的组织/细胞,以Western blot、免疫组化(OR免疫荧光)检测目的蛋白的表达。
3. 检测目的蛋白的细胞定位:将目的基因克隆至带荧光标签(如GFP)的表达载体,在适合的模式细胞中表达,在活细胞中观察蛋白的细胞定位。
C. 细胞水平研究某一基因功能研究的主要方法
细胞水平研究某一基因功能研究的主要方法是对基因进行测序,了解基因的形成以及应在表现形式上对人体和细胞方面的变化。可以在细胞水平上通过基因工程或基因剪辑研究细胞的整体发育状况