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肿瘤学研究方法

发布时间:2023-05-22 06:49:06

A. 2019医学考研:肿瘤学的研究方向是什么

以下是猎考考研小编为大家整理的“2019医学考研:肿瘤学的研究方向是什么?”的相关内容,希望对考研的同学有所帮助,一起来看看吧!
研究方向
目前,各大院校与肿瘤学专业相关的研究方向都略有不同的侧重点。以中山大学肿瘤防治中心为例,该专业硕士研究方向主要有:
01肿瘤分子分型与个体化治疗
02肿瘤药理与个体化治疗
03肿瘤信号转导与靶向药物
04恶性肿瘤的靶向治疗的研究
05恶性肿瘤发病及转移的分子标志
06恶性肿瘤早期诊断及发病机制
07EB病毒致癌机制的研究
08肿瘤靶向药物
09肿瘤信号传导和细胞周期调控
10肿瘤免疫与免疫治疗
11肿瘤免疫逃逸与细胞免疫治疗研究
12肿瘤相关基因的研究
13肿瘤发生和发展的分子机理
14肿瘤的分子病因学及基因治疗
15肿瘤基因治疗
16肿瘤病理学
17靶向治疗分子机制
18肺癌靶向治疗
19乳腺癌综合治疗
20食管癌的个体化治疗
21肺癌分子分型研究
22炎性器官功能损害的机制与防控方法
23卵巢癌诊治
24妇科肿瘤诊治进展
25妇科肿瘤相关基因的研究
26头颈肿瘤诊断治疗的基础研究
27膀胱癌动脉化疗
28激素非依赖性前列腺癌新型药物研究
29肾癌的微创外科治疗
30恶性肿瘤放射生物学行为
31鼻咽癌分子指标的预后
32鼻咽癌筛查指标的评价
33肿瘤转移机制
34肿瘤纳米靶向治疗机制研究
35血液肿瘤的临床和基础研究
36胶质瘤综合治疗基础研究
37鼻咽癌综合治疗
38肿瘤生物标志物的分子机理及其临床应用研究
以上是猎考考研为大家准备整理的“2019医学考研:肿瘤学的研究方向是什么?”的相关内容。另则模返外,猎考考研针对每一个科目要点与每年的大纲进行深入并具有针对性码码的指导分析,欢迎各位考生了解咨询。同时,猎考考研一直为大家推出考研直播课堂,足不出户就可以边听课边学习,为大家的考研梦孙饥想助力!
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B. 医学考研专业:肿瘤学专业研究方向

目前,各大院校与肿瘤学专业相关的研究方向都略有不同的侧重点。以中山大学肿瘤防治中心为例,该专业硕士研究方向主要有:01肿瘤分子分型与个体化治疗02肿瘤药理与个体化治疗03肿瘤信号转导与靶向药物04恶性肿瘤的靶向治疗的研究05恶性肿瘤发病及转移的分子标志06恶性肿瘤早期诊断及发病机制07EB病毒致癌机制的研究08肿瘤靶向药物09肿瘤信号传导和细胞周期调控10肿瘤免疫与免疫治疗11肿瘤免疫逃逸与细胞免疫治疗研究12肿瘤相关基因的研究13肿瘤嫌陵发生和发展的分子机理14肿瘤的分子病因学及基因治疗15肿瘤基因治疗16肿瘤病理学17靶向治疗分子机制18肺癌靶向治疗19乳腺癌综合治疗20食管癌的个体化治疗21肺癌分子分型研究22炎性器官功能损害的机制与防控方法23卵巢癌诊治24妇科肿瘤诊治进展25妇科肿瘤相关基因的研究26头颈肿瘤诊断治疗的基础研究27膀胱癌动脉化疗则巧28激素非依赖性前列腺癌新型药物研究29肾癌的微创外科治疗30恶性肿瘤放射生物学行为31鼻咽癌分子指标的预孙者键后32鼻咽癌筛查指标的评价33肿瘤转移机制34肿瘤纳米靶向治疗机制研究35血液肿瘤的临床和基础研究36胶质瘤综合治疗基础研究37鼻咽癌综合治疗38肿瘤生物标志物的分子机理及其临床应用研究

C. 请问目前肿瘤检测的方法都有哪些

肿瘤筛查是早期发现癌症和癌前病变的重要途径。
目前肿瘤筛查的方式主要有以下几个方法:
1. 包括X光,B超,CT等一些影像学设备的影像检测。但是经过影像学检查查出的肿瘤都是比较大的肿瘤了,基本都到了中晚期。总的来说,作为早期筛查,影像学手段发现的还是比较晚的。

2. 肿瘤标志物检查,包括癌胚抗原定量CEA、肿瘤特异性生长因子TSGF,甲胎蛋白AFP等等。在美国,肿瘤标志物通常用作检验癌症是否复发,而不是用在健康人身上,医生不鼓励健康人盲目地做血清肿瘤标志物检查。

3. 基因检测,肿瘤的产生源自于细胞的无限增殖。癌基因又称转化基因,它们一旦活化便能促使人或动物的正常细胞发生癌变。目前常见的癌基因家族src家族、ras家族、myc家族、sis家族、myb家族。抑癌基因的缺失也会导致肿瘤发生。目前基因检测比较昂贵,且受基因样本库、专业解读水平的制约,基因检测的结果解读难度大。

尿液检测,恶性肿瘤患者普遍存在氨基酸代谢异常的现象,氨基酸代谢异常在肿瘤发生早期就存在,其中一个重要表现,就是尿液中对羟基苯丙氨酸(酪氨酸)的含量升高。肿瘤细胞代谢越活跃,氨基酸代谢异常越显着,酪氨酸含量升高越明显。通过大量实验研究发现,几乎所有恶性肿瘤病人尿液中的酪氨酸含量会明显地升高50%-150%。目前市场上的好益测癌症检测试剂可以与与尿液中的酪氨酸及其衍生物发生特异性显色反应,定性检测其含量,从而判断人体内恶性肿瘤细胞的代谢活跃程度,进而进行恶性肿瘤风险评估。

D. 如何应用蛋白质组学技术进行肿瘤研究思路设计

双向凝胶电泳 双向凝胶电泳的原理是第一向基于蛋白质的等电点不同用等电聚焦分离,第二向则按分子量的不同用SDS-PAGE分离,把复杂蛋白混合物中的蛋白质在二维平面上分开。由于双向电泳技术在蛋白质组与医学研究中所处的重要位置,它可用于蛋白质转录及转录后修饰研究,蛋白质组的比较和蛋白质间的相互作用,细胞分化凋亡研究,致病机制及耐药机制的研究,疗效监测,新药开发,癌症研究,蛋白纯度检查,小量蛋白纯化,新替代疫苗的研制等许多方面。近年来经过多方面改进已成为研究蛋白质组的最有使用价值的核心方法。 等电聚焦 等电聚焦(isoelectric focusing,IEF)是60年代中期问世的一种利用有pH梯度的介质分离等电点不同的蛋白质的电泳技术。等电聚焦凝胶电泳依据蛋白质分子的静电荷或等电点进行分离,等电聚焦中,蛋白质分子在含有载体两性电解质形成的一个连续而稳定的线性pH梯度中电泳。载体两性电解质是脂肪族多氨基多羧酸,在电场中形成正极为酸性,负极为碱性的连续的pH梯度。蛋白质分子在偏离其等电点的pH条件下带有电荷,因此可以在电场中移动;当蛋白质迁移至其等电点位置时,其静电荷数为零,在电场中不再移动,据此将蛋白质分离。 生物质谱 生物质谱技术是蛋白质组学研究中最重要的鉴定技术,其基本原理是样品分子离子化后,根据不同离子之间的荷质比(M/E)的差异来分离并确定分子量。对于经过双向电泳分离的目标蛋白质用胰蛋白酶酶解(水解Lys或Arg的-C端形成的肽键)成肽段,对这些肽段用质谱进行鉴定与分析。目前常用的质谱包括两种:基质辅助激光解吸电离-飞行时间质谱(MALDI-TOF-MS)和电喷雾质谱(ESI- MS)。 飞行时间质谱 MALDI 的电离方式是 Karas和Hillenkamp于1988年提出。MALDI的基本原理是将分析物分散在基质分子(尼古丁酸及其同系物)中并形成晶体,当用激光(337nm的氮激光)照射晶体时,基质分子吸收激光能量,样品解吸附,基质-样品之间发生电荷转移使样品分子电离。它从固相标本中产生离子,并在飞行管中测定其分子量,MALDI-TOF-MS一般用于肽质量指纹图谱,非常快速(每次分析只需3~5min),灵敏(达到fmol水平),可以精确测量肽段质量,但是如果在分析前不修饰肽段,MALDI-TOF-MS不能给出肽片段的序列。 电喷雾质谱(ESI-MS) ESI- MS是利用高电场使质谱进样端的毛细管柱流出的液滴带电,在N2气流的作用下,液滴溶剂蒸发,表面积缩小,表面电荷密度不断增加,直至产生的库仑力与液滴表面张力达到雷利极限,液滴爆裂为带电的子液滴,这一过程不断重复使最终的液滴非常细小呈喷雾状,这时液滴表面的电场非常强大,使分析物离子化并以带单电荷或多电荷的离子形式进入质量分析器。ESI-MS从液相中产生离子,一般说来,肽段的混合物经过液相色谱分离后,经过偶联的与在线连接的离子阱质谱分析,给出肽片段的精确的氨基酸序列,但是 分析时间一般较长。 目前,许多实验室两种质谱方法连用,获得有意义的蛋白质的肽段序列,设计探针或引物来获得有意义的基因。随着蛋白质组研究的深入,又有多种新型质谱仪出现,主要是在上述质谱仪的基础上进行改进与重新组合。

E. 如何从肿瘤免疫应答的角度设计研究思路

在抗肿瘤免疫应答过程中,药物的疗效很大程度上取决于肿瘤特异的效应性免疫细胞的功能状态,而效应细胞的增殖和活性受免疫检查点共刺激和共抑制信号的共同调节。因此增加抗肿瘤免疫反应往往是通过 增强作为正向调节的共刺激信号,或阻断负向调节的抑制信号 。但往往事情没有我们想的那么简单,尤其是在异质性很强的肿瘤微环境中,各种免疫调控网络纷繁复杂,这也就促使我们采用多种免疫检查点抑制剂联合治疗的方案。

目前发旁仿现具有可用于药物治疗的免疫检查点分子有很多: PD-1, PD-L1, CTLA4, LAG-3, TIM-3, TIGIT, PVRIG, NKG2A 等,因为PD-1/PD-L1和CTLA4最早被发现,也研究的最多,因此目前抗CTLA-4 与抗 PD-1/PD-L1 联合策略也被用于多种肿瘤的免疫治疗中。但这种组合方式在很多肿瘤患者中的疗效并不显着,还具有很强的副作用,因此近些年科学家正不断研究别的免疫检查点联合用药方式。其中因 TIM-3 广泛表达于T细胞、Tregs、B细胞、NK细胞、DCs、巨噬细胞和肥大细胞等各种免疫细胞,并与 Galectin9 、高迁移率组盒1( HMGB1 )和癌胚抗原相关细胞粘附分子1( CEACAM-1 )结合成为了近几年基础和临床研究工作者的青睐。此外,TIM-3与PD-1在耗尽的T细胞和TILs上的共表达现胡启或象为联合使用抗PD-1和抗TIM-3提供了一个思路。并且一些小鼠模型的实验为这种组合的有效性提供了直接证据,几个I期的抗PD-1联合抗TIM-3的研究已经在晚期和转移性实体肿瘤中开始施行。

那么接下来我就先通过解读今年发表在 Nat Commun (IF:14.91)一篇名为:Galectin-9 interacts with PD-1 and TIM-3 to regulate T cell death and is a target for cancer immunotherapy的文章介绍免疫检查点分子情侣PD-1/TIM-3以及 Galectin-9 的三角恋故事。

1.质谱分析筛选PD-1的结合蛋白

研究者首先通过IP/Western和免疫复合物的质谱分析确定了Galectin-9是PD-1的结合蛋白,且具有免疫调节活性。这里可能大家需要想到作者肯定筛选出了很多可以与PD-1结合裤伍的蛋白,然后通过实验逐一进行功能验证,最后发现Galectin-9蛋白具有较好的表型,因此后续都对这个蛋白进行分析。 类比这样的方法我们还可以筛选与自己研究基因相结合的蛋白,从而缩小靶基因的范围。 后续实验证明了Galectin-9与PD-1的结合是高度选择性的,并且是由多糖介导的,它不影响PD-1与其同源配体PD-L1的结合,也不影响PD-1和治疗性抗体Pembrolizumab和nivolumab的结合。

Galectin-9主要有两个CRD ( N-CRD,C-CRD )结合位点,研究者发现Galectin-9主要通过其 C-CRD 与PD-1结合,而N-CRD和C-CRD均介导其与Tim-3的结合。为了确定PD-1上与Galectin-9结合的糖基化位点,将PD1上4个可能的糖基化位点(N49、N58、N74和N116)上的天冬酰胺(N)残基分别突变为谷氨酰胺(Q),发现 N116Q 突变在很大程度上影响了PD-1与Gal-9的结合,因此Galectin-9/PD-1的相互作用主要由Gal-9的C-CRD和PD-1的N116连接的糖链介导。

图1:

2. Galectin-9可与PD-1和TIM-3交联形成复合物

紧接着研究者通过平板蛋白结合实验,发现在没有Galectin-9的情况下,PD-1 ECD并不结合TIM-3 ECD,而Galectin-9促进了它们的协同结合。DuoLink实验和IP/Western实验的结果进一步证实了这一点。但神奇的是, 在没有外源Galectin-9的情况下,PD-1/TIM-3相互作用也能被检测到 ,这种相互作用并不被乳糖或PD-1 N116Q突变所抑制。这就好比PD-1/TIM-3本来是一对情侣,只是感情并不是太稳定,这时生活中出现了一个和两人都能处得来的好友Galectin-9,表面是调节二者关系,其实是和其中一人搞暧昧。

图2:

3. Galectin-9可作为癌症免疫治疗的靶点

通过流式细胞术分析,研究者发现 Galectin-9诱导的T细胞死亡可能与抗癌免疫抑制有关 ,因此研究者评估了抑制Galectin-9在癌症治疗中的潜力,并推测这可能是由于抑制Galectin-9后T细胞共刺激受损所致。接下来,通过将抗Galectin-9与 GITR (TNFRSF共刺激受体家族的一个成员)的激动型抗体DTA-1相结合验证了这一想法,它们的组合在不同的肿瘤模型中协同抑制了肿瘤的生长和延长了总生存期。因此,这些结果表明Galectin-9是肿瘤免疫治疗的靶点,并且抗Galectin-9联合GITR激动剂可以诱导出强大的抗肿瘤活性。

图3:

4. 质谱流式证实抗Galectin-9治疗针对特定的肿瘤浸润性T细胞亚群

只有推测,没有动物实验当然是不行的,研究者接下来就在荷瘤小鼠中进行体内实验。通过分析几组质谱流式的结果,研究者发现抑制Galectin-9可以选择性地扩大了瘤内TIM-3+ CD8T和CD4T细胞亚群,这也包括具有免疫抑制性的Treg细胞, 并且Treg细胞在总CD45+TIL中的比例增加 ,特别是CD8T细胞中CD8T_1亚群的比例在抗Galectin-9处理后增加了两倍以上。由于Treg可以特异性的抑制抗肿瘤免疫,因此接着通过联合使用抗Galectin-9和抗GITR(可特异下调Treg)后,CD8T亚群的比例进一步增加,而Treg细胞几乎完全丧失。因此,抗Galectin-9单一疗法虽然扩增了具有效应潜能的CD8T细胞亚群。然而,它的治疗效果可能会因为Treg细胞的共同扩增而受到影响。

图4:

一般情况下,CD8T细胞在肿瘤抗原的不断刺激下会逐渐失去功能,变成衰竭前体细胞。在这个阶段的CD8T细胞会高表达TCF1,同时也表达PD-1,TIM-3,如果肿瘤抗原持续存在,CD8T细胞就会走向终末衰竭的T细胞,并且逐渐走向死亡。但是处在这个终末衰竭性T细胞状态前的T细胞可以被抗Galectin-9治疗给逆转成具有较强增殖和分化能力的功能性T细胞,只不过同时扩增的还有Treg细胞。因此,联合使用抗GITR来控制Treg细胞的扩增则解决了这一难题。

图5:

5.单细胞数据揭示Galectin-9的表达分布

其实讲到这,文章的主体研究思路都讲完了,但是为了进一步解析Galectin-9在各类免疫细胞的表达情况,作者还分析了之前发表的一套单细胞数据。所以,这也进一步说明了数据挖掘的重要性。无论是多高级的研究思路,都是需要大数据作为支撑才变得更有说服力,这个数据可以来源于自己花钱测的,也可以来自已经发表的研究。这里作者就通过数据挖掘发现Galectin-9(LGALS9)在多种免疫细胞中都有表达,而且发现与对PD-1治疗没有应答的患者相比,应答患者表达更高水平的Galectin-9,这也证实了抗Galectin-9和抗PD-1联合用药的可能性。

图6:

6.关于免疫应答研究可做的生信思路

好了,上面介绍了如何通过 实验研究 免疫检查点分子间的互作关系从而探索影响肿瘤免疫治疗应答的因素,学习了一些实验设计的研究策略。然而,为了符合我一贯写作的气质,下面得对应来点别的有深意的生信干货。其实作为数据挖掘的热点,有关肿瘤对免疫治疗应答的相关生信思路有很多,下面主要列举几篇今年刚发表的研究免疫治疗应答的文章思路:

图7:

第一篇解读的是发表在Mol Ther Oncolytics(IF:7.20)杂志上篇名为“Single-cell RNA-sequencing analyses identify heterogeneity of CD8 + T cell subpopulations and novel therapy targets in melanoma”的文章。作者重新分析了已经发表的黑色素瘤单细胞数据,揭示出来7群CD8 T细胞亚群,这些亚群具有不一样的特征。此外,作者还鉴定出了3个在衰竭性CD8 T细胞上过表达的基因(PMEL, TYRP1和EDNRB),它们与患者的不良预后显着相关。像这种思路,只要有数据都能很容易的复现一篇,至于发到什么样的杂志上,就看证实的发现是否新颖。

图8:

另一篇发表在 J Immunother Cancer (IF:13.75)篇名为:CXCL13 shapes immunoactive tumor microenvironment and enhances the efficacy of PD-1 checkpoint blockade in high-grade serous ovarian cancer的文章则是从影响免疫浸润的趋化因子着手。这个思路主要是对明星分子在不同癌型中的功能进行探索,需要通过实验来进行功能验证。因为明星分子被研究的很多了,除非做泛癌分析,否则基本上很难做出太新颖的东西。但是这类实验设计很简单,只需要证明某个明星分子在 特定的癌型 中通过何种方式影响免疫治疗反应即可。

图9:

如果觉得明星分子没有太多研究新意,当然还可以通过各种生信方法筛选出关键基因。接下来一篇发表在 Oncoimmunology (IF:8.11)的篇名为“YKT6, as a potential predictor of prognosis and immunotherapy response for oral squamous cell carcinoma, is related to cell invasion, metastasis, and CD8+ T cell infiltration”的文章就是先通过 WGCNA 的方法筛选出和免疫抑制相关的基因YKT6,进行后续的分析。对于这种新筛出的之前没有报道过的基因就比较容易说故事,当然这个思路有一些运气的成分,很有可能百费周折筛选出的基因要么没有很好的功能,要么就已经被报道。

图10:

如果你肿瘤免疫的生物学背景知识不强,也没有很好的实验平台,那么还有最后一种选择,那就是万能膏药之临床预测模型。最后一篇发表在 Front Immunol (IF:7.56)杂志上,篇名为“9-Gene Signature Correlated With CD8 + T Cell Infiltration Activated by IFN-γ: A Biomarker of Immune Checkpoint Therapy Response in Melanoma”的文章就是通过构建和免疫治疗相关的临床预测模型。有关临床预测模型的构建,现在已经很成熟了,如 LASSO,COX,NMF 等模型都可以套用。这个思路前提是需要找一个较为新颖切入点,且最后能被多套数据集验证出来,那就基本可以发表一点不错的SCI文章了。

7.小结

本文从研究肿瘤免疫治疗应答的这个科学问题着手,先是通过一篇以实验为主的研究型文章解读了如何通过巧妙的实验设计筛选出有潜力的免疫检查点分子,随后分别解读了一些纯生信和生信联合实验的文章思路。有关肿瘤免疫治疗问题可以研究的方向有很多,但是 一般需要先了解研究癌型的免疫治疗进展 ,有的问题在一些癌型中已经被研究的很通透,那就没有必要再去浪费时间了,而同样的科学问题在一些肿瘤中就还是一个未知,那这样的问题就比较有研究的价值了。此外,就像开头说的因为免疫治疗应答与否牵扯的问题主要和免疫细胞的比例有关,而免疫细胞在肿瘤中的占比不高,因此bulk测出来的高表达基因主要是肿瘤细胞自身的基因,从这个角度看基于 bulk数据差异分析找出的高表达基因需要用肿瘤细胞系去做实验验证 。而单细胞数据就比较利于揭示免疫细胞上表达和免疫治疗的基因,但是商品化的10X平台可测得的基因不多,我的经验是先从单细胞数据揭示各种免疫细胞的比例,找出应答和非应答的差异免疫细胞亚群,从而进一步找出高表达的基因,最后通过简单实验进行免疫细胞的功能验证就基本都可以发表一篇不错的生信文章了。

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F. 如何利用组学的方法研究肿瘤的发病机制

你好!肿瘤学是研究肿瘤的综合治疗喊陵,内科,外科,放疗科等都会涉及到,肿瘤放射治疗学以放射治疗为主的学科。肿瘤放射治疗学与肿瘤外科、肿瘤内科一样是临床学科。
硒维康口嚼片中硒麦芽是以小麦作为硒转化的活性载体,通过发芽过程的吸收转化作用,使硒富集在麦芽所含的氨基酸、橡李蛋白质等分子上,从而获得的一种富含天然有机硒,硒的吸收率和留 存率高于其他补硒产品,98%的分子能量能充分利用而不浪费。补硒能增强人体免疫功能、抗氧化、延缓衰老,并能有效抑制郑如戚肿瘤生长。点击左上方◆体恒健◆了解更多。

G. 肿瘤研究

肿瘤学
肿瘤学——医学研究生入学考试精要丛书
图书作者: 蒋国梁、杜祥 主编
出版社: 复旦大学出版社
ISBN: 7309046064
出版时间: 2005-10第1版
印刷时间: 2005-10第1次印刷
开 本: 16
价 格(元): 36

我国恶性肿瘤的发生率和死亡率在过去的20年中明显上升,在我国的一些主要大城市中,恶性肿瘤已居死亡病因中的首位,已成为危害人民健康和生命的主要疾病。在全球范围内也一样,恶性肿瘤已成为人类的主要杀手。国内外对恶性肿瘤的研究投入了大量的握举人力、物力和财力,包括基础和临床研究两方面。近年来对恶性肿瘤的研究进展迅速,包括肿瘤的病因学、遗传基因、分子流行病学,以及临床方面对传统手术、放射治疗、化学治疗方法的改进,特别是多学科综合治疗概念的提出和应用,新的治疗手段和途径的发明和成功的临床实践。然而在恶性肿瘤的预防、诊断和治疗方面,还没有出现革命性的进步,未知的领域和待解决的问题远远多于我们已获得的知识和已解决的问题,因此对恶性肿瘤的研究具有极大的挑战性和艰巨性,同时又存在巨大的发展空间和成功机遇。这也许就是近年来越来越多的医学生和学习生命科学的学生投身于对恶性肿瘤研究的原因。为了帮助这些有志于肿瘤事业的青年人复习和参加研究生入学考试,我们编写了这本“医学研究生入学考试精要丛书”——《肿瘤学》供复习和参考。
本书包括了两大部分,第一部分是内容精要,主要根据朱雄增、蒋国梁主编《肿瘤学概论》(复旦大学出版社,2005)的教材,对报考肿瘤学专业研究生的考生应掌握的主要和重点内容进行了整理,其中还包括了一些最新进展的理论和临床实践。书中列出的楷体文字为研究生复试可能涉及的内容,希望有助于大家复习。第二部分是真题、仿真题与答题要点,目的是让考生了解考试的方式和方法,指明一条路径。

【目录】
第一部分 内迟做容精要
第一章 肿瘤的基本概念
第一节 肿瘤的定义
第二节 肿瘤的分类与命名
第三节 与肿瘤有关的病变
第四节 与肿瘤性生长有关的概念
第二章 肿瘤病因学
第一节 肿瘤病因学概述
第二节 肿瘤的环境因素
第三节 肿瘤与基因
第四节 肿瘤的组织学发生
第三章 肿瘤流行病学
第一节 临床流行病学的发展简史和基础概念
第二节 肿瘤流行病学的主要研究内容
第三节 肿瘤流行病学的主要研究成果
第四节 肿瘤流行病学发展的前沿——分子流行病学
第五节 癌症的遗传流行病学
第六节 肿瘤流行病学采用的一些统计方法
第四章 肿瘤病理学
第一节 肿瘤的大体形态
第二节 肿瘤的组织形态特点
第三节 非肿瘤性增生和肿瘤性增生的区别
第四节 良性和恶性肿瘤的区别
第五节 恶性肿瘤的病理分级和分期
第六节 肿瘤的病理学诊断
第七节 肿瘤病理诊断的应用技术
第五章 肿瘤的播散
第一节 肿瘤侵袭和转移的基本过程
第二节 肿瘤侵袭和转移的分子机制
第三节 血管形成与肿瘤转移
第四节 淋巴管形成与肿瘤转移
第五节 肿瘤侵袭转移防治研究现状及展望
第六章 循证医学与肿瘤学
第一节 循证医学的概念
第二节 最佳证据
第三节 系统综述
第四节 临床实践指南
第五节 循证医学在肿瘤学中的应用
第七章 肿瘤多学科综合治疗
第一节 肿瘤治疗方法的发展过程
第二节 肿瘤多学科治疗的概念
第三节 肿瘤多学科治疗的原则
第四节 肿瘤多学科治疗的模式
第五节 肿瘤多学科治疗的发展方向
第八章 肿瘤外科治疗
第一节 总论
第二节 各论
第九章 肿瘤药物治疗
第一节 化学治疗简史
第二节 制定合理的化学治疗方案
第三节 化学治疗癌症的水平
第四节 细胞增殖动力学概念
第五节 抗肿瘤化学治疗药物的分类
第六节 抗肿瘤药物的代谢动力学
第七节 肿瘤化学治疗的不良反应及其防治
第八节 联合化学治疗原则
第九节 剂量强度
第十节 剂量调整
第十一节 实体瘤疗效段旦碧评价标准
第十二节 化学治疗的适应证
第十三节 化学治疗的禁忌证
第十四节 辅助化学治疗
第十五节 新辅助化学治疗
第十六节 腔内化学治疗
第十七节 化学治疗药物应用中一些特殊注意点
第十八节 肿瘤化学治疗的辅助药物
第十九节 常见恶性肿瘤的化学治疗
第二十节 抗肿瘤新药临床试验
第二十一节 恶性肿瘤并发症的处理
第二十二节 癌症疼痛三阶梯止痛疗法
第十章 肿瘤放射治疗
第一节 肿瘤放射治疗发展的历程
第二节 现代肿瘤放射治疗科医师的知识结构
第三节 现代肿瘤放射治疗的流程
第四节 放射治疗的生物学基础
第五节 放射治疗的物理学基础
第六节 放射治疗的临床应用
第七节 放射治疗的不良反应
第八节 放射治疗的新技术
第九节 放射治疗的质量控制和保证
第十节 提高放射治疗疗效的途径
第十一节 放射治疗和其他疗法的综合治疗
第十二节 常见恶性肿瘤临床放射治疗学
第十一章 肿瘤免疫治疗学
第一节 肿瘤抗原
第二节 肿瘤抗原的处理、加工和递呈
第三节 抗肿瘤免疫效应机制
第四节 肿瘤免疫治疗的方法
第十二章 妇科恶性肿瘤
第一节 子宫颈癌
第二节 子宫内膜癌
第三节 卵巢恶性肿瘤
第十三章 肿瘤分子生物学
第一节 肿瘤的生长生物学
第二节 癌基因和抑癌基因
第三节 肿瘤的播散
第四节 肿瘤与宿主
第五节 肿瘤基因治疗
第十四章 肿瘤遗传及遗传性肿瘤
第一节 肿瘤发生的遗传学基础
第二节 肿瘤遗传易感性
第三节 遗传性肿瘤的特征
第四节 常见的遗传性肿瘤
第二部分 真题、仿真题与答题要点
真题1 复旦大学2005年硕士研究生入学考试肿瘤学试题与答题要点
仿真题1
仿真题2
仿真题3
仿真题4
仿真题5
请采纳。

H. 肿瘤3大研究方向之 纯粹肿瘤异质性探索

DOI: 10.1126/science.1254257

Broad研究所和麻省总医院(MGH)于2014年6月12日发表在Science上: Single-cell RNA-seq highlights intratumoral heterogeneity in primary glioblastoma

目前将胶质母细胞瘤分为4个亚型,在单细胞水平对不同分型的脑胶质瘤细胞进行瘤内异质性检测是本文的重点。

这是第一次对获取胶质母细胞瘤中的单个细胞展开大规模的研究 ,当时单细胞转录组还是相对较新的办法。利用流式细胞术的方法,对来自5位患者的脑胶质瘤细胞进行分选,检测了430个细胞的基因表达模式,揭示了:每个胶质母细胞瘤都包含来自多种癌症亚型的细胞,肿瘤之间这些细胞的分布各不相同。

doi: 10.1126/science.aad0501.

Broad研究所于2016年4月8日在Science上发表: Dissecting the multicellular ecosystem of metastatic melanoma by single-cell RNA-seq

对19名黑色素瘤病人的单细胞样本进行测序,共计4645个不同的肿瘤细胞;类型包括了恶性肿瘤细胞,免疫细胞,间质细胞和内皮细胞。发现:在同种肿瘤中的恶性细胞,其转录的异质性与细胞周期,空间分布和抗药性相关。单细胞转录组表达矩阵:GSE72056

doi: 10.1016/j.cell.2017.10.044

2017年12月发表在CELL杂志上,题目是: Single-Cell Transcriptomic Analysis of Primary and Metastatic Tumor Ecosystems in Head and Neck Cancer 。通讯作者为Itay Tirosh 、Derrick T. Lin 、 Aviv Regev 、Bradley E. Bernstein

HNSCC 头颈部鳞状细胞癌是最常见的十大癌症之一,是一种与酒精和烟草暴露密切相关的具有异质性的上皮肿瘤,患者往往在晚期出现的淋巴结转移(LN)。实验使用 Smart-seq2 方法得到了:研究者对 18个头颈部鳞癌(HNSCC)患者( 其中包含5对原发性肿瘤和淋巴结节转移配对样本)中分离得到的 6000个单细胞 进行大规模scRNA-seq分析【数据公布在 GSE103322】。实验验证用的是细胞系 Oral cavity HNSCC cell lines (Cal-27, SCC9, SCC4, SCC25, and JHU-006; all derived from male patients) 做了RNA-seq 数据。 创造了头颈部肿瘤的第一个细胞图谱,揭示了头颈部肿瘤及其转移的许多不同类型的细胞。

DOI: 10.1126/science.aai8478

美国麻省总院和Broad研究所合作,于2017年3月31日发表在Science上: Decoupling genetics, lineages, and microenvironment in IDH-mutant gliomas by single-cell RNA-seq

10例星形胶质瘤 样本中的9800个细胞和 6例少突胶质瘤 样本中的4300个细胞进行了单细胞RNA测序。再结合癌症基因组Atlas中的165例转录组数据。两种肿瘤都含有3种癌症细胞:非增殖性细胞(nonproliferating cells)、类神经干细胞(resemble neural stem)和祖细胞(progenitor cells)。结果表明两种脑肿瘤亚型起源于神经祖细胞的相同类型,由基因突变模式和其微环境的组成分而区分开。结果重新定义了两种密切相关胶质瘤的细胞组成,它们是以IDH基因突变为特征的星形细胞瘤和少突胶质细胞瘤。

doi: 10.1002/hep.29778.

美国国家癌症中心Zheng H, Pomyen Y, Hernandez M O等于2018年7月发表在Hepatology上: Single‐cell analysis reveals cancer stem cell heterogeneity in hepatocellular carcinoma

肝细胞癌(HCC,hepatocellularcarcinoma)的肿瘤内分子异质性部分归因于肝癌干细胞(CSC,hepatic cancer stem cells)的存在。研究人员在 单细胞水平 (10X Chromium、SMART-seq)上 整合转录组学和功能分析 用以评估CSC的异质性程度。结果表明, CSC在单细胞水平上的表型、功能和转录均存在异质性,不同的CSC亚群具有不同的分子特征 。而且不同CSC亚群内的不同基因与HCC预后相关,并且彼此相互独立,表明 CSC异质性影响肿瘤内异质性和肿瘤进展

DOI: 10.1126/science.aat1699.

2018年8月英国剑桥大学、桑格研究所等在Science上发表: Single-cell transcriptomes from human kidneys reveal the cellular identity of renal tumors

探究了来自胎儿、儿童和成人肾脏的 72,501 个人肾肿瘤和正常组织的单细胞转录组,将儿童期Wilms肿瘤与特定的胎儿细胞类型相匹配,从而为Wilms肿瘤细胞是异常胎儿细胞的假设提供证据。在成人肾细胞癌中,对肿瘤组成的分析定义了癌症相关的正常细胞,并描绘了复杂的血管内皮生长因子(VEGF)信号转导通路。结果揭示了人类肾脏肿瘤的确切细胞特征和组成。

doi:10.1038/s41586-019-1373-2

2019年8月发表在nature上: A human liver cell atlas reveals heterogeneity and epithelial progenitors.

对来自9个人类捐赠者的正常肝脏组织内约10,000个单细胞进行了RNA测序,并构建了人类肝细胞图谱。首次揭示了未知的内皮细胞、Kupffer细胞和肝细胞的亚型,并对其中一些群体进行了转录区划分。证实了EPCAM+ 种群是异质的。EPCAM+ 种群包括肝细胞偏置种群、胆囊素种群以及具有强大双能性肝脏类器官转化潜力的TROP2int 祖细胞群体。单细胞转录组表达矩阵,数据公布在 GSE124395

doi: 10.1016/j.cell.2019.06.024

哈佛医学院、博得研究所2019年8月8日 发表在cell上,题目是: An Integrative Model of Cellular States, Plasticity, and Genetics for Glioblastoma.

采用了包括 28个肿瘤的单细胞RNA测序 401个肿瘤基因组图谱(TCGA) 标本的大量遗传和表达分析、功能方法和单细胞谱系追踪的整合方法获得了胶质母细胞瘤细胞状态和遗传多样性的统一模型。发现胶质母细胞瘤中的恶性细胞 以四种主要的细胞状态存在 ,这些细胞状态概括了不同的神经细胞类型,受肿瘤微环境的影响。胶质母细胞瘤不同状态下细胞的相对频率不同,受CDK 4、EGFR和PDGFRA基因拷贝数扩增和NF1位点突变的影响。作者整合了胶质母细胞瘤恶性细胞程序,其可塑性以及其通过遗传驱动因素的调节,为胶质母细胞瘤研究提供了一个模型。

doi: 10.1158/2159-8290.CD-19-0094

2019年7月13日冷泉港实验室发表在Cancer Discov: Cross-species single-cell analysis of pancreatic ctal adenocarcinoma reveals antigen-presenting cancer-associated fibroblasts

癌症相关的成纤维细胞(CAFs)是胰腺导管腺癌(PDAC)进展和耐药的主要因素。文章对人和小鼠使用单细胞RNA测序(scRNA-seq)将CAFs分为三个不同的亚群(myCAFs、iCAFs、apCAFs),确定每个亚群的特定功能和特征。证实了肌纤维母细胞CAFs(myCAFs)和炎症性CAFs(iCAFs)的存在,并定义了它们在体内的独特基因特征。描述了一种表达MHCⅡ类基因和CD 74基因、但不表达经典的共刺激分子的新的CAFs(抗原呈递CAFs),在模型系统中以抗原特异性方式激活CD4 + T细胞,证实了它们被推测的免疫调节能力。

DOI:10.1038/s41422-019-0195-y

Chinese Academy of Medical Science & Peking Union Medical College于2019年7月4日发表在Cell Research: Single-cell RNA-seq highlights intra-tumoral heterogeneity and malignant progression in pancreatic ctal adenocarcinoma

使用10× scRNA技术测序:【Case】 24例胰腺导管腺癌 (PDAC)(41986个细胞);【Control】 胆管肿瘤和十二指肠肿瘤共3例,8例非恶性胰腺肿瘤患者 (15444个细胞),揭示了导管腺癌肿瘤微环境图谱特征;比较了实验组和对照组之间以及不同细胞类型之间细胞CNV水平的差异,发现相对于1型导管来说,2型导管是恶化程度较高的导管细胞;另外对两种导管细胞的marker进行免疫组化,发现通过单细胞测序鉴定出的marker基因可以作为临床中导管腺癌进程的分子标志物;伴随着导管的恶性化进程,导管高表达细胞增殖和细胞迁移相关的基因;基于上述挖掘到的恶性导管细胞的marker基因,作者进行TCGA数据挖掘,将178个PAAD病人分为4种类型;通过不同的靶点抑制剂作用实验发现CDK1可以作为一个比较好的潜在治疗靶点;增殖性导管细胞伴随着T细胞活化的缺失预示着较差的预后

doi: 10.1038/s41586-019-1434-6

美国圣犹大儿童研究医院和麻省总医院于2019年7月25日在Nature上发表: Resolving melloblastoma cellular architechture by single-cell genomics

髓母细胞瘤是最为常见的恶性儿童脑瘤。2012年,国际上将髓母细胞瘤分为4种分子亚型:WNT型、SHH型、三型和四型。WNT和SHH的肿瘤也有较为确定的细胞起源,但是三型和四型的细胞起源却仍是个未知之谜。从目前的存活率来看,WNT亚型患者存活期较长,而三型和四型的存活期却明显偏短。通过将肿瘤细胞和发表的成熟脑细胞单细胞图谱进行比较,作者发现SHH型肿瘤和其已知的起源细胞,小脑颗粒神经祖细胞(GNP )最为类似,而四型肿瘤和单极刷细胞(UBC)最为类似。

单细胞转录组测序技术检测了25个儿童髓母细胞瘤样品。 发现三型和四型的主要差异在于不同类型的细胞比例,并通过计算推测出三型和四型肿瘤的可能起源和致癌通路。

doi: 10.1038/s41467-019-11738-0.

美国杜克大学医学院的Jason W. Locasale、Ziwei Dai和Zhengtao Xiao于2019年8月21日发表在Nature Communications上: Metabolic landscape of the tumor microenvironment at single cell resolution

分析了来自两种代表性人类肿瘤的 9000多个单细胞 的代谢基因表达谱,包括 黑色素瘤和头颈癌 ,然后为评估该研究中单个肿瘤细胞的转录组图谱是否与常用组织样本的转录组图谱一致,研究人员将测序数据 与来自TCGA的RNA-seq数据进行了比较 。研究发现,该单细胞RNA-seq研究中的肿瘤样本与TCGA中的肿瘤样本大致相当。

首次在单细胞水平解析了肿瘤微环境中的细胞代谢基因表达谱,揭示了肿瘤代谢异质性在单细胞和组织水平上的显着差异 。在肿瘤微环境中, 不同患者来源的肿瘤细胞拥有不同的代谢基因表达特征,但不同类型非肿瘤细胞的代谢基因表达并不受患者来源的影响 ,且不同细胞类型具有各自独特的基因表达特征。

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