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研究基因表达的方法有哪些

发布时间:2023-01-12 22:56:57

⑴ 列举3种研究基因在体内表达方式的试验方法

目的比较不同途径递送质粒DNA至Balb/c小鼠体内所诱导的报告基因表达效果。方法将编码荧光素酶(luc+)蛋白的重组质粒(pGL-3-CMV)或空载体质粒pGL-3-basic以肌肉注射或电脉冲方法将10μg或100μg上述质粒注入小鼠股四头肌,基因枪法以三枪接种质粒于小鼠腹部(2μg质粒DNA/4.5Mpa/枪)。于质粒注入后24~144h,检测小鼠体内的荧光素酶活性。结果肌肉注射10μg的小鼠未检测到荧光素酶的表达;肌肉注射100μg、电脉冲法递送10μg和100μg质粒的小鼠,接种后48h体内荧光素酶活性达到峰值,递送100μg的小鼠体内表达量明显高于10μg的小鼠。基因枪免疫小鼠在接种24h达到峰值。结论电脉冲和基因枪介导的基因递送方式基因表达水平远远高于传统注射方法,是基因疫苗免疫递送的可靠方法

⑵ 基因表达谱分析方法

表达谱案例分析
肺癌组织的表达谱分析:选取 2 个肺癌病人( 5T 和 10T)的组织提取总 RNA,进 行分析。
实验目的:为了检测两个病人中表达差异较大的基因, 以便找出两个病人症状差 异的原因,并进行下一步相关的研究。
1、 数据质量的概述
通过严格的质量标准筛选后, 通过率达到 80%,最终得到 500 万左右的 Tag标签。
2、 标签的初步分析统计
两个样品中有 95%的 Tag重复频度超过 1,73%以上的 Tag重复频度超过 50。
3、 表达谱测序饱和度分析
通过对表达谱测序饱和度的分析,通常在表达谱 Tag数目达到 200 万时,测序 Tag接近饱和。因此,通过 Solexa 测序,仅需要 1次试验,就可以得到足够后 续进行表达分析的数据。
4、 样品重复性。
5、 Tag 标签的注释(含 cDNA,预测基因, EST,线粒体基因组,基因组等)
本案例中,人的 2 万 7 千个基因中有 50~60%都被 Tag所覆盖。即一般的基因的 表达量差异被检测出来。 为了提高 Tag同基因关联的可信度, 我们仅仅选取了在 基因序列中唯一定位的 Tag。这部分唯一定位的 Tag占全部 Tag数目的 50%左右。
另外,除去上述用于基因表达量统计的唯一定位 Tag,有大约 20%的 Tag 被定位 到了基因组的未注释区域, 其中大约有 10万个 Tag在基因组上的位置是唯 一的。 利用这些数据我们找到了许多新的转录本和调控区域。 同时发现了若干潜在的两 个样品间显着差异的区域。为后续的实验提供了可靠的研究目标。
6、 参考 Tag标签的统计分析
下表显示的人的参考 Tag 的统计信息,我们可以看到 96.53%的基因都拥有 Tag。 说明 Tag-based 新一代测序技术的方法进行表达谱分析的可行性
7、 基因表达量的分布统计
8、 样本间表达差异基因的相关分析
通过对表达差异基因的统计和分析,我们可以选取样品间表达存在差异的基因, 反馈给用户; 此外一些已经报道可能相关的基因, 是这一部分研究的重点, 通过 表达差异,我们可以推测出相关基因可能发生的变化。针对此例,图 3-3 中 2 个基因是已经报道的在 10T样品中高表达的基因。
9、 样本间表达差异基因的信号通路相关分析
对差异表达基因进行功能分析和信号通路分析。 结合样本性状差异, 鉴定与性状 关联的候选基因,以便通过进一步实验验证。
10、 根据 Tag距离 3’端的位置对 tag 和基因数目进行的统计分析

⑶ 检测基因表达的方法有哪些

基因工程第四步中包括导入检测,转录检测和翻译检测,方法分别是dna分子杂交技术、分子杂交技术、抗原-抗体杂交技术。有的还可在个体水平是进行检测,如抗性检测等

⑷ 基因表达的检测方法有哪些

老兄。我扫个盲哈。检测基因表达的方法主要有:表达谱,全转录组的信息,目前最流行平台包括47,000个转录本,检测全基因组的表达变化。简单的经典的方法有Northern Blot,常用的有反转录PCR,定量分析表达的变化qRT-PCR这些都是检测单一转录子的方法。

⑸ 研究基因表达的方法

真核基因表达研究方法与应用

1、基因敲除技术 (Gene Knockout)

注意事项:
(1)、有合适的胚胎干细胞(embryonic stem cells);
(2)、有已知的单拷贝基因位点;
(3)、用线性载体或不能自我复制的载体。

2.蛋白质相互作用(Pull-down assay)Science, 289:1550-1554 (2000)

NFkB基因表达后导致细胞炎症,而NFkB基因的活化受炎症诱发因子的刺激。IKKα、IKKβ及NEMO(NFkB-essential modifier)抑制NFkB基因的表达。

3、导弹药物--药物导向治疗

肿瘤或癌细胞表面通常过量表达某些特征性蛋白质(如人乳腺癌细胞表面的28 kD 蛋白),可作为肿瘤导向治疗的作用靶。将抗体的某些部分与外毒素相连接,就可以把毒素直接送到病变细胞表面,有效地杀死病变细胞,保护健康细胞。

⑹ 常用于研究基因表达的分子生物学技术

首先,基因表达是基因转录和翻译的过程,大多数基因表达都经历“转录→翻译→蛋白质”的过程,因此研究基因表达就是检测mRNA和蛋白质。DNA印迹,是通过杂交检测DNA的缺失、插入的方法;RNA印迹和反转录PCR分别通过杂交、逆转录和PCR检测mRNA的方法;Weasten印迹,是通过杂交蛋白质的方法。
所以常用的基因表达分子生物学技术有:RNA印迹和反转录PCR,Weasten印迹。

⑺ 检测基因表达水平差异的方法有哪些

基因的表达是dna-rna-蛋白,期间有转录水平调控、转录后调控、翻译后调控等多种调控机制影响该基因的表达.

所以蛋白水平高低的原因就可能是多方面的.蛋白表达多,可能是mrna多,也可能mrna变化不大,而是翻译多了;蛋白表达少,原因亦然.

从2个水平检测一个基因的表达,可以更全面地了解该基因在该组织某个时期或某种条件下的变化受到什么水平的调控.

所谓基因表达,就是从dna到mrna再到蛋白的一个过程,基因表达水平一般是通过该基因转录的mrna的多少来衡量的.

每个基因转录产生的mrna的量,是受到时空等多种因素调控的,个体在不同的生长发育阶段,或者不同的组织水平,基因转录出mrna的量都是不一样的.

例如,当某种植物长期生长在高盐的环境里,该植物体内与抗盐相关的基因的表达量就会增加,以适应这种高盐环境,是植物能够生存下来,这时植物抗盐相关的基因表达水平就相对高

检测基因表达的方法:

转录水平检测:rt-pcr,real-time pcr,northern blot

翻译水平检测:western blot

还有直接检测,如报告基因、融合荧光蛋白等。

rt-pcr是反转录pcr,是半定量方式。real-time pcr可以精确定量。 二者不同。后者为了区别于rt-pcr,一般不缩写。

各位观众老爷们大家好!我是吆五,打算从今以后不定期分享一些生物类的专业知识。

一方面供自己学习积累,另一方面也希望对大家有所帮助。

生物是很枯燥的呢

⑻ 列举两种研究基因表达模式的方法并简述其原理

1、经典的半定量RT-PCR和实时荧光定量RT-PCR。提取总RNA,通过光度计和电泳法检测质量并定量,采用反转录试剂盒进行反转录。对于半定量RT-PCR,采用内标基因(如25SRNA)引物对各样品进行普通PCR扩增和电泳,证明反转录成功,并通过调整加入的总cDNA第一链的量,使各样品间内标扩增条带亮度达到一致。然后以此总cDNA第一链的模板量进行目标基因的普通PCR扩增,电泳后通过条带有无和亮度强弱来比较各样品间(器官组织间、发育阶段间、诱导时间间等)目标基因表达的水平的差异性或变化动态。对于实时荧光定量RT-PCR,反转录完成后,通过内标基因或其它基因的扩增证明反转录成功,然后直接对内标基因和目标基因进行实时荧光定量PCR扩增,通过仪器自动检测Ct值来比较各样品间目标基因表达水平的差异性或动态变化。
2、芯片杂交法和SAGE法。将各样品的总RNA反转录得到的总cDNA进一步合成为双链总cDNA,用适当的酶切处理,得到小片段,然后与芯片杂交,电脑对不同样品间相同基因的杂交信号强度进行叠加处理,自动分析出各样品间各基因表达水平的表达差异性或变化动态。SAGE (serial analysis of gene expression)是基因表达系列分析,将各样品总cDNA采用适当酶切,得到短片段,然后互相连接成800bp左右的串联体,然后测序,然后采用电脑自动统计各基因被测序到的次数,以此表示各样品内各基因表达的丰度,然后比较各样品间各基因表达水平的差异性或动态变化。

⑼ 基因表达的方式有哪些

基因表达概念:就是基因转录和翻译的过程。
基因表达的方式有(1)组成性表达也称基本表达:有些基因产物对生命全过程都是必需或不可少的。这类基因在一个生物个体的几乎所有细胞中持续表达,不易受环境条件的影响,称基本表达,更简单来说,管家基因的表达称为基本表达。
(2)诱导:有一些基因对环境信号应答时被激活基因表达产物增加,这种基因表达方式称为诱导。
(3)阻遏:有一些基因对环境信号应答时被抑制,基因表达产物水平降低,这种基因表达方式称为阻遏。

⑽ 基因有哪些表达方式

基因表达调控分为很多水平:
1.dna和染色体水平:基因丢失、基因修饰、基因重排、基因扩增、染色体结构变化。
2.转录水平调控(主要调控方式):转录起始、延伸、终止均有影响。原核生物借助于操纵子,真核生物通过顺式作用元件和反式作用因子相互作用进行调控。
3.转录后水平调控:主要指真核生物原初转录产物经过加工成为成熟的mrna,包括加帽、加尾、甲基化修饰等。
4.翻译水平调控:对mrna稳定性的调控、反义rna对翻译水平的调控等。
5.翻译后水平调控:蛋白质的剪切、化学修饰(磷酸化、乙酰化、糖基化等)、转运等。
6.mrna降解的调控。

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