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信号通路研究方法

发布时间:2022-01-11 19:44:42

❶ 怎样研究il-6-stat3这条信号通路

STAT3是一类由750~800个氨基酸组成的DNA结合蛋白,有αβγ三种亚型,它因可介导细胞的恶性转化而被确认为癌基因,STAT3在早期胚胎发育和骨髓细胞的分化中发挥着不可缺少的重要作用,此外它还参与了肿瘤的增殖、分化、血管生成、侵袭转移和免疫逃避等生理功能的调控。与STAT3相关的几条信号转导通路特别是Jak-STAT3信号转导通路在多种肿瘤细胞中均有激活,体内外阻断或抑制肿瘤细胞中STAT3的信号通路可抑制细胞恶性增殖和存活,并诱导细胞凋亡,而对正常细胞却无影响。

❷ 细胞内的信号通路是怎么发现的大致给个科普思路就行,不要大段抄

这个主要依靠蛋白质组学和基因组学,信号通路中的分子在外界刺激下一般会发生一些变化,一般来说,这些分子应该包括膜受体,细胞质中的级联放大信号分子核受体以及细胞核内的一些因子。在你将配体作用于细胞后,如果你对这个通路一无所知的话,你可以首先做一个蛋白质组的研究,检测一下阳性组和对照组之间蛋白表达的差异,蛋白磷酸化的差异等等,找出差异之后,在单个验证,利用敲出等技术。
很笼统,希望能帮你

❸ western blot 研究未知的信号通路的大致步骤 或者给篇信号通路研究的经典文献也行,fxw0110/ 163.com

有人的歌哈特

❹ 【求助/交流】信号通路如何研究

不过信号通路最好还是从蛋白层面进行,分析可能的4条信号通路,做相关蛋白的western blot,检测下游蛋白常见的如磷酸化修饰silicare(站内联系TA)信号通路太复杂了,还是文献吧,当然是 diea了livee(站内联系TA):tiger07:xuec(站内联系TA)多看些英文文献吧,很多有关报道的 看多了你就有思路了 所以还是勤奋点儿吧tongyanna(站内联系TA)我还真不明白啊xp198766(站内联系TA)帮LZ顶,最近我想也知道类似问题的答案,不知道有没有高手会KEGG的,能不能写一点总结出来啊……期待啊……lwiaanngg(站内联系TA)如果你知道大概的途径,可以用上面说的RT-PCR等手段 如果你不知道,你可以使用蛋白microarray/DNA microarray来测定相对变换量sqhnsd(站内联系TA)先做相关的表型观察,看看表型符合那个通路相关的现象,然后做WB、蛋白质相互作用等试验进一步去检测具体的机制如何。但是如何去做,还必须通过看文献才能帮助你解决问题。charlie9(站内联系TA)信号通路的变化,一般与mRNA的变化关系不大。它一般通过关键蛋白分子的修饰有关,因此RT-PCR一般不能说明问题。Western-blots检测被修饰的蛋白分子为好。

❺ 如何通过分子生物学找下游的信号通路

您的问题太笼统了,代谢通路,信号传导通路等等研究方法完全的不一样;一般先经过生物信息学的方法确定您所研究物种中已经过验证的通路,设计实验思路后,然后再通过测序、转染、蛋白质组等手段验证假设。、

❻ 如何确定某种因子在信号传导通路的上游或下游

钙离子导致P38mapk的增高,如果某种损伤可以通过钙离子导致P38mapk的增高,那么你就建立起了一个损伤模型。这时,对P38做个RNA干扰,使其表达下降,再来损伤刺激,如果这时损伤刺激不会导致损伤,那么可以说P38mapk的增高会导致损伤。

这里最好不要用P38的抑制剂SB来处理,因为这个抑制剂是针对P38活性的抑制剂,抑制的是P38的磷酸化,而不是表达量。

如果说明的问题是p38磷酸化水平增加而导致损伤,那么我建议用抑制剂。这时还可以用Dominant-negative。抑制剂的实验证实该药物不影响P38表达,而影响其活化。(应该首先考虑选用抑制剂,因为目前一些药物的作用机制不是抑制靶点的表达,而是抑制靶点的激活。如果在此应用RNAi的话,很可能会漏掉这个机制或增加实验步骤。)

其次,要证明你的药物存在保护作用。
当然就是用你的药物先处理一下,再来损伤刺激,如果这时损伤刺激不会导致损伤,那么可以说你的药物存在保护作用。

再次,证明你的药物可以抑制P38表达。
用你的药物先处理一下,再来损伤刺激,再检测P38表达,如果用药组相对于没有用药组P38表达下降,那么可以说你的药物可以抑制P38表达。

❼ 如何研究信号传导通路请问研究某种受体或蛋白的下游信号传导通路,实验设计的一般方法,都有哪些谢谢

在KEGG或BioCarta这些pathway数据库里找到你感兴趣的通路,在pathway图上找到你感兴趣的蛋白后就能确认它的下游。实验方法大体上就是上调(瞬时表达、mimics)或下调(Knockout、RNAi)你的Gene of Interest,再检测下游的蛋白发生了上调还是下调,看看你的GOI和它们什么联系。

❽ 如何研究细胞内两个信号通路的交互作用

通过实验研究

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如果你对这个答案有什么疑问,请追问,
另外如果你觉得我的回答对你有所帮助,请千万别忘记采纳哟!
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❾ 如何对一组基因做信号通路分析

般的转录组测序可以得到大量差异表达基因和调控代谢通路,但由于基因与表型难以直接关联,导致关键信号通路难以确定,因此往往达不到预期研究目的。相信很多做过转录组测序的老师都深有体会。总感觉中间缺少了一步?没错,就是代谢物!代谢物是基因型与表型之间的桥梁,代谢物的变化更能直接揭示基因的功能,因此能够更有效地揭示生物学及其生化、分子机理。在植物研究中,目前代谢组+转录组的策略已经被广泛运用于植物生理、生长发育、及逆境胁迫研究中。
那么如何进行代谢组与转录组的关联分析?总的来说,是基于“参与同一生物过程中的基因或代谢物具有相同或相似的变化规律”这一原理进行分析的。举个例子,研究不同颜色品种的菊花颜色差异的原因,首先通过代谢物检测,发现不同颜色品种的菊花积累的花青素类型和含量并不一致;然后进行转录组测序,在众多差异基因及代谢通路中,我们可以重点研究与花青素合成相关的代谢通路上的基因,从而一方面快狠准地找到导致颜色差异的功能基因,另一方面代谢组的结果也相当于是对转录组结果的验证。

❿ 如何研究基因调控信号通路

代谢通路:目前在通路数据库(PATHWAY database) 中代谢通路是建立得最好的,有大约90个参考代谢途径的图形。每个参考代谢途径是一个由酶或EC号组成的网络。
利用如下方法可通过计算机构建出生物体特有 的代谢通路:
先根据基因的序列相似性和位置相关性确定基因组中酶的基因。
然后合理地安排EC号。
最后将基因组中的基因和参照通路中用EC号编号的基因产物 结合起来。

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