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核酸和多肽药物分析方法

发布时间:2022-08-17 18:02:50

Ⅰ 跪求实验方案急。关于植物小分子多肽的提取分离和分析 最好用到高效液相提取 分析的

多肽类化合物广泛存在于自然界中,其中对具有一定生物活性的多肽的研究,一直是药物开发的一个主要方向。生物体内已知的活性多肽主要是从内分泌腺组织器官、分泌细胞和体液中产生或获得的,生命活动中的细胞分化、神经激素递质调节、肿瘤病变、免疫调节等均与活性多肽密切相关。随着现代科技的飞速发展,从天然产物中获得肽类物质的手段也不断得到提高。一些新方法、新思路的应用。不断有新的肽类物质被发现应用于防病治病之中。本文介绍了近几年肽类物质分离、分析的主要方法研究进展。
1 分离方法
采取何种分离纯化方法要由所提取的组织材料、所要提取物质的性质决定。对蛋白质、多肽提取分离常用的方法包括:盐析法、超滤法、凝胶过滤法、等电点沉淀法、离子交换层析、亲和层析、吸附层析、逆流分溶、酶解法等。这些方法常常组合到一起对特定的物质进行分离纯化,同时上述这些方法也是蛋白、多肽类物质分析中常用的手段,如层析、叫泳等。
1.1 高效液相色谱(HPLC)
HPLC的出现为肽类物质的分离提供了有利的方法手段,因为蛋白质、多肽的HPLC应用与其它化合物相比,在适宜的色谱条件下不仅可以在短时间内完成分离目的,更重要的是HPLC能在制备规模上生产具有生物活性的多肽。因此在寻找多肽类物质分离制备的最佳条件上,不少学者做了大量的工作。如何保持多肽活性、如何选择固定相材料、洗脱液种类、如何分析测定都是目前研究的内容。
1.1.1 反相高效液相色谱(RP-HPLC)
结果与保留值之间的关系:利用RP-HPLC分离多肽首先得确定不同结构的多肽在柱上的保留情况。为了获得一系列的保留系数,Wilce等利用多线性回归方法对2106种肽的保留性质与结构进行分析,得出了不同氨基酸组成对保留系数影响的关系,其中极性氨基酸残基在2~20氨基酸组成的肽中,可减少在柱上的保留时间;在10~60氨基酸组成的肽中,非极性氨基酸较多也可减少在柱上的保留时间,而含5~25个氨基酸的小肽中,非极性氨基酸增加可延长在柱上的保留时间。同时有不少文献报道了肽链长度、氨基酸组成、温度等条件对保留情况的影响,并利用计算机处理分析得到每种多肽的分离提取的最佳条件。
肽图分析(Peptide Mapping):肽图分析是根据蛋白质、多肽的分子量大小以及氨基酸组成特点,使用专一性较强的蛋白水解酶[一般未肽链内切酶(endopeptidase)]作用于特殊的肽链位点将多肽裂解成小片断,通过一定的分离检测手段形成特征性指纹图谱,肽图分析对多肽结构研究合特性鉴别具有重要意义。利用胰蛋白酶能特意性作用于Arg和Lys羧基端的肽链的性质,通过RP-HPLC法采用C18柱检测了重组人生长激素特征性胰肽图谱。同时胰岛素的肽图经V8酶专一裂解也制得,并可鉴别仅相差一个氨基酸残疾的不同种属来源的胰岛素。人类肿瘤坏死因子的单克隆抗体结构也应用酶解法及在线分析技术确定了肽图,便于鉴定分析。此项技术已经在新药开发中得到广泛应用。
1.1.2 疏水作用色谱(Hydrophobic interaction chromatogrphy,HIC)
HIC是利用多肽中含有疏水基因,可与固定相之间产生疏水作用而达到分离分析的目的,其比RP-GPLC具有较少使多肽变性的特点。利用GIC分离生产激素(GH)产品的结构与活性比EP-GPLC分离的要稳定,活性较稳定。Geng等利用HIC柱的低变性特点,将大肠杆菌表达出的经盐酸胍乙啶变性得到人重组干扰素-γ。通过HIC柱纯化、折叠出高生物活性的产品。不同人尿表皮生长因子(EGF)也利用HIC纯化到了,均具有良好的生物活性。HIC可将未经离子交换柱的样品纯化。而RP-HPLC则不能达到这一要求。
1.1.3 分子排阻色谱(Sizs-Exclusion chromatogrphy,SEC)
SEC是利用多肽分子大小、形状差异来分离纯化多肽物质,特别对一些较大的聚集态的分子更为方便,如人重组生长激素(hgH)的分离,不同结构、构型的GH在SEC柱上分离行为完全不同,从而可分离不同构型或在氨基酸序列上有微小差异的变异体,利用SEC研究修饰化的PEG的分离方法,此PEC具有半衰期长、作用强的特点。一些分子量较大的肽或蛋白均可利用此法分离分析。
1.1.4离子交换色谱(Iron-Exchange chromatography,IEXC)
IEXC可在中性条件下,利用多肽的带电性不同分离纯化具有生物活性的多肽。其可分为阳离子柱与阴离子柱两大类,还有一些新型树脂,如大孔型树脂、均孔型树脂、离子交换纤维素、葡聚糖凝胶、琼脂糖凝胶树脂等。在多肽类物质的分离分析研究中,对多肽的性质、洗脱剂、洗脱条件的研究较多,不同的多肽分离条件有所不同,特别是洗脱剂的离子强度、盐浓度等对纯化影响较大。Wu等报道利用离子交换柱层析法,探讨分离牛碳酸酐异构体和牛血清白蛋白、鸡血清白蛋白酶的提取条件,获得了有价值的数据供今后此类物质分离研究。
1.1.5膜蛋白色谱(Chromatography of Membrane Protein,CMP)
CMP+分离强蔬水性蛋白、多肽混合物的层析系统,一般有去垢剂(如SDS)溶解膜蛋白后形成SDS-融膜蛋白,并由羟基磷灰石为固定相的柱子分离纯化。羟基磷灰石柱具有阴离子磷酸基团(P-端),又具有阳离子钙(C-端),与固定相结合主要决定于膜蛋白的大小、SDS结合量有关。利用原子散射法研究cAMP的分离机制发现,样品与SDS结合后在离子交换柱上存在SDS分子、带电荷氨基酸与固定相中带电离子间的交换,从而达到分级分离的目的。
1.1.6高效置换色谱(High-Performance Displacement Chromatography,HPDC)
HPDC是利用小分子高效置换剂来交换色谱柱上的样品,从而达到分离的目的。它具有分离组分含量较少成分的特性。利用HPDC鉴定分离了低于总量1%组分的活性人重组生长激素(rHG )。在研究非毒性交换剂时Jayarama发现硫酸化葡萄糖(Detran Sulfate,DS)是对β乳球蛋白A和B的良好置换剂,一般DS的相对分子质量为1×104和4×104最宜。研究表明置换剂的相对分子质量越低,越易于与固定相结合,因此在分离相对分子质量小的多肽时,需要更小的置换剂才能将其置换纯化出来。
1.1.7 灌注层析(Perfusion Chromatography,PC)
PC是一种基于分子筛原理与高速流动的流动相的层析分离方法,固定相孔径大小及流动相速度直接影响分离效果。试验证明其在生产、制备过程中具有低投入、高产出的特性。目前市场上可供应的PC固定相种类较多,适合于不同分子量的多肽分离使用。
1.2 亲和层析(Affinity Chromatography,AC)
AC是利用连接在固定相基质上的配基与可以和其特异性产生作用的配体之间的特异亲和性而分离物质的层析方法。自1968年Cuatrecasas提出亲和层析概念以来,在寻找特异亲和作用物质上发现了许多组合,如抗原-抗体、酶-催化底物、凝集素-多糖、寡核苷酸与其互补链等等。对多肽类物质分离目前主要应用其单抗或生物模拟配基与其亲和,这些配基由天然的,也有根据其结构人工合成的。Patel等人利用一系列亲和柱分离纯化到了组织血浆纤维蛋白酶原激活剂蛋白多肽。
固定金属亲和层析(Immobilized Metal Affinity Chromatography.LMAC)是近年来发展起来的一种亲和方法。其固定相基质上鳌合了一些金属离子,如Cu2+、Ni2+、Fe3+等,此柱可通过配为键鳌合侧链含有Lys、Met、Asp、Arg、Tyr、Glu和His的多肽,特别是肽序列中含有His-X-X-X-His的结构最易结合到金属离子亲和柱上,纯化效果较好。其中胰岛素样生长因子(Insylin Like Growth Factor,IGF)、二氢叶还原酶融合蛋白等均用此方法分离到纯度较高的产品。
Chaiken等人报道了另一种亲和层析方法,利用反义DNA表达产生,其与正链DNA表达产生的肽或蛋白具有一定的亲和性,如Arg加压素受体复合物,已用此法分离得到。DNA与蛋白、多肽复合物之间的作用也是生物亲和中常用的方法。将人工合成的寡核苷酸结合在固定相基质上,将样品蛋白或多肽从柱中流过,与之结合可达到分离特定结构多肽的目的。
1.3 毛细管电泳(Capillary electrophoresis,CE)--分离分析方法
CE是在传统的电泳技术基础上于本世纪60年代末由Hjerten发明的,其利用小的毛细管代替传统的大电泳槽,使电泳效率提高了几十倍。此技术从80年代以来发展迅速,是生物化学分析工作者与生化学家分离、定性多肽与蛋白类物质的有利工具。CE根据应用原理不同可分为以下几种;毛细管区带电泳Capillary Zone electrophoresis,CZE)、毛细管等电聚焦电泳(Capillary Isoeletric Focusing,CIEF)毛细管凝胶电泳(CapillaryGelElectrophoresis,CGE)和胶束电动毛细管层析(Micellar Electokinetic Electrophoresis Chromatorgraphy,MECC)等。
1.3.1 毛细管区带电泳(Capillary Zone Electrophoresis,CZE)
CZE分离多肽类物质主要是依据不同组分中的化合物所带电性决定,比传统凝胶电泳更准确。目前存在于CZE分离分析多肽物质的主要问题是天然蛋白或肽易与毛细管硅胶柱上的硅醇发生反应,影响峰形与电泳时间,针对这些问题不少学者做了大量实验进行改进,如调节电池泳液的PH值,使与硅醇反应的极性基团减少;改进毛细管柱材料的组成,针对多肽性质的不同采取不同的CZE方法研究分离5个含9个氨基酸残基的小肽,确定了小肽分析的基本条件,即在低PH条件下,缓冲液中含有一定浓度的金属离子如Zn2+等,此时分离速度快而且准确。
1.3.2细管等电聚电泳(Capillary Isleletric Focusing,CIEF)
由于不同的蛋白、多肽的等电点(PI)不同,因此在具有不同pH梯度的电泳槽中,其可在等电点pH条件下聚集沉淀下来,而与其他肽类分离开来。CIEF在分离、分析混合多肽物质中应用不多,主要应用与不同来源的多肽异构体之间的分离,如对rHG不同异构体分离。由于在CIEF柱表面覆盖物的不稳定性限制了此法的广泛应用。
1.3. 3毛细管凝胶电泳 (Capillary Gel Electrophoresis,CGE)
CGE是基于分子筛原理,经十二烷基磺酸钠(SDS)处理的蛋白或多肽在电泳过程中主要靠分子形状、分子量不同而分离。目前,又有一种非交联欢、线性、疏水多聚凝胶柱被用于多肽物质的分离分析,此电泳法适于含疏水侧链较多的肽分离,这种凝胶易于灌注,使用寿命长,性质较为稳定。
1.3.4胶束电动毛细管层析(Micellar Electrokinetic Electorphoresis Chromatography, MECC)
MECC的原理是在电泳液中加入表面活性剂,如SDS,使一些中性分子带相同电荷分子得以分离。特别对一些小分子肽,阴离子、阳离子表面活性剂的应用都可使之形成带有一定电荷的胶束,从而得到很好的分离效果。有文献报道在电解液中加入环糊精等物质,可使用权含疏水结构组分的多肽选择性与环糊精的环孔作用,从而利用疏水作用使多肽得到分离。
1.4多肽蛋白质分离工程的系统应用
以上提到的分离多肽的技术在实际应用过程中多相互结合,根据分离多肽性质的不同,采用不同的分离手段。特别是后基因组时代,对于蛋白质组深入的研究,人们对于分离多肽及蛋白质的手段不断改进,综合利用了蛋白质和多肽的各种性质,采用包括前面提到的常规蛋白多肽提取方法,同时利用了高效液相色谱,毛细管电泳,2-D电泳等手段分离得到细胞或组织中尽可能多的蛋白多肽。在蛋白质组学研究中系统应用蛋白和多肽分离鉴定的技术在此研究中即是分离手段也是分析方法之一。特别是以下提到的质谱技术的发展,大大的提高了蛋白多肽类物质的分析鉴定的效率。
2 分析方法
2.1 质谱分析(Mass Spectrometry, MS)
MS在蛋白、多肽分析中已经得到了广泛应用,特别是在分离纯化后的在线分析中,MS的高敏性、快速性特别适合多肽物质分析鉴定。其中连续流快原子轰击质谱(Continuous-Flow Fast Atom Bombardment, cf-FAB)和电雾离子化质谱(Electrospray Ionization, EIS)是近几年发展起来的新方法。
2.1.1连续流快原子轰击质谱(Continuous-Flow Fast Atom Bombardment, cf-FAB)
cf-FAB是一种弱离子化技术,可将肽类或小分子量蛋白离子化成MH+或(M-H)形式。主要应用于肽类的分离检测,其具有中等分辨率,精确度大于+0.2amu,流速一般在0.5-1.5μl·Ml-1。在测定使流动相需加0.5%-10%基质如甘油和高有机溶剂成分,使样品在检测探针处达到敏感化。cf-FAB常与HPLC、CEZ等方法结合使用达分离分析的目的,许多多肽的cf-FAB分析方法已经建立,并得到很好的应用。如Hideaki等利用此法研究L-Pro、L-Ala的四肽化合物系列。证明L-Pro在保持小肽构相稳定性。连接分子方面具有重要意义。
2.1.2 电雾离子化质谱(Electrospray Ionozation,EIS)
EIS可产生多价离子化的蛋白或多肽,允许相对分子质量达1×105蛋白进行分析,分辨率在1500-2000amu。精确度在0.01%左右。EIS更适合相对分子质量大的蛋白质的在线分析,且需要气化或有机溶剂使样品敏感化。利用EIS与HPLC联合分离分析GH和血红蛋白均获成功,其也可与CEZ联合应用。
2.1.3 基质辅助激光解析/离子化-飞行时间质谱(Matrix-associated laser disso-ciation/ionization time of flight mass spectrmtry,MALDI-TOF MS)
MALDI-TOF是目前蛋白质鉴定中精确测定测定分子质量的手段,特别适合对混合蛋白多肽类物质的相对分子质量的测定,灵敏度和分辨率均较高。它是目前蛋白质组学研究的必备工具。同时结合液相色谱的联用技术可以高效率的鉴定多肽物质。特别是当各种原理的质谱技术串联应用时,不但可以得到多肽的相对分子质量信息,还可以测定它的序列结构,此项技术将在未来蛋白质组学研究中起到决定性作用。
2.2 核磁共振(Nuclear Magnetic resonance,NMR)
NMR因图谱信号的纯数字化、过度的重叠范围过宽(由于相对分子质量太大)核信号弱等原因,在蛋白、多肽物质的分析中应用一直不多。随着二维、三维以及四维NMR的应用,分子生物学、计算机处理技术的发展,使NMR逐渐成为此类物质分析的主要方法之一。NMR可用于确定氨基酸序列、定量混合物中的各组分组成含量等分析中。但要应用于蛋白质分析中仍有许多问题需要解决,例如,如何使分子量大的蛋白质有特定的形状而便于定量与定性分析,如何减少数据处理的时间问题等。这些问题多有不少学者在进行研究。虽然在蛋白质分析中应用较少,NMR在分析分子中含少于30个氨基酸的小肽时是非常有用的,可以克服上述蛋白质分析中的缺点而达到快速准确分析的目的。
2.3 其他
除上述方法之外,氨基酸组成分析、氨基酸序列分析、场解析质谱、IR、UV光谱、CD、圆而色谱、生物鉴定法、放射性同位素标记法及免疫学方法等都已应用于多肽类物质的结果鉴定、分析检测之中。
以上简要的介绍了近几年多肽物质分离、分析的常用方法及最新研究方向。随着科学技术水平的不断发展,会有许多更新的分离分析手段不断涌现,因此这一领域的研究具有广阔的前景。 应用SDS-PAGE显示小分子多肽
SDS-PAGE在分离、鉴定和纯化蛋白质方面有着广泛应用,其有效分离范围取决于聚丙烯酰胺的浓度和交联度,其孔径随着双丙烯酰胺与丙烯酰胺比率的增加而减小,比率接近于1:20时,孔径达到最小值。分子量低于10kD的小分子肽类,即使用较高浓度的聚丙烯酰胺凝胶的SDS-PAGE也不能完全分离,或是显不出色,或是显带较弱,带型弥散。且分子量越小,效果也越差。
为了能在SDS-PAGE上显示测定小分子量的多肽,通常采取两种方法:一是增加凝胶的浓度和交联度,在制胶时加入一些可以降低聚丙烯酰胺凝胶网限孔径的溶质分子,使用尿素、甘油或蔗糖等物质;二是选择缓冲液中的拖尾离子的种类和浓度以达到改善多肽的分离效果。
操作步骤
1.电泳缓冲液的配制如下表所示
缓冲液Tris
(mol/L)Tricine
(mol/L)pHSDS
(%)
阳极缓冲液
阴极缓冲液
胶缓冲液0.2
0.1
3.0—
0.1
—8.9*
8.25**
8.4*—
0.1
0.3
* 用HCl调pH
** pH约为8.25

2.丙烯酰胺贮存液的配制
单丙-双丙混合物单丙的百分数双丙的百分数
49.5% T, 3%C
49.5% T, 6%C48
46.51.5
3.0
T:丙烯酰胺的总浓度
C:交联度

3.胶的制备,与一般SDS-PAGE相似,按下表配制分离胶和浓缩胶
组 份分离胶
16% T,6%C浓缩胶
6% T,3%C
49.5% T, 3%C丙烯酰胺溶液(ml)
49.5% T, 6%C 丙烯酰胺溶液(ml)
胶缓冲液(ml)
脲(g)[甘油(ml)]
水(ml)
10%过硫酸铵(μl)
TEMED(μl)
总体积(ml)—
3.3
3.3
3.6[2.4]
1
40
4.0
10.040.48

1.00

1.50
25
2.5
3.03
4.样品缓冲液
4% SDS
12%甘油
50mmol/L Tris
2%巯基乙醇
0.01% Serva blue
多肽样品与样品缓冲液混合沸煮2min(或40℃温浴30min)。
5.将灌胶的玻璃板固定在电泳装置上,用1%琼脂糖封边,倒入阴极缓冲液,依次加样。
6.将电泳装置放入电泳槽内,倒入阳极缓冲液,将正负极与电泳仪相接,恒电压50~60V,待指示剂进入分离胶后,电压可升至70~90V,恒压约3h待指示剂走出凝胶下缘停止电泳。
7.染色、脱色及胶的保存同SDS-PAGE。

Ⅱ 多肽和蛋白质类药物的分析方法

1.1生物检定法
由于蛋白多肽类药物多为有生物活性的物质,且生物活性不仅取决于药物的一级结构,与二 、三级结构亦密切相关,故生物检定法是研究该类药物动力学独特而必需的方法。生物检定 法 有两个目的,直接测定体液中药物浓度及鉴定标记药物的生物活性。其方法主要可分为两大 类。
1.1.1在体分析常规的有胰岛素的小鼠血糖法等,另外还有根据各 类蛋白多肽的生物活性 不同而建立的各异的方法,如根据IL-8可将大量中性粒细胞从骨中动员出的性质[1] 而建立 的IL-8动员中性粒细胞家兔体内实验。这类方法最直观地反映生物活性,但涉及整体动物 ,费时费力,灵敏度不高,变异较大。
1.1.2离体组织(细胞)分析如NGF刺激鸡背根神经节增长,缩宫素 的大鼠离体子宫法等。 随着分子生物学的发展,许多特异性强,灵敏度高的依赖细胞株被建立,细胞培养已是最常 用的方法。根据蛋白多肽与细胞相互作用的机理不同,具体的操作亦有多种。如细胞增殖法 (Proliferation assays),快速灵敏,但特异性稍差; 抑制增殖法(Antiproliferation as s ays),检测系统简单,灵敏而专一; 减少细胞损伤法(Cytopathic effect rection assays ) [2],则是依据具有抗病毒活性的药物如干扰素,保护细胞不受病毒损伤, 方法直观 灵敏, 但 可能会受到多肽亚型的干扰。以上的方法都是以细胞数目的增减为量效指标,计数方法有直 接计数法和间接计数法,后者包括MTT法,同位素(3H,14C)掺入法 等。此外,还有根据蛋 白多肽与细胞间接作用进行检测,如与免疫检测联用的抗体诱导法[3],结合酶反 应的酶诱 导分解法[4]等。总的说来,细胞培养法多具有灵敏特异,客观可靠的优点,但其 不足也显 而易见。首先,生物检定法无法定量失去活性的小代谢物,无法示踪它们的体内动态;其次 ,样品多存在于人或动物血清中,血清中内源物质的干扰以及可能存在的内源因子的交叉反 应,影响了方法的专属性;再者,启动生物过程常需阈量细胞因子从而降低了方法的灵敏度 ;依赖株细胞长期培养易发生变异而影响检测的特异性。
1.2免疫学方法
免疫学方法是利用蛋白多肽药物抗原决定簇部位的单克隆或多克隆抗体特异地识别被检药物 ,再以放射计数,比色等方法予以定量,即将特异的抗原抗体反应配以灵敏检测的方法。常 用的方法有三种。
1.2.1放射免疫法(Radioimmunoassays RIA)该法是被测药物(Ag ),标记药物(多为125I-Ag)与抗体(Ab)的竞争性结合反应,方法的特异性 取决于抗原抗体的亲和力及标记药 物的纯度,与生物检定法相比,有简明,易于控制的优点。
1.2.2免疫放射定量法(Immunoradiometrec assays IRMA)该法中 被测药物依然是Ag,它 先与固定相上的Ab形成Ab∶Ag复合物,再与标记抗体125I-Ab结合,形成Ab∶Ag ∶125I-Ab夹心 状。由于Ag需有两个Ab来识别,这就大大增加了方法的特异性,是一灵敏而低变异的方法, 只是对标记抗体的纯度要求很高。
1.2.3酶联免疫法(Enzyme-linked immunosorbent assays ELISA)ELISA的原理与IRMA相 似,只是第二个抗体不是用碘标,而是用可以与底物发生显色反应的酶如HRP来标记,与上 述两法相比,ELISA具有使用寿命长,重复性好,无辐射源的优点,并且已有不少实验证明 ,它与生物检定法具有一定的量效关系[4]及相关性[5],提示它可部分地 反映药物的生物活性。
免疫学方法的缺点在于它测定的是蛋白多肽的免疫活性而不是生物活性;不能同时测定代谢 物,且具有抗原决定簇的代谢片段可能增加结果误差;不同来源的抗体与相同的蛋白多肽反 应可能有较大的差别;还可能受到内源物质的干扰。但免疫法毕竟是一种迅速,灵敏,适于批处理的方法,已有数十种蛋白多肽被开发成能满足药物动力学研究的商品药盒。临床 药动学领域,免疫法已逐渐取代生物检定法。
1.3同位素标记示踪法
放射性同位素标记技术是研究蛋白多肽在生物体内处置的一种最常用的方法。所使用的同位 素有125I, 99mTc, 3H,14C, 35S 等,其中125I因比放射性高,半衰期适宜,标记制备简单 而最为常用。标记方法有两种,一是内标法,即把含有同位素的氨基酸加入生长细胞或合成 体系,该法对生物活性地影响可能较小,但由于制备复杂而限制了其广泛应用;二是外标法 ,常用化学方法如氯胺T或Iodogen法将125I连接于大分子上,因相对简单而被首 选。
同位素法具有简便直观,检测迅速的优点,尤其适用于蛋白多肽药物的组织分布研究,但其 缺点亦显而易见。首先,它不能进行人体药物动力学研究;其次,同位素标记后是否会引起 药物的生物活性及其在生物体内的代谢行为发生变化,一直存在争议.前者可通过调整反应 条件和生物检定法加以改善和验证,基本上可使生物活性无明显变化;后者因药而异则复杂 的多,已有报道认为[6],放射性标记法可干扰表皮生长因子与细胞的相互作用, 从而导致 其体内清除的紊乱;最后,由于蛋白多肽进入体内会被降解代谢,或与其它蛋白质结合,总 的放射性不能代表药物动力学过程,因此如何鉴别样品的原药,降解物及结合物是该法中需 解决的关键问题,常用的方法有两种。
1.3.1SDS-PAGE法根据药物Mr的大小选择不同浓度的凝胶电 泳,通过控制电流等条件使得原 药与其它产物分开,然后通过切割胶条放射计数或放射自显影的方法,来检测电泳放射性图 谱。该法具有较高的分辨率和灵敏度,但电泳过程中,125I-小肽和游离 125I可能扩散至空白凝胶或电解液中,从而使结果可能偏高。
1.3.2HPLC法高效反相色谱(RHPLC),高效排阻液相色谱(SEHPLC )[7],高效离子交换液相色 谱(IEHPLC)分别根据保留时间与蛋白多肽的疏水-亲水性特征,Mr大小,极性的 关系 来分离样品中的物质。它们共同的优点是特异性高,分辨率好,可同时测定原药和降解物, 其中SEHPLC亦可得到结合物的信息,而RHPLC用于蛋白多肽的分离有独特的优越性。但因受 注入样品量的限制,灵敏度,重现性都受影响,且设备昂贵,成本较高。
1.3.3 HPLC-RAD法
高效液相偶联同位素在线检测系统。这种方法将HPLC的高度分析分离行为和同位素的高灵敏度检测结合在一起。使得药物的分析分离更加直观和方便。特别在蛋白质多肽类药物药动学方面体现了其独特的优点。
1.4色谱法
1.4.1HPLC在进行普通药物动力学研究中,HPLC是技术成熟,应用广 泛的分析手段。在蛋 白多肽药物的实验研究或产业化中,HPLC都是主要的分离纯化工具。但鉴于蛋白多肽药物结 构的特殊性,除了一些小分子多肽,如peptichemio[8],加压素的八肽拮抗剂(oc tapeptid e antagonist of vasopressin)[9]可分别直接或经选择性柱反应后,单独 用带荧光检测 器的HPLC进行药动学研究外,HPLC常需进一步改进或与其它更灵敏的检测技术联用方能满足 药动学的需要。除了上述提及的与同位素的联用,还有许多与免疫学方法的联用,如Philli ps[10]采用免疫亲和色谱技术分析人三种不同体液中粒细胞集落刺激因子的浓度; Partilla [11]等认为HPLC与RIA联用可以检测人体液中的神经肽。此外,令人瞩目的还有液 /质在线联用(LC-MS)。
LC-MS将高分离能力,适用范围广泛的色谱分离技术与高灵敏、专属及通用,在研究蛋 白多肽的结构中具有重要价值的质谱法联用起来,成为强有力的分离分析方法。多年来限制 LC-MS技术发展的决定因素是接口问题,由传送带接口(Moving-belt interface),热喷 雾 接口(Thermospray),到最近的电喷雾离子化接口(Electrosptay ionization ESI),联 用技术日趋成熟,尤其适用于生物样品中低浓度(pg/ml)药物及代谢物的测定[12] ,而蛋 白多肽类药物恰有在体内代谢快,浓度低的特点。国外已将用LC-MS于该类药物,药物代 谢 物[13,14]的动力学研究,国内尚处于起步阶段,除了仪器本身价格昂 贵,技术上亦存在 一些问题,如它对样品的纯度要求很高如何将药物从生物体液,尤其是血浆中提取纯化以 减少干扰;如何选择合适的内标以减少系统误差;在将LC-MS用于检测体育禁用肽(HCG,HGH ,EPO,ACTH等)时发现,糖肽难用于质谱分析,因为在质谱条件下,同样的氨基酸序列可产生 多种不同质量的多糖链,而每条链及整个分子都有可以产生质谱信号,这就大大降低了质谱 信号的专属性。尽管LC-MS在蛋白多肽药物的体内药物代谢动力学研究中还存在一 定的难度,但其作为实用性强,前景好的领域已引起人们的广泛关注。
1.4.2高效毛细管电泳(HPCE)HPCE是离子或荷电粒子以电场为驱动 力,在毛细管中按其 浓度和分配系数不同进行高效,快速分离的新技术,它以高分辨率,高灵敏度,分析时间短 ,样品量少及操作简单等诸多优点而成为蛋白多肽生物分子分离分析的重要手段。在临床 上 ,生物体液中低浓度蛋白多肽的分析面临的问题有:蛋白多肽与毛细管壁的相互作用所引起 的迁移时间的改变,这可以通过涂层CE加以改善;由于毛细管很细,管内容积很小,进样量 的不易控制给实验的重复性带来影响,而且很可能无法对低浓度的样品提供足够的灵敏度。 国外根据样品的性质采用不同的预处理,大体上可分为非特异性和高亲和性两种, 将样品加以浓缩,取得了满意的效果[15]。HPCE在检测上的迅速发展与HPLC已有并 驾齐驱之 势,况且鉴于HPCE在样品微量分析的优越性,已有人在药物动力学研究、体内分析中,将微 透析连续采样与之联用[16],这在整个药动学研究中都不失为一有希望的方向。 2结语
由以上可知,现代科学技术的发展给蛋白多肽类药物的研究提供了多样的分析手段,但鉴于 该类药物的特殊性,尚无一种方法能完全满足动力学研究的要求。根据人用药物注册国 际协调会议(ICH)对生物药物临床前安全性评价“在科学基础上的灵活性和具体情节个别 处理”的总则,人们通常将几种方法联合应用,互相补充,才能得到比较可靠的结果。

Ⅲ 多肽纯化的方法有哪些

对多肽纯化常用的方法包括:盐析法、超滤法、凝胶过滤法、等电点沉淀法、离子交换层析、亲和层析、吸附层析、逆流分溶、酶解法等。这些方法常常组合到一起对特定的物质进行分离纯化,同时上述这些方法也是多肽类物质分析中常用的手段。

Ⅳ 论述核酸与蛋白质变性的机制及其在生命活动中的重要意义

生物化学
绪 论 Preface
生物化学(biochemistry)是研究生命化学的科学,它在分子水平上探讨生命的本质,即研究生物体的分子结构与功能,物质代谢与调节,遗传信息的传递与调控,及其在生命活动中的作用。
人们通常将研究核酸、蛋白质等所有生物大分子的结构、功能及基因结构、表达与调控的内容,称为分子生物学。所以分子生物学是生物化学的重要组成部分。
一、生物化学发展简史
1.初期阶段(18世纪—20世记初)
生物化学的研究始于18世纪,但作为一门独立的科学是在20世纪初期。主要研究生物体的化学组成。
2.蓬勃发展阶段(从20世记初—20世记中期)
主要在营养学,内分泌学,酶学,物质代谢及其调控等方面取得了重大进展。
3.分子生物学发展阶段(从20世纪中期 至今)
主要有物质代谢途径的研究继续发展,重点进入代谢调节与合成代谢的研究。
另外,显着特征是分子生物学的崛起。DAN双螺旋结构模型的提出,遗传密码的破译,重组DNA技术的建立等。
20世纪末始动的人类基因组计划(human genome project)是人类生命科学中的又一伟大创举。
以基因编码蛋白质的结构与功能为重点之一的功能基因组研究已迅速崛起。当前出现的的蛋白质组学(proteomics)领域。
阐明人类基因组功能是一项多学科的任务,因而产生了一门前景广阔的新兴学科-----生物信息学(bioinformatics)。
我国科学家对生物化学的发展做出了重大的贡献。
二、生物化学研究的主要内容
1.生物分子的结构与功能 2.物质代谢及其调节 3.基因信息传递及其调控
三、生物化学与医学 生物化学是一门重要的医学基础课,与医学有着紧密的联系。
四、本书纲要 全书分四篇,共23章。
第一篇 生物大分子的结构和功能
生物大分子通常都有一定的分子结构规律,即由一定的基本结构单位,按一定的排列顺序和连接方式而形成的多聚体。蛋白质和核酸是体内主要的生物大分子,各自有其结构特征,并分别行使不同的生理功能。
酶是一类重要的蛋白质分子,是生物体内的催化剂。
本篇将介绍蛋白质的结构、功能;核酸的结核与功能;酶等三章。重点掌握上述生物大分子物质的结构特性,重要功能及基本的理化性质与应用,这对理解生命的本质具有重要意义。
第一章 蛋白质的结构与功能
Structure and Function of Protein
一、授课章节及主要内容:第一章 蛋白质的结构与功能
二、授课对象:临床医学、预防、法医(五年制)、临床医学(七年制)
三、授课学时
本章共3节课时(每个课时为45分钟)。讲授安排如下:
第一次课(2学时):绪论;第一节;第二节。 第二次课(1学时):第三节,第四节
四、教学目的与要求
目的:通过本章学习掌握蛋白质是由20种氨基酸藉肽键组成的生物大分子,是机体的基本结构成分,也是机体各种生理功能的物质基础,是生命活动的直接体现者。
要求:掌握蛋白质的生物学重要性。掌握蛋白质的分子组成特点和基本单位。掌握蛋白质的分子结构及其与功能的关系。熟悉蛋白质的重要理化性质。了解蛋白质的重要分离和纯化方法。
五、重点与难点
重点:1.蛋白质的生物学重要性。2.蛋白质的分子组成特点和基本单位。3.蛋白质的分子结构及其与功能的关系。
难点:蛋白质的分子结构及其与功能的关系。
六、教学方法及授课大致安排
重点讲授,复习、提问、小结相结合。 应用多媒体课件。
七、主要外文专业词汇 protein amino acid isoelectric point polypeptide glutathione(GSH) β-pleated sheat motif chaperon domain subunit fibronectin cytochrome c myoglubin hemoglobin(Hb) ACTH protein denature electrophoresis chromatography allosteric effect
十、授课提纲(或基本内容)
蛋白质是生物体含量最丰富的生物大分子物质,约占人体固体成分的45%,且分布广泛,所有细胞、组织都含有蛋白质。生物体结构越复杂,蛋白质的种类和功能也越繁多。蛋白质也是机体的功能分子(working molecules)。它参与机体的一切生理活动,机体的各种生理功能几乎都是通过蛋白质来完成的,而且在其中起着关键作用,所以蛋白质是生命的物质基础。
第一节 蛋白质的分子组成
Conformation of Protein Molecules
一、蛋白质的元素组成
组成蛋白质的元素除含有碳、氢、氧外都含有氮。有些蛋白质还含有少量硫、磷、铁、锰、锌、铜、碘等。
大多数蛋白质含氮量比较接近,平均为16%,这是蛋白质元素组成的一个特点。
蛋白质的元素组成中含有氮,是碳水化物、脂肪在营养上不能替代蛋白质的原因。
二、 氨基酸
氨基酸(amino acid)是组成蛋白质的基本单位。组成人体蛋白质的氨基酸仅有20种。其化学结构式有一个共同特点,即在连接羧基的α碳原子上还有一个氨基,故称α氨基酸(除甘氨酸外)。
(一)氨基酸的结构
组成人体蛋白质的20种氨基酸,其结构可由下列通式表示(图1-1 见六版教材图1-1)。
各种氨基酸在结构上有下列特点。
1.组成蛋白质的氨基酸,除甘氨酸外,均属L-α-氨基酸。
2.不同的L-α-氨基酸,其侧链(R)不同。
(二)氨基酸的分类
根据氨基酸侧链R基团的结构和性质,可将20种氨基酸分成四类。
1. 非极性疏水性氨基酸 2.极性中性氨基 3.酸性氨基酸 4.碱性氨基酸
在蛋白质的修饰过程中,蛋白质分子中20种氨基酸残基的某些基团还可被甲基化、甲酰化、乙酰化、异戊二烯化和磷酸化等。
(三)氨基酸的理化性质
1.两性解离及等电点:所有氨基酸都含有碱性的α-氨基和酸性的α-羧基,因此氨基酸是一种两性电解质,具有两性解离的特性。
2.紫外吸收性质 根据氨基酸的吸收光谱,含有共轭双键的色氨酸、酪氨酸的最大吸收峰在280nm波长附近(图1-3)。
3.茚三酮反应:可作为氨基酸定量分析方法。
三、 肽(peptides)
一肽(peptide)
在蛋白质分子中由一分子氨基酸的α-羧基与另一分子氨基酸的α-氨基脱水生成的键称为肽键(peptide bond)。肽键是蛋白质分子中基本的化学键。如由 二个氨基酸以肽键相连形成的肽称为二肽,相互之间以肽键相连。二肽还可通过肽键与另一分子氨基酸相连生成三肽。此反应可继续进行,依次生成四肽、五肽……。由10个以内的氨基酸由肽键相连生成的肽称为寡肽(oligopeptide),由更多的氨基酸借肽键相连生成的肽称为多肽(polypeptide)。多肽是链状化合物,故称多肽链(polypeptide chain)。多肽链中的氨基酸分子因脱水缩合而基团不全,故称为氨基酸残基(resie)。多肽链中形成肽键的4个原子和两侧的α-碳原子成为多肽链的骨架或主链。构成多肽链骨架或主链的原子称为主链原子或骨架原子,而余下的R基团部分,称为侧链。多肽链的左端有自由氨基称为氨基末端(aminoterminal)或N-端,右端有自由羧基称为羧基 末端(carboxylterminal)或C-端。把含有51个氨基酸残基、分子量为5733的胰岛素称作蛋白质。这似乎是习惯上的多肽与蛋白质的分界线(见六版图1-4)。
二生物活性肽
⒈谷胱甘肽(glutathione, GSH) GSH是由谷、半胱和甘氨酸组成的三肽。第一个肽键与一般不同,由谷氨酸γ-羧基与半胱氨酸的氨基组成(图1-5),分子中半胱氨酸的巯基是该化合物的主要功能基团。(见六版图1-5和图1-6)。
⒉多肽类激素及神经肽
第二节 蛋白质的分子结构
Molecular Structure of Protein
人体的蛋白质分子是由20种氨基酸借肽键相连形成的生物大分子。每种蛋白质都有其一定的氨基酸组成及氨基酸排列顺序,以及肽链特定的空间排布。从而体现了蛋白质的特性,是每种蛋白质具有独特生理功能的结构基础。蛋白质分子结构分成一级结构、二级结构、三级结构、四级结构4个层次,后三者统称为空间结构、高级结构或空间构象(conformation)。蛋白质的空间结构涵盖了蛋白质分子中的每一原子在三维空间的相对位置,它们是蛋白质特有性质和功能的结构基础。由一条肽链形成的蛋白质只有一级结构、二级结构和三级结构,由二条或二条以上肽链形成的蛋白质才可能有四级结构。
一、蛋白质的一级结构
蛋白质中氨基酸的排列顺序称为蛋白质的一级结构(primary structure)。肽键是一级结构的主要化学键。有些蛋白质还包含二硫键,即由两个半胱氨酸巯基脱氢氧化而成。图2-3为牛胰岛素的一级结构。(见六版教材图1-8)。 目前已知一级结构的蛋白质数量已相当可观,并且还以更快的速度增长。国际互联网有若干重要的蛋白质数据库(updated protein databases),收集了大量最新的蛋白质一级结构及其他资料,为蛋白质结构与功能的深入研究提供了便利。
二、蛋白质的二级结构
蛋白质的二级结构(secandary structure)是指蛋白质分子中某一段肽链的局部空间结构,也就是该段肽链主链骨架原子的相对空间位置。不涉及氨基酸残基侧链的构象。蛋白质的二级结构主要包括α-螺旋、β-折叠、β-转角和无规卷曲。
(一)肽单元
构成肽键的4个原子和与其相邻的两个α碳原子(Cα)构成一个肽单元(peptide unit)。由于参与肽单元的6个原子——Cα1、C、O、N、H、Cα2位于同一平面,故又称为肽平面( 见六版教材图1-9)。
(二)α-螺旋
α-螺旋(α-helix):蛋白质分子中多个肽单元通过氨基酸α-碳原子的旋转,使多肽链的主链围绕中心轴呈有规律的螺旋上升,盘旋成稳定的α-螺旋构象( 见六版教材图1-10)。α螺旋靠氢键维持。若氢键破坏,则α-螺旋构象即遭破坏。
(三)β-折叠(β-pleated sheet)
每个肽单元以Cα为旋转点,依次折叠成锯齿状结构, 氨基酸残基侧链交替地位于锯齿状结构的上下方。(图2-6 见六版教材图1-11),氢键是维持β-折叠结构的主要次级键。图2-6 β-折叠
(四)β-转角(β-turn)和 无规卷曲(random coil)
β-转角伸展的肽链形成180°回折,即U形转角结构(图1-7 见六版教材图1-11B)。无规卷曲系指没有确定规律性的那部分肽链构象。
(五)模体(motif)
在许多蛋白质分子中,可发现二个或三个具有二级结构的肽段,在空间上相互接近,形成一个特殊的空间构象,被称为模体。一个模序总有其特征性的氨基酸序列,并发挥特殊的功能。如在许多钙结合蛋白分子中通常有一个结合钙离子的模序。它由α-螺旋-环-α-螺旋三个肽段组成(图1-12A)。锌指结构(zinc finger)也是一个常见的模体例子。此模体由1个α-螺旋和2个反平行的β-折叠三个肽段组成(图1-12B)。由于Zn2+可稳固模体中α-螺旋结构,致使此α-螺旋能镶嵌于DNA的大沟中,因此含锌指结构的蛋白质都能与DNA或RNA结合。可见模体的特征性空间构象是其特殊功能的结构基础。
(六)氨基酸残基的侧链对二级结构形成的影响
蛋白质二级结构是以一级结构为基础的。一段肽链其氨基酸残基的侧链适合形成α-螺旋或β-折叠,它就会出现相应的二级结构。
三、蛋白质的三级结构
(一)蛋白质的三级结构(tertiary structure)是指整条肽链中全部氨基酸残基的相对空间位置,也就是整条肽链所有原子在三维空间的排布位置。
例:Mb(肌红蛋白)是由153个氨基酸残基构成的单条肽链的蛋白质,含有1个血红素辅基。可进行可逆的氧合和脱氧,图1-13
蛋白质三级结构的形成和稳定主要靠次级键——疏水键、离子键(盐键)、氢键和Van der Waals力等。疏水性氨基酸的侧链R基为疏水基团,有避开水,相互聚集而藏于蛋白质分子内部的自然趋势,这种结合力叫疏水键(图1-11 见六版教材图1-14)。
图1-11 维持蛋白质分子构象的各种化学键
(二)结构域
分子量大的蛋白质三级结构常可分割成1个和数个球状或纤维状的区域,折叠得较为紧密,各行其功能,称为结构域(domain)。如纤连蛋白(fibronectin),它由二条多肽链通过近C-端的两个二硫键相连而成,含有6个结构域,各个结构域分别执行一种功能,有可与细胞、胶原、DNA和肝素等配体结合的结构域(图1-15)。
(三)分子伴侣
除一级结构为决定因素外,蛋白质空间构象的正确形成还需要一类称为分子伴侣(chaperon)的蛋白质参与。分子伴侣通过提供一个保护环境从而加速蛋白质折叠成天然构象或形成四级结构。分子伴侣广泛地存在于从细菌到人的生物体中,其中有很大一部分被称之为热休克蛋白(heat shock protein)。
四、蛋白质的四级结构
在体内有许多蛋白质分子含有二条或多条多肽链,才能全面地执行功能。每一条多肽链都有其完整的三级结构,称为蛋白质的亚基(subunit),这种蛋白质分子中各个亚基的空间排布及亚基接触部位的布局和相互作用,称为蛋白质的四级结构(quaternary structure)。
在四级结构中,各个亚基间的结合力主要是氢键和离子键维持四级结构。含有四级结构的蛋白质,单独的亚基一般没有生物学功能,只有完整的四级结构寡聚体才有生物学功能。亚基分子结构相同,称之为同二聚体(homodimer),若亚基分子结构不同,则称之为异二聚体(heterodimer)。血红蛋白(hemoglobin,Hb)是由2个α亚基和2个β亚基组成的四聚体,两种亚基的三级结构颇为相似,且每个亚基都结合有1个血红素(heme)辅基(图1-16 见六版教材图1-16)。
五、蛋白质的分类
(一)根据蛋白质组成成分可分成单纯蛋白质和结合蛋白质,单纯蛋白质只含氨基酸;结合蛋白质,除蛋白质部分外,还含有非蛋白质部分,为蛋白质的生物活性或代谢所依赖。结合蛋白质中的非蛋白质部分被称为辅基,绝大部分辅基通过共价键方式与蛋白质部分相连。辅基的种类也很广,常见的有色素化合物、寡糖、脂类、磷酸、金属离子甚至分子量较大的核酸。
(二)蛋白质还可根据其形状分为纤维状蛋白质和球状蛋白质两大类。
第三节 蛋白质的结构与功能的关系 Relationship of Protein Structure and Function
一、蛋白质的一级结构与功能的关系
(一)蛋白质的一级结构是空间构象的基础
Anfinsen在研究核糖核酸酶时已发现,蛋白质的功能与其三级结构密切相关,而特定三级结构是以氨基酸顺序为基础的。核糖核酸酶是由124个氨基酸残基组成的一条多肽链,分子中8个半胱氨酸的巯基构成四对二硫键(Cys26和Cys84, Cys40和Cys95, Cys58和Cys110, Cys65和Cys72)(图1-17A)。进而形成具有一定空间构象的球状蛋白质。用变性剂和还原剂β-巯基乙醇处理该酶溶液,分别破坏二硫键和次级键,使其空间结构被破坏。但肽键不受影响,一级结构仍保持完整,酶变性失去活性。如用透析方法除去尿素和β-巯基乙醇后,核糖核酸酶又从无序的多肽链卷曲折叠成天然酶的空间结构,酶从变性状态复性,酶的活性又恢复至原来水平(图1-17B见六版教材图1-17)。这充分证明,只要其一级结构未被破坏,就可能恢复原来的三级结构,功能依然存在,所以多肽链中氨基酸的排列顺序是蛋白质空间结构的基础。
(二)一级结构与功能的关系
已有大量的实验结果证明,一级结构相似的多肽或蛋白质,其空间构象以及功能也相似。
例如不同哺乳类动物的胰岛素分子结构都由A和B两条链组成,且二硫键的配对和空间构象也极相似,它们都执行着相同的调节糖代谢等的生理功能(表1-2)。
又例如垂体前叶分泌的促肾上腺皮质激素(ACTH)和促黑激素(α-MSH, β-MSH)共有一段相同的氨基酸序列(图1-18),因此,ACTH也可促进皮下黑色素生成,但作用较弱。
又例存在于生物界的蛋白质如细胞色素C(cytochrome C),比较它们的一级结构,可以帮助了解物种进化间的关系(图1-19)。
但有时蛋白质分子中起“关键”作用的氨基酸残基缺失或被替代,都会严重影响空间构象乃至生理功能,甚至导致疾病产生。例如正常人血红蛋白β亚基的第6位氨基酸是谷氨酸,而镰刀形贫血患者的血红蛋白中,谷氨酸变成了缬氨酸,即酸性氨基酸被中性氨基酸替代,仅此一个氨基酸之差,本是水溶性的血红蛋白,就聚集成丝,相互粘着,导致红细胞变形成为镰刀状而极易破碎,产生镰刀形红细胞性贫血(sickle cell anemia)。这种由蛋白质分子发生变异所导致的疾病,被称之为“分子病”,其病因为基因突变所致。
二、蛋白质空间结构与功能的关系
体内蛋白质所具有的特定空间构象都与其发挥特殊的生理功能有着密切的关系。
(一)肌红蛋白和血红蛋白结构
肌红蛋白(myoglubin, Mb)与血红蛋白都是含有血红素辅基的蛋白质。血红素是铁卟啉化合物(图1-20),它由4个吡咯环通过4个甲炔基相连成为一个环形,Fe2+ 居于环中。从X线衍射法分析获得的肌红蛋白的三维结构(图1-13)中,可见它是一个只有三级结构的单链蛋白质,氨基酸残基上的疏水侧链大都在分子内部,富极性及电荷的则在分子表面,因此其水溶性较好。Mb分子内部有一个袋形空穴,血红素居于其中。
血红蛋白(hemoglubin,Hb)具有四个亚基组成的四级结构(图1-16),每个亚基结构中间有一个疏水局部,可结合1个血红素并携带1分子氧,因此一分子Hb共结合4分子氧。成年人红细胞中的Hb主要由两条α肽链和两条β肽链(α2β2)组成,α链含141个氨基酸残基,β链含146个氨基酸残基。胎儿期主要为α2γ2,胚胎期为α2ε2。Hb各亚基的三级结构与Mb极为相似。Hb亚基之间通过8对盐键(图1-21),使四个亚基紧密结合而形成亲水的球状蛋白。
(二)血红蛋白的构象变化与结合氧
Hb与Mb一样可逆地与O2结合,氧合Hb占总Hb的百分数(称百分饱和度)随O2浓度变化而变化。图1-22为Hb和Mb的氧解离曲线,前者为S状曲线,后者为直角双曲线。可见,Mb易与O2结合,而Hb与O2的结合在O2分压较低时较难。为什么?根据S形曲线的特征可知,Hb中第一个亚基与O2结合以后,促进第二及第三个亚基与O2的结合,当前三个亚基与O2结合后,又大大促进第四个亚基与O2结合,这种效应称为正协同效应(positive cooperativity)。协同效应的定义是指一个亚基与其配体(Hb中的配体为O2)结合后,能影响此寡聚体中另一亚基与配体的结合能力。如果是促进作用则称为正协同效应; 反之则为负协同效应。还可根据Perutz等利用X线衍射技术分析Hb和氧合Hb结晶的三维结构图谱,提出了解释O2与Hb结合的正协同效应的理论。未结合O2时,Hb的α1/β1和α2/β2呈对角排列,结构较为紧密,称为紧张态(tense state, T态),T态Hb与O2的亲和力小。随着O2的结合,4个亚基羧基末端之间的盐键(图1-21)断裂,其二级、三级和四级结构也发生变化,使α1/β1和α2/β2的长轴形成15°的夹角(图1-23),结构显得相对松弛,称为松弛态(relaxed state, R态)。图1-24显示Hb氧合与脱氧时T态和R态相互转换的可能方式。此种一个氧分子与Hb亚基结合后引起亚基构象变化,称为变构效应(allosteric effect)。小分子O2称为变构剂或效应剂,Hb则被称为变构蛋白。变构效应具有普遍生物学意义。
(三)蛋白质构象改变与疾病
若蛋白质的折叠发生错误,尽管其一级结构不变,但蛋白质的构象发生改变,仍可影响其功能,严重时可导致疾病发生,有人将此类疾病称为蛋白构象疾病。有些蛋白质错折叠后相互聚集,常形成抗蛋白水解酶的淀粉样纤维沉淀,产生毒性而致病,表现为蛋白质淀粉样纤维沉淀的病理改变,这类疾病包括人纹状体脊髓变性病、老年痴呆症、亨丁顿舞蹈病(Huntington disease)、疯牛病等。
第四节 蛋白质的理化性质及其分离纯化 The Characters of Protein and its Purification
一、蛋白质的理化性质
(一)蛋白质的两性电离
蛋白质是由氨基酸组成,其分子末端除有自由的α-NH2和α-COOH外,许多氨基酸残基的侧链上尚有可解离的基因,这些基团在溶液一定pH条件下可以解离成带负电荷或正电荷的基团。当蛋白质溶液在某一pH时,蛋白质解离成正负离子的趋势相等,即成兼性离子,净电荷为零,此时溶液的pH称为蛋白质的等电点(isoelectric point,PI)。蛋白质溶液的pH大于等电点时,该蛋白质颗粒带负电荷,小于等电点时则带正电荷。
(二)蛋白质的胶体性质
蛋白质是生物大分子,分子量可自1万至100万之巨,其分子的直径可达1~100nm,为胶粒范围之内。(三)蛋白质的变性、沉淀和凝固
在某些物理和化学因素作用下,其特定的空间构象被破坏,也即有序的空间结构变成无序的空间结构,从而导致其理化性质的改变和生物活性的丧失,称为蛋白质的变性(denaturation)。
1. 蛋白质变性的特征:蛋白质变性的主要特征是生物活性丧失。
2. 蛋白质变性的本质:一般认为蛋白质的变性主要发生二硫键和非共价键的破坏,蛋白质变性是蛋白质空间构象的改变或破坏,不涉及一级结构中氨基酸序列的改变。
3. 蛋白质变性的意义:在临床医学上,变性因素常被应用来消毒及灭菌。此外, 防止蛋白质变性也是有效保存蛋白质制剂(如疫苗等)的必要条件。
4. 若蛋白质变性程度较轻,去除变性因素后,有些蛋白质仍可恢复或部分恢复其原有的构象和功能,称为复性(renaturation)。图1-17所示。但是许多蛋白质变性后,空间构象严重被破坏,不能复原,称为不可逆性变性。
5. 蛋白质经强酸、强碱作用发生变性后,仍能溶解于强酸或强碱溶液中,若将pH调至等电点,则变性蛋白质立即结成絮状的不溶解物,此絮状物仍可溶解于强酸和强碱中。如再加热则絮状物可变成比较坚固的凝块,此凝块不易再溶于强酸和强碱中,这种现象称为蛋白质的凝固作用(protein coagulation)。
(四)蛋白质的紫外吸收
蛋白质在280nm波长处有特征性的紫外吸收,可作蛋白质定量测定。
(五)蛋白质的呈色反应
⒈茚三酮反应(ninhydrin reaction) 蛋白质经水解后产生的氨基酸也可发生茚三酮反应,详见本章第一节。
⒉双缩脲反应(biuret reaction) 蛋白质和多肽分子中肽键在稀碱溶液中与硫酸铜共热,呈现紫色或红色,称为双缩脲反应。氨基酸不出现此反应。
二、蛋白质的分离和纯化
(一) 透析及超滤法 (二)丙酮沉淀、盐析及免疫沉淀(三)电泳(四) 层析(五) 分子筛(六) 超速离心
小 结 Summary
蛋白质是重要的生物大分子,在体内分布广泛,含量丰富,种类繁多。每一种蛋白质都有其特定的空间构象和生物学功能。
组成蛋白质的基本单位为L-α-氨基酸,共有20种,可分为非极性疏水性氨基酸、极性中性氨基酸、酸性氨基酸和碱性氨基酸四类。氨基酸属于两性电解质,在溶液的pH等于其pI时,氨基酸呈兼性离子。氨基酸可通过肽键相连而成肽。小于10个氨基酸组成的肽称为寡肽,大于10个则称为多肽。体内存在许多如GSH、促甲状腺释放激素和神经肽等重要的生物活性肽。
复杂的蛋白质结构可分成一级、二级、三级和四级结构四个层次。蛋白质一级结构是指蛋白质分子中氨基酸自N端至C端的排列顺序,即氨基酸序列,其连接键为肽键,还包括二硫键的位置。形成肽键的6个原子处于同一平面,构成了所谓的肽单元。二级结构是指蛋白质主链局部的空间结构,不涉及氨基酸残基侧链构象。主要为α-螺旋、β-折叠、β-转角和无规卷曲,以氢键维持其稳定性。在蛋白质分子中,空间上相互邻近的二个或三个具有二级结构的肽段,完成特定的生物学功能,称之为模体。三级结构是指多肽链主链和侧链的全部原子的空间排布位置。三级结构的形成和稳定主要靠次级键。一些蛋白质的三级结构可形成1个或数个球状或纤维状的区域,各行其功能,称为结构域。四级结构是指蛋白质亚基之间的缔合,也主要靠次级键维系。根据蛋白质的形状,可分成球状蛋白质和纤维状蛋白质。根据组成成分,还可分成单纯蛋白质和结合蛋白质,前者仅含有氨基酸,后者除氨基酸外,还含有非蛋白质的辅基成分。

Ⅳ 核酸的检测方法和含量测定

不知道谁知道顺便也告诉我下

康恩健核酸胶囊
本品是以现代分子生物学为理论基础,采用酶切等高新技术精制而成的功能保健食品,富含核酸及蛋白多肽和多种微量元素及维生素,本品具有广泛的生理活性,是天然的代谢激活剂与能量补充剂,能够有效调节新陈代谢,激发体内潜能,使智力和体力更加活跃,充沛;显着提高机体免疫力;增强体质,改善微循环,及时消除体内有害物质,具有益智、安神、抗疲劳、抗衰老、防病健身的作用。服用康恩健核酸(基因营养素)。能够促进病体的自主康复进程,提高自身的健康状况,从而达到不药而愈,不药而康的科学保健目的。
脱氧核糖核酸 核糖核酸 核酸是什么 核酸的功能 小分子核酸 正分子核酸 核酸胶囊 康恩健核酸 核酸肽酶
核酸ppt 核酸保健品 核酸的基本单位 核酸酶 核酸的作用

【功效成份及含量】每100g含:核糖核酸大于60g、维生素C 11.8g
【保健功能】免疫调节
【适宜人群】免疫力低下者
【不适宜人群】痛风患者
食用方法及食用量】每日2次,每次2粒
【规格】400mg/粒
【保质期】24个月
【贮藏方法】置阴凉干燥处
【注意事项】本品不能代替药物
脱氧核糖核酸 核糖核酸 核酸是什么 核酸的功能 小分子核酸 正分子核酸 核酸胶囊 康恩健核酸 核酸肽酶
核酸ppt 核酸保健品 核酸的基本单位 核酸酶 核酸的作用

1.含量高的核酸

每100克含核酸大于60g;(核酸类产品主要是补充核酸)

2.更高品质的核酸
康恩健核酸主要原料是核酸、维生素C,同时借鉴美国配方中大豆低聚肽和核酸酶的协调作用,品质更高,效果更好。

3.好吸收的核酸
采用了最先进的工艺,酶解、酶切技术(预消化处理),在活性酶、小分子肽和辅酶促进作用下、临床试验吸收率高达97%以上。

4.更全面更均衡的核酸
由核酸酶解(预消化处理)而成的小分子核苷酸、寡核苷酸、碱基,营养基因更全面更均衡。

5.更便宜的核酸
康恩健核酸采用技术授权,指定GMP厂加工分装等先进的生产经营模式,减低成本,产品更具优势,使消费者花同样的钱,买更多的产品。
脱氧核糖核酸 核糖核酸 核酸是什么 核酸的功能 小分子核酸 正分子核酸 核酸胶囊 康恩健核酸 核酸肽酶
核酸ppt 核酸保健品 核酸的基本单位 核酸酶 核酸的作用

Ⅵ 关于多肽的结构分析

化学的方法是埃德曼降解法,这种方法是瑞典科学家埃德曼创立的连续测定蛋白质或肽链N端氨基酸残基序列的经典方法.用异硫氰酸苯酯(PTH)等与多肽反应,逐个水解N端氨基酸残基,依次生成各种PTH-氨基酸,层析鉴定PTH-氨基酸就可从N端逐个确定被测肽段的氨基酸残基排列顺序. 对于含有氨基酸残基较多的蛋白质,一般采用质谱的方法.质谱轰击蛋白质是指称为碎片,根据碎片在电场中的运动情况确定质荷比,在根据计算机软件分析和数据库确定蛋白质的氨基酸序列.

Ⅶ 急需以下物质的分析方法。气相或者液相。

你说的这个原因有点难以解决了!现在的专家们还没有研究出来呢?你要是想看到真正的解释!请到以下的网站了!我给你介绍一个:
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气相色谱
挥发性不好的用HPLC
高效液相色谱
这是几乎唯一的也是最标准的方法!

问题补充1:这是同学(化学波士)给的答案。
问题补充2:我对化学是一点都不懂,同学给我提供答案的时候,简直是鸡同鸭讲,所以不知道从何问起啊!!!他有时间的时候我再问吧。址会帮助你的!

Ⅷ 生物技术制药的目录

第1章 生物技术制药总论第1节基因工程与基因工程制药
步骤
一、基因工程
二、基因工程制药的基本步骤
三、基因工程制药的具体步骤
第2节细胞工程制药
一、细胞工程
二、细胞工程制药
第3节酶工程制药
一、酶与酶工程
二、酶工程制药
第4节发酵工程制药
一、发酵与发酵工程
二、发酵工程制药
第5节蛋白质工程制药
一、蛋白质与蛋白质工程
二、蛋白质工程制药
第6节生物医学工程与生物信息
工程
一、生物医学工程
二、生物信息工程
思考题
参考文献
第2章 基因工程制药第1节基因克隆表达
一、大肠杆菌表达系统
二、酵母表达系统
三、昆虫细胞表达系统
第2节各种产物表达形式采用的
分离纯化方法
一、大肠杆菌细胞内不溶性表达产物
二、分泌型的表达产物
三、大肠杆菌细胞内可溶性表达产物
四、大肠杆菌细胞周质表达蛋白
第3节表达产物的活性、安全性
评价、稳定性考察
一、生物活性(效价)测定
二、安全性评价
三、稳定性
四、产品
思考题
参考文献
第3章 细胞工程制药第1节细胞、细胞工程与细胞
工程制药
一、细胞
二、细胞工程
三、细胞工程制药
第2节动物细胞工程制药
一、动物细胞的全能性
二、动物细胞工程制药中的转基因
与细胞培养技术
第3节植物细胞工程制药
一、植物细胞的特点
二、植物细胞工程药物研究
三、植物细胞融合与核移植技术
四、转基因植物药物技术
五、植物细胞培养工程
六、植物细胞的染色体工程
第4节细胞工程制药的应用、前景
和存在的问题
一、临床用细胞工程药物
二、人源化抗体的研制与“分子药田”
工程
三、细胞工程药物的安全性
思考题
参考文献
第4章 酶工程制药第1节酶工程制药概述
一、酶及酶催化特性
二、影响酶催化反应的主要因素
三、酶的分类
四、酶工程和酶工程制药
第2节酶工程制药技术
一、药用酶的生产技术
二、药物的酶法生产技术
第3节酶工程制药的现状与前景
思考题
参考文献
第5章 发酵工程制药第1节发酵工程制药基础
一、微生物发酵生产的药物
二、发酵制药工业中的微生物
第2节微生物制药发酵工艺
第3节微生物发酵工艺过程的控制
思考题
参考文献
第6章 蛋白质工程制药第1节蛋白质工程制药的概念
一、蛋白质工程制药研究的核心内容
和基本概念及方法
二、改造蛋白质的一些方法
第2节蛋白质工程制药方法
一、随机诱变
二、体外重组
三、蛋白质工程制药方法的常用目的
第3节蛋白质工程制药现状
一、蛋白质定点突变改造
思考题
参考文献
第7章 核酸类药物第1节反义核酸药物
一、反义药物的作用机制
二、反义药物的设计策略
三、反义药物的作用特点
四、反义核酸药物的合成与纯化
第2节短小干扰RNA(siRNA)
一、RNAi的作用机制
二、RNAi的特点
三、siRNA的制备方法
第3节miRNA
一、miRNA的基本特征
二、miRNA的作用机制
三、siRNA和miRNA的异同
第4节核酸类药物的临床试验现状
与前景
一、反义核酸类药物的临床试验现状
与前景
二、RNAi的临床试验现状与前景
思考题
参考文献
第8章 多肽类药物第1节多肽类药物的概念和优点
一、多肽、多肽药物的概念
二、多肽药物的优点
第2节多肽药物的制备
一、固相合成法
二、液相合成法
三、多肽合成仪法
四、酶解法制备多肽
第3节多肽药物的稳定性、检测、
制剂与给药途径
一、多肽药物的稳定性
二、多肽类药物制剂的分析方法
三、多肽类药物的缓释制剂研究
四、多肽药物的给药途径
第4节多肽药物的应用
一、多肽疫苗
二、抗肿瘤多肽
三、抗病毒多肽
四、多肽导向药物
五、抗菌性活性肽
六、细胞因子模拟肽
七、用于心血管疾病的多肽
八、其他药用小肽
九、诊断用多肽
思考题
参考文献
第9章 治疗性抗体药物第1节抗体概述
一、抗体的基本结构
二、抗体的基因组成
三、抗原识别特异性的产生
四、亲和力与结合力
五、类别转换
六、药物代谢动力学
七、效应功能
第2节治疗性小型化抗体
第3节单链抗体(ScFv)、单域抗体
第4节重组人鼠嵌合单克隆抗体
第5节重组人源化单克隆抗体
一、人单克隆抗体
第6节抗体药物与化疗药物
的联合应用
思考题
参考文献
Ⅸ……………………Ⅹ第10章 治疗性细胞株第1节治疗性细胞株——干细胞
疗法
第2节树突状细胞共培养的细胞
因子
第3节治疗性克隆
第4节核移植与重编程
参考文献
第11章 细胞因子类药物第1节重组人干扰素
一、概述
二、IFN的性质、结构和功能
三、IFN的生物学活性和作用机制
四、IFN的基因工程制备
五、IFN的临床应用及不良反应
第2节重组人白细胞介素
一、概述
二、各类IL
第3节粒细胞集落刺激因子
一、结构与性质
二、G?CSF、GM?CSF的临床应用
三、G?CSF、GM?CSF的不良反应
四、基因重组人G?CSF和GM?CSF
第4节促红细胞生成素
一、EPO基因和分子结构
二、EPO的产生及性质
三、重组人EPO的制备
四、临床应用
五、EPO的不良反应
第5节组织型纤溶酶原激活剂
一、概述
二、性质、结构和功能
三、生物学活性及作用机制
四、基因工程制备t?PA
五、重组t?PA的临床应用
第6节肿瘤坏死因子
一、概述
二、TNF的分子结构与功能
三、TNF的生物活性和临床应用
四、TNF的制备
思考题
参考文献
第12章 基因治疗第1节基因治疗研究现状
一、基因治疗的现状
二、目前基因治疗存在的问题
第2节基因转移的方法
一、基因治疗的概念及步骤
二、基因转移方法
第3节基因治疗的应用与安全性
一、基因治疗的应用
二、基因治疗的安全性
思考题
参考文献
第13章 动物基因工程药物第1节动物细胞培养
一、动物细胞培养的几个基本概念
二、动物细胞培养的基本条件
三、动物细胞形态
四、哺乳动物细胞冷冻保存
五、动物细胞的解冻复苏
六、动物细胞的传代培养
第2节动物转基因技术
一、动物细胞转基因技术
二、转基因动物制备技术
第3节动物反应器与动物基因
工程药物
一、转基因动物细胞生物反应器
二、乳腺生物反应器
思考题
参考文献
第14章 植物基因工程药物第1节植物基因工程
一、植物表达载体的构建
二、植物转化
第2节植物基因工程药物
一、植物基因工程重组蛋白药物
二、植物次生代谢工程
思考题
参考文献
第15章 分子靶向药物第1节概述
第2节细胞信号转导通路分子靶向
药物
一、Ras/MAPK通道抑制剂
二、蛋白激酶C抑制剂
三、环氧合酶?2选择性抑制剂
四、端粒酶抑制因子
五、法基尼转移酶抑制剂
第3节原癌基因和抑癌基因
的分子靶向药物
一、原癌基因表达的特点
二、原癌基因的结构改变形式及其
表达激活
第4节细胞因子受体分子靶向药物
第5节抗肿瘤血管形成分子靶向药物
第6节小型化抗体靶向药物
第7节自杀基因
参考文献
第16章 融合蛋白药物第1节重组人肿瘤坏死因子受体—
Fc融合蛋白
一、肿瘤坏死因子
第2节重组抗肿瘤融合蛋白
一、融合蛋白与肿瘤
二、融合蛋白与恶性肿瘤的演进
三、融合蛋白在肿瘤治疗、预防研究
中的应用
第3节重组人血清清蛋白?干扰素
一、干扰素的产生及其结构特点
二、干扰素的治病原理
三、已上市的衍生干扰素产品
第4节重组人成纤维细胞生长因子
一、αFGF及FGFR的结构和功能
二、生物学功能
三、基因工程表达αFGF现状
四、αFGF用于临床应注意的问题
第5节重组人粒细胞巨噬细胞
集落刺激因子
一、人粒细胞巨噬细胞集落刺激因子
的分子生物学特征
二、人粒细胞巨噬细胞集落刺激因子
的临床应用
三、人粒细胞巨噬细胞集落刺激因子
转基因表达研究
第6节白细胞介素
一、种类和结构
二、生物学活性
三、IL的功能
思考题
参考文献
Ⅺ……………………Ⅻ第17章 治疗性激素第1节胰岛素
一、胰岛素分子
二、胰岛素受体与信号转导
三、重组DNA技术制备胰岛素产品
四、用胰岛素合成细胞治疗糖尿病
第2节人生长激素
一、生长激素释放因子与抑制因子
二、GH受体、GH的生理作用与
GH的治疗作用
三、重组huGH与垂体性矮小
四、huGH的代谢作用
五、GH、泌乳与排卵
第3节促性腺激素
一、重组促性腺激素
二、促性腺激素在兽医学中的应用
三、促性腺激素释放激素
第4节其他批准用于临床的重组
激素
一、重组人甲状旁腺激素
二、重组降钙素
三、重组促甲状腺素
思考题
参考文献
第18章 血液制品和治疗性酶第1节血液代用品
一、右旋糖酐
二、清蛋白
三、明胶蛋白
四、携氧血液替代品
第2节凝血因子和血友病
一、凝血因子Ⅷ
二、凝血因子Ⅸ、Ⅶa
第3节治疗用酶
一、抗凝血酶(AT)
二、溶栓剂
三、超氧化物歧化酶
四、其他治疗用酶
思考题
参考文献
第19章 疫苗技术和分子诊断技术第1节疫苗技术
一、传统疫苗制剂
二、基因工程疫苗技术与DNA疫苗
三、艾滋病疫苗
四、肿瘤疫苗
五、佐剂技术及作用模式
第2节分子诊断技术
一、分子诊断的概念及原理
二、分子诊断的常用技术方法
第3节分子诊断的临床应用
一、分子诊断与遗传疾病
二、分子诊断与传染性疾病
三、分子诊断与肿瘤
四、分子诊断与个性化治疗
思考题
参考文献

Ⅸ 求一种多糖的分离和药物活性

2.1 概述
 在自然科学,尤其是生命科学高度发展的今天,蛋白质、酶和核酸等生物大分子的结构与功能的研究是探求生命奥秘的中心课题,而生物大分子结构与功能的研究,必须首先解决生物大分子的制备问题,有能够达到足够纯度的生物大分子的制备工作为前题,结构与功能的研究就无从谈起。然而生物大分子的分离纯化与制备是一件十分细致而困难的工作。

 与化学产品的分离制备相比较,生物大分子的制备有以下主要特点:
 ⑴生物材料的组成极其复杂,常常包含有数百种乃至几千种化合物。
 ⑵许多生物大分子在生物材料中的含量极微,分离纯化的步骤繁多,流程长。
 ⑶许多生物大分子一旦离开了生物体内的环境时就极易失活,因此分离过程中如何防止其失活,就是生物大分子提取制备最困难之处。
 ⑷生物大分子的制备几乎都是在溶液中进行的,温度、pH值、离子强度等各种参数对溶液中各种组成的综合影响,很难准确估计和判断。

 生物大分子的制备通常可按以下步骤进行:
 ①确定要制备的生物大分子的目的和要求,是进行科研、开发还是要发现新的物质。
 ②建立相应的可靠的分析测定方法,这是制备生物大分子的关键。
 ③通过文献调研和预备性实验,掌握生物大分子目的产物的物理化学性质。
 ④生物材料的破碎和预处理。
 ⑤分离纯化方案的选择和探索,这是最困难的过程。
 ⑥生物大分子制备物的均一性(即纯度)的鉴定,要求达到一维电泳一条带,二维电泳一个点,或HPLC和毛细管电泳都是一个峰。
 ⑦产物的浓缩,干燥和保存。


 分析测定的方法主要有两类:
 即生物学和物理、化学的测定方法。
 生物学的测定法主要有:酶的各种测活方法、蛋白质含量的各种测定法、免疫化学方法、放射性同位素示踪法等;
 物理、化学方法主要有:比色法、气相色谱和液相色谱法、光谱法(紫外/可见、红外和荧光等分光光度法)、电泳法、以及核磁共振等。
 实际操作中尽可能多用仪器分析方法,以使分析测定更加快速、简便。

要了解的生物大分子的物理、化学性质主要有:
 ①在水和各种有机溶剂中的溶解性。
 ②在不同温度、pH 值和各种缓冲液中生物大分子的稳定性。
 ③固态时对温度、含水量和冻干时的稳定性。
 ④各种物理性质:如分子的大小、穿膜的能力、带电的情况、在电场中的行为、离心沉降的表现、在各种凝胶、树脂等填料中的分配系数。
 ⑤其他化学性质:如对各种蛋白酶、水解酶的稳定性和对各种化学试剂的稳定性。
 ⑥对其他生物分子的特殊亲和力。

 制备生物大分子的分离纯化方法多种多样,主要是利用它们之间特异性的差异,如分子的大小、形状、酸碱性、溶解性、溶解度、极性、电荷和与其他分子的亲和性等。
 各种方法的基本原理可以归纳为两个方面:
 ①利用混合物中几个组分分配系数的差异,把它们分配到两个或几个相中,如盐析、有机溶剂沉淀、层析和结晶等;
 ②将混合物置于某一物相(大多数是液相)中,通过物理力场的作用,使各组分分配于不同的区域,从而达到分离的目的,如电泳、离心、超滤等。
 目前纯化蛋白质等生物大分子的关键技术是电泳、层析和高速与超速离心。

 2.2 生物大分子制备的前处理
 2.2.1 生物材料的选择
 制备生物大分子,首先要选择适当的生物材料。材料的来源无非是动物、植物和微生物及其代谢产物。
 选择的材料应含量高、来源丰富、制备工艺简单、成本低,尽可能保持新鲜,尽快加工处理。
 动物组织要先除去结缔组织、脂肪等非活性部分,绞碎后在适当的溶剂中提取,如果所要求的成分在细胞内,则要先破碎细胞。
 植物要先去壳、除脂。
 微生物材料要及时将菌体与发酵液分开。
 生物材料如暂不提取,应冰冻保存。动物材料则需深度冷冻保存。

 2.2.2 细胞的破碎
 不同的生物体或同一生物体的不同部位的组织,其细胞破碎的难易不一,使用的方法也不相同,如动物脏器的细胞膜较脆弱,容易破碎,植物和微生物由于具有较坚固的纤维素、半纤维素组成的细胞壁,要采取专门的细胞破碎方法。
 (1)机械法:
 1) 研磨:将剪碎的动物组织置于研钵或匀浆器中,加入少量石英砂研磨或匀浆。
 2) 组织捣碎器:这是一种较剧烈的破碎细胞的方法,通常可先用家用食品加工机将组织打碎,然后再用10000r/min~20000r/min的内刀式组织捣碎机(即高速分散器)将组织的细胞打碎。

 (2)物理法:
 1) 反复冻融法:将待破碎的细胞冷至-15℃到-20℃,然后放于室温(或40℃)迅速融化,如此反复冻融多次,由于细胞内形成冰粒使剩余胞液的盐浓度增高而引起细胞溶胀破碎。
 2) 超声波处理法:此法是借助超声波的振动力破碎细胞壁和细胞器。破碎微生物细菌和酵母菌时,时间要长一些。
 3) 压榨法:这是一种温和的、彻底破碎细胞的方法。在1000×105Pa~2000×105Pa 的高压下使细胞悬液通过一个小孔突然释放至常压,细胞将彻底破碎。
 4) 冷热交替法:从细菌或病毒中提取蛋白质和核酸时可用此法。在90℃左右维持数分钟,立即放入冰浴中使之冷却,如此反复多次,绝大部分细胞可以被破碎。

 (3)化学与生物化学方法:
 1) 自溶法:将新鲜的生物材料存放于一定的pH和适当的温度下,细胞结构在自身所具有的各种水解酶(如蛋白酶和酯酶等)的作用下发生溶解,使细胞内含物释放出来。
 2) 溶胀法:细胞膜为天然的半透膜,在低渗溶液和低浓度的稀盐溶液中,由于存在渗透压差,溶剂分子大量进入细胞,将细胞膜胀破释放出细胞内含物。
 3) 酶解法:利用各种水解酶,如溶菌酶、纤维素酶、蜗牛酶和酯酶等,于37℃,pH8,处理15分钟,可以专一性地将细胞壁分解。
 4) 有机溶剂处理法:利用氯仿、甲苯、丙酮等脂溶性溶剂或SDS(十二烷基硫酸钠)等表面活性剂处理细胞,可将细胞膜溶解,从而使细胞破裂,此法也可以与研磨法联合使用。


 2.2.3 生物大分子的提取
 “提取”是在分离纯化之前将经过预处理或破碎的细胞置于溶剂中,使被分离的生物大分子充分地释放到溶剂中,并尽可能保持原来的天然状态不丢失生物活性的过程。
 影响提取的因素主要有:
 目的产物在提取的溶剂中溶解度的大小;
 由固相扩散到液相的难易;
 溶剂的pH值和提取时间等。
 通常:
 极性物质易溶于极性溶剂,非极性物质易溶于非极性溶剂;
 碱性物质易溶于酸性溶剂,酸性物质易溶于碱性溶剂;
 温度升高,溶解度加大;
 远离等电点的pH值,溶解度增加。
 提取时所选择的条件应有利于目的产物溶解度的增加和保持其生物活性。

 ⑴ 水溶液提取:
 蛋白质和酶的提取一般以水溶液为主。稀盐溶液和缓冲液对蛋白质的稳定性好,溶解度大,是提取蛋白质和酶最常用的溶剂。用水溶液提取生物大分子应注意的几个主要影响因素是:
 1) 盐浓度(即离子强度):
 离子强度对生物大分子的溶解度有极大的影响,有些物质,如DNA-蛋白复合物,在高离子强度下溶解度增加。
 绝大多数蛋白质和酶,在低离子强度的溶液中都有较大的溶解度,如在纯水中加入少量中性盐,蛋白质的溶解度比在纯水时大大增加,称为“盐溶”现象。盐溶现象的产生主要是少量离子的活动,减少了偶极分子之间极性基团的静电吸引力,增加了溶质和溶剂分子间相互作用力的结果。
 为了提高提取效率,有时需要降低或提高溶剂的极性。向水溶液中加入蔗糖或甘油可使其极性降低,增加离子强度(如加入KCl、NaCl、NH4Cl或(NH4)2SO4)可以增加溶液的极性。


 2) pH值:蛋白质、酶与核酸的溶解度和稳定性与pH值有关。过酸、过碱均应尽量避免,一般控制在pH=6~8范围内,提取溶剂的pH应在蛋白质和酶的稳定范围内,通常选择偏离等电点的两侧。
 3) 温度:为防止变性和降解,制备具有活性的蛋白质和酶,提取时一般在0℃~5℃的低温操作。
 4) 防止蛋白酶或核酸酶的降解作用:加入抑制剂或调节提取液的pH、离子强度或极性等方法使相应的水解酶失去活性,防止它们对欲提纯的蛋白质、酶及核酸的降解作用。

 5) 搅拌与氧化:搅拌能促使被提取物的溶解,一般采用温和搅拌为宜,速度太快容易产生大量泡沫,增大了与空气的接触面,会引起酶等物质的变性失活。因为一般蛋白质都含有相当数量的巯基,有些巯基常常是活性部位的必需基团,若提取液中有氧化剂或与空气中的氧气接触过多都会使巯基氧化为分子内或分子间的二硫键,导致酶活性的丧失。在提取液中加入少量巯基乙醇或半胱氨酸以防止巯基氧化。

 ⑵ 有机溶剂提取
 一些和脂类结合比较牢固或分子中非极性侧链较多的蛋白质和酶难溶于水、稀盐、稀酸、或稀碱中,常用不同比例的有机溶剂提取。
 常用的有机溶剂有乙醇、丙酮、异丙醇、正丁酮等,这些溶剂可以与水互溶或部分互溶,同时具有亲水性和亲脂性。
 有些蛋白质和酶既溶于稀酸、稀碱,又能溶于含有一定比例的有机溶剂的水溶液中,在这种情况下,采用稀的有机溶液提取常常可以防止水解酶的破坏,并兼有除去杂质提高纯化效果的作用。
例如,胰岛素(见讲义p36)。

 2.3 生物大分子的分离纯化
 由于生物体的组成成分是如此复杂,数千种乃至上万种生物分子又处于同一体系中,因此不可能有一个适合于各类分子的固定的分离程序,但多数分离工作关键部分的基本手段是相同的。
 为了避免盲目性,节省实验探索时间,要认真参考和借鉴前人的经验,少走弯路。常用的分离纯化方法和技术有:
 沉淀法(包括:盐析、有机溶剂沉淀、选择性沉淀等)、离心、吸附层析、凝胶过滤层析、离子交换层析、亲和层析、快速制备型液相色谱以及等电聚焦制备电泳等。本章以介绍沉淀法为主。

 2.3.1 沉淀法
 沉淀是溶液中的溶质由液相变成固相析出的过程。沉淀法(即溶解度法)操作简便,成本低廉,不仅用于实验室中,也用于某些生产目的的制备过程,是分离纯化生物大分子,特别是制备蛋白质和酶时最常用的方法。通过沉淀,将目的生物大分子转入固相沉淀或留在液相,而与杂质得到初步的分离。
 其基本原理是根据不同物质在溶剂中的溶解度不同而达到分离的目的,不同溶解度的产生是由于溶质分子之间及溶质与溶剂分子之间亲和力的差异而引起的,溶解度的大小与溶质和溶剂的化学性质及结构有关,溶剂组分的改变或加入某些沉淀剂以及改变溶液的pH值、离子强度和极性都会使溶质的溶解度产生明显的改变。

 在生物大分子制备中最常用的几种沉淀方法是:
 ⑴中性盐沉淀(盐析法):多用于各种蛋白质和酶的分离纯化。
 ⑵有机溶剂沉淀:多用于蛋白质和酶、多糖、核酸以及生物小分子的分离纯化。
 ⑶选择性沉淀(热变性沉淀和酸碱变性沉淀):多用于除去某些不耐热的和在一定pH值下易变性的杂蛋白。
 ⑷等电点沉淀:用于氨基酸、蛋白质及其他两性物质的沉淀,但此法单独应用较少,多与其他方法结合使用。
 ⑸有机聚合物沉淀: 是发展较快的一种新方法, 主要使用PEG聚乙二醇(Polyethyene glycol)作为沉淀剂。

 2.3.1.1 中性盐沉淀(盐析法)
 在溶液中加入中性盐使生物大分子沉淀析出的过程称为“盐析”。除了蛋白质和酶以外,多肽、多糖和核酸等都可以用盐析法进行沉淀分离。
 盐析法应用最广的还是在蛋白质领域,已有八十多年的历史,其突出的优点是:
 ①成本低,不需要特别昂贵的设备。
 ②操作简单、安全。
 ③对许多生物活性物质具有稳定作用。

 ⑴ 中性盐沉淀蛋白质的基本原理
 蛋白质和酶均易溶于水,因为该分子的-COOH、-NH2和-OH都是亲水基团,这些基团与极性水分子相互作用形成水化层,包围于蛋白质分子周围形成1nm~100nm颗粒的亲水胶体,削弱了蛋白质分子之间的作用力,蛋白质分子表面极性基团越多,水化层越厚,蛋白质分子与溶剂分子之间的亲和力越大,因而溶解度也越大。亲水胶体在水中的稳定因素有两个:即电荷和水膜。因为中性盐的亲水性大于蛋白质和酶分子的亲水性,所以加入大量中性盐后,夺走了水分子,破坏了水膜,暴露出疏水区域,同时又中和了电荷,破坏了亲水胶体,蛋白质分子即形成沉淀。盐析示意图如下页“图 4”所示。

 ⑵ 中性盐的选择
 常用的中性盐中最重要的是(NH4)2SO4,因为它与其他常用盐类相比有十分突出的优点:
 1) 溶解度大:尤其是在低温时仍有相当高的溶解度,这是其他盐类所不具备的。由于酶和各种蛋白质通常是在低温下稳定,因而盐析操作也要求在低温下(0~4℃)进行。由下表可以看到, 硫铵在0℃时的溶解度,远远高于其它盐类:
 表2-1 几种盐在不同温度下的溶解度(克/100毫升水)
 0℃ 20℃ 80℃ 100 ℃
(NH4)2SO4 70.6 75.4 95.3 103
 Na2SO4 4.9 18.9 43.3 42.2
 NaH2PO4 1.6 7.8 93.8 101






 2) 分离效果好:有的提取液加入适量硫酸铵
盐析,一步就可以除去75%的杂蛋白,纯
度提高了四倍。
 3) 不易引起变性,有稳定酶与蛋白质结构的
作用。有的酶或蛋白质用2~3mol/L浓度的
(NH4)2SO4保存可达数年之久。
 4) 价格便宜,废液不污染环境。

 ⑶ 盐析的操作方法
 最常用的是固体硫酸铵加入法。将其研成细粉,在搅拌下缓慢均匀少量多次地加入,接近计划饱和度时,加盐的速度更要慢一些,尽量避免局部硫酸铵浓度过大而造成不应有的蛋白质沉淀。盐析后要在冰浴中放置一段时间,待沉淀完全后再离心与过滤。
 在低浓度硫酸铵中盐析可采用离心分离,高浓度硫酸铵常用过滤方法。
 各种饱和度下需加固体硫酸铵的量可由附录中查出。

 ⑷ 盐析曲线的制作
 如果要分离一种新的蛋白质和酶,没有文献数据可以借鉴,则应先确定沉淀该物质的硫酸铵饱和度。具体操作方法如下(讲义p39):

蛋白质量(mg)或酶活力

10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 硫铵饱
和度%

 ⑸盐析的影响因素
 1) 蛋白质的浓度:高浓度的蛋白质用稍低的硫酸铵饱和度沉淀,若蛋白质浓度过高,易产生各种蛋白质的共沉淀作用。低浓度的蛋白质,共沉淀作用小,但回收率降低。较适中的蛋白质浓度是2.5%~3.0%,相当于25 mg/mL~30mg/mL。
 2) pH值对盐析的影响:在等电点处溶解度小,pH值常选在该蛋白质的等电点附近。
 3) 温度的影响:对于蛋白质、酶和多肽等生物大分子,在高离子强度溶液中,温度升高,它们的溶解度反而减小。在低离子强度溶液或纯水中蛋白质的溶解度大多数还是随浓度升高而增加的。一般情况下,可在室温下进行。但对于某些对温度敏感的酶,要求在0℃~4℃下操作,以避免活力丧失。


 2.3.1.2 有机溶剂沉淀法
 ⑴基本原理
 有机溶剂对于许多蛋白质(酶)、核酸、多糖和小分子生化物质都能发生沉淀作用,是较早使用的沉淀方法之一。其原理主要是:
 ①降低水溶液的介电常数,向溶液中加入有机溶剂能降低溶液的介电常数,减小溶剂的极性,从而削弱了溶剂分子与蛋白质分子间的相互作用力,导致蛋白质溶解度降低而沉淀。
 ②由于使用的有机溶剂与水互溶,它们在溶解于水的同时从蛋白质分子周围的水化层中夺走了水分子,破坏了蛋白质分子的水膜,因而发生沉淀作用。


 有机溶剂沉淀法的优点是:
 ①分辨能力比盐析法高,即一种蛋白质或其他溶质只在一个比较窄的有机溶剂浓度范围内沉淀。
 ②沉淀不用脱盐,过滤比较容易(如有必要,可用透析袋脱有机溶剂)。因而在生化制备中有广泛的应用。
 其缺点是对某些具有生物活性的大分子容易引起变性失活,操作需在低温下进行。
 ⑵有机溶剂的选择和浓度的计算
 用于生化制备的有机溶剂的选择首先是要能与水互溶。沉淀蛋白质和酶常用的是乙醇、甲醇和丙酮。
 为了获得沉淀而不着重于进行分离,可用溶液体积的倍数:如加入一倍、二倍、三倍原溶液体积的有机溶剂,来进行有机溶剂沉淀。

 ⑶有机溶剂沉淀的影响因素
 1) 温度:多数生物大分子如蛋白质、酶和核酸在有机溶剂中对温度特别敏感,温度稍高就会引起变性,且有机溶剂与水混合时产生放热反应,因此必须预冷,操作要在冰盐浴中进行,加入有机溶剂时必须缓慢且不断搅拌以免局部过浓。
 一般规律是温度越低,得到的蛋白质活性越高。
 2) 样品浓度:低浓度样品回收率低,要使用比例更大的有机溶剂进行沉淀。高浓度样品,可以节省有机溶剂,减少变性的危险,但杂蛋白的共沉淀作用大。
 通常使用5mg/mL~20mg/mL的蛋白质初浓度为宜。


 3) pH值:选择在样品稳定的pH值范围内,通常是选在等电点附近,从而提高此沉淀法的分辨能力。
 4) 离子强度:盐浓度太大或太小都有不利影响,通常盐浓度以不超过5%为宜,使用乙醇的量也以不超过原蛋白质水溶液的2倍体积为宜,少量的中性盐对蛋白质变性有良好的保护作用,但盐浓度过高会增加蛋白质在水中的溶解度,降低了沉淀效果,通常是在低浓度缓冲液中沉淀蛋白质。
 沉淀所得的固体样品,如果不是立即溶解进行下一步的分离,则应尽可能抽干沉淀,减少其中有机溶剂的含量,如若必要可以装透析袋透析脱有机溶剂,以免影响样品的生物活性。

 2.3.1.3 选择性变性沉淀法
 这一方法是利用生物大分子与非目的生物大分子在物理化学性质等方面的差异,选择一定的条件使杂蛋白等非目的物变性沉淀而得到分离提纯。
 ⑴ 热变性
 利用生物大分子对热的稳定性不同,加热升高温度使非目的生物大分子变性沉淀而保留目的物在溶液中。
 ⑵ 表面活性剂和有机溶剂变性
 使那些对表面活性剂和有机溶剂敏感性强的杂蛋白变性沉淀。通常在冰浴或冷室中进行。
 ⑶ 选择性酸碱变性
 利用对pH值的稳定性不同而使杂蛋白变性沉淀。通常是在分离纯化流程中附带进行的分离纯化步骤。

 2.3.1.4 等电点沉淀法
 利用具有不同等电点的两性电解质,在达到电中性时溶解度最低,易发生沉淀,从而实现分离的方法。氨基酸、蛋白质、酶和核酸都是两性电解质,可以利用此法进行初步的沉淀分离。
 由于许多蛋白质的等电点十分接近,而且带有水膜的蛋白质等生物大分子仍有一定的溶解度,不能完全沉淀析出,因此,单独使用此法分辨率较低,因而此法常与盐析法、有机溶剂沉淀法或其他沉淀剂一起配合使用,以提高沉淀能力和分离效果。
 此法主要用于在分离纯化流程中去除杂蛋白,而不用于沉淀目的物。

 2.3.1.5 有机聚合物沉淀法
 有机聚合物是六十年代发展起来的一类重要的沉淀剂,最早应用于提纯免疫球蛋白和沉淀一些细菌和病毒。近年来广泛用于核酸和酶的纯化。其中应用最多的是
“聚乙二醇”【HOCH2(CH2OCH2)nCH2OH (n >4)】( Polyethylene Glycol 简写为 PEG ),它的亲水性强,溶干水和许多有机溶剂,对热稳定,有广泛围的分子量,在生物大分子制备中,用的较多的是分子量为6000~20000的 PEG。
 本方法的优点是:
 ①操作条件温和,不易引起生物大分子变性。
 ②沉淀效能高,使用很少量的P“EG即可以沉淀相当多
的生物大分子。
 ③沉淀后有机聚合物容易去除。

 2.3.2 透析
 自Thomas Graham 1861年发明透析方法至今已有一百多年。透析已成为生物化学实验室最简便最常用的分离纯化技术之一。在生物大分子的制备过程中,除盐、除少量有机溶剂、除去生物小分子杂质和浓缩样品等都要用到透析的技术。
 透析只需要使用专用的半透膜即可完成。保留在透析袋内未透析出的样品溶液称为“保留液”,袋(膜)外的溶液称为“渗出液”或“透析液”。截留分子量MwCO通常为1万左右。
 用1% BaCl2检查(NH4)2SO4,用1% AgNO3 检查NaCl、KCl等。

 2.3.3 超滤
 超过滤即超滤,自20年代问世后,直至60年代以来发展迅速,很快由实验室规模的分离手段发展成重要的工业单元操作技术。超滤现已成为一种重要的生化实验技术,广泛用于含有各种小分子溶质的各种生物大分子(如蛋白质、酶、核酸等)的浓缩、分离和纯化。
 超滤是一种加压膜分离技术,即在一定的压力下,使小分子溶质和溶剂穿过一定孔径的特制的薄膜,而使大分子溶质不能透过,留在膜的一边,从而使大分子物质得到了部分的纯化。

 超滤根据所加的操作压力和所用膜的平均孔径的不同,可分为微孔过滤、超滤和反渗透三种。
 微孔过滤所用的操作压通常小于4×104Pa,膜的平均孔径为500埃~14微米(1微米=104埃),用于分离较大的微粒、细菌和污染物等。
 超滤所用操作压为4×104Pa~7×105Pa,膜的平均孔径为10—100埃,用于分离大分子溶质。
 反渗透所用的操作压比超滤更大,常达到35×105Pa~140×105Pa,膜的平均孔径最小,一般为10埃以下,用于分离小分子溶质,如海水脱盐,制高纯水等。

 超滤技术的优点是操作简便,成本低廉,不需增加任何化学试剂,尤其是超滤技术的实验条件温和,与蒸发、冰冻干燥相比没有相的变化,而且不引起温度、pH的变化,因而可以防止生物大分子的变性、失活和自溶。
 在生物大分子的制备技术中,超滤主要用于生物大分子的脱盐、脱水和浓缩等。
 超滤法也有一定的局限性,它不能直接得到干粉制剂。对于蛋白质溶液,一般只能得到10~50%的浓度。

 超滤技术的关键是膜。
 常用的膜是由乙酸纤维或硝酸纤维或此二者的混合物制成。近年来发展了非纤维型的各向异性膜,例如聚砜膜、聚砜酰胺膜和聚丙烯腈膜等。这种膜在pH 1~14都是稳定的,且能在90℃下正常工作。超滤膜通常是比较稳定的,能连续用1~2年。
 超滤膜的基本性能指标:水通量(cm3/(cm2•h));截留率(以百分率%表示);化学物理稳定性(包括机械强度)等。
 超滤装置由若干超滤组件构成。分为板框式、管式、螺旋卷式和中空纤维式四种主要类型。
 由于超滤法处理的液体多数是含有水溶性生物大分子、有机胶体、多糖及微生物等。这些物质极易粘附和沉积于膜表面上,造成严重的浓差极化和堵塞,这是超滤法最关键的问题,要克服浓差极化,通常可加大液体流量,加强湍流和加强搅拌。

 2.3.4 冰冻干燥
 冰冻干燥机是生化与分子生物学实验室必备的仪器之一,因为大多数生物大分子分离纯化后的最终产品多数是水溶液,要从水溶液中得到固体产品,最好的办法就是冰冻干燥

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