模体分析方法

① 利用放射性测量方法进行工程检测时，为什么特别需要注意安全问题

从事放射卫生防护评价与检测机构需要具备的条件
一、机构条件
(一)具有法人资格;
(二)能独立开展相应技术服务工作;
(三)有固定的办公场所和从事相应技术服务的工作场所、工作条件;
(四)岗位设置合理，职责明确;
(五)通过计量认证，并具有完善的质量保证体系;
(六)具有《放射工作卫生许可证》。
二、人员要求
(一)基本条件
1、有与其申请技术服务项目相适应的管理、技术和质量控制人员。
2、熟悉相关法律、标准和文件以及本单位质量管理手册。
3、专业技术负责人应精通本专业业务，专业人员的专业与申请的技术服务项目相一致。
4、专业技术人员必须经省级培训并考核合格后持证上岗。
(二)有关人员具体条件
1、申请放射卫生防护检测与评价的，应当有项目评价、放射卫生防护检测和质量控制等方面的专业技术人员。
项目评价、放射卫生检测和质量控制方面的技术负责人必须具有相关专业副高级以上专业技术职称，并从事相关专业工作5年以上。卫生检验方面技术负责人应当具有中级以上专业技术职称，从事相关专业工作3年以上。
中级以上技术职称的专业人员人数不得少于专业人员总数的30%。
2、外聘(含返聘)技术人员不得超过从事该项目总人数的20%，技术负责人不得外聘。
三、仪器设备
(一)申请单位应当具有所申请的技术服务项目所必需的仪器设备：
项目名称主要设备名称
医用辐射卫生防护诊断X射线机X、γ射线测量仪、环境X、γ剂量率仪、诊断X射线机(不包括CT机、DSA)质量控制X射线剂量仪、数字式X射线曝光时间测量仪、千伏(kVp)测量仪、X射线质控检测工具
X射线CT机质量控制CT剂量仪/专用电离室、性能检测模体、头部剂量模体、体部剂量模体
X射线数字减影装置(DSA)质量控制X射线剂量仪、数字式X射线曝光时间测量仪、kVp测量仪、DSA性能检测模体、X射线质控检测工具
放射治疗装置(钴-60治疗机、后装治疗机、医用加速器、γ刀、深部治疗机、模拟定位机)放疗剂量仪/电离室、标准充水模体、热释光测量装置、中子测量装置、扫描水箱、低感光度胶片、环境X、γ剂量率仪、α、β表面污染监测仪、X、γ射线测量仪
核医学设备(SPECT 、PET、γ照相机)X、γ射线测量仪、环境X、γ剂量率仪、α、β表面污染监测仪、风速仪、SPECT性能测试模体、PET性能测试模体
非医用辐射的卫生防护检测非医用加速器(不包括中(高)能加速器) 、中子发生器、X、γ剂量率仪、热释光测量装置、中子测量装置、环境X、γ剂量率仪、工业射线探伤机、核子计、测厚仪、料位计等小型密封型放射源、X射线衍射仪X、γ剂量率议、环境X、γ剂量率议、α、β表面污染监测仪非密封型放射源应用X、γ剂量率议、环境X、γ剂量率议、α、β表面污染监测仪、空气取样装置、低本底α、β测量仪
职业人员个人剂量监测X、γ射线个人剂量监测热释光剂量元件、热释光测读装置、退火装置。
中子射线个人剂量监测中子测量用径迹片、蚀刻装置、显微镜或其他测读装置、中子测量用径迹片、蚀刻装置、显微镜或其他测读装置、热释光剂量元件、热释光测读装置、退火装置。
β射线个人剂量监测β射线个人剂量计、β射线个人剂量测读装置。
人淋巴细胞染色体畸变分析光学显微镜、培养箱、超净工作台
淋巴细胞微核实验光学显微镜、培养箱、超净工作台
环境与生物样品的放射性测量环境样品(大气、水、土壤及其他固体，疑被污染的各类场所)空气取样装置、低本底α、β测量仪、低本底α能谱仪、γ能谱仪、环境X、γ剂量率仪、灰化装置
生物样品(粮食、蔬菜、水果等食品，动物、人体组织和器官，毛发等)低本底α、β测量仪、低本底α能谱仪、γ能谱仪、环境X、γ剂量率仪、灰化装置
氡(室内、外，矿山、水、土壤)氡测量仪、固体径迹探测元件、元件测读装置、核设施与辐照装置等大型设施检测(核电站、核反应堆、辐照加工装置、中(高)能加速器)X、γ剂量率仪、放疗剂量仪、γ能谱仪、低本底α、β测量仪、低本底α能谱仪、环境X、γ剂量率仪、低本底液闪测量仪、中子测量仪
(二)仪器设备的种类、数量、性能、量程、精度应能满足工作的需要，并能良好运行。
(三)仪器设备应定期进行计量检定，并贴有检定或校验标识。无计量检定规程的仪器设备，应有自行编制的校验和检验方法并进行定期校验。
(四)仪器设备应有完整的操作规程。
四、其他要求
(一)检测实验室应当有良好的内务管理，以保证实验室整洁有序。检测仪器放置合理，便于操作。并配有必要的防污染、防火、控制进入等安全措施。
(二)凡是检测方法或检测仪器有要求的，应按要求对检测场所的温度、湿度和放射性本底等环境条件进行有效、准确的测量并记录。
(三)检测方法应尽可能采用国际、国家、行业或地方规定的方法或标准。必要时应备有检测方法细则、仪器操作规程、样品管理程序和数据处理规则等作业指导文件。
(四)职业卫生技术服务机构应编制质量管理手册，并严格开展质量控制。
(五)应当为检验样品建立唯一识别系统和状态标识。应当编制有关样品采集、接收、流转、保存和安全处置的书面程序。
(六)原始记录和检测报告应按照各自的要求，包含有足够的信息，并且按照规定书写、更改、审核、签章、分发和保存。
(七)放射性检测场所，应当符合放射卫生有关法规、规章和标准的要求。有使用放射性标准源或有证标准物质控制检测质量的措施。有参与实验室间检测能力验证活动的纪录。
(八)开展放射卫生技术服务的机构应有与其相适应的经费保障。

② degs分析是什么意思

differentially expressed genes差异表达基因。

利用挖掘所得的知识和信息进行线性模体相关方法学研究，并以此搭建用于域/肽识别抑制剂设计的计算平台。

以PSD-95蛋白的PDZ3结构域为具体对象，利用新收获的理论知识和方法策略设计、合成、测试和构效研究一系列对该域具有高亲和力的肽配基；并利用实验结论反回去修正理论模型,实现干湿相济。

线性模体是在序列局部范围决定蛋白质特定生物学功能的氨基酸特征排列模式；先前对其研究多在一级序列水平开展，却无法阐释其行使生物职能的深层次分子基础。本项目拟利用目前丰富的蛋白质三维结构数据对线性模体在域/肽识别和相互作用中所扮演的角色进行深度探索。

目的是揭示隐藏于线性模体序列表象之下的物理化学本质，进而在结构层次发展用于其生物信息分析处理的新方法和新工具。研究内容主要包括三个依次递进的方面。

③ 模体（motif）英文解释是什么

模体(motif)表示具有特定功能的或作为一个独立结构域一部分的相邻的二级结构的聚合体，它一般被称为功能模体（functional motif）或结构模体（structural motif），相当于超二级结构（super-secondary structure）。模体和结构域一起组成了蛋白质的三级结构。

结构模体作为结构域的组分，介于蛋白质二级结构和三级结构之间，由相邻的二级结构单元彼此相互作用，组合在一起，排列成规则的，在空间结构能够辨认的二级结构组合体，并充当三级结构的构件，其基本形式有aa、bab和bbb等。多数情况下，只有非极性残基侧链参与这些相互作用，而亲水侧链多在分子的外表面。
常见模体：
（1）左手超螺旋——3根右手a-螺旋拧到一起形成一个左手超螺旋；
（2）右手超螺旋——3根左手螺旋拧到一起形成一个右手超螺旋，如胶原蛋白；
（3）卷曲螺旋——相邻的2根右手a-螺旋拧到一起形成一个左手超螺旋；
（4）螺旋束——多个a-螺旋的聚合体；
（5）b-折叠-a-螺旋-b-折叠，即bab；
（6）b-发夹环——两个反平行b-股由一个环相连；

（7）a-螺旋-b-转角-a-螺旋，即aba；
（8）a-螺旋-环-a-螺旋(EF手相）；
（9）Rossmann卷曲——也称Rossmann折叠，它由两个bab连在一起，形成babab结构，通常能结合辅酶I；
（10）希腊钥匙模体——是一种全b折叠聚合体，存在于许多不同类型的蛋白质中，因在拓扑学上像古代花瓶上的希腊钥匙而得名，清蛋白原就含有这种模体。
模体是刻画蛋白质家族组成结构和执行功能的重要部分,但是对于通过各种生物信息学方法识别出的模体,目前没有很好的办法辨别真假和优劣.文中提出一种新的模体评价策略,从分类器的观点出发,对不同方法在同一个蛋白质家族上建立的不同模体进行比较,从而推断出最具有生物意义的模体.本文在PROSITE数据库中选取7个细胞因子家族,采用MEME和HMMER两种模体识别方法分别识别每个家族的模体,将每个模体看作一个分类器,通过计算同一家族的每个模体的敏感性和特异性并比较它们对应的接收机操作特性曲线,进而比较不同模体,确定真的模体和排除假的模体,从而获得每个蛋白质家族的最佳模体的模型.这种策略可以应用于对任意蛋白质家族模体识别结果的评价.此外,还可以利用最佳模体搜索数据库的结果预测每个家族的新成员.

④ 吸塑铜模的好坏关键在哪

1、吸塑局部采用铜抽芯，全铜价格太高了。
看看冰箱内胆真空成型模具设计方法.领悟吧！
模具是决定冰箱内胆真空成型质量和产量的关键。冰箱内胆真空成型模具的结构不同于其它塑料模具, 不同的真空成型设备, 其模具结构也有很大差别。由于成型工艺的特殊性, 使得此类模具设计更具点特色。
当然, 作为塑料模具的一种, 它也存在塑料模具设计的一些共性, 如成型模型腔设计、抽芯机构设计和冷却系统设计等。在设计程序上与其它料模具设计基本相同, 一般按以下程序设计。
2.1、搜集、分析和消化原始资料。接受模具设计任务后, 应做下列一些工作：
1、分析制品：从制品的几何形状、尺寸精度、拉伸比、圆角、脱模斜度、加强筋及材质等方面分析塑料件结构是否符合真空成型工艺要求。通常, 因真空成型制品容易变形, 其几何形状和尺寸精度要求不能太高，理论上以拉伸比为0.5左右较合适, 但箱胆成型的拉伸比往往会大于此值, 此时可以采取吹泡预拉伸成型,否则制品壁厚不均匀, 容易被拉破, 特别要注意某些局部凸起部分不能太高，拐角处不能有锐角, 圆弧半径不能小于板材厚度，门胆的脱模斜度一般为“0.5 °一3 °”, 但箱胆较深有的达620（如340内胆）, 为了与搁架配合良好, 其脱模斜度宜小些, 最小可达0.25 °, 因此必须采用压缩空气辅助脱模；为了提高制品的刚性, 在适当部位应设置加强筋。塑料件结构是否合理还与所选成型材料的性能有关，如果制品结构不能满足这些要求, 必要时还应与产品设计人员共同探讨修改制品结构或另选成型材料, 以满足制品成型质量和成本的要求。
2、分析工艺资料：
分析厂家提出的成型方法、成型设备、材料规格、生产率等要求是否合理, 能否落实。即分析采用连体模成型,冷藏室和冷冻室内胆同时成型,还是单体模成型, 用什么类型的设备成型等.所选材料规格能否满足成型需要.采用手工切边还是自动切边, 能否满足生产率要求, 模具设计是否要考虑切边装置等。
3、熟悉有关参考资料和工厂实际情况：
熟悉一些设计标准和同类模具图纸资料、成型设备说明书等。到使用部门走访有关工艺技术人员和生产人员, 了解设备实际使用情况、操作人员技术水平、最常出现的与模具有关的成型质量问题等, 为模具设计准备更充分的第一手资料。
2.2、制定成型工艺。
通常由成型工艺人员根据制品成型要求制定成型工艺, 并提出模具设计任务书, 由模具设计人员进行模具设计, 但有时工厂往往会将这两项工作合并起来做, 也就是说, 模具设计人员在进行模具设计之前, 还应制定合理的成型工艺, 为后面的模具设计打下基础。此时, 应结合节中提出的问题进行综合考虑。
2.3、熟悉成型设备技术规范：
成型工艺中仅仅对成型设备的类型、型号做出粗略的选择, 这种选择远远不能满足模具设计的需要, 还必须熟悉设备的有关技术规范。比如, 模具安装方式、接口尺寸、切边装置安装尺寸、连体模中隔板位置与尺寸、真空室密封原理与结构、最大抽真空度、成型合模、预拉伸、脱模用压缩空气的工作压力、加热方式与加热温度调节、冷却方式, 以及冷却系统布置等。
2.4、模具设计
（1）成型体设计-凸模
成型体设计是真空成型模具设计的重点。成型体设计主要考虑塑料件的收缩、表面粗糙度、脱模斜度、抽气孔的大小与布置、冷却系统布置、抽芯机构的安装与配合、成型体与模座之间的装配关系, 以及模具材料等。
①塑料件的收缩率计算方法与注射模的收缩率计算方法相同, 但精确度可以适当降低, 因为真空成型塑料件的收缩量有50%是在脱模后产生的。不过对有公差要求的局部尺寸还是要想办法严格保证。为了提高内胆表面质量, 国内大多数生产厂家都采用凸模成型, 但也有少数厂家采用凹模成型, 凹模成型的收缩量一般比凸模成型的收缩量大25%一50%，设计时应充分注意这一点。冰箱内胆成型材料一般使用ABS或HIPS板材, ABS板材的收缩率一般为0.4%一0.8%; HIPS板材的收缩率一般为0.5%一0.7%。影响塑料件收缩率的因素很多, 如板材加热温度、模具温度、模具结构、塑料材质等, 可参考厂家的其它同类模具, 采用类比法确定收缩率如果要求较高, 也可先通过简易模具试模, 测定其收缩率。
②成型体的表面粗糙度对塑料件质量和脱模有很大影响。因真空成型模具一般没有顶出装置, 靠压缩空气辅助脱模, 表面粗糙度要求太高, 对脱模不利, 且加工成本高。而表面粗糙度要求太低, 不符合塑料件质量要求, 因此, 综合考虑, 成型面的表面粗糙度一般取Ra0.4一0.8。精加工后进行表面氧化处理。③脱模斜度应保持与塑料件设计的斜度一致。④为了便于模具制造、安装及维修, 提高模具制造质量, 一般将模具分为成型体和模座两部分分别进行设计、制造, 这就要求考虑好它们间的装配关系。⑤冰箱内胆产量大、生产率高, 对成型模具要求高。因此, 成型体及模座材料一般采用ZL105, 铸件不允许有砂眼、气孔、缩孔、缩松等缺陷。
（2）抽芯机构设计：
冰箱内胆壁薄, 强度低, 容易被拉破, 一般不宜采用强制脱模, 而应采用抽芯脱模。抽芯的方式有直抽芯和斜抽芯两种, 设计时应注意以下几点：①根据抽芯部位结构特点, 灵活设计抽芯机构。直抽芯必须依靠气缸来完成，斜抽芯既可用气缸也可不用气缸, 还可利用脱模力来直接实现（如350冰箱）。在利用气缸合模与脱模的直抽芯机构设计中, 必须根据合模力及抽芯距离选择气缸的缸径与行程。但在斜抽芯机构设计时, 应设法将活动块受到的吸附力传递到模体上, 以减小气缸的缸径, 甚至省去气缸。辅助脱模所用气缸的缸径及行程应根据机构运动所需动力及斜滑块运动行程来选择。②活动块与模体之间分型面的选取应避免让分型面在塑料件上留下痕迹, 因此分型面一般选取在活动块的拐角处, 或者选取在易被其它结构件搁架遮住的部位。③活动块与模体间的配合间隙对活动块的运动及塑料件表面质量有很大影响。一般单边间隙控制在0.05一0.1mm, 有时最大可达到0.2一0.25mm。活动块与模体的成型面高度差应控制在0一0.1mm范围内。④大型活动块上也应设置冷却水管, 进出口采用软管连接。⑤为了保证活动块复位准确、运动顺畅, 应设有导向装置和限位装置。⑥反复承受摩擦的小活动块应采用铜制件, 大型活动块可采用摩擦面镶铜边, 以避免发生“ 咬死”现象。
(3)、抽气孔设计
为了顺利实现抽真空, 成型体表面必须打抽气孔, 且抽气孔应开设在最后贴合成型的部位。在不影响内胆表面质量的前提下, 抽气孔的孔径应偏大,以提高抽真空速率, 这对提高成型质量和生产率有利。
一般在大平面上, 孔径为0.7mm, 孔距为50--80mm.在不易抽真空的角隅处, 孔径为1.0mm, 孔距为20一40在mm，形状复杂的部位, 应集中布置抽气孔。模具毛坯一般采用铸造成型, 壁厚较大, 可以先在模具内侧用Φ4mm或Φ6mm的钻头钻成大孔,在距表面一处改用小钻头钻透至成型表面。
(4)、模座设计：
模座设计的关键是要注意模座与成型体之间的装配关系、模座在成型设备上的安装方式及其接口尺寸, 水、气连接方式及接口尺寸。成型设备不同,模座结构设计有很大差别, 要根据设备而定。对于箱胆连体模, 两个内胆必须同时分别被吹泡预拉伸,两个成型体之间有中隔板（钢丝）。模座中隔板的位置必须与成型设备上方压边框的中间压板位置相对应。两个成型体之间的距离应根据上下内胆中间边的大小来确定, 一般两者相等, 即从中间划开后不需要再切边。有些厂家已实现两胆联体装配生产, 不需要从中间划开。
（5）、加热和冷却系统设计：
模具工作温度对成型质量和生产率有很大影响。模具温度通过埋设在其内的水道的循环水来调节, 使用ABS板材的成型模具, 其工作温度一般要控制在72 ℃一80℃ 。
成型体内壁上必须按一定要求布满水道。水道可以是管径Φ12mmX1mm或Φ14mmX1mm的无缝不锈钢管或紫铜管, 两管之间的中心距离为80mm一100mm, 水管距模具端面的距离一般为40mm一60mm,水管表面距成型面最近处距离不小于8mm， 一般水管中心与成型面的距离为水管直径的1一2倍,若距离太小, 容易使塑料件产生冷斑，距离太大时,传热效果不好。拐角处不允许过分弯曲水管, 要保证水流通畅布置水管时要注意不影响抽气孔的开设。
对于模座, 一般在模座与成型体接合处的下方沿周向布置根水管即可。水管的埋设方法有两种：一种是在铸造模体毛坯时预埋，另一种是在加工模体时镶嵌人内, 并用锡铅合金密封。水管接好后, 应进行一压力试验, 检查其气密性。
（6）、密封结构设计：
为了抽真空, 在模具与板材之间必须形成封闭的空腔, 为此模具上必须设有相应的密封结构。成型设备不同, 密封结构有所不同, 一般是在模具的适当部位开设矩形槽, 在槽内嵌人圆截面的橡胶密封条。对于门胆模具, 有时是利用上压框将塑料板材直接压紧在模具边沿上而形成密封。
（7）、切边装置设计：
无论是手动切边还是机器自动切边, 在成型过程中, 为了抽真空, 设备上方都有一个压边框将板材紧紧地压在设备台面板的下压框或模具的边沿上。如果是手动切边, 则在上压边框的下面装有切刀, 成型时在板料周围压制出一条细槽,
然后靠人工沿细槽将边角余料切下，如果是机器自动切边, 则在上压边框的下面装有细锯齿形的矩形截面压边条, 保证压紧, 成型后将塑料件输送到专用切边机上切下边角余料。因此, 要正确设计压边框与模具的相对位置, 确保制品外形尺寸准确。
四、结语
冰箱内胆真空成型模具设计与其它塑料成型模具设计有相同的地方, 但更有它的特点。

⑤ 请问多肽链中氨基酸序列分析主要特点是什么

三、蛋白质的分子结构1.
蛋白质一级结构：概念：指多肽链中氨基酸的排列顺序。主要化学键：肽键。2.
蛋白质的二级结构：概念：蛋白质分子中某一段肽链的局部空间结构，即该段肽链主链骨架原子的相对空间位置，并不涉及氨基酸残基侧链的构象
。主要化学键：氢键
肽单元：参与肽键的6个原子Ca1、C、O、N、H、Ca2位于同一平面，Ca1和Ca2在平面上所处的位置为反式(trans)构型，此同一平面上的6个原子构成了所谓的肽单元
(peptide
unit)
。四种主要结构形式（α螺旋、β折叠、β转角、无规则卷曲）。模体：在许多蛋白质分子中，可发现二个或三个具有二级结构的肽段，在空间上相互接近，形成一个特殊的空间构象，被称为模体(motif)。常见的有：钙结合蛋白中结合钙离子的模体、锌指结构。
氨基酸残基的侧链对二级结构形成的影响：一段肽链其氨基酸残基的侧链适合形成a-螺旋或β-折叠，它就会出现相应的二级结构。
3.
蛋白质的三级结构：概念：整条肽链中全部氨基酸残基的相对空间位置。即肽链中所有原子在三维空间的排布位置。主要次级键——疏水作用、离子键（盐键）、氢键、范德华力等，结构域（domain）：大分子蛋白质的三级结构常可分割成一个或数个球状或纤维状的区域，折叠得较为紧密，各行使其功能，称为结构域(domain)
。分子伴侣(chaperon)：通过提供一个保护环境从而加速蛋白质折叠成天然构象或形成四级结构。4.
蛋白质的四级结构：概念：蛋白质分子中各亚基的空间排布及亚基接触部位的布局和相互作用，称为蛋白质的四级结构。亚基：有些蛋白质分子含有二条或多条多肽链，每一条多肽链都有完整的三级结构，称为蛋白质的亚基
(subunit)。各亚基之间的结合力：疏水作用、氢键、离子键。

⑥ 从生物化学角度比较核酸二级结构与蛋白质二级结构的特点

核酸二级结构一般是指DNA双螺旋结构，RNA一般比较flexible，以线性存在，但在分子生物学中也经常出现RNA二聚体这样的形式，或像tRNA这样的也具有二级结构
蛋白质的二级结构指的是在其一级结构的基础上进一步折叠，其中可看到的折叠形态有alpha helices, beta sheets, beta turn和一些loop结构，这些结构一起构成了蛋白质的二级结构

⑦ 关于论文前言

我是复制的，希望对楼主能有所帮助

※ Multiplexing：一种同时采用多种样品的测序方法，能够大大提高测序速度。
※ 突变（Mutation）：DNA序列上任一种可以被遗传的变易。
※ 核苷酸（Nucleotide）：DNA和RNA的基本组成部分，通常包含一分子核糖，一分子磷酸和一分子碱基。多个核苷酸通过磷酸二酯键连接成一条链状。
※ 细胞核（Nucleos）：真核细胞中的一种细胞器，内含遗传物质。
癌基因（Oncogene）：一种能够导致癌症的基因。许多致癌基因都直接或间接地控制细胞的成长速度。
※ 噬菌体（phage）：一种以细菌为宿主细胞的病毒。
※ 物理图谱（Physics Map）：物理图谱描绘DNA上可以识别的标记的位置和相互之间的距离(以碱基对的数目为衡量单位)，这些可以识别的标记包括限制性内切酶的酶切位点，基因等。物理图谱不考虑两个标记共同遗传的概率等信息。对于人类基因组来说，最粗的物理图谱是染色体的条带染色模式，最精细的图谱是测出DNA的完整碱基序列。
※ 质粒（Plasmid）：质粒是细菌的染色体外能够自我复制的环状DNA分子。它能够和细胞核中的染色体明显地区别开来，而且并不是细胞生存的必要物质。一些质粒适宜于引入到宿主细胞中去，并利用宿主细胞的DNA大量繁殖，因此我们常常采用质粒作为外源DNA的载体，外源DNA借助于质粒在宿主细胞中大量繁殖。
※ 多基因病（Polygenic Disorder）：有多个基因位点共同决定的遗传病（如心脏病、糖尿病、一些癌症等）。这类疾病的遗传由多个基因位点共同控制，因而比单基因病的遗传更为复杂。
※ 多聚酶链式反应（PCR）：一种体外扩增DNA的方法。PCR使用一种耐热的多聚酶，以及两个含有20个碱基的单链引物。经过高温变性将模板DNA分离成两条链，低温退火使得引物和一条模板单链结合，然后是中温延伸，反应液的游离核苷酸紧接着引物从5‘端到3’端合成一条互补的新链。而新合成的DNA又可以继续进行上述循环，因此DNA的数目不断倍增。
※ 多聚酶（Polymerase）：多聚酶具有催化作用，能够加快游离的核苷酸和DNA模板结合形成新链的反应速度。
※ 多态性（Polymorphism）：多个个体之间DNA的差异称为多态性。DNA变异概率超过1％的变异，比较适宜作为绘制连接图谱的证据。
※ 引物（Primer）：预先制备的比较短的核苷酸链，在新链合成过程中作为引物，游离的核苷酸在引物之后按顺序和模板上的碱基结合，形成新链。
※ 原核生物（Prokaryote）：原核生物没有细胞膜，结构清晰的核以及其他细胞器。细菌是原核生物。
※ 探针（Probe）：是一条DNA单链或者一条RNA链，具有特定的序列，并且使用放射性元素或者免疫特性物质进行标记。探针和克隆库中的某条互补片段结合成一条双链结构，我们可以借助于探针的检测来获知与其互补的链的位置。
※ 启动子（Promoter）：DNA上的一个特定位点，RNA聚合酶在此和DNA结合，并由此开始转录过程。
※ 蛋白质（Protein）：一种由一条或者多条肽链构成的大分子。每条肽链上核苷酸的顺序是由基因外显子部分的碱基序列决定的。蛋白质是细胞、组织和器官的重要组成部分，每种蛋白质都具有特定的功能。酶、抗体和激素等都是蛋白质。
※ 嘌呤（Purine）：一种含氮的单环结构物。是核苷酸的重要组成部分，有腺嘌呤A和鸟嘌呤G两种。
※ 嘧啶（Pyrimidine）：一种含氮的双环结构，是核苷酸的重要组成部分。分为胞嘧啶C，胸腺嘧啶T和尿嘧啶U三种。
※ 重组克隆（Recombinant Clone）：将不同来源的DNA片段合成在一个DNA分子中，这种技术称为重组，得到的分子为重组克隆。
※ DNA重组技术（Recombinant DNA Technology）：在细胞体外将两个DNA片段连接成一个DNA分子的技术。在适宜的条件下，一个重组DNA分子能够被引入到宿主细胞中并在宿主细胞中大量繁殖。
※ 调控序列（regulatory regions and sequence）：一段控制基因表达的DNA片段。
※ 限制性内切酶（Restriction enzyme， endonuclease）：这种酶能够识别出DNA上特定的碱基序列，并在这个位点将DNA酶切。细菌中有400中限制性内切酶，能够识别出100中DNA序列。
※ 酶切位点（Restriction Enzyme cutting site）：DNA上一段碱基的特定序列，限制性内切酶能够识别出这个序列并在此将DNA酶切成两段。
※ 限制性长度多态性（Restriction fragment length polymorphsm）：从不同个体制备的DNA，使用同一种限制性内切酶酶切，切得的片段长度各不相同。酶切片段的长度可以作为物理图谱或者连接图谱中的标记子。通常是在酶切位点处发生突变而引发的。
※ 核糖核酸RNA（Ribonucleic acid）：从细胞的细胞核和细胞质部分分离出来的化学物质。在蛋白质合成和其他生化反应中起着重要作用，RNA的结构和DNA的结构类似，都是有核苷酸按照一定顺序排列成的长链。RNA可以分为信使RNA、转运RNA、核糖体RNA以及其他类型的RNA。
※ 核糖体RNA（Ribonsomal RNA rRNA）：存在于核糖体中的RNA。
※ 核糖体（Ribonsome）：细胞质中含有rRNA和相关蛋白质的细胞器，是蛋白质的合成场所。
序列位置标签（Sequence Tagged Site, STS）：一段短的DNA序列（200－500个碱基对），这种序列在染色体上只出现一次，其位置和碱基顺序都是已知的。在PCR反应中可以检测处STS来，STS适宜于作为人类基因组的一种地标，据此可以判定DNA的方向和特定序列的相对位置。ETS是cDNA上的STS。
※ 性染色体（Sex Chromosome）：在人类细胞中是X或者Y染色体，性染色体决定了个体的性别。雌性细胞中含有两个X染色体，而雄性细胞中含有1个X染色体和1个Y染色体。
※ 鸟枪法（Shotgun method）：使用基因组中的随机产生的片段作为模板进行克隆的方法。
※ 单基因病（Single Gene Disorder）：一个基因的等位基因之间发生了突变造成的疾病。
※ 体细胞（Somatic Cells）：个体中除了生殖细胞及其母细胞之外的细胞，都是体细胞。
※ 串联重复序列（Tandem repeat sequences）：在染色体上一段序列的多次重复，称为串联重复序列。常用来作为物理图谱中的标记子。
※ 端粒（Telomere）：是染色体的末端部分，这一特殊结构区域对于线型染色体的结构和稳定起重要作用。
※ 转录（Transcription）：以某一DNA链为模板，按照碱基互补原则形成一条新的RNA链的过程，是基因表达的第一步。
※ 转运RNA（tRNA）：转运RNA具有特殊的结构，其一端包含3个特定的核苷酸序列，能和信使RNA上的密码子按照碱基配对原则进行结合。另一端则带有一个氨基酸。因此转运RNA能够同细胞质中游离的氨基酸结合并运到核糖体上，核糖体按mRNA上的遗传信息将氨基酸装配成蛋白质。
※ 转化（Transformation）：将外源DNA整合到某一细胞基因组中的过程。。
※ 翻译（Translation）：mRNA上携带的遗传信息指导蛋白质的合成过程，称为翻译。
※ 病毒（Virus）：一种不具备细胞结构的生物体。只能寄生在宿主细胞中才能生存。病毒一般包含核酸以及外壳蛋白，有些动物的病毒的外面也偶尔覆盖一层细胞膜。病毒进入宿主细胞之后，利用宿主的合成机制复制出大量的后代。。
※ 酵母菌人工合成染色体（Yeast Artificial Chromosome）：一种能够克隆长达400Kb的DNA片段的载体，含有酵母细胞中必需的端粒、着丝点和复制起始序列。
(卜东波、伍树明翻译整理)
生物信息名词
§§§ BLAST （Basic Local Alignment Search Tool），基本的基于局部对准的搜索工具；一种快速查找与给定序列具有连续相同片断的序列的技术。
§§§ Entrez 美国国家生物技术信息中心所提供的在线资源检索器。该资源将GenBank序列与其原始文献出处链接在一起。
§§§ NCBI 美国国立生物技术信息中心（National Center for Biotechnology Information），1988年设立，为美国国家医学图书馆（NLM）和国家健康协会（NIH）下属部门之一。提供生物医学领域的信息学服务，如世界三大核酸数据库之一的GenBank数据库，PubMed医学文献检索数据库等。
§§§ Conserved sequence 保守序列。演化过程中基本上不变的DNA中的碱基序列或蛋白质中的氨基酸序列。
§§§ Domain 功能域。蛋白质中具有某种特定功能的部分，它在序列上未必是连续的。某蛋白质中所有功能域组合其起来决定着该蛋白质的全部功能。
§§§ EBI 欧洲生物信息学研究所（European Bioinformatics Institute）。 The National Center for Biotechnology Information (NCBI) at the NationalLibrary of Medicine (NLM), National Institutes of Health (NIH)
§§§ EMBL 欧洲分子生物学实验室（uropean Molecular Biology Laboratory）。
§§§ GenBank 由美国国家生物技术信息中心提供的核酸序列数据库。
§§§ Gene 基因。遗传的基本的物理和功能单位。一个基因就是位于某条染色体的某个位置上的核苷酸序列，其中蕴含着某种特定功能产物（如蛋白质或RNA分子）的编码。
§§§ DUST A program for filtering low complexity regions from nucleic acid sequences.
§§§ Gene expression 基因表达。基因中的编码信息被转换成行使特定功能的结构产物的过程。
§§§ Gene family 基因家族。一组密切相关的编码相似产物的基因。
§§§ Gene mapping 基因作图。对DNA分子（染色体或质粒）中基因的相对位置和距离进行确定的过程。
§§§ Genetic code 遗传密码。以三联体密码子的形式编码于mRNA中的核苷酸序列，决定着所合成蛋白质中的氨基酸序列。
Genome 基因组。某一物种的一套完整染色体组中的所有遗传物质。其大小一般以其碱基对总数表示。
§§§ Genomics 基因组学。从事基因组的序列测定和表征描述，以及基因活性与细胞功能关系的研究。
§§§ HGMP 英国剑桥的人类基因组绘图计划（Human Genome Mapping Project）。
§§§ Informatics 信息学。研究计算机和统计学技术在信息处理中的应用的学科。在基因组计划中，信息学的内容包括快速搜索数据库方法的开发、DNA序列信息分析方法的开发和从DNA序列数据中预测蛋白质序列和结构方法的开发。
§§§ Physical map 物理图谱。不考虑遗传，DNA中可识别的界标（如限制性酶切位点和基因等）的位置图。界标之间的距离用碱基对度量。对人类基因组而言，最低分辨率的物理图谱是染色体上的条带图谱；最高分辨率的物理图谱是染色体中完整的核苷酸序列。
§§§ Promoter 启动子。DNA中被RNA聚合酶结合并从此起始转录的位点。
§§§ Proteome 蛋白质组。一个基因组的全部蛋白产物及其表达情况。
§§§ Regulatory region or sequence 调控区或调控序列。控制基因表达的DNA碱基序列。
§§§ Ribosomal RNA 核糖体RNA。简写为rRNA。是一组存在于核糖体中的RNA分子。
§§§ Sequence tagged site 序列示踪位点，简写为STS。在人类基因组中只出现一次的位置和序列已知的长约200到500bp的短DNA序列片断。由于可以通过PCR检测到，STS在将来源于许多不同实验室的基因图谱和测序数据进行定位和定向时非常有用，并且STS在人类基因组的物理图谱中也具有界标的作用。表达的序列标签（ESTs）就是那些得自cDNAs的STSs。
§§§ Single-gene disorder 单基因病。由单个基因的等位基因的突变所导致的遗传病（如杜兴肌营养不良和成视网膜细胞瘤等）。
§§§ UniGene 美国国家生物技术信息中心提供的公用数据库，该数据库将GenBank中属于同一条基因的所有片断拼接成完整的基因进行收录。
§§§ 非蛋白质编码区（“Junk”DNA）占据了人类基因组的大部分，研究表明“Junk”是许多对生命过程富有活力的不同类型的DNA的复合体，它们至少包括以下类型的DNA成份或由其表达的RNA成分：内含子（intron）、卫星（Satellite）DNA、小卫星（minisatellite）DNA、微卫星（microsatellite）DNA、非均一核RNA（hmRNA）、短散置元（short interspersed elements）、长散置元（long interspersed elements）、伪基因（pseudogenes）等。除此之外，顺式调控元件，如启动子、增强子等也属于非编码序列。
双重序列对比 两序列间的对比分析。最常见的方法为Needle-Wunsch方法。能够利用的软件如BLAST、FASTA等。
§§§ Autosome 常染色体。与性别决定无关的染色体，人双倍体染色体组含有46条染色体，其中22对常染色体，一对与性别决定有关的性染色体（X和Y染色体）。
sex chromosome. 包括序列（核酸与蛋白）搜索，结构比较，结构预测，蛋白质域，模体（Motif ），测序，发育与进化分析，双向电泳成像分析，质谱蛋白质鉴定，三维蛋白结构模建与成像，基因组图谱比较，基因预测，非编码区功能位点识别，基因组重叠群集装，后基因组功能分析，结构基因组学以及药物基因组学等等。
在BLAST2.0，2.05新版中启用了gapped BLAST、PSI-BLAST 和PHI-BLAST。gapped BLAST是比原BLAST 更灵敏更快的局部相似联配（俗称局部同源）搜索法；PSI- BLAST用迭代型的剖面打分算法，每次迭代所费时间与前者相同，它可检索弱同源的目标；PHI-BLAST 98年刚出台，是模体（Motif ）构造与搜索软件，是更灵敏的同源搜索软件。例如线虫§§§ 的CED4是apoptosis 的调控蛋白，含有涉及磷酸结合的P 环模体，在各种ATP 酶和GTP 酶中可发现。在用gapped BLAST搜索NR数据库时，CED4仅跟人凋亡调控蛋白Apaf-1显着同源或相似（其中含有P-loop保守区）。但PHI- BLAST搜索，另有一个显着同源（E=0.038 ）目标，是植物抗病蛋白Arabidopsis thaliana T7N9.18，证实此动物与植物蛋白确实在apoptosis 中有相似的功能。另有，按PHI- BLAST搜索在MutL DNA修复蛋白中的ATP 酶域，II型拓扑异构酶，组氨酸激酶和HS90家族蛋白，发现一个新的真核蛋白族，共有HS90型ATP 酶域。再有在古核tRNA核苷酸转移酶中发现核苷酸转移酶域，在细菌DNA 引物酶的古核同源体中发现螺旋酶超家族II的模体VI。用以往的搜索法这些是得不到的。
深层事项：
后基因组时期的主要任务：Data mining ，即从完全测序的基因组中预测功能。
1 、序列、结构和功能 自分子生物学产生以来，均相信序列决定结构，结构决定功能。随着基因组学的发展，对此理解已有长足的深化。同源序列（具有共同祖先）未必具有相同的功能；相同功能未必源自同源序列。相异序列可能有相似的结构；序列与结构不相似的蛋白可能会有相似的功能。现在发现存在不相似（在序列与结构水平上）酶催化相同的生化反应。当然亦存在甚至结构水平上很相似的酶催化不同的生化反应。例如人与鼠的3?- 羟甾类脱氢酶，1AHH和1RAL；前者是Rossmann折叠，而后者是TIM-桶。肯定，这些相似酶不是共同祖先趋异的结果，而是不同祖先趋同的结果。如结构决定功能还是合理的，那么至少在功能活性位点具有相似结构特征（即3D- 功能模体）。属于今后研究的课题，对了解酶催化机制与功能蛋白的小分子模拟具有很大价值。 何谓功能？功能有层次的：表型的，细胞的和分子的。 目前开始高层功能预测，分子相互作用、代谢途径和调控网络。目前，已从结构基因组学，功能基因组学和蛋白质组学多种角度研究基因组功能。
2 、结构基因组学中的生物信息学 希望大通量地测定和模建完全测序基因组的全部蛋白三维结构。生物信息学可以发挥作用，一方面规划好测定的对象，另一方面可靠地模建结构。
3 、功能基因组学中的生物信息学 美国HGP 已编制1998-2003 的新五年计划。提出八项目标：其中目标7 特指生物信息学和计算生物学，其实几乎每项目标都要生物信息学，例如目标4 功能基因组学中的非编码区功能位点预测，基因表达分析（如DNA Chip）以及蛋白质全局分析（如蛋白质组学）。
§§§ 蛋 白 质 组 学（Proteomics）
1.蛋白质组学研究的目的和任务 20世纪中期以来，随着DNA双螺旋结构的提出和蛋白质空间结构的X射线解析，开始了分子生物学时代，对遗传信息载体DNA和生命功能的主要体现者蛋白质的研究，成为生命科学研究的主要内容。90年代初期，美国生物学家提出并实施了人类基因组计划，预计用15年的时间，30亿美元的资助，对人类基因组的全部DNA序列进行测定，希望在分子水平上破译人类所有的遗传信息，即测定大约30亿碱基对的DNA序列和识别其中所有的基因（基因组中转录表达的功能单位）。经过各国科学家8年多的努力，人类基因组计划已经取得了巨大的成绩，一些低等生物的DNA全序列已被阐明，人类3%左右DNA的序列也已测定，迄今已测定的表达序列标志（EST）已大体涵盖人类的所有基因。在这样的形势下，科学家们认为，生命科学已经入了后基因组时代。在后基因组时代，生物学家们的研究重心已经从解释生命的所有遗传信息转移到在整体水平上对生物功能的研究。这种转向的第一个标志就是产生了一门成为功能基因组学（Functional Genomics）的新学科。它采用一些新的技术，如SAGE、DNA芯片，对成千上万的基因表达进行分析和比较，力图从基因组整体水平上对基因的活动规律进行阐述。但是，由于生物功能的主要体现者是蛋白质，而蛋白质有其自身特有的活动规律，仅仅从基因的角度来研究是远远不够的。例如蛋白质的修饰加工、转运定位、结构变化、蛋白质与蛋白质的相互作用、蛋白质与其它生物分子的相互作用等活动，均无法在基因组水平上获知。正是因为基因组学（Genomics）有这样的局限性，于90年代中期，在人类基因组计划研究发展及功能基因组学的基础上，国际上萌发产生了一门在整体水平上研究细胞内蛋白质的组成及其活动规律的新兴学科——蛋白质组学（Proteomics），它以蛋白质组（Proteome）为研究对象。蛋白质组是指“由一个细胞或一个组织的基因组所表达的全部相应的蛋白质”。测定一个有机体的基因组所表达的全部蛋白质的设想，萌发在1975年双向凝胶电泳发明之时。1994年Williams正式提出了这个问题，而“蛋白质组”的名词则是由Wilkins创造的，发表在1995年7月的Electrophoresis杂志上。蛋白质组与基因组相对应，但二者又有根本不同之处：一个有机体只有一个确定的基因组，组成该有机体的所有不同细胞斗拱享用一个确定的基因组；而蛋白质组则是一个动态的概念，她不仅在同一个机体的不同组织和细胞中不同，在同一机体的不同发育阶段，在不同的生理状态下，乃至在不同的外界环境下都是不同的。正是这种复杂的基因表达模式，表现了各种复杂的生命活动，每一种生命运动形式，都是特定蛋白质群体在不同时间和空间出现，并发挥功能的不同组合的结果。基因DNA的序列并不能提供这些信息，再加上由于基因剪接，蛋白质翻译后修饰和蛋白质剪接，基因遗传信息的表现规律就更加复杂，不再是经典的一个基因一个蛋白的对应关系，一个基因可以表达的蛋白质数目可能远大于一。对细菌，可能为1.2～1.3;对酵母则为3;而对人,可高达10。后基因组和蛋白质组研究，是为阐明生命活动本质所不可缺少的基因组研究的远为复杂的后续部分，无疑将成为21世纪生命科学研究的主要任务。

⑧ 蛋白质的超二级机构，模体，结构域有什么区别

蛋白质的超二级机构、模体、结构域有2点不同：

一、三者的含义不同：

1、蛋白质超二级机构的含义：蛋白质超二级结构是指在多肽链内题序上相互邻近的二级结构盒盒在空间新金中靠近，彼此相互作用，形成规则的二级结构聚集体。在球状蛋白质分子的一级结构的基础上，相邻的二级结构单位（α螺旋β折叠等）在三维折叠中相互靠近。

2、蛋白质模体的含义：蛋白质模体指的是由2个或3个具有二级结构的肽段，在空间上相互接近，形成一个特殊的空间结构。它具有特征性的氨基酸排列顺序，并且同特定的功能相联系。蛋白质分子中由氨基酸残基空间排布形成具有特定生物学功能的结构模式。

3、蛋白质结构域的含义：蛋白质结构域是在较大的蛋白质分子中，由于多肽链上相邻的超又变给构紧密联系，形成两个或多个在空间上可以明显区别的局部区域。结构域与分子整体低价键超连，一般难以分离，这是它与蛋白质亚基结构的区别。

二、三者的的形式不同：

1、蛋白质超二级机构的形式：目前发现的超二级结构有三种基本形式：α螺旋组合（αα）、β折叠组合（βββ）和a螺旋-β折叠组合(βαβ)其中以βαβ组合最为常见。

2、蛋白质模体的形式：

（1）左手超螺旋：3根右手α-螺旋拧到一起形成一个左手超螺旋；

（2）右手超螺旋：3根左手螺旋拧到一起形成一个右手超螺旋，如胶原蛋白；

（3）卷曲螺旋：相邻的2根右手α-螺旋拧到一起形成一个左手超螺旋；

（4）螺旋束：多个α-螺旋的聚合体。

3、蛋白质结构域的形式：把蛋白质结构分为四类：α型、β型、α/β型以及其它类型的结构域结构。α型结构域结构主要由α-螺旋所构成，例如肌红蛋白的结构等。

β型结构域结构主要由反平行的卜回折所构成，通常是两个卜回折相互包裹在一起，例如质体兰素的结构等。α/β型结构域结构则是由α-螺旋所包裹的以平行β-链为主的。

(8)模体分析方法扩展阅读：

蛋白质结构域的性质：

1、结构域在空间上具有临近相关性即在一级结构上相互临近的氨基酸残基，在结构域的三维空间结构上也相互临近，在一级结构上相互远离的氨基酸残基，在结构域的空间结构上也相互远离，甚至分别属于不同的结构域。

2、结构域与蛋白质完成生理功能有着密切的关系，有时几个结构域共同完成一项生理功能，有时一个结构域就可以独立完成一项生理功能，但是一个结构不完整的结构域是不可能产生生理功能的。因此结构域是蛋白质生理功能的结构基础，但必须指出的是，虽然结构域与蛋白质的功能关系密切，但是结构域和功能域的概念并不相同。

3、结构域实质上是二级结构的组合体，充当三级结构的构件，每个结构域分别代表一种功能。

4、结构域之间常只有一段肽链相连，使域间容易发生相对运动，这将有利于活性中心结合底物或施加应力，有利于别构中心结合调节物和发生别构效应，以利于酶对反应的催化。

5、通过结构域容易构建具有特定三维排布的活性中心。

⑨ motif 在分子生物学中是什么意思 怎么翻译

motif是在许多蛋白质分子中，由几个具有二级结构的肽段在空间上相互接近、相互作用，所形成的折叠模样称为超二级结构，又称为模体。锌指结构是一种常见的模体。

motif在生物学中是一个基于数据的数学统计模型，典型的是一段sequence也可以是一个结构，是特定的group的序列预测，例如一个DNA sequence可以定义为转录因子结合位点，也就是序列倾向于被这种factor结合。

对蛋白质来说，sequence motifs可以被定义为蛋白质（蛋白质序列）属于一个给定的蛋白质家族。一个简单的motif可以是，例如，一个模式pattern，而这个模式被这个group中的所有成员共享。

例如WTRXEKXXY（这里，X代表任何氨基酸）。当然也有更复杂的motif模型。Motif有时和特定的功能联系一起。

motif在生物学上翻译成，模体，模序，基序等。

(9)模体分析方法扩展阅读

常见模体：

1、左手超螺旋——3根右手α-螺旋拧到一起形成一个左手超螺旋；

2、右手超螺旋——3根左手螺旋拧到一起形成一个右手超螺旋，如胶原蛋白；

3、卷曲螺旋——相邻的2根右手α-螺旋拧到一起形成一个左手超螺旋；

4、螺旋束——多个α-螺旋的聚合体；

5、β-折叠-α-螺旋β-折叠，即βαβ；

6、β-发夹环——两个反平行β-股由一个环相连；

7、α-螺旋-β-转角-α-螺旋，即αβα；

8、α-螺旋-环-α-螺旋(EF手相）；

9、Rossmann卷曲——也称Rossmann折叠，它由两个βαβ连在一起，形成βαβαβ结构，通常能结合辅酶I；

10、希腊钥匙模体——是一种全β折叠聚合体，存在于许多不同类型的蛋白质中，因在拓扑学上像古代花瓶上的希腊钥匙而得名，清蛋白原就含有这种模体。