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蛋白质多肽链断裂的计算方法

发布时间:2023-01-17 01:41:14

❶ 关于高一生物蛋白质中肽链,肽键等各种计算公式

假设氨基酸的平均相对分子质量为a,由n个氨基酸分别形成1条肽链或m条肽链.
形成肽键数=脱去水分子数=n-m
多肽相对分子质量=na-18(n-m)
(1)氨基数=肽链数+R基上的氨基数=各氨基酸中氨基总数-肽键数.
(2)羧基数=肽链数+R基上的羧基数=各氨基酸中羧基总数-肽键数.
(3)N原子数=各氨基酸中N的总数=肽键数+肽链数+R基上的N原子数.
(4)O原子数=各氨基酸中O的总数-脱去水分子数=肽键数+2×肽链数+R基上的O原子数.

❷ 有关蛋白质计算的方法和技巧

一.有关氨基酸脱水缩合形成蛋白质的计算

(一)计算形成的肽键数、脱去的水分子数

计算技巧1:

蛋白质中的肽键数=脱去的水分子数=氨基酸个数-肽链数

例1.免疫球蛋白IgG的结构示意图如下.其中—s—s表示连接两条相邻肽链的二硫链。若该lgG由m个氨基酸构成,则该lgG有肽键数

A.m个 B.(m+1)个 C.(m—2)个 D.(m—4)个

点拨:由题图可知,该蛋白IgG由4条肽链组成,所以该lgG有肽键数为(m—4)。

答案:D

注意:若由氨基酸脱水缩合形成环状肽,则肽键数=氨基酸个数=脱去的水分子数

(二)计算蛋白质相对分子质量

计算技巧2:

蛋白质的相对分子质量=氨基酸分子个数×氨基酸平均相对分子质量-18×脱去的水分子数

例2、一种蛋白质由两条肽链构成,共含有100个氨基酸,若每个氨基酸相对平均分子质量是120,则该蛋白质的相对分子质量约是__________

A. 12000 B。10236 C。10218 D。13764

点拨:脱去的水分子数要应用计算技巧1来求得,所以蛋白质的相对分子质量=100*120-18*(100-2)=10236。

答案:B

二.有关蛋白质结构的计算

(一)计算多肽种类

计算技巧3:

假设有n(0<n<20)种氨基酸,由这n种氨基酸形成多肽,情况如下:

(1)每种氨基酸数目无限的情况下,可形成m肽的种类为nm种;

(2)每种氨基酸数目只有一个的情况下,可形成m肽的种类为n×(n-1)×(n-2)……×(n-m+1)

例3:下列几种物质最多可以构成几种三肽( )

A.43 B.53 C.34 D.35

点拨:根据氨基酸结构通式判断出前四种化合物为构成蛋白质的氨基酸,因为没有限制氨基酸的数目,所以构成三肽的种数为43种。

答案:A

(二)计算蛋白质中氨基酸数目

计算技巧4:

(1)若已知多肽中氮原子数为m,氨基个数为n,则缩合为该多肽的氨基酸数目为 m-n+肽链数。

(2)若已知多肽中的氮原子数为m,则缩合成该多肽的氨基酸数目最多为m。

❸ 蛋白质的计算公式

★★规律1:有关氨基数和羧基数的计算
⑴蛋白质中氨基数=肽链数+R基上的氨基数=各氨基酸中氨基的总数-肽键数;

⑵蛋白质中羧基数=肽链数+R基上的羧基数=各氨基酸中羧基的总数-肽键数;

⑶在不考虑R基上的氨基数时,氨基酸脱水缩合形成的一条多肽链中,至少含有的氨基数为1,蛋白质分子由多条肽链构成,则至少含有的氨基数等于肽链数;

⑷在不考虑R基上的羧基数时,氨基酸脱水缩合形成的一条多肽链中,至少含有的羧基数为1,蛋白质分子由多条肽链构成,则至少含有的羧基数等于肽链数。

★★规律2:蛋白质中肽键数及相对分子质量的计算
⑴蛋白质中的肽键数=脱去的水分子数=水解消耗水分子数=氨基酸分子个数-肽链数;

⑵蛋白质的相对分子质量=氨基酸总质量(氨基酸分子个数×氨基酸平均相对分子质量)-失水量(18×脱去的水分子数)。

注意:有时还要考虑其他化学变化过程,如:二硫键(—S—S—)的形成等,在肽链上出现二硫键时,与二硫键结合的部位要脱去两个H,谨防疏漏。

★★规律3:有关蛋白质中各原子数的计算
⑴C原子数=(肽链数+肽键数)×2+R基上的C原子数;
⑵H原子数=(氨基酸分子个数+肽链数)×2+R基上的H原子数=各氨基酸中H原子的总数-脱去的水分子数×2;

⑶O原子数=肽链数×2+肽键数+R基上的O原子数=各氨基酸中O原子的总数-脱去的水分子数;

⑷N原子数=肽链数+肽键数+R基上的N原子数=各氨基酸中N原子的总数。
注意:一个氨基酸中的各原子的数目计算:① C原子数=R基团中的C原子数+2;②H原子数=R基团中的H原子数+4;③ O原子数=R基团中的O原子数+2;④N原子数=R基团中的N原子数+1。

❹ 蛋白质序列测定的原理与方法

网络"蛋白质测序"词条下有详细介绍
1肽链的拆开和分离
●2测定蛋白质分子中多肽链的数目
●3二硫键的断裂
●4测定每条多肽链的氨基酸组成,并计算出氨基酸成分的分子比
●5N端、C端的测定
●6多肽链断裂
●7测定每个肽段的氨基酸顺序。
●8确定肽段在多肽链中的次序。
●9确定原多肽链中二硫键的位置。

❺ 蛋白质多肽链N端测定的方法及基本原理

1 多肽链的拆分。由多条多肽链组成的蛋白质分子,必须先进行拆分。几条多肽链借助非共价键连接在一起,称为寡聚蛋白质,如,血红蛋白为四聚体,烯醇化酶为二聚体;可用8mol/L尿素或6mol/L盐酸胍处理,即可分开多肽链(亚基).
2 测定蛋白质分子中多肽链的数目。通过测定末端氨基酸残基的摩尔数与蛋白质分子量之间的关系,即可确定多肽链的数目。
3 二硫键的断裂。几条多肽链通过二硫键交联在一起,可在8mol/L尿素或6mol/L盐酸胍存在下,用过量的-巯基乙醇处理,使二硫键还原为巯基,然后用烷基化试剂保护生成的巯基,以防止它重新被氧化。
二硫键的切割与保护(元素后数字为下标)
a 过甲酸〔performic acid〕 不可逆
-CH2SO3H
b、还原+氧化 不可逆
[ 巯基乙醇,DTT ] + 碘乙酸等
-S-CH2-COOH
c、亚硫酸分解〔Sulfitolysis〕 可逆
-R1-S-S-R2 + HSO3-
R1-S- + R2-S-SOH3
可以通过加入盐酸胍的方法解离多肽链之间的非共价力;应用过甲酸氧化法或巯基还原法拆分多肽链间的二硫键。
巯基(-SH)的保护4 测定每条多肽链的氨基酸组成,并计算出氨基酸成分的分子比(如右图)
5 分析多肽链的N-末端和C-末端
多肽链端基氨基酸分为两类:N-端氨基酸(amino-terminal)和C-端氨基酸(Carboxyl-terminal) 。在肽链氨基酸顺序分析中,最重要的是N-端氨基酸分析法。N末端分析法(Sanger法;Edman法;DNS-Cl;酶降解法),C末端分析法(肼解法;酶降解法;硼氢化锂法)。
6 多肽链断裂成多个肽段。可采用两种或多种不同的断裂方法将多肽样品断裂成两套或多套肽段或肽碎片,并将其分离开来。
7 测定每个肽段的氨基酸顺序
8 确定肽段在多肽链中的次序。
利用两套或多套肽段的氨基酸顺序彼此间的交错重叠,拼凑出整条多肽链的氨基酸顺序。
9 确定原多肽链中二硫键的位置
一般采用胃蛋白酶处理没有断开二硫键的多肽链,再利用双向电泳技术分离出各个肽段,用过甲酸处理后,将可能含有二硫键的肽段进行组成及顺序分析,然后同其它方法分析的肽段进行比较,确定二硫键的位置。

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