基因计算方法视频

㈠ 有关基因频率的计算

基因频率计算的方法取决于遗传方式，不同的遗传方式,计算方法各异
1.你的第一种情况,只能在完全显性条件下，一对基因的基因型有三种,但表型只有两种,这时无法区别纯合显性,与杂合显性的表型，此时即可根据显性或纯合隐性的个体表型数量来求出基因频率:
q=R的开方值。有某遗传病在人群中每10000人就有一人患病，这时我们可以用aa=1/10000或0.001%来算出a的基因频率为0.0316%.
2.你的第二种情况,已从表型区别出基因型，表明遗传方式为无显性或显性不完全。这时的计算公式为:
p=D+1/2×H
q=1/2×H+R
p为显性基因频率;D为纯合显性基因型频率;H为为杂合基因型频率;R为纯合隐性基因型频率;q为隐性基因频率。

㈡ 怎样批量计算基因编码区长度

有些时候我们需要知道转录本长度，比如在使用RNA-seq计算FPKM的时候，为了准确地评估不同基因的表达量，一般是用覆盖该基因/转录本的总reads数除以基因/转录本的长度，有些时候我们需要知道基因编码区的长度，比如在使用VAAST评估致病候选基因的时候，有些基因因为编码区特别长（如TTN）总是排名靠前，如果考虑到它的编码区长度后，排序将会更加科学。 那么怎样获得基因编码区长度呢？这个问题看起来比较简单，只要将每个外显子的长度加起来就可以了，对于单个转录本可以通过NCBI的CCDS数据库查询，但是基因有多个转录本，每个转录本的编码区有重合，所以基因编码区不是每个转录本编码区的简单相加，所以要想准确地获得每个基因的编码区长度并不容易，而且目前并没有现成的数据库，经过游侠在网上摸索后将相关方法整理如下，供大家参考。首先从sanger网站下载基因注释文件GTF，ftp://ftp.sanger.ac.uk/pub/gencode/Gencode_human/release_19/gencode.v19.annotation.gtf.gz。然后在R中使用GenomicFeatures工具包。library(GenomicFeatures)txdb <- makeTranscriptDbFromGFF("yourFile.gtf",format="gtf")收集每个基因的编码区编号exons.list.per.gene <-cdsBy(txdb,by="gene")通过rece函数避免重复计算重叠区exonic.gene.sizes <- lapply(exons.list.per.gene,function(x){sum(width(rece(x)))})生成的gene ID为ensemble编号，可以通过https://biodbnet-abcc.ncifcrf.gov/db/db2dbRes.php，转换为gene symbol。另外游侠已经处理好了人类所有基因的编码区长度，如果有需要的话，可以在微信号留言索取。
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㈢ 基因频率计算公式是什么

基因频率=某基因的数目/全部等位基因的总数*100%

以A，a为例，基因频率为A的频率或a的频率，两者之和为1。基因型的频率为AA或Aa或aa的频率，三者之和为1.另外如aa的频率为16%，则a的频率为40%，因为aa基因型频率即为两次a出现的概率为40%*40%=16%。

设二倍体生物个体的某一基因座上有两个等位基因A和a，假设种群中共有N个个体，而AA、Aa、aa三种基因型的个体数分别为n1、n2、n3，那么种群中A基因的频率和AA基因型的频率分别是：

①A基因的频率=A基因的总数/（A基因的总数+a基因的总数）=(2n1+n2)/2N 或 n1/N+n2/2N

②AA基因型的频率=AA基因型的个体数/该二倍体群体总数=n1/N。

基因频率与基因型频率的计算关系，由上述①②推得：A基因的频率=n1/N+1/2·n2/N=AA基因型的频率+1/2·Aa基因型的频率。

拓展资料：

基因频率（gene frequency）是指在一个种群基因库中，某个基因占全部等位基因数的比率。群体中某一特定基因的频率可以从基因型频率（genotype frequency）来推算。如人们熟悉的人的MN血型，它是由一对共显性等位基因M和N所决定，产生3种基因型M/M、M/N和N/N，而相应的表型是M、MN和N，而且比例是1/4M、1/2MN和1/4N。这个原理可以推广到一般群体内婚配，如以群体中MN表型（基因型）的具体样本数被所观察到总数相除即可得到（转换）相对频率数。

㈣ 基因频率怎么计算

已知基因型aa的个体失去求偶的繁殖的能力，则参与随机交配的个体，基因型aa所占比例为1/3，aa所占比例为2/3。由基因型频率可计算出基因a配子频率为2/3，基因a配子的频率为1/3。所以子代中aa的个体所占比例为1/3×1/3=1/9。所以随机交配后代种可育的占8/9

㈤ 怎样计算基因频率（详细解答过程）

按照概率学的说法，假设事件a和事件b的概率分别p1和p2，事件a和b发生地概率是p1*p2，a或b发生地概率是p1+p2，前提是两事件为互斥事件
生物子代基因重组中，由于两代频率不可能同时发生改变，所以算做互斥事件，子代的基因频率又亲代基因频率和重组分布概率共同决定，因此，重组的时候两个基因结合的概率就是他们之间相乘的概率
不懂得话直接相乘就好了
比如杂合子aa自交，亲代个体只有两个基因，所以a的频率就是0.5，a的也是0.5，后代中出现aa的概率就是0.5*0.5，出现aa的概率就是0.5*0.5+0.5*0.5（因为第一次出现的基因可能是a或a，所以有两种情况）进一步可以计算出aabb的概率，自己去体会一下

㈥ 基因型的种类怎么算

1、表现型四种即AB双显：A显B隐：A隐B显：AB双隐=9：3：3：1
2、基因型9种AABB:AaBB:AAbb:Aabb:AaBb:AABb:aaBB:aaBb:aabb=1：2：1：2：4：2：1：2：1
3、AaBb占1/4
绝对原创请加分!

㈦ 基因频率计算公式

基因型AA=x aa=y Aa=z
A基因频率=该基因所在基因型的比列/所有等位基因所在基因型比列和=(2X+Z)/(2X+2Y+Z+Z)
a基因频率=该基因所在基因型的比列/所有等位基因所在基因型比列和=(2Y+Z)/(2X+2Y+Z+Z)

基因型频率 AA=X aa=Y A基因频率=X开平方 a基因频率=Y开平方

㈧ 生物基因型计算

FF的概率为1/3,Ff概率为2/3，
可知FF：Ff=1：2 F有4，f有2 共有6
F就是4/6=2/3F f就是2/6=1/3f
用棋盘法
2/3F 1/3f
1/3F 4/9FF 2/9Ff

2/3f 2/9Ff 2/9ff（死亡）
得子代基因型FF：ff=1：1
FF占4/9 ff占4/9
不知道会不会乱，这是今年的一道高考题目，只不过是意思一样，题目变了一下，字母变了一下。

㈨ 如何计算生物基因频率

1．理想状态下种群基因频率的计算
种群后代中出现三种基因型AA、Aa、aa,并且三种基因型出现的频率分别为P（AA）= p×p= p2=D；P（Aa）=2p×q=2pq=H； P（aa）= q×q = q 2=R.且它们的频率之和为p2+2pq+q2=（p+q）2=1.其基因频率为A基因的频率P（A）=D+1/2H= p2+ pq=p（p+q）=p；a基因的频率P（a）= R+1/2H=q2+ pq=q（p+q）=q.可见子代基因频率与亲代基因频率一样.所以,在以后所有世代中,如果没有突变、迁移和选择等因素干扰,这个群体的遗传成分将永远处于p2+ 2pq+q2平衡状态.伴性基因和多等位基因遗传平衡的计算仍遵循上述规律.运用此规律,已知基因型频率可求基因频率；反之,已知基因频率可求基因型频率.

㈩ 怎么计算基因型和表现性 通俗一点

基因型的计算方法和表现型的计算方法差不多，都是采用化自由组合为分离的方法来进行，一对一对的来计算，这样更加简单明了。以下举例说明一些常规的算法：
例一：基因型类型：YyRr与YyRr杂交，其后代基因型你书写的完全正确，那么后代基因型种类有：3乘以3=9种。
例二：表现型类型：YyRr与YyRr杂交，其后代表现型各有两种，因此种类数有：2乘以2=4种。
为了让你更加理解，我写下来拍照给你看一下：