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逆转录计算方法

发布时间:2022-06-04 09:18:23

‘壹’ 2微克RNA反转录后的cDNA浓度大约为多少

可以大概估算。考虑一下几个因素:
1. 大多数RNA是28s,16s ,5s等rRNA,mRNA其实占少数。他们都会反转录为cDNA.。你若估计mRNA反转为cDNA的量较难。
2、反转录和你添加的引物量有关。假设你加了1份引物,那就只能转录1分cDNA,按100%的反转效率计算,你能合成大概2ug cDNA。若你添加了2份引物,那就只能转录2份cDNA,按100%的反转效率计算,你能合成大概4ug cDNA。这些都是估算。
3.你问的是浓度,我上面大概估算了下量。折算为浓度时,须看你做上述反应,用的反应体系是多大?50ul?100ul? 有估算量和反应体系,你大概就能算出cDNA的浓度啦。
4.尽管能基本估算出浓度,但是这样做,意义不大。

‘贰’ 反转录PCR和荧光定量PCR

反转录PCR(Reverse Transcription-Polymerase Chain Reaction,RT-PCR)又称为逆转录PCR。其原理是:提取组织或细胞中的总RNA,以其中的mRNA作为模板,采用Oligo(dT)或随机引物利用逆转录酶反转录成cDNA。再以cDNA为模板进行PCR扩增,而获得目的基因或检测基因表达。RT-PCR使RNA检测的灵敏性提高了几个数量级,使一些极为微量RNA样品分析成为可能。该技术主要用于:分析基因的转录产物、获取目的基因、合成cDNA探针、构建RNA高效转录系统。

荧光定量PCR是通过荧光染料或荧光标记的特异性的探针,对PCR产物进行标记跟踪,实时在线监控反应过程,结合相应的软件可以对产物进行分析,计算待测样品的初始模版。
原理是PCR扩增时在加入一对引物的同时加入一个特异性的荧光探针,该探针为一寡核苷酸,两端分别标记一个报告荧光基团和一个淬灭荧光基团。探针完整时,报告基团发射的荧光信号被淬灭基团吸收;刚开始时, 探针结合在DNA任一一条单链上;PCR扩增时,Taq酶的5’端-3’端外切酶活性将探针酶切降解,使报告荧光基团和淬灭荧光基团分离,从而荧光监测系统可接收到荧光信号,即每扩增一条DNA链,就有一个荧光分子形成,实现了荧光信号的累积与PCR产物形成完全同步。
科学研究应用于:医学、农牧、生物相关分子生物学定量研究。

‘叁’ 知道RNA浓度,反转录时怎么计算加的模板量呢 ,RNA浓度单位是ng/ul 模板的加入量单位为ug,还有PCR也是ug

看你的结果,有几种原因:1,模版浓度太低;2,上样量太少;3,缓冲液有问题。你的RNA浓度是1749.91ng/ul ,也就是1.74ug/ul,因此加入1ul的RNA也就差不多是1ug的量。

‘肆’ 做逆转录实验中,配置25ul体系,需要Total RNA 1ug ,请问这1ug怎么换算成ul

这要通过分光光度计进行测定,算出总RNA的含量,取10ulRNA提取液,稀释300倍,以同体积的水作为对照,用UV-2401紫外分光光度计测RNA260nm处和280nm处的吸收值并计算纯度公式OD260/OD280。浓度公式=总浓度(ng/nl)=(OD260)*(稀释倍数n)*40
如要计算很麻烦,所以一般加2-5ul,量多不碍事。
自己的经验所得~~

‘伍’ PCR时,将RNA反转录成cDNA反应体系怎么算

pcr时,将rna反转录成cdna反应体系怎么算
再以cdna为模板进行pcr扩增,而获得目的基因或检测基因表达。rt-pcr使rna检测的灵敏性提高了几个数量级,使一些极为微量rna样品分析成为可能。该技术主要用于:分析基因的转录产物、获取目的基因、合成cdna探针、构建rna高效转录系统。
rt-
pcr即逆转录pcr,是将rna的逆转录(rt)和cdna的聚合酶链式扩增反应(pcr)相结合的技术。rt-pcr技术灵敏而且用途广泛,可用于检测细胞/组织中基因表达水平,细胞中rna病毒的含量和直接克隆特定基因的cdna序列等。

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