内含子测量方法

⑴ 怎么确定一个基因有多少内含子多少外显子

在NCBI上的OMIM数据库输入基因名，在TITLE上就会显示它的学名。

用学名检索基因是比较靠谱的。建议用ENSEMBL找基因，显示其外显子和内含子。进入ENSEMBL的方法有两种，1.NCBI上进入基因的检索条以后，summary里会有相应的ENSEMBL的链接（see related）；2.直接进入ENSEMBL主页检索该基因。进入基因的检索条以后，点左侧的CDNA和EXONS就能相应地看到转录本的注释信息，包括外显子和内含子的注释，5‘和3’UTR的注释，和密码子的注释。

⑵ 如何确定一个基因所含有的内含子的数目和大小

将该基因的基因组DNA与成熟的mRNA进行比较，在成熟mRNA中不存在的片段就是内含子。

第一个转酯反应由一个游离的鸟苷或鸟苷酸（GTP、GMP或GDP）介导，其3‘-OH作为亲核基团攻击内含子5’端的磷酸二酯键，从上游切开RNA链。

在第二个转酯反应中，上游外显子的自由3‘-OH作为亲核基团攻击内含子3’位核苷酸上的磷酸二酯键，使内含子完全被切开，上下游两个外显子通过新的磷酸二酯键重新连接。

(2)内含子测量方法扩展阅读：

相位：

内含子可以在转录抄本的任何位置，甚至在以后成为密码子的三核苷酸之间。若内含子位于一密码子的第三位核苷酸和另一密码子的第一位核苷酸，则被称为0位内含子。相应地，位于一密码子第一第二位核苷酸之间的内含子被称为1位内含子。

位于第二和第三位之间时，则被称为2位内含子。这在外显子复制中很重要，处于两同相位内含子的外显子被称为对称外显子，其核苷酸数为3的整数倍，它可以被成功复制，不会造成阅读框的推移。相反，非对称外显子是不可复制的。

⑶ 生物高手救我~如何鉴定内含子

杂交法是较简单的方法，由于mRNA不含内含子，DNA与mRNA杂交后会可形成环，见图解

⑷ 怎么测外显子和内含子的总长

内含子序列一般可以占到一个基因总长的60%以上真核生物中。也就是说，一个基因中，大部分的序列都是内含子

⑸ 观察研究外显子和内含子的主要方法有哪些

同组成.c-myc基因由个外显子及个内含子组成，第一个外显子不编码，只起调节作 用，只有外显子和与v-myc相对应，发现这些突变不能自身抑制，说明了亮氨酸拉链区在自身抑制中的重要 性.stone等研究认为，c-myc分子的中间/以及n-

⑹ 观察研究外显子和内含子的主要方法有哪些

高通量，外显子测序，算一个吧。

⑺ 我现在有了一个基因的cDNA序列，现在想找到这个基因的内含子序列，怎么办

为具有与某RNA链呈互补的碱基序列的单链DNA即complementary DNA之缩写，或此DNA链与具有与之互补的碱基序列的DNA链所形成的DNA双链。与RNA链互补的单链DNA，以其RNA为模板，在适当引物的存在下，由依赖RNA的DNA聚合酶（反转录酶）的作用而合成，并且在合成单链cDNA后，在用碱处理除去与其对应的RNA以后，以单链cDNA为模板，由依赖DNA的DNA聚合酶或依赖RNA的DNA聚合酶的作用合成双链cDNA。真核生物的信使RNA或其他RNA的cDNA，在遗传工程方面广为应用。在这种情况下，mRNA的cDNA，与原来基因的DNA（基因组DNA，genomic DNA）不同而无内含子；相反地对应于在原来基因中没有的而在mRNA存在的3′末端的多A序列等的核苷序列上，与exon序列、先导序列以及后续序列等一起反映出mRNA结构。cDNA同样可以被克隆。

⑻ 在NCBI上怎么找到一个基因的外显子和内含子

事实上，在NCBI有很多种办法可以确定某个基因的外显子或者内含子，当然还有UTR区域。今天我们来介绍NCBI的其中一个使用软件Splign来在NCBI上找到一个基因的外显子和内含子。操作步骤如下：

1.在Gene数据库，填入基因名HNF-4，我一般的话习惯叫Symbol，每个基因都有个Symbol，即基因名。

⑼ 已知一段真菌序列，如何预测内含子

一般而言，我们根据RNA剪接位点（内含子/外显子）来预测内含子和外显子区间。该生物信息学推断是基于剪接的保守性序列“GU－AG”规则，即内含子5’端序列一般是GU，而3’端一般是AG，当然它们附近的序列也是有一定规律的，但不是很保守。根据这一特点并结合ORF, Blast等数据就可以对未知基因的成熟mRNA序列进行预测。
经典的内含子预测网站有Augustus，SplicePort，GeneSplicer，NetGene2，MaxEntScan。但考虑到你是真菌序列，所有只能选择前两个网站进行运算。

⑽ 什么叫做间隔子如何测定一段基因中的间隔子

间隔子就是内含子.可以通过这段基因表达的蛋白质的氨基酸序列倒推出外显子序列,用该基因序列减去外显子序列就是内含子序列