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配制琼脂糖的步骤方法

发布时间:2022-12-13 23:11:07

如何配制2%琼脂糖溶液

0.29g NaCl + 50mL TAE + 5uL GelRed 摇床上30min,之后将其倒入装有1g琼脂糖(矮胖杯的)的锥形瓶中,加盖保鲜膜,扎多些孔跑气,微波炉中加热至沸(以10s为单位,大约6次)后,取出摇动1分钟,再进入加热至沸腾,冷却至60℃倒胶,梳子在倒胶前插好。

c(NaCl)≈ (0.2925 / 58.5)/ 0.050 = 0.1mol / L
TAE原液为50×,取1体积50×TAE + 49体积的ddH2O配制1×TAE

Ⅱ RNA的琼脂糖凝胶电泳实验原理和步骤

一、实验目的

掌握植物总RNA非变性胶电泳的原理和方法。

二、实验原理

RNA电泳可以在变性及非变性两种条件下进行。非变性电泳使用1.0%--1.4%的凝胶,不同的RNA条带也能分开,但无法判断其分子量。只有在完全变性的条件下,RNA的泳动率才与分子量的对数呈线性关系。因此要测定RNA分子量时,一定要用变性凝胶。在需快速检测所提总RNA样品完整性时,配制普通的1% 琼脂 糖凝胶即可。

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三、实验材料、器具及药品

蘑菇的总RNA溶液。 电泳仪,电泳槽,电子 天平 , 移液器 ,枪头,微波炉,紫外透射检测仪等。 琼脂糖,1XTAE电泳缓冲液,0.5μg/ml溴化乙锭(EB)10X载样缓冲液。

四、实验步骤

(1)用1×TAE电泳缓冲液制作琼脂糖凝胶,加1×TAE电泳缓冲液至液面覆盖凝胶。

(2)在超净工作台上,用移液器吸取总RNA样品4μl于封口膜上。在 实验台 上再加入5μl 1×TAE电泳缓冲液及1μl 的10X载样缓冲液,混匀后,小心加入点样孔。

(3)打开电源开关,调节电压至100V,使RNA由负极向正极电泳,约30min后将凝胶放入EB染液中染色5min,用清水稍微漂洗。在紫外透射检测仪上观察RNA电泳结果。

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RNA的变性琼脂糖凝胶检测

试剂 :

(1)MOPS缓冲液(10*):0.4mol/L 吗啉代丙烷磺酸(MOPS) (Ph7.0),0.1mol/L NaAc, 10mol/L EDTA 。

(2)上样染料:50%甘油,1mmol/L EDTA ,0.4%溴酚蓝,0.4%二甲苯蓝。

(3)甲醛。

(4)去离子甲酰胺。v电泳槽清洗:去污剂洗干净(一般浸泡过夜)——水冲洗——乙醇 干燥 ——3%H2O2灌满——室温放置10分钟——0.1%DEPC水冲洗。

操作:

(1) 将制胶用具用70%乙醇冲冼一遍,晾干备用。

(2) 配制琼脂糖凝胶。

①称取0.5g琼脂糖,置干净的100ml 锥形瓶中,加入40ml蒸馏水,微波炉内 加热 使琼脂糖彻底溶化均匀。

②待胶凉至60--70 ℃,依次向其中加入9ml 甲醛、5ml 10X MOPS缓冲液和0.5ul 溴化乙锭,混合均匀。

③灌制琼脂糖凝胶。

(3) 样品准备:

① 取 DEPC处理过的500ul小离心管,依次加入如下试剂: 10x MOPS缓冲液2ul,甲醛3.5ul,甲酰胺(去离子)10ul,RNA 样品 4.5ul,混匀。

② 将离心管置于60℃水浴中保10分钟,再置冰上2分钟。

③ 向管中加入3ul 上样染料,混匀。

(4)上样。

(5)电泳:电泳槽内加入1XMOPS缓冲液,于7.5V/ml 的电压下电泳。

(6)电泳结束后,在紫外灯下检查结果。

Ⅲ 琼脂糖凝胶的配制

称量、溶胶、倒胶、拔梳。
配置步骤如下:
1、称量,小胶板0.8%的胶需要琼脂粉0.104gTBE13mL。
2、熔胶,将所称量的琼脂粉与TBE在锥形瓶中混合,在微波炉内反复加热2到3次至琼脂粉溶解并无气泡。
3、倒胶,干净的胶槽内摆好梳子,往胶内滴加1uL左右核酸染料,混匀,待冷却至不烫手,轻轻倒入胶板内。
4、拔梳待大约2分钟即可。

Ⅳ 琼脂糖凝胶电泳具体操作步骤是什么需要注意什么事项

一、操作步骤:

1、电泳方法

一般的核酸检测只需要琼脂糖凝胶电泳就可以;如果需要分辨率高的电泳,特别是只有几个bp的差别应该选择聚丙烯酰胺凝胶电泳;用普通电泳不合适的巨大DNA链应该使用脉冲凝胶电泳。

2、凝胶浓度

对于琼脂糖凝胶电泳,浓度通常在0.5~2%之间,低浓度的用来进行大片段核酸的电泳,高浓度的用来进行小片段分析。低浓度胶易碎,小心操作和使用质量好的琼脂糖是解决办法。

3、缓冲液

常用的缓冲液有TAE和TBE,而TBE比TAE有着更好的缓冲能力。电泳时使用新制的缓冲液可以明显提高电泳效果。

4、电压和温度

电泳时电场强度不应该超过20V/cm,电泳温度应该低于30℃,对于巨大的DNA电泳,温度应该低于15℃。

5、DNA样品的纯度和状态

注意样品中含盐量太高和含杂质蛋白均可以产生条带模糊和条带缺失的现象。乙醇沉淀可以去除多余的盐,用酚可以去除蛋白。

6、DNA的上样

正确的DNA上样量是条带清晰的保证。注意太多的DNA上样量可能导致DNA带型模糊,而太小的DNA上样量则导致带信号弱甚至缺失。

7、Marker的选择

DNA电泳一定要使用DNA Marker或已知大小的正对照DNA来估计DNA片段大小。Marker应该选择在目标片段大小附近ladder较密的,这样对目标片段大小的估计才比较准确。

8、凝胶的染色和观察

实验室常用的核酸染色剂是溴化乙锭(EB),染色效果好,操作方便,但是稳定性差,具有毒性。注意观察凝胶时应根据染料不同使用合适的光源和激发波长,如果激发波长不对,条带则不易观察,出现条带模糊的现象。

二、注意事项:

1、巨大的DNA链用普通电泳可能跑不出胶孔导致缺带。

2、高浓度的胶可能使分子大小相近的DNA带不易分辨,造成条带缺失现象。

3、电泳缓冲液多次使用后,离子强度降低,pH值上升,缓冲性能下降,可能使DNA电泳产生条带模糊和不规则的DNA带迁移的现象。

4、如果电泳时电压和温度过高,可能导致出现条带模糊和不规则的DNA带迁移的现象。特别是电压太大可能导致小片段跑出胶而出现缺带现象。

5、变性的DNA样品可能导致条带模糊和缺失,也可能出现不规则的DNA条带迁移。在上样前不要对DNA样品加热,用20mM NaCl缓冲液稀释可以防止DNA变性。

6、太多的DNA上样量可能导致DNA带型模糊,而太小的DNA上样量则导致带信号弱甚至缺失。

(4)配制琼脂糖的步骤方法扩展阅读

琼脂糖凝胶具有网络结构,物质分子通过时会受到阻力,大分子物质在涌动时受到的阻力大,因此在凝胶电泳中,带电颗粒的分离不仅取决于净电荷的性质和数量,而且还取决于分子大小,这就大大提高了分辨能力。

但由于其孔径相比于蛋白质太大,对大多数蛋白质来说其分子筛效应微不足道,现广泛应用于核酸的研究中。

蛋白质和核酸会根据pH不同带有不同电荷,在电场中受力大小不同,因此跑的速度不同,根据这个原理可将其分开。电泳缓冲液的pH在6~9之间,离子强度0.02~0.05为最适。常用1%的琼脂糖作为电泳支持物。

琼脂糖凝胶约可区分相差100bp的DNA片段,其分辨率虽比聚丙烯酰胺凝胶低,但它制备容易,分离范围广。普通琼脂糖凝胶分离DNA的范围为0.2-20kb,利用脉冲电泳,可分离高达10^7bp的DNA片段。

DNA分子在琼脂糖凝胶中泳动时有电荷效应和分子筛效应。DNA分子在高于等电点的pH溶液中带负电荷,在电场中向正极移动。由于糖-磷酸骨架在结构上的重复性质,相同数量的双链DNA几乎具有等量的净电荷,因此它们能以同样的速率向正极方向移动。

Ⅳ 低熔点琼脂糖凝胶怎么配制

琼脂糖凝胶的配制
⑴琼脂糖凝胶的制备:称取0.3g琼脂糖,置于三角瓶中,加入30ml TBE或TAE缓液,置于三角瓶中,加入30ml TBE或TAE缓液,置于三角瓶中,加入30ml TBE或TAE缓液,将该三角瓶置于微波炉加热至琼脂糖溶解。将冷却至65℃左右的琼脂糖凝胶液,加入溴化乙锭,充分混匀。

⑵胶板的制备:

①取有机玻璃内槽,洗净、晾干;

②将有机玻璃内槽置于一水平位置模具上,安好挡板,放好梳子。吸取少量琼脂糖溶液封固胶膜边缘,任其凝固,在距离底板0.5~1.0mm的位置上放置梳子,以便加入琼脂糖后可以形成完好的加样孔。如果梳子距离玻璃板再近,则拔出梳子时孔底将有破裂的危险,破裂后将使样品在凝胶与玻璃板之间渗漏。

③将剩余的温热琼脂糖溶液倒入胶膜中,使胶液缓慢地展开,直到在整个有机玻璃板表面形成均匀的胶层。凝胶的厚度在3~5mm之间,检查一下梳子的齿下或齿间是否有气泡。

④室温下静置30min左右,待凝固完全后,轻轻拔出梳子,在胶板上即形成相互隔开的上样孔。制好胶后将铺胶的有机玻璃内槽放在含有0.5~1×TAE(Tris-乙酸) 或TBE(Tris-硼酸)工作液的电泳槽中使用,没过胶面1mm以上。

(注:溴化乙锭是一种强烈的诱变剂并有中度毒性。使用含有该染料的溶液时必须戴手套。使用完后应该进行净化处理。通常用水配制成10mg/ml的贮存液在室温下避光储存,使用终浓度为0.5μg/ml。)

Ⅵ 如何配制1%琼脂

取1g的琼脂糖溶解在100ml的TBE(0.5%)中煮沸两次,然后等凉一会再倒平板就好啦

Ⅶ 怎么配置1%琼脂糖胶

1、制备1%琼脂糖凝胶(大胶用70ml,小胶用50ml):称取0.7 g(0.5 g)琼脂糖置于锥形瓶中,加入70 ml(50ml)1×TAE,瓶口倒扣小烧杯.微波炉加热煮沸3次至琼脂糖全部融化,摇匀,即成1.0%琼脂糖凝胶液。

2、胶板制备:取电泳槽内的有机玻璃内槽(制胶槽)洗干净,晾干,放入制胶玻璃板.取透明胶带将玻璃板与内槽两端边缘封好,形成模子.将内槽置于水平位置,并在固定位置放好梳子.将冷却到65℃左右的琼脂糖凝胶液混匀小心地倒入内槽玻璃板上,使胶液缓慢展开,直到整个玻璃板表面形成均匀胶层。

3、室温下静置直至凝胶完全凝固,垂直轻拔梳子,取下胶带,将凝胶及内槽放入电泳槽中。添加1×TAE电泳缓冲液至没过胶板为止。


(7)配制琼脂糖的步骤方法扩展阅读:

储藏温度:常温

商品名很多,常见的有,Sepharose(瑞典,pharmacia ),Bio-Gel-A(美国Bio-Rad)等。琼脂糖凝胶是依靠糖链之间的次级链如氢键来维持网状结构,网状结构的疏密依靠琼脂糖的浓度。一般情况下,它的结构是稳定的,可以在许多条件下使用(如水,pH4-9范围内的盐溶液)。

琼脂糖凝胶在40℃以上开始融化,也不能高压消毒,可用化学灭菌活处理。

琼脂糖 Agarose,缩写为AG,是琼脂中不带电荷的中性组成成份,也译为琼胶素或琼胶糖。琼胶糖化学结构由β-D-吡喃半乳糖(1-4)连接3,6-脱水α-L-吡喃半乳糖基单位构成.

把琼脂糖,即几乎不含硫酸根的主要成分为多糖的琼脂,溶于热水,冷却制成的凝胶。制成的小颗粒用于凝胶过滤。适于用sephadex不能分级分离的大分子的凝胶过滤,若使用5%以下浓度的凝胶,也能够分级分离细胞颗粒、病毒等。

利用其吸附性小的特点,有时用它代替琼脂、以作为免疫电泳或凝胶内沉降反应的支持物。

Ⅷ 琼脂糖凝胶怎么配制

把琼脂糖,即几乎不含硫酸根的主要成分为多糖的琼脂,溶于热水,倒入玻璃杯中,冷却制成的凝胶。融化后在37°C下可维持液态数小时,30°C时凝固成胶。即完成琼脂糖凝胶的配置。

制成的小颗粒用于凝胶过滤,适于用sephadex不能分级分离的大分子的凝胶过滤,若使用5%以下浓度的凝胶,也能够分级分离细胞颗粒、病毒等。利用其吸附性小的特点,有时用它代替琼脂、以作为免疫电泳或凝胶内沉降反应的支持物。

(8)配制琼脂糖的步骤方法扩展阅读:

琼脂糖分为一般琼脂糖和经化学修饰后熔点降低的低熔点琼脂糖,琼脂糖的熔点在62〜65°C之间,多用于对染色体DNA在凝胶内进行原位酶切及DNA片段回收。琼脂糖凝胶由于孔径大常用于大分子蛋白质、DNA的分离。

琼脂由琼脂糖和琼脂果胶两部分组成:

作为胶凝剂的琼脂糖是不含硫酸酯的非离子型多糖,是形成凝胶的组分,其大分子链链节着1,3苷键交替相连的β-D-半乳糖残基和3,6-内醚-L-半乳糖残基 。而琼脂果胶是非凝胶部分,是带有硫酸酯、葡萄糖醛酸和丙酮酸醛的复杂多糖,也是商业提取中力图去掉的部分。

商品琼脂一般带有2%~7%的硫酸酯,0%~3%的丙酮酸醛及1%~3%的甲乙基。在工业上的琼脂 色泽由白到微黄,具有胶质感,无气味或有轻微的特征性气味,琼脂不溶于冷水,易溶于沸水。

琼脂系选用优质天然石花菜、江蓠菜、紫菜等海藻为原料,采用科学方法精炼提纯的天然高分子多糖物质。

琼脂为亲水性胶体,分有条状和粉末状,不溶于冷水,易溶于热水。琼脂在工业上具有独特的重要性,琼脂的浓度即使低至1%仍能形成相当稳定的凝胶,是食品工业、化学工业、医学科研所必需之原料。

Ⅸ 如何配制2%琼脂糖溶液

秤一克琼脂糖,加100毫升蒸馏水。
但是,一般跑电泳的时候,需要加tae缓冲液,50×tae加2毫升,再加98毫升蒸馏水。
配琼脂糖,差一两毫升没什么影响的,我们实验室用的是百分之二的。

Ⅹ 1.2%琼脂糖怎么配

琼脂糖凝胶的配制是分子实验室比较基本的操作,因此正确地操作对整个实验来讲很有必要,大体流程如下:称量、熔胶、倒胶、拔梳。
要进行一个称量进行配置。
1.称量 我们通常所说的0.8%、1%的胶都是指的质量体积分数,即所称取的琼脂糖粉的质量(g)比所加的TBE缓冲液的体积(mL)即胶的浓度。缓冲液的体积根据胶板的大小而定。如小胶板0.8%的胶需要琼脂粉0.104g,TBE13mL。

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