『壹』 核酸的檢測
核酸的檢測其實可以檢測出部分病毒,比如艾滋病和新型冠狀病毒之類的,不過核酸的檢測在檢測前是有注意事項的,比如能不能吃東西,能不能抽煙喝酒等等,這都可能影響檢測結果,接下來我們來具體了解一下核酸的檢測知識吧。
核酸的檢測試劑及顏色變化
核酸的檢測有試劑的檢測,那麼核酸的檢測試劑及顏色變化是什麼樣的呢?
核酸的檢測試劑及顏色變化為:紅色是陽性,綠色是陰性。最常用的病毒快速檢測方法主要有兩大類:核酸檢測,核酸(DNA 或 RNA)是病毒的遺傳物質,篩選其中獨一無二的特徵核酸序列進行檢測可准確確定病原體。
還有抗原抗體免疫檢測,病毒作為抗原可激發人體免疫反應產生抗體,可以通過抗原抗體特異性相互結合的特性進行檢測。當然,不論是哪種檢測技術,只有操作簡單,設備要求低,速度快,效率高才是王道。例如:針對新冠病毒的檢測,主要是通過基於實時熒光PCR技術原理研發的核酸檢測試劑進行快速確診,基於抗體檢測技術原理研發的核酸檢測試劑進行補充檢測。
核酸的檢測方法有哪幾種
核酸的檢測方法並不只是有一種的,具體核酸的檢測方法有哪幾種呢?
核酸檢測採用咽拭子檢測,有口咽拭子采樣和鼻咽拭子采樣兩種方式。口咽拭子采樣就是在咽喉部位用棉簽塗擦,取咽喉部上皮細胞的檢測,檢測方法一般是受檢測者張口發出「啊——」的聲音,檢測人員用棉簽採取樣本,檢測過程並沒有創傷風險,是非常安全的檢測。還有是鼻咽拭子採集,一般是將一根細棉簽深入鼻孔,從下鼻道深入抵達鼻咽後壁,然後捻轉棉簽取樣,一般檢測很有可能會有嘔吐的感覺,所以需要忍耐一下。
陽性(+)和陰性(-)是實驗結果的判別方式之一,被稱為定性檢查。核酸檢測陽性代表感染了病毒。核酸檢測的操作要求較高,若因采樣不當導致樣本病毒含量低,或運輸儲存條件不當等情況,都有可能導致核酸檢測可能出現假陰性結果。
核酸檢測前注意事項
核酸檢測前是有一些准備事項的,具體核酸檢測前注意事項有哪些呢?
核酸在檢測前,應當注意的是不要過度地吃東西,另外要少喝水,如果是在鼻子有症狀或者是有咽喉症狀的話,盡量不要去檢測核酸。首先我們要知道這個核酸的檢測,它是確定新型冠狀病毒肺炎的一個很重要的方法。
其實通過核酸檢測的結果,可以確診或者是排除患者的新冠病毒的診斷,或者是確診或者是排除。在檢測的時候,醫護人員會拿一個非常長的棉簽,我們叫咽拭子,在咽後壁進行旋轉、取樣,如果我們吃太多的食物,很可能會引起惡心反射、咳嗽反射,從而導致誤吸,一定要空腹。但是如果我們有咽喉部或者鼻部的炎症,也不適合去采樣,容易出現大出血,所以還是等情況穩定的時候去做核酸。
核酸的檢測時間怎麼算
核酸的檢測結果不會馬上出來,那麼對於核酸的檢測時間怎麼算呢?
核酸的檢測一般是從做完核酸采樣之後開始算時間。對於發熱門診患者的核酸檢測,應在6小時內報告結果,並努力將報告時間縮短至4小時。對於普通門急診患者、住院患者和護理人員的核酸檢測,原則上應在12小時內報告結果。對於願意接受檢測的人的核酸檢測,結果通常在24小時內報告。
目前,核酸的檢測採用實時定量PCR方法被廣泛應用於檢測COVID-19特異性核酸片段。測試時,醫生會用類似拭子的拭子擦拭扁桃體和咽凹附近的分泌物,或通過鼻腔清除鼻咽後部的分泌物,然後將其放入試管中,然後送到檢驗部門做相應的病毒核酸檢測。核酸檢測通過五個步驟完成:取樣、樣品保留、保存、核酸提取和計算機檢測。
『貳』 認識核酸提取的知識筆記2020-05-07
一.核酸抽提原理:
核酸抽提包含樣品的裂解和純化兩大步驟。其是:裂解樣品中的核酸游離在體系;純化游離的核酸,使之與體系中的其它成分分離(如蛋白質、鹽及其它雜質徹底分離)。
常用的裂解液:包括去污劑 (如 SDS、Triton X-100、NP-40、Tween 20 等) 和鹽 (如 Tris、EDTA、NaCl 等)。
去污劑的作用,是通過使蛋白質變性、破壞膜結構、解開與核酸相連接的蛋白質,從而實現核酸游離在裂解體系中。
鹽的作用,除了提供一個合適的裂解環境 (如 Tris),還包括抑制樣品中的核酸酶在裂解過程中對核酸的破壞 (如 EDTA)、維持核酸結構的穩定 (如NaCl) 等。
裂解體系中還可能加入蛋白酶,利用蛋白酶將蛋白質消化成小的片段,促進核酸與蛋白質的分開,同時,也便於後面的純化操作以及獲得更純的核酸。也有直接使用高濃度的蛋白質變性劑 (如 GIT、GuHCl 等) 裂解的,該方法已經成為了 RNA 抽提的主流,卻不是基因組 DNA 抽提的主流。
二.最常用的純化方法
(一) PC 抽提(Phenol-chloroform extraction:酚氯仿抽提)+醇沉澱:利用PC對裂解體系進行反復抽提以去除蛋白質,實現核酸與蛋白質的分離,再用醇將核酸沉澱下來,實現核酸與鹽的分離。
(二)介質純化:利用某些固項介質,在某些特定的條件下,選擇性地吸附核酸,而不吸附蛋白質及鹽的特點,實現核酸與蛋白質及鹽的分離。
(三)高鹽沉澱去除蛋白質是第一種純化方法的一個變體,省略了PC操作的麻煩,也有不純化的抽提方法,但是用途多局限於簡單的 PCR。
三.裂解方法的評價
(一)含蛋白酶的裂解方法是抽提基因組 DNA 的首選。包括裂解游離的膜蛋白與基因組 DNA 相連接的游離蛋白質。
(二)不使用蛋白酶的去污劑裂解方法,在細胞基因組 DNA 抽提方面仍然有優勢。尤其是當得率和純度要求不是最高,而經濟性及操作簡單很重要時,控制好裂解液/樣品的比例是該方法成功的關鍵。該方法結合高鹽沉澱,可以實現最簡單的操作,但純度及得率的穩定性可能會比用 PC 抽提的差一些。
(三)高濃度蛋白質變性劑 (如 GIT、GuHCl 等) 的裂解方法是抽提 RNA 的首選。
(四)含 CTAB 的裂解液,幾乎成為富含多糖的樣品,如細菌、植物的基因組 DNA 抽提的首選裂解方法。
(五)SDS 鹼裂解法是質粒抽提的首選裂解方法,具有快速、得率高、幾乎無基因組 DNA 污染的特點。
(六)PCR 模板的簡易裂解方法,也是使用面很廣的一類方法。該方法的特點是無須純化,樣品被裂解後即可直接取裂解液用於 PCR,非常快速。
四.純化方法的評價
(一)PC 抽提/醇沉澱方法:穩定、可靠、經濟、方便。PC 抽提可以徹底去除蛋白質,醇沉澱可以去除鹽,對於一般的干凈的樣品 (雜質為蛋白質),該方法完全可以獲得高質量的核酸。
(二)高鹽沉澱蛋白質/醇沉澱方法:同樣也是一個非常不錯的方法。與 PC 抽提方法相比,除了純度的穩定性可能要低一點外,該方法幾乎克服了 PC 抽提的所有缺點。更快、更輕松去除蛋白質所伴隨的好處是,可以用於大規模抽提,不足是純度 (蛋白質殘留) 不夠穩定。
(三)介質純化方法:是一個越來越受到重視的方法。其最大特點是非常適合大規模核酸抽提,並且因為受人為操作因素影響小,純度的穩定性很高 (雖然純度不一定比PC 純化方法更高)。其致命弱點是樣品過量。介質可以分為兩大類,一類是柱式的,即介質被預先裝填在下面是通的柱子里;另外一類則是顆粒狀 (如Glassmilk、磁性小珠等)。
五.醇的沉澱
醇的沉澱,目的是使核酸從裂解體系中沉澱下來,從而實現核酸與其它雜質(主要是鹽)的分離。實際操作中,許多雜質也會與核酸一起被醇沉澱下來,尤其是當其它雜質的濃度也比較高的時候。醇的沉澱並不是非常特異性的,任何有機大分子及一些鹽,當濃度達到一定水平後,都可能同步被沉澱下來。最有參考價值的是 TRIzol 提供的一個沉澱方案:一半異丙醇加一半高鹽溶液替代純粹的異丙醇,可以大大降低多糖殘留。
PEG、LiCl、CTAB 都可以用於核酸沉澱。雖然它們遠沒有醇沉澱的高使用頻率,但卻各有特點。LiCl 可以沉澱 RNA 以去除DNA,CTAB 可以從含多糖的裂解體系中將核酸沉澱下來。PEG是沉澱病毒顆粒的方便手段。
六.洗滌
洗滌首先一定要將沉澱懸浮起來;第二就是要有一定的時間,尤其是當核酸沉澱比較大時 (使核酸沉澱最終蓬鬆);第三是少量多次;第四則是去上清要徹底。
七.核酸質量的檢測問題
目前用於正式實驗前檢測核酸質量的方法,一是電泳,二是紫外分光光度儀。
(一)電泳檢測的主要是核酸的完整性和大小,只要核酸不是太小或者太大 (超出電泳分離范圍),電泳還可以用於估計核酸的濃度,但其准確度與經驗有關;另外,電泳也可能提供某些雜質污染的信息。
(二)紫外分光光度儀檢測的是純度和核酸含量,該儀器的靈敏度非常高,A230 : A260 : A280 = 1 : 2 (DNA 為 1.8) : 1 為理論上的數據,實際測定時會有一些差別;但如果差別太大,就有問題了。如: A260/A230 > 2 就是純的,如果 A260/A280
> 2.3 就是核酸降解,A260/A230比2大許多,一定是有雜質殘留的。
八.核酸的溶解和保存
純化後的核酸,最後多使用水或者低濃度緩沖液溶解;其中 RNA以水為主,DNA 則多以弱鹼性的 Tris 或者 TE 溶解。經典的 DNA 溶解方法多提倡使用 TE 溶解,認為 EDTA 可以減少DNA 被可能殘留下來的 DNase 降解的風險;如果操作過程式控制製得當,DNase 的殘留幾乎是可以忽略的,完全可以直接使用 Tris 或者水 (pH 接近 7) 溶解DNA。
實驗室常用保存方法: -20℃保存的 DNA, -70℃保存的RNA。
『叄』 核酸幾種方法
1.定磷法。簡單快捷,靈敏度高,但易受蛋白質和核苷酸影響。
2.定糖法。靈敏度高,但特異性差,戊糖也會產生反應,容易產生干擾。
3.紫外線吸收法。適用於濃度大的核酸溶液,而人體感染新冠病毒後,咽部所含的病毒量極少,無法通過此種方法被檢測。
4.熒光法。目前廣泛被使用的是熒光定量RT-PCR檢測法,通過對標本進行逆轉錄擴增、使病毒片段達到一定數量,可以被檢測到,但是由於受采樣標本、運輸等多種因素影響,也有假陰性的可能。
『肆』 核酸提取中除去蛋白質的方法主要有哪幾種
可以用氯仿抽提之後離心,離心後分三層,下層有機層中有一些脂溶性的雜質,中間層白色絮狀沉澱是蛋白,上清液中即含有核酸。也有很多試劑盒,是可以把核酸掛在柱子上,把蛋白質等雜質離心掉,這個方法即快捷又方便。
凝膠過濾,這是很容易去除小分子雜質物質的方法。
如果蛋白樣本和核酸的分子大小差別比較大,可以考慮用超濾的方法。
超濾是以壓力為推動力的膜分離技術之一,以大分子與小分子分離為目的 。
加入核酸酶消化三個小時。
比如加一定量的DNAase 和RNAse酶消化。
(4)目前核酸提取常用方法擴展閱讀:
核酸模板在核酸聚合酶、引物、四種單脫氧核苷酸存在條件下復制或轉錄時,如果在四管反應系統中分別按比例引入四種雙脫氧核苷酸,只要雙脫氧核苷酸摻入鏈端,該鏈就停止延長,鏈端摻入單脫氧核苷酸的片段可繼續延長。
如此每管反應體系中便合成以共同引物為5』端,以雙脫氧核苷酸為3』端的一系列長度不等的核酸片段。反應終止後,分四個泳道進行電泳。以分離長短不一的核酸片段(長度相鄰者僅差一個核苷酸),根據片段3』端的雙脫氧核苷酸,便可依次閱讀合成片段的核苷酸排列順序。
『伍』 核酸提取或純化技術主要有哪幾類
核酸提取或純化技術主要有三類:
1、傳統方法(操作復雜,耗時長)
2、離心柱法(試劑盒)
3、磁珠法(可單獨采購磁珠或買成品試劑盒)
其中,磁珠法可實現自動化操作,是目前比較主流的方法。
核酸提取應用在疾病控制中心、臨床疾病診斷、輸血安全、法醫學鑒定、環境微生物檢測、食品安全檢測、畜牧業和分子生物學研究等多種領域。
(5)目前核酸提取常用方法擴展閱讀:
核酸提取的注意事項:
1、儀器的安裝環境:正常的大氣壓(海拔高度應該低於3000m)、溫度20-35℃、典型使用溫度25℃、相對濕度10%-80%、暢通流入的空氣為35℃或以下。
2、避免將儀器放置在靠近熱源的地方,如電暖爐;同時為防止電子元件的短路,應避免水或者其他液體濺入其中。
3、進風口和排風口均位於儀器背面,同時避免灰塵或纖維在進風口聚集,保持風道的暢通。
4、核酸提取儀離其他豎直面至少10cm。
5、儀器接地:為了避免觸電事故,儀器的輸入電源線必須接地。
6、遠離帶電電路:操作人員不得擅自拆解儀器,更換元件或進行機內調節必須有持證的專業維修人員完成,不要在接通電源的情況下更換元件。
『陸』 核酸的提取方法有幾種
DNA的提取方法有7種:酚抽提法、甲醯胺解聚法、玻璃棒纏繞法、異丙醇沉澱法、表面活性劑快速制備法、加熱法快速制備、鹼變性快速制備。核酸是一類生物聚合物,是所有已知生命形式必不可少的組成物質。核酸是脫氧核糖核酸(DNA)和核糖核酸(RNA)的總稱。
脫氧核糖核酸(英文DeoxyriboNucleicAcid,縮寫為DNA)是生物細胞內含有的四種生物大分子之一核酸的一種。DNA攜帶有合成RNA和蛋白質所必需的遺傳信息,是生物體發育和正常運作必不可少的生物大分子。DNA由脫氧核苷酸組成的大分子聚合物。脫氧核苷酸由鹼基、脫氧核糖和磷酸構成。其中鹼基有4種:腺嘌呤(A)、鳥嘌呤(G)、胸腺嘧啶(T)和胞嘧啶(C)。