『壹』 巧克力囊腫的最佳治療方法
可以手術，也可以選擇超聲下穿刺。
手術雖然風險大，花費也高，但更准確一些。畢竟僅有超聲說是巧囊，存在一定的誤差可能，做手術可以送病理確診。
『貳』 巧克力囊腫最佳治療
巧克力囊腫主要是子宮內膜的異位症，來月經的時候它會充血增大。這種情況下，主要是根據巧克力囊腫的大小來選擇治療的方案。如果巧克力囊腫小於五厘米，一般可以選擇葯物治療，比如選擇金剛藤、桂枝茯苓丸或者達拉唑膠囊，這些葯物進行治療效果會比較好。同時可以觀察，因為懷孕之後巧克力囊腫可能會吸收或消失掉。但是如果巧克力囊腫比較大，大於五厘米，因為它很容易導致急性壞死出血，對於患者的危險是很大的。這個情況下就應該盡早的採取腹腔鏡的手術，剔除巧克力囊腫，還可以保存部分的卵巢功能。如果後期越來越大，不處理，對於卵巢的損害是很大的。
『叄』 卵巢巧克力囊腫如何治療
卵巢巧克力囊腫在臨床上主要是手術治療，術後因為卵巢囊腫具有復發性，所以如果計劃懷孕，建議盡快准備懷孕。否則一旦巧克力囊腫復發，在臨床上會導致不孕不育的可能。沒有計劃懷孕者建議在術後可以用達菲林治療，連續用葯3個月到半年的時間，避免巧克力囊腫復發。另外，也可以上宮內節育器，比如用曼月樂環治療巧克力囊腫復發，主要是可以導致子宮內膜萎縮。這樣在臨床上導致閉經的情況，也會抑制巧克力囊腫的復發。