『壹』 浼犳煋鐥呯殑鐥呭師瀛︽鏌ユ柟娉曚笉鍖呮嫭
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『貳』 鑒定未知病原體的技術有哪些
鑒定未知病原體的技術雀明棗可以用快速測試片技術法,具體介紹如下:
快速測試片是指以紙片、紙膜、膠片等作為培養基載體,將特定的培養基和顯色物質附著在上面,通過微生物在上面的生長、顯色來測定食品中微生物的方法。
細菌總數檢測紙片的研製始於20世紀80年代,其主要優點是簡便、實用、經濟、操作性強。近年來槐閉以濾紙和美國某公司的Petrifilm為載體的測試片已開始被廣泛應用。
每個人一生中可能受到150種以上的病原體感頃拆染,在人體免疫功能正常的條件下並不引起疾病,有些甚至對人體有益,如腸道菌群(大腸桿菌等)可以合成多種維生素。
『叄』 抗體檢測怎麼檢測(核酸、抗原、抗體檢測)
自 2020 年新冠疫情爆發以來,「核酸檢測」作為一項檢測是否感染的重要指標,開始反復出現在我們的生活中。2022 年 3 月 10 日,國務院應對新型冠狀病毒肺炎疫情聯防聯控機制綜合組發布通知,決定推進「抗原篩查、核酸診斷」的檢測模式,在核酸檢測基礎上增加抗原檢測作為補充。
抗原檢測是什麼?和其他的檢測手段有什麼不同?這篇文章,我們以新型冠狀病毒為例,講講常見的快速篩查手段,聊聊相關的原理以及適用范圍。
想要對一種疾病或是一種物質進行篩查,我們首先要弄清楚的就是「從何下手」的問題,其次是「如何檢測」,讓微觀世界的變化反映到我們眼前,幫助我們作出判斷。
我們面對的是病毒。根據大家耳熟能詳的中學生物課知識,病毒是一類由遺傳物質和蛋白質外殼組成的類生命體 。如果想對病毒的感染情況進行探測,就需要從它的組分下手。接下來的內容,希望大家帶著自己中學的生物知識閱讀。
以目前正在困擾我們的 SARS-CoV-2 為例。它屬於冠狀病毒科下,冠狀病毒亞科的乙型冠狀病毒屬,是已知的第七種能夠感染人類的冠狀病毒。所有的冠狀病毒都是具有 包膜 的 正義單鏈 RNA 病毒 ,也就是說,它們的遺傳物質是一條單獨的 RNA 鏈,並且這條 RNA 鏈可以直接作為 mRNA(信使 RNA)參與翻譯,指導蛋白質的合成。
編號為NPRC 2020.00002的毒種,圖片由國家病原微生物資源庫(中國疾病預防控制中心病毒病預防控制所)提供。
我們現在的目的是檢測標本中是否存在這種病毒,無論是檢測它本身,還是檢測病毒帶來的產物,能夠下手的方向也就是兩種:蛋白質外殼(包膜)、遺傳物質。
順著這個邏輯,那最顯而易見的方法就是檢查它「能不能看到」,但病毒本體小得很,SARS-CoV-2 的直徑在 80-120 nm,要想每個標本都拿電鏡過一遍是不現實的,人力物力和財力都撐不住。那麼更經濟實惠的方法,就是通過某些措施,讓 病毒的組分 ,或是因為病毒而出現的 某些特殊物質 積攢到一定數量級後發光、變色,出現 宏觀表現 。
那麼我們的問題就轉化成了,選擇一種可以觀察到宏觀尺度變化的方法,和病毒的組分、病毒引發的某種物質產生關聯。我們能選擇的物質也擺在檯面上:病毒的遺傳物質,在這里是它的 RNA;病毒的包膜,也就是蛋白質外殼;以及,如果你還記得一些基礎的生物知識,人體的免疫系統會在感染病毒之後產生抗體以抵抗入侵,它也是不錯的選材。
我們目前採用的幾種檢測方式,也就從這些物質(以及它們的相關物質)脫胎而來,分別為針對遺傳物質的核酸檢測,針對包膜的抗原檢測,以及針對抗體的血清抗體檢測。
作為病毒的遺傳物質,核酸序列載寫了能夠鑒定病毒為某一特定種的基因特徵,因此核酸陽性,也就意味著病毒在體內存在過。
我們目前進行的「核酸檢測」其實分為兩個部分。平常我們進行的「捅鼻子」「捅嗓子」取樣和後續的定性是第一部分。在取得標本之後,因為病毒量太少,樣本會在實驗室中進行一定次數的擴增,並根據熒光反應結果來判定陽性陰性。
第二部分,確定為陽性的樣本,還需要通過基因測序,確定樣本病毒的分型,以便溯源。這一步已經不屬於日常篩查的范疇,但在流行病學調查上具有重大意義,如果有興趣了解,可以參看 Wikipedia 簡要了解。
我們平常參與的作為 篩查 工具的核酸檢測,指的就是採集到定性的第一部分。
在感染了 SARS-CoV-2 之後,咽拭子、痰、下呼吸道分泌物、血液等標本中均可發現病毒核酸。不同部分標本核酸檢測的陽性率有一定差異,隨著病程進展,各個部位的檢出率也會發生變化。
我們習慣稱呼的「鼻拭子」與「咽拭子」,其實都是採集咽腔後壁的分泌物與組織,前者採集鼻咽,後者採集口咽。也有採用其他標準的,比如唾液等亦可作為檢測標本,本質上也是不同地區規定有差異
鼻(咽)拭子與(口)咽拭子已經是綜合了陽性率與便利程度的考量。糞便和尿液等其實也可以作為標本採集的對象。而且根據一項對 31 例患者的研究,肛拭子的准確率要高於鼻咽與口咽采樣,尤其病程後期,肛拭子確診病例的鼻拭子陽性率不到 30%。 4 但顯然,由於操作的限制,它無法作為早期篩查的首選手段。
接下來的工作,就是從獲取的那一點點標本中提取核酸。由於樣本中病毒的數量級很小,不足以拿來分析,還需要將其擴增並標記。需要用到的同樣是高中學過的知識:聚合酶鏈式反應(PCR)——這一步看起來麻煩,但由於它的原理和工序已經研究成熟,實際操作中只需要加好試劑送機器,整個核酸檢測的過程里最麻煩的還是讓待測者安安分分弄來標本(笑)。
各地疾控機構或檢測中心會采購合適的核酸 提取試劑盒 與核酸 檢測試劑盒 。提取試劑盒負責將 RNA 從混雜的樣本(細胞碎屑、分泌物、灰塵等雜質)中提取出來,常見的有磁珠法、離心柱法和釋放劑法,不同提取方法可能對後期檢測的准確度略有影響 。之後,提純出的 RNA 就會移交給檢測試劑盒(也有一些試劑盒將兩者合一),進行之後的工序。
檢測試劑盒帶著樣本在機器中進行的過程,就是這個檢測中最主要的反應:RT-qPCR(實時定量逆轉錄聚合酶鏈反應)。
接下來需要你撿起高中生物的知識。一般的 PCR 反應有以下幾步:
加熱:讓雙鏈 DNA 解旋變形,成為兩條單鏈; 退火:讓混合的單鏈 DNA 與根據需要復制的片段而設計好的引物結合; 延伸:調整溫度,讓 DNA 聚合酶順著引物開始工作,復制出新鏈,形成新的雙鏈。在對病毒的探測中,我們要做的工作也無非上面幾步,只是需要多出兩樣東西:
在第一次反應之前,使用 逆轉錄酶 (依賴 RNA 的 DNA 聚合酶),合成病毒單鏈 RNA 的互補鏈,組合成 cDNA ; 在退火與延伸的階段,除了引物和所需的酶外,還需要 TaqMan 探針 。你可以把 TaqMan 探針這樣理解:它的主體部分是一段寡核苷酸鏈,被設計成能和一小部分需要復制的基因片段配對成雙鏈的樣子;它一端接了一個熒光分子,另一端接了一個開關(淬滅基團),兩者和探針相連時,熒光就會被淬滅基團壓制,探測不到。退火時,這個探針會和引物一起結合在要復制的單鏈片段上。在延伸的過程中,DNA 聚合酶會把擋在面前的障礙物切碎,其中就包括這段探針,淬滅基團和熒光分子就這樣分離,熒光就表現出來。
隨著循環數的增多,擴增的 DNA 片段和熒光也越來越多。對比每個循環的熒光亮度和前若干次循環的基準亮度,我們就能得出目前的 DNA 片段量,也可以直接用循環數和熒光亮度做定性的判斷。
那麼具體復制哪一部分呢?既然要探測病毒,那我們就選取最有代表性的核酸片段。現行的標准中,ORF 基因與 N 基因是常用的檢測位點。
檢測試劑盒負責的就是將提取出的 RNA(樣本)投入後,根據試劑盒上的程序說明,設定對應的 PCR 溫度與時長,由機器控制完成擴增過程,在固定的環節收集熒光信號,記錄對應的循環數(Ct 值)。判斷陰性陽性 / 是否還具有傳染力的標准,就是看熒光信號達到閾值時,目前循環數是多少。根據目前現行的《新型冠狀病毒肺炎診療方案(試行第九版)》,解除隔離管理的標准為 Ct 值 ≥ 35 。和此前通行的 ≥40 標准相比,出院與解除隔離的時間會大大縮短 。
經 RT-PCR 的核酸檢測到現在都是確診的金標准,因為它在方法學的角度看來,(理論上)可以做到 100% 准確。但核酸檢測耗時長、對環境與操作人員要求高,在環境條件達不到標准、物資與儀器不齊全等情況下,大批量的核酸檢測會帶來巨大人力與財力消耗。
在本次疫情中,我們採用的免疫測定包括了快速抗原檢測與抗體檢測,它以 抗原-抗體反應 為基本原理,旨在通過抗原與抗體快速的中和效應,以較少的時間成本探測樣本中是否存在待測物。兩者都屬於免疫層析法的范疇。
以盒裝方式出現、可以自行操作的抗原檢測就很適合作為物資不足、自我測定等情況下的補充。
核酸檢測檢查的是病毒的(標志性)遺傳物質,是病毒的「內里」。那麼(快速)抗原檢測檢查的就是病毒的「外在」,直接檢查完整的病毒顆粒。目前通過審批的抗原檢測試劑盒包括三種類型:膠體金法、乳膠法、熒光免疫層析法。三者內在原理一致。但其中熒光免疫層析法試劑盒仍然需要專用的檢測儀或紫外線手電筒,不適合家庭自測;膠體金法和乳膠法則都是將檢查結果轉化成肉眼可見的條帶,差別在於用於標記上色的物質不同。
當然,抗原檢測自然有它的劣勢在,它的 假陰性率 (是陽性但顯示陰性)要更高,可能導致漏檢錯檢。但放在一杯茶就能出結果的時間優勢面前,准確性上的差距在某些特定情況下可以暫時讓步。
圖源:How the SARS-CoV-2 EUA Antigen Tests Work | ASM.org
和核酸檢測相比,抗原檢測增加了「鼻拭子」這一采樣途徑,降低了個人自測的難度。拭子上的樣本在緩沖液中洗脫,取液體滴加在加樣孔後,液體會因為毛細作用,帶著潛在的抗原,經過一片預載了抗體的區域(結合墊,conjugate pad)。
這片區域上的抗體,是抗目標抗原(SARS-CoV-2)的單克隆抗體,每一個抗體分子都和特別的標記結合,它們與樣本中的抗原發生反應,形成抗原-抗體復合物,並隨著毛細作用向下一條帶流去。
緊接著經過的是檢測線(T 線,test line),在檢測線上附著的同樣是抗目標抗原的單克隆抗體,你可以理解成這里的東西和結合墊上的一樣,只是沒帶標記。此時,如果受測者已經感染了 SARS-CoV-2,他留在樣本中的抗原形成的抗原-抗體復合物,會在此處與固定在線上的抗體再次結合。在這里,這些帶著標記的復合物不斷沉積,最終會顯示出一條或深或淺的條帶。條帶的顏色來源,就是之前結合墊上的抗體分子附著的標記,在膠體金法中是膠體狀態的金顆粒,在乳膠法中是上色的乳膠滴,在熒光法中是熒光分子。所以你在使用這類試紙時,會發現剛剛加樣結束,液體剛開始擴散的時候,擴散的最前端會有一點點很淡的顏色不斷推移,這就是還沒有固定沉積的標記的顏色。
接下來,液體繼續擴散,經過質控線(C 線,control line),在質控線上附著的是另一種抗體——『抗「抗目標抗原的單克隆 抗體 」 的 單克隆 抗體 』,簡稱「 二抗 」。這種新的抗體是讓上一種抗體在另一種動物的免疫系統中反應得來的,比如結合墊的抗體來自兔,那這里的抗體就來自羊,是羊抗兔的單克隆抗體。也就是說, 二抗的抗原是 之前在 結合墊上的抗體 。這條線就是為了檢測液體有沒有正常擴散、結合墊上的抗體有沒有失效等等而存在的。此時,液體中剩餘的大量來自結合墊的抗體就會作為抗原,與質控線上的二抗發生抗原抗體反應,形成復合物,顯出一條明顯的條帶。
由於結合墊上的抗體非常充裕,這條質控線條帶會出現得非常快、非常顯色,而檢測線由於抗原(病毒)數量不一定,顯色速度會有差別,但一般在 15 分鍾內就足夠判斷結果。所以不要看 C 線很明顯,T 線隱隱約約就覺得「沒事了」, T 線不管深淺,只要有,就是陽性 。
具體操作方面,可以參考醫政醫管局發布的 教學視頻。目前國家也在逐步推廣抗原自測試劑盒,在一定程度上可以減輕未來醫療與街道的壓力。
除了前兩種檢測手段外,還有一種使用不太多,但同樣重要的檢測方法,就是同屬免疫測定方法的「血清抗體檢測」。
抗體檢測採用的試劑盒與抗原檢測非常接近,但標本的限制更大——由於檢測的對象變成了抗體,標本就必須是明確有抗體存在的血液(或血漿、血清)。而且人體在初次感染病毒後,並不會第一時間內產生抗體。抗體能夠明確達到被檢測的數量級,一般是在初次感染(或接種疫苗)的一到兩周之後。這些條件限制了抗體檢測不能作為確診性質的檢查。目前,血清抗體檢測僅作為一定情況下檢查疫苗是否生效,或查驗受測者近期是否感染過新冠病毒的方法。
在人體中有五種抗體,分別是 IgA、IgD、IgE、IgG 和 IgM。IgA 主要負責黏膜免疫。IgD 與免疫反應激活有關。IgE 抵禦寄生蟲,同時也參與過敏反應。剩下的 IgG 與 IgM 就是對抗病原體的過程中,免疫系統派出的主力軍。
SARS-CoV-2 作為病原體,人體經刺激主要分泌的就是 IgG 與 IgM 兩種。現有的抗體檢測試劑盒,主要也是針對人體對 SARS-CoV-2 的 N 蛋白(核衣殼蛋白)或 S 蛋白(刺突蛋白)產生的 IgG 與 IgM。
抗體試劑盒的檢測裝置外觀和抗原檢測別無二致。二者的差別就是上文中提到的結合墊、檢測線、質控線上附著的物質。
這次,加樣孔中滴入的樣本可能有對 SARS-CoV-2 的抗體。因此,結合墊上就應當是帶了標記物的抗原——當然不可能放活病毒上來。一般這里使用的都是設計檢測的抗原蛋白,比如前文提到的 N 蛋白或 S 蛋白,或是重組病毒,無論是哪種,它都必須包含受體結合域(RBD)作為抗體結合的靶點。在檢測線上,附著的就是抗 IgM 或抗 IgG 抗體,以捕獲結合了抗原的抗體蛋白。最後,質控線上附著抗原的特異性抗體,捕獲剩餘的游離抗原。
總的說來,三種檢測方式針對的是不同的需求,互有優勢,互相補充。核酸檢測作為金標准,直接查驗病毒的 RNA,負責看被檢者帶不帶病毒;抗原檢測作為快速檢測方法,查的是病毒的蛋白質,但准確度不如核酸檢測,對傳染力強的感染者更有效;抗體檢測查的是疫苗有沒有生效、人近期有沒有感染過病毒。
近期,新冠疫情在各地卷土重來。Omicron 變種與此前流行的 Delta 變種相比,雖然病死率與重症率明顯下降,但潛伏期更短,病毒復制速度更快,傳染力明顯增強。希望大家在這樣的環境中保持健康。
『肆』 椋熸簮鎬ц嚧鐥呰弻鐨勫揩閫熸嫻嬫柟娉曟湁鍝浜涳紵
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『伍』 支原體衣原體怎麼檢查
問題一:怎樣檢查支原體和衣原體 10分 原體和衣原體檢查都是提取尿道分泌物,然後進行化驗。最好停用抗生素10天後去醫院檢查,避免出現「假愈」現象。如果前列腺已經感染需要與尿道炎同時治療,尿道前端刺癢應該是尿道炎症狀。停葯後做一下葯敏試驗,試驗與支原體、衣原體檢查同時進行,到時候別忘了提醒醫生。葯敏試驗的目的是根據身體對葯物敏感性合理用葯,既防止錢財鄲必要浪費,又能有效治療。
祝你早日恢復健康
問題二:在婦科檢查中,什麼叫衣原體,支原體檢查 衣原體、支原體是引起人體感染的一種非常小的微生物,它的特徵主要有幾點,一個是它感染人體初期的症狀不是很明顯,經常我們發現的時候,它已經時間比較長了,已經感染了其他的組織或器官了。所以初期症狀不明顯。第二個特點,衣原體、衣原體造成的危害是比較大的,尤其是對生殖系統。第三,衣原體支原體的治療相對來說是比較困難的。
1、支原體一般對泌尿生殖系統的感染有三種,解脲支原體,人型支原體,還有生殖道支原體,還有感染呼吸系統,引起肺炎,我們叫肺炎支原體,一般來說支原體有四型。
支原體是一類大小和結構復雜程度介於病毒和細菌之間,能在人工培養基中生長、增殖的最小原核微生物。大小約為 0.3~0.4μm,難以在顯微鏡下看清楚。由於支原體缺乏細胞壁,故在形態上呈多形性。迄今,已知的支原體有150多種,廣泛分布在自然界中。寄居於人類的支原體有16種,其中寄居在人泌尿生殖道中的常見支原體包括解脲支原體、人型支原體、生殖支原體、靈長類支原體、嗜 *** 支原體、穿通支原體等6種。由於口和生殖器接觸,有時寄居於泌尿生殖道的支原體(如解脲支原體、人型支原體、生殖支原體、穿通支原體)偶爾可在口咽部分離出來。相反,有些寄居在口咽部的支原體(如發酵支原體、唾液支原體、肺炎支原體)也可出現在泌尿生殖道中。解脲支原體、人型支原體和生殖支原體等三種支原體是目前在正悄喊醫學領域最受重視的支原體。
支原體不耐乾燥,對熱抵抗力差,煮沸或高溫、紫外線均能輕易將支原體殺滅。同時,支原體易被脂溶劑、清潔劑、常用消毒劑,如酒精、酚、甲醛、來蘇爾等滅活。
2、衣原體常說的是說只有沙眼衣原體,可以感染我們的眼睛,也可以感染我們的泌尿生殖系統,衣原體在臨床上是比較大的一個話題。
衣原體是自然界中傳播很廣泛的病原體。多呈球狀、堆狀,有細胞壁,以一般寄生在動物細胞內。從前它們被劃歸病毒,後來發現自成一類。是一種比病毒大、比細菌小的原核微生物,呈球形,直徑只有O.3-0.5微米,它無運動能力,衣原體廣泛寄生於人類,哺乳動物及鳥類,僅少數有致病性。
衣原體為革蘭氏陰性病原體,是一種專性細胞內微生物,沒有合成高能化合物ATP、GTP的能力,必須由宿主細胞提供,因而成為能量寄生舉野物。衣原體是一類能通過細胞濾器,有獨特發育周期、嚴格細胞內寄生的原核細胞型微生物。
主要是通過性接觸傳播,進入生殖道後,喜歡進入粘膜細胞內生長繁殖,在女性引起子宮內膜炎、輸卵管炎、盆腔炎、尿道炎等。在男性可引起尿道炎、附睾炎、直運數腸炎等炎症。女性感染沙眼衣原體,會引起不孕、異位妊娠(宮外孕)、流產、死胎、胎膜早破、早產等。
問題三:衣原體檢查方法有哪些 衣原體是引起非淋菌性尿道炎(宮頸炎)的主要病原微生物的一種。衣原體分為三種,即沙眼衣原體、鸚鵡熱衣原體和肺炎衣原體。引起性病是沙眼衣原體。沙眼衣原體具有細胞壁、核糖體、DNA和RNA,具有合成蛋白質、核酸和脂類的能力,但不能產生三磷酸腺苷,因而完全依靠宿主細胞提供必需的能量,所以沙眼衣原體是一類在真核細胞內寄生的微生物,即在細胞內寄生是其特點。沙眼衣原體引起的疾病,除非淋菌性尿道炎外,還有沙眼、包涵體性結膜炎、性病淋巴肉芽腫、衣原體性宮頸炎、輸卵管炎、副睾炎、直腸炎、新生兒肺炎等。臨床對沙眼衣原體的檢查方法包括:1、塗片直接鏡檢:主要用於眼部標本,診斷沙眼,姬姆薩染色後在上皮細胞內查找包涵體。2、抗原檢測:①直接免疫熒光抗體檢測法。②酶聯免疫吸附試驗。這兩種方法均有快速、簡單、敏感性高的優點,廣泛應用於新近感染的臨床診斷。缺點是死菌也可被檢測到,易出現假陽性。3、細胞培養:此法操作復雜,操作條件要求高,但是檢測衣原體的「金標准」。4、血清學試驗:主要用於流行病學調查,對診斷急性輸卵管炎、附睾炎、肛周炎和嬰兒衣原體肺炎有價值。5、分子生物學技術:包括核酸探針檢測法、核酸擴散技術(PCR)、連接酶鏈反應等,敏感性均高。正常參考值: 正常人 陰性(譚立明)
問題四:男性支原體衣原體怎麼檢查 您好!
最准確的應該尿道取樣,衣原體化驗一般50分鍾出結果,支原體做細菌培養,3天出結果,檢查出致病菌後在針對性用葯,並且日常需要注意衛生,檢查的前三天避免同房,最好夫妻同治。
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問題五:女性支原體衣原體的檢查方法 1 快速抗原檢測:多採用單克隆抗體直接免疫熒光法檢測標本中的衣原體還可應用2I―IsA法加入抗衣原體抗體酶標抗體18G及底物進行比色定量檢測這兩種方法簡便敏感.2 血常規:周圍血白細胞計數一般正常嗜酸性粒細胞增多.3 PcR技術 普通PcR技術檢測肺炎衣原體特異性DNA具有快速簡便特異的優點敏感性高於細胞分離技術但在檢測咽拭於標本中效果不夠理想用套式PcR(nPcR)檢測可顯著提高其敏感性.4 x線檢查:衣原體肺炎胸片無特異性多為單側下葉浸潤表現為節段性肺炎嚴重者呈廣泛雙側肺炎沙眼衣原體肺炎胸片顯示雙側廣泛間質和肺泡浸潤過度充氣征比較常見偶見大葉實變.5 血清學檢查 採用補體結合試驗著恢復期血清抗體效價比急性期血清效價增高 4倍或4倍以上即有診斷意義但無早期診斷意義微量免疫熒光法(MrF)適用於沙眼衣原體.6 直接塗片鏡檢:取咽分泌物痰呼吸道教膜或其他部位標本做塗片進行GZmesa染色原體染成紅色始體染成深藍色沙眼衣原體包涵體因含有糖原801染色染成褐色.7 衣原體分離 肺炎衣原體培養最好用Hela細胞或Hep一2細胞一般取氣管或鼻咽吸取物作為臨床標本及時接種目前衣原體鑒定多採用Hela細胞或Hep一2細胞培養後通過特異性單克隆熒光抗體法(MFA)該技術敏感性高特異性強如能早期採集標本可在48h內獲得陽性結果。
『陸』 微生物生長的常用檢測方法
一、生長量測定法
1.1體積測量法:又稱測菌絲濃度法。
通過測定一定體積培養液中所含菌絲的量來反映微生物的生長狀況。方法是,取一定量的待測培養液(如10毫升)放在有刻度的離心管中,設定一定的離心時間(如5分鍾)和轉速(如5000rpm),離心後,倒出上清夜,測出上清夜體積為v,則菌絲濃度為(10-v)/10。菌絲濃度測定法是大規模工業發酵生產上微生物生長的一個重要監測指標。這種方法比較粗放,簡便,快速,但需要設定一致的處理條件,否則偏差很大,由於離心沉澱物中夾雜有一些固體營養物,結果會有一定偏差。
1.2稱乾重法:
可用離心或過濾法測定。一般乾重為濕重的10-20%。在離心法中,將一定體積待測培養液倒入離心管中,設定一定的離心時間和轉速,進行離心,並用清水離心洗滌1-5次,進行乾燥。乾燥可用烘箱在105℃或100℃下烘乾,或採用紅外線烘乾,也可在80℃或40℃下真空乾燥,乾燥後稱重。如用過濾法,絲狀真菌可用濾紙過濾,細菌可用醋酸纖維膜等濾膜過濾,過濾後用少量水洗滌,在40℃下進行真空乾燥。稱乾重發法較為煩瑣,通常獲取的微生物產品為菌體時,常採用這種方法,如活性乾酵母(activitydryyeast,ADY),一些以微生物菌體為活性物質的飼料和肥料。
1.3比濁法:
微生物的生長引起培養物混濁度的增高。通過紫外分光光度計測定一定波長下的吸光值,判斷微生物的生長狀況。對某一培養物內的菌體生長作定時跟蹤時,可採用一種特製的有側臂的三角燒瓶。將側臂插入光電比色計的比色座孔中,即可隨時測定其生長情況,而不必取菌液。該法主要用於發酵工業菌體生長監測。如我所使用UNICO公司的紫外-可見分光光度計,在波長600nm處用比色管定時測定發酵液的吸光光度值OD600,以此監控E.Coli的生長及誘導時間。
1.4菌絲長度測量法:
對於絲狀真菌和一些放線菌,可以在培養基上測定一定時間內菌絲生長的長度,或是利用一隻一端開口並帶有刻度的細玻璃管,到入合適
的培養基,卧放,在開口的一端接種微生物,一段時間後記錄其菌絲生長長度,藉此衡量絲狀微生物的生長
二、微生物計數法
2.1血球計數板法:
血球計數板是一種有特別結構刻度和厚度的厚玻璃片,玻片上有四條溝和兩條嵴,中央有一短橫溝和兩個平台,兩嵴的表比兩平台的表面高0.1mm,每個平台上刻有不同規格的格網,中央0.1mm2面積上刻有400個小方格。通過油鏡觀察,統計一定大格內微生物的數量,即可算出1毫升菌液中所含的菌體數。這種方法簡便,直觀,快捷,但只適宜於單細胞狀態的微生物或絲狀微生物所產生的孢子進行計數,並且所得結果是包括死細胞在內的總菌數。
2.2染色計數法:
為了彌補一些微生物在油鏡下不易觀察計數,而直接用血球計數板法又無法區分死細胞和活細胞的不足,人們發明了染色計數法。藉助不同的染料對菌體進行適當的染色,可以更方便的在顯微鏡下進行活菌計數。如酵母活細胞計數可用美藍染色液,染色後在顯微鏡下觀察,活細胞為無色,而死細胞為藍色。
2.3比例計數法:
將已知顆粒(如黴菌孢子或紅細胞)濃度的液體與一待測細胞濃度的菌液按一定比例均勻混合,在顯微鏡視野中數出各自的數目,即可得未知菌液的'細胞濃度。這種計數方法比較粗放。並且需要配製已知顆粒濃度的懸液做標准。
2.4液體稀釋法:
對未知菌樣做連續十倍系列稀釋,根據估計數,從最適宜的三個連續的10倍稀釋液中各取5毫升試樣,接種1毫升到3組共15隻裝培養液的試管中,經培養後記錄每個稀釋度出現生長的試管數,然後查最大或然數表MPN(mostprobablynumber)得出菌樣的含菌數,根據樣品稀釋倍數計算出活菌含量。該法常用於食品中微生物的檢測,例如飲用水和牛奶的微生物限量檢查。
2.5平板菌落計數法:
這是一種最常用的活菌計數法。將待測菌液進行梯度稀釋,取一定體積的稀釋菌液與合適的固體培養基在凝固前均勻混合,或將菌液塗布於已凝固的固體培養基平板上。保溫培養後,用平板上出現的菌落數乘以菌液稀釋度,即可算出原菌液的含菌數。一般以直徑9cm的平板上出現50-500個菌落為宜。但方法比較麻煩,操作者需有熟練的技術。平板菌落計數法不僅可以得出菌液中活菌的含菌數,而且同時將菌液中的細菌進行了一次分離培養,獲得了單克隆。
2.6試劑紙法:
在平板計數法的基礎上,發展了小型商品化產品以供快速計數用。形式有小型厚濾紙片,瓊脂片等。在濾紙和瓊脂片中吸有合適的培養基,其中加入活性指示劑2,3,5-氯化三苯基四氮唑(TTC,無色)待蘸取測試菌液後置密封包裝袋中培養。短期培養後在濾紙上出現一定密度的玫瑰色微小菌落與標准紙色板上圖譜比較即可估算出樣品的含菌量。試劑紙法計數快捷准確,相比而言避免了平板計數法的人為操作誤差。
2.7膜過濾法:
用特殊的濾膜過濾一定體積的含菌樣品,經丫叮橙染色,在紫外顯微鏡下觀察細胞的熒光,活細胞會發橙色熒光,而死細胞則發綠色熒光。
2.8生理指標法:
微生物的生長伴隨著一系列生理指標發生變化,例如酸鹼度,發酵液中的含氮量,含糖量,產氣量等,與生長量相平行的生理指標很多,它們可作為生長測定的相對值。
2.9測定含氮量:
大多數細菌的含氮量為乾重的12.5%,酵母為7.5%,黴菌為6.0%。根據含氮量×6.25,即可測定粗蛋白的含量。含氮量的測定方法有很多,如用硫酸,過氯酸,碘酸,磷酸等消化法和Dumas測N2氣法。Dumas測N2氣法是將樣品與CuO混合,在CO2氣流中加熱後產生氮氣,收集在呼吸計中,用KOH吸去CO2後即可測出N2的量。
2.10測定含碳量:
將少量(乾重0.2-2.0mg)生物材料混入1毫升水或無機緩沖液中,用2毫升2%的K2Cr2O7溶液在1000C下加熱30分鍾後冷卻。加水稀釋至5毫升,在580nm的波長下讀取吸光光度值,即可推算出生長量。需用試劑做空白對照,用標准樣品做標准曲線。
2.11還原糖測定法:
還原糖通常是指單糖或寡糖,可以被微生物直接利用,通過還原糖的測定可間接反映微生物的生長狀況,常用於大規模工業發酵生產上微生物生長的常規監測。方法是,離心發酵液,取上清液,加入斐林試劑,沸水浴煮沸3分鍾,取出加少許鹽酸酸化,加入Na2S2O3臨近終點時加入澱粉溶液,繼續加Na2S2O3至終點,查表讀出還原糖的含量。
2.12氨基氮的測定:
方法是,離心發酵液,取上清液,加入甲基紅和鹽酸作指示劑,加入0.02N的NaOH調色至顏色剛剛褪去,加入底物18%的中性甲醛,反應數刻,加入0.02N的使之變色,根據NaOH的用量折算出氨基氮的含量。根據培養液中氨基氮的含量,可間接反映微生物的生長狀況。
2.13其他生理物質的測定:
P,DNA,RNA,ATP,NAM(乙醯胞壁酸)等含量以及產酸,產氣,產CO2(用標記葡萄糖做基質),耗氧,黏度,產熱等指標,都可用於生長量的測定。也可以根據反應前後的基質濃度變化,最終產氣量,微生物活性三方面的測定反映微生物的生長。如我所在BMP-2的發酵生產上,隨時監測溶氧量的變化和酸鹼度的變化,判斷細菌的長勢。
拓展:微生物的現代定義
肉眼難以看清,需要藉助光學顯微鏡或電子顯微鏡才能觀察到的一切微小生物的總稱。微生物包括細菌、病毒、真菌和少數藻類等。(但有些微生物是肉眼可以看見的,像屬於真菌的蘑菇、靈芝等。)病毒是一類由核酸和蛋白質等少數幾種成分組成的「非細胞生物」,但是它的生存必須依賴於活細胞。根據存在的不同環境分為空間微生物、海洋微生物等,按照細胞結構分類分為原核微生物和真核微生物。
微生物的主要特徵
體小面大
一個體積恆定的物體,被切割的越小,其相對表面積越大。微生物體積很小,如一個典型的球菌,其體積約1mm,可是其表面積卻很大。這個特徵也是賦予微生物其他如代謝快等特性的基礎。
吸多轉快
微生物通常具有極其高效的生物化學轉化能力。據研究,乳糖菌在1個小時之內能夠分解其自身重量1000-10000倍的乳糖,產朊假絲酵母菌的蛋白合成能力是大豆蛋白合成能力的100倍。
生長繁殖快
相比於大型動物,微生物具有極高的生長繁殖速度。大腸桿菌能夠在12.5-20分鍾內繁殖1次。不妨計算一下,1個大腸桿菌假設20分鍾分裂1次,1小時3次,1晝夜24小時分裂24×3=72次,大概可產生4722366500萬億個(2的72次方),這是非常巨大的數字。但事實上,由於各種條件的限制,如營養缺失、競爭加劇、生存環境惡化等原因,微生物無法完全達到這種指數級增長。 已知大多數微生物生長的最佳pH范圍為7.0 (6.6~7.5)附近,部分則低於4.0。
微生物的這一特性使其在工業上有廣泛的應用,如發酵、單細胞蛋白等。微生物是人類不可或缺的好朋友。
適應強 易變異
分布廣 種類多
微生物對我們生活的影響
微生物對人類最重要的影響之一是導致傳染病的流行。在人類疾病中有50%是由病毒引起。微生物導致人類疾病的歷史,也就是人類與之不斷斗爭的歷史。在疾病的預防和治療方面,人類取得了長足的進展,但是新現和再現的微生物感染還是不斷發生,像大量的病毒性疾病一直缺乏有效的治療葯物。一些疾病的致病機制並不清楚。大量的廣譜抗生素的濫用造成了強大的選擇壓力,使許多菌株發生變異,導致耐葯性的產生,人類健康受到新的威脅。一些分節段的病毒之間可以通過重組或重配發生變異,最典型的例子就是流行性感冒病毒。每次流感大流行流感病毒都與前次導致感染的株型發生了變異,這種快速的變異給疫苗的設計和治療造成了很大的障礙。而耐葯性結核桿菌的出現使原本已近控制住的結核感染又在世界范圍內猖獗起來。
微生物千姿百態,有些是腐敗性的,即引起食品氣味和組織結構發生不良變化。當然有些微生物是有益的,它們可用來生產如乳酪,麵包,泡菜,啤酒和葡萄酒。微生物非常小,必須通過顯微鏡放大約1000 倍才能看到。比如中等大小的細菌,1000個疊加在一起只有句號那麼大。
微生物能夠致病,能夠造成食品、布匹、皮革等發霉腐爛,但微生物也有有益的一面。最早是弗萊明從青黴菌抑制其它細菌的生長中發現了青黴素,這對醫葯界來講是一個劃時代的發現。後來大量的抗生素從放線菌等的代謝產物中篩選出來。抗生素的使用在第二次世界大戰中挽救了無數人的生命。一些微生物被廣泛應用於工業發酵,生產乙醇、食品及各種酶制劑等;一部分微生物能夠降解塑料、處理廢水廢氣等等,並且可再生資源的潛力極大,稱為環保微生物;還有一些能在極端環境中生存的微生物,例如:高溫、低溫、高鹽、高鹼以及高輻射等普通生命體不能生存的環境,依然存在著一部分微生物等等。看上去,我們發現的微生物已經很多,但實際上由於培養方式等技術手段的限制,人類現今發現的微生物還只佔自然界中存在的微生物的很少一部分。
微生物間的相互作用機制也相當奧妙。例如健康人腸道中即有大量細菌存在,稱為正常菌群,其中包含的細菌種類高達上百種。在腸道環境中這些細菌相互依存,互惠共生。食物、有毒物質甚至葯物的分解與吸收,菌群在這些過程中發揮的作用,以及細菌之間的相互作用機制還不明了。一旦菌群失調,就會引起腹瀉。
隨著醫學研究進入分子水平,人們對基因、遺傳物質等專業術語也日漸熟悉。人們認識到,是遺傳信息決定了生物體具有的生命特徵,包括外部形態以及從事的生命活動等等,而生物體的基因組正是這些遺傳信息的攜帶者。因此闡明生物體基因組攜帶的遺傳信息,將大大有助於揭示生命的起源和奧秘。
工業微生物涉及食品、制葯、冶金、采礦、石油、皮革、輕化工等多種行業。通過微生物發酵途徑生產抗生素、丁醇、維生素C以及一些風味食品的制備等;某些特殊微生物酶參與皮革脫毛、冶金、採油采礦等生產過程,甚至直接作為洗衣粉等的添加劑;另外還有一些微生物的代謝產物可以作為天然的微生物殺蟲劑廣泛應用於農業生產。通過對枯草芽孢桿菌的基因組研究,發現了一系列與抗生素及重要工業用酶的產生相關的基因。乳酸桿菌作為一種重要的微生態調節劑參與食品發酵過程,對其進行的基因組學研究將有利於找到關鍵的功能基因,然後對菌株加以改造,使其更適於工業化的生產過程。國內維生素C兩步發酵法生產過程中的關鍵菌株氧化葡萄糖酸桿菌的基因組研究,將在基因組測序完成的前提下找到與維生素C生產相關的重要代謝功能基因,經基因工程改造,實現新的工程菌株的構建,簡化生產步驟,降低生產成本,繼而實現經濟效益的大幅度提升。對工業微生物開展的基因組研究,不斷發現新的特殊酶基因及重要代謝過程和代謝產物生成相關的功能基因,並將其應用於生產以及傳統工業、工藝的改造,同時推動現代生物技術的迅速發展。
經濟作物柑橘的致病菌是國際上第一個發表了全序列的植物致病微生物。還有一些在分類學、生理學和經濟價值上非常重要的農業微生物,例如:胡蘿卜歐文氏菌、植物致病性假單胞菌以及中國正在開展的黃單胞菌的研究等正在進行之中。日前植物固氮根瘤菌的全序列也剛剛測定完成。借鑒已經較為成熟的從人類病原微生物的基因組學信息篩選治療性葯物的方案,可以嘗試性地應用到植物病原體上。特別像柑橘的致病菌這種需要昆蟲媒介才能完成生活周期的種類,除了殺蟲劑能阻斷其生活周期以外,只能通過遺傳學研究找到毒力相關因子,尋找抗性靶位以發展更有效的控制對策。固氮菌全部遺傳信息的解析對於開發利用其固氮關鍵基因提高農作物的產量和質量也具有重要的意義。[10]
在極端環境下能夠生長的微生物稱為極端微生物,又稱嗜極菌。嗜極菌對極端環境具有很強的適應性,極端微生物基因組的研究有助於從分子水平研究極限條件下微生物的適應性,加深對生命本質的認識。
『柒』 細菌的鑒定有哪些
細菌的鑒定有哪些:
實驗室使用常用的培養方法通常可以識別常見細菌的典型菌株。然而,當資料庫中沒有非典型菌株或稀有或新出現的細菌時的確會出現問題。
細菌培養往往是通過形態特徵以及生長特徵分辨細菌,進一步的鑒定還包括:
生化鑒定:主要是藉助細菌對營養物質分解能力的不同及其代謝產物的差異對細菌進行鑒定,包括蛋白質分解產物試驗、觸酶試驗、糖分解產物試驗、氧化酶試驗、凝固酶試驗等。
血清學鑒定:適用於含較多血清型的細菌,用已知抗體檢測未知抗原(待檢測的細菌),或用已知抗原檢測患者血清中的相應抗細菌抗體及其效價。血清學鑒定操作簡單快速,特異性高,可在生化鑒定基礎上為細菌鑒定提供確定診斷。
分子生物學檢測:適用於人工培養基不能生長、生長緩慢及營養要求高不易培養的細菌,主要是對基因、蛋白質、細胞及其他生物進行大信息量分析的檢測技術。16S rRNA 基因序列分析法逐漸成為臨床細菌鑒定、分離的金標准。
免疫學鑒定:通過 ELISA 的方法進行細菌檢測。這種方法度敏感高,但它依賴於非常特異的抗體和高度區分的蛋白質。
質譜分析:通常使用氣相色譜法和質譜法的組合對脂肪酸進行分析。脂肪酸在細菌細胞膜中是必不可少的,不同的細菌種類會產生不同的脂肪酸組合。 該脂肪酸譜可用於通過與已知譜匹配來確定未鑒定的細菌種類。