㈠ 熒光PCR法與PCR熒光探針法有何不同
熒光定量PCR法檢測的是SYBR Green摻入到雙鏈DNA中的量。SYBR Green摻入到雙鏈DNA中後會發出熒光。但是只要是雙鏈,它都摻。
而探針法是當探針結合到目標序列上以後,聚合酶降解探針後,探針上自帶的熒光基團離開淬滅基團,從而發出熒光。
從兩者的原理上來看,不難判斷,熒光PCR法更加簡單方便,而且成本低。而探針法特異性更強。
(1)熒光pcr檢測方法擴展閱讀:
熒光定量PCR(Flurogenic Quantitative Polymerase ChainReaction,FQ-PCR;real-time quantitative PCR, RT-qPCR or qPCR)。
1996 年由美國Applied Biosystems 公司推出的一種新定量試驗技術,它是通過熒光染料或熒游標記的特異性探針,標記跟蹤PCR產物進行實時監測反應,利用與之相適應的軟體對產物進行分析,計算待測樣品模板的初始濃度。
㈡ 什麼是實時熒光定量PCR,檢測指標是什麼
實時熒光定量PCR( realtime fluorescence quantitative PCR,RTFQ PCR) 是1996 年由美國Applied Biosystems 公司推出的一種新定量試驗技術,它是通過熒光染料或熒游標記的特異性的探針,對PCR產物進行標記跟蹤,實時在線監控反應過程,結合相應的軟體可以對產物進行分析,計算待測樣品模板的初始濃度。
檢測指標是:各樣品的目的基因和管家基因分別進行Realtime PCR反應。PCR產物與 DNA Ladder在2%瓊脂糖凝膠電泳,GoldView染色,檢測PCR產物是否為單一特異性擴增條帶。
原理:
PCR擴增時在加入一對引物的同時加入一個特異性的熒光探針,該探針為一寡核苷酸,兩端分別標記一個報告熒光基團和一個淬滅熒光基團。探針完整時,報告基團發射的熒光信號被淬滅基團吸收;剛開始時, 探針結合在DNA任意一條單鏈上;PCR擴增時,Taq酶的5』端-3』端外切酶活性將探針酶切降解,使報告熒光基團和淬滅熒光基團分離,從而熒光監測系統可接收到熒光信號,即每擴增一條DNA鏈,就有一個熒光分子形成,實現了熒光信號的累積與PCR產物形成完全同步。
㈢ 請問熒光定量pcr是一個檢測儀器的名稱還是檢測方法
PCR是一種檢測方法,因此法是一種基因擴增法,實驗室條件要求很高,臨床使用實驗室達不到要求,造成假陽性很多,特別是在性病門診的使用,所以衛生部已下文停用,只用於科研。
檢測性病,有用棉拭子采樣的方法,檢測一般是顯微鏡檢和培養法,如淋病等。還有就是采血檢測抗體的方法,如梅毒、艾滋病。
㈣ 熒光檢測方法
熒光檢測是一種自然發光反應,通過熒光素酶與 ATP進行反應,可檢測人體細胞、細菌、黴菌、食物殘渣,在15秒鍾內得到反應結果。光照度通過專用設備進行測量,並以數字形式予以表示,在1975年首先被應用到食品工業中,在1985年在化妝品製造業中得到應用。
熒光定量:採用國際主流的熒光定量PCR技術,迅速提升技術水平。
結果穩定:檢測結果CV值與進口全自動PCR儀接近,具有自檢功能,避免錯誤數據的輸出。
封閉操作:全部檢測過程均為閉管操作,於反應管處檢測熒光,有效防止污染,解決PCR技術中最棘手之難題。
准確定量:滿足臨床對量化的需求,定量盪圍寬,可涵蓋大部分病原微生物,自動曲線擬合。
靈敏度高:利用光譜信號靈敏性的優勢,有效提高檢測靈敏度。
安全:全程無毒檢測。
操作簡便:省去後處理的煩瑣過程。
直接列印:直接列印結果,無須記錄大量數據。
升級版:FS1000有與電腦連接的數傳輸口,可以連接電腦,根據用戶需要提供先進分析軟體,全面分析實驗數據。(電腦和列印機選配件)
故障率低:維護非常簡單。
節約資源:可利用現用PCR擴增儀,最大限度節約資源。
㈤ 如何用熒光PCR做定性檢測實驗
就直接把熒光定量PCR儀當定性PCR儀用就行了呀,只是不要定量PCR結果而已
㈥ PCR產物的檢測方法有哪些
PCR產物的檢測方法:
瓊脂糖凝膠電泳
這是實驗室最常用的方法,簡便易行,只需少量DNA即可進行實驗。其原理是不同大小的DNA分子通過瓊脂糖凝膠時,由於泳動速度不同而被分離,經溴化乙錠(EB)染色,在紫外光照射下DNA分子發出熒光而判定其分子的大小。
用於電泳檢測PCR產物的瓊脂糖濃度常為1%—2%,應該使用純度高的電泳純級瓊脂糖,這種瓊脂糖已除去了熒光抑制劑及核酸酶等雜質。
(1)制膠
瓊脂糖凝膠厚度約為3~5mm。過薄則加樣孔樣品會溢出來,過厚觀察時熒光穿透不強以至有些小片段DNA帶型不易分辨。如配製2%凝膠100ml,稱取瓊脂糖2g於三角瓶中,加入100ml0.5×TBE液,微波爐加熱2-5min,使瓊脂糖完全溶解(注意不要暴沸),置室溫等溫度下降至60℃時,加入終濃度0.5μg/ml的EB液,充分混勻後倒板(注意排除氣體)。
(2)加樣和電泳
上樣時一般取PCR反應液5~10μl,加入3μl溴酚蘭液,充分混勻,加入凝膠加樣孔中。電泳儀可用一般穩壓可調中壓電泳儀,電泳工作液為0.5×TBE液,接通電源,使樣品由負極向正極移動。60-100V恆壓電泳約30-60分鍾。
(3)檢測
將凝膠板放在紫外透射儀的石英玻璃台上進行檢測,DNA產物與熒光染料EB形成橙黃色熒光復合物。觀察各泳道是否有橙黃色熒光帶出現,並與擴增時所設的陽性對照比較,判斷陽性或陰性結果。也可在電泳時以標準分子量作對照,判斷其擴增片段是否與設計的大小相一致。
聚丙烯醯胺凝膠電泳
聚丙烯醯胺凝膠電泳比瓊脂糖凝膠電泳繁瑣,但在引物純化、PCR擴增指紋圖、多重PCR擴增、PCR擴增產物的酶切限制性長度多態性分析時常用到。
聚丙烯醯胺凝膠電泳分辨DNA片段的有效范圍:
(1)制膠
在兩塊制膠玻璃板中間放上墊片,放上制膠架,擰緊制膠螺絲夾緊玻璃板。
制備適量合適濃度的凝膠,使之略多於膠板。制備100μl體積凝膠的配製方法見下表。
不同濃度(%)聚丙醯胺凝膠的製法:
在加入TEMED和10%過硫酸銨後,立即混勻,倒入放置45℃角的玻璃板內,完全注滿(注意不要有氣泡),迅速將玻璃板放置水平位置。立即放成型梳子於腔頂並夾緊,待30-60分鍾膠聚合後,取下膠板,放入電泳槽中固定。
(2)加樣和電泳
上下槽中加入1×TBE電泳緩沖液,溢過加樣孔,拔出梳子,排出加樣孔中的氣泡,將PCR產物或限制性內切酶消化產物2與1上樣緩沖液混勻,用微量注射器加入加樣孔底部,使樣品在孔底成一層,兩側孔中加入標準分子量的DNAMarker。
以2-10V/cm電壓電泳,電泳時間足夠長,使片斷足以分開,待指示劑走到適宜位置時關閉電源,將膠片取出。
(3)銀染
分開兩塊玻璃板,將凝膠片放入100ml銀染固定液中振盪15min,雙蒸水洗3次,每次2min,然後將凝膠片轉入100ml0.2%的AgNO3中於搖床上染色約10min,吸去AgNO3液,用雙蒸水洗3次,每次30s,加入100ml顯色液約7-10min,待DNA帶顯示清除時,吸去顯色液,加入固定液Na2CO3,靜置2-3min,取出凝膠觀察。
㈦ 熒光定量PCR檢測
如果臨床症狀已經沒有了
微生物死了 它的DNA只是會延遲一段時間消失
不表示它會一直存在著
葯物治療後一兩個星期用PCR法測
應該就測不出陽性了
說明完全好了
不過PCR法在這個領域唯一的優點就是快速
不太適合跟蹤監測治療效果
你可以考慮用微生物培養法
不過要去好的醫院
具體情況可以向醫生咨詢
要相信大多數醫生還是有醫德的
還不給我分數嗎?
㈧ 乙型肝炎病毒DNA熒光PCR定量檢測
Ct值是熒光定量PCR的一個指標,代表達到設定閾值所需要的循環數。一般Ct值越小定量值越高。通俗地將,這個檢測結果的意義是:通過熒光定量PCR的方法檢測血液中乙肝病毒DNA的量。儀器測得Ct值為18.20,根據Ct值與定量DNA之間的換算公式,計算出每毫升血中含有82450000(八千多萬)個乙肝病毒DNA分子。也就是說每毫升血液中有八千多萬個乙肝病毒。
㈨ RT-PCR檢測方法的具體步驟
RT-PCR檢測方法的具體步驟如下:
(一)RNA提取
1、根據標本數量分裝RLT液:從Kit中取出RLT液,用1.5mL離心管分裝,每管500μL(在體系配製區操作)。
2、在生物安全櫃內將采樣液(鼻拭子、咽拭子、胸水等)或病毒培養物(雞胚尿囊液或細胞培養液)取100μL加入RLT液管中,充分混勻。 3、每管分別加入5μL β-巰基乙醇,混勻後依次加入600μL 70%的乙醇,充分混勻。
4、從Kit中取出帶濾柱的2mL收集管,打開包裝將其做好標記。取步驟(3)中的混合液600μL加入濾柱中,12000rpm,離心15s,棄收集管中的離心液。
5、濾柱仍放回收集管上,將步驟(3)剩餘的混合液全部吸入濾柱中,12000rpm,離心15s,棄離心液。
6、於濾柱中加入700μL Wash Buffer RW1液,12000rpm,離心15s。
7、從QIAGEN RNeasy Mini Kit中取一支幹凈的2mL收集管,將離心後的濾柱移到新的收集管上,於濾柱中加入500μL Wash Buffer RPE液,12000rpm,離心15s。
8、棄收集管中的離心液,再於濾柱中加入500μL Wash Buffer RPE液,13000~14000rpm,離心2min。
9、將濾柱移到一個干凈的1.5mL eppendorf管上,向濾柱中加入30~50μL的Rnase-free Water,室溫靜置1~3min。
10、12000rpm,離心1min,收集離心液即為提取的病毒RNA,立即做實驗或-20℃以下保存。
注意:Buffer RPE使用之間加44mL無水乙醇。
(二)反應體系配製
1、實驗設計: 檢測標本RNA
陰性對照:無菌水(標本RNA提取時,跟標本同時提取無菌水。) 陽性對照:已知病毒RNA
2、PCR反應體系配製(在體系配製區配反應液) 1)按下表加入試劑: PCR反應體系
對每一個建立的反應確定反應數(n=擬進行的PCR管數,包括陰性,陽性對)。考慮到陰性無模板對照,陽性對照,誤差,制備過量的反應混合物是必要的。具體如下:
(1)如果包括對照,樣品的數量(n)為1到14,那麼N=n+1;
(2)如果包括對照,樣品的數量(n)大於15,那麼N=n+2。
2)將上述反應液混勻,分裝到0.2mL PCR小管中,每管20μL,分別做好標記。
3)加RNA模板(在核酸提取區)
將上述分裝好的PCR小管分別加入模板。首先加入陰性對照管(5μL無菌水),然後分別加標本RNA(每管5μL),最後加入陽性對照RNA(每管5μL)。
3、RT-PCR反應
將上述加好模板的反應管混勻,短暫離心後放入PCR儀進行RT-PCR 擴增。
4、RT-PCR產物檢測
1)2.0%瓊脂糖凝膠制備:稱取2.0g Agarose,倒入耐熱玻璃瓶內,再加入電泳液(1×TBE)100mL,輕輕混勻後加熱,使Agarose完全熔化。待Agarose膠溫度降至50~60℃左右,加入核酸染料,輕輕混勻(不要產生氣泡)。待膠溫度降至50℃左右時,將其倒入制膠板,插好電泳梳子。待膠完全凝固(約30~60min)之後,將梳子拔出。
2)將制備好的電泳膠放入電泳槽(帶梳子孔的一端在陰極),倒入電泳液(1×TBE)浸過膠面即可。
3)PCR產物各取10μL,加入2μL上樣緩沖液(6×Loading Buffer),混勻後加入電泳膠孔內(先加Marker(DL-2000)5μL,然後依次加標本PCR產物,再加陰性對照,最後加陽性對照產物)。 4)電泳電壓100V,約30~40min後看結果。 5)將電泳膠放入凝膠成像系統觀察結果並照相。
5、結果判斷。