❶ 如何測量RNA的純度和含量
RNA膠(凝膠成像)檢測。例如:原核生物的核糖體所含的rRNA有5S、16S及23S三種。在膠上就有三條明顯大小不一的條帶。
凝膠遷移分析。可以用來研究RNA-蛋白相互作用。基本原理是:結合了蛋白的RNA在凝膠中的遷移速率更慢,因而可以區分出結合蛋白與未結合蛋白的RNA條帶。RNA-seq即轉錄組測序技術,把mRNA,smallRNA等用高通量測序技術把RNA的序列測出來。反映出RNA的表達水平。
RNA純度:RNA在純化過程中容易受到DNA、蛋白質及有機溶劑的影響,這些殘存物將會影響以後的操作。光譜分析(NANODROP)利用物質對不同波長光的吸收度的不同,可以鑒別出溶液純度及濃度。
組成結構
RNA和DNA一樣,也是由各種核苷酸通過3′,5′-磷酸二酯鍵連接構成的多核苷酸鏈,但與DNA有一系列差異。
在化學組成方面,RNA含核糖而不含脫氧核糖。含尿嘧啶而不含胸腺密啶。例外的是,每個tNA分子含有一個胸腺嘧啶,這是在RNA鏈合成後由尿嘧啶甲基化生的,此外,前面已提到,少數DNA含有少量核糖,但這些個別的例外並不能以此否定兩類核酸組成上的差異。
以上內容參考:網路-核糖核酸
❷ RNA的提取及鑒定可以用哪些方法
傳統方法,可以用氛氯仿抽提,現在有很多的試劑盒,過柱子即可。鑒定方法,可以電泳檢測,測OD值,或是用安捷倫檢測,做qPCR也可以
❸ 如何檢測RNA提取成功或如何檢測RNA的完整性
檢測RNA的完整性的方法:
完整的總RNA在進行變性凝膠電泳時會產生清晰的28S和18S rRNA條帶(真核樣品)。28S rRNA條帶的強度應當大致為18S rRNA條帶的兩倍。這種2:1的比率(28S:18S)是判斷RNA完整性的一個很好的指標。
使用變性凝膠電泳來評估RNA完整性的一個缺陷是觀察所需的RNA樣品量。通常情況下,需要在變性凝膠中上樣至少200 ng的RNA才能在EtBr染色下進行觀察。而在某些RNA制備實驗中,如從穿刺活檢樣品或激光捕獲顯微切割樣品中提取RNA,得率是非常低的。這種情況下,或許就不可能在進行表達譜分析實驗前取出200ng的RNA來評估其完整性。其它的核酸染料,比如Moleculor Probes (Eugene, OR) 的SYBR® Gold及SYBR Green II RNA染料,相比傳統的瓊脂糖凝膠電泳EtBr染色方法可以顯著提高靈敏度。通過使用300nm的透射光源(6 x 15瓦的燈泡)及特殊的濾光片,SYBR Gold RNA凝膠染色可以檢測到低至1ng的RNA,而SYBR Green II則可以檢測到2ng,從而可以使用更少的樣品來進行RNA完整性分析。
目前有一種快速簡單的方法可以替代傳統的凝膠分析方法,這種方法可以同時對RNA樣品進行定量及質量評估。Agilent 2100 Bioanalyzer (Agilent Technologies)是第一款商業化的提供RNA樣品狀態細節信息的微流體儀器。當與RNA 6000 LabChip®(Caliper Technologies Corporation所擁有的一個注冊商標)結合使用時,每次進行分析最低僅需1µl濃度為10 ng/µl 的樣品。除了評估RNA完整性,這台自動化系統同樣可以提供樣品RNA濃度及純度(如mRNA制備中的rRNA污染)的評估。在過去,檢測濃度及純度需要使用部分RNA樣品(通過A260分光光度法),而評估完整性則需要另外使用部分樣品。通過使用LabChip®系統,可以僅使用一份5ng的樣品來同時對濃度、完整性及純度進行分析。分析數據可以顯示為類凝膠圖像、電泳峰圖及表格形式等。
❹ 小分子RNA的檢測方法
實時熒光定量PCR技術是1996年由美國Applied biosystems公司推出在定性PCR技術基礎上發展起來的核酸定量技術。該技術在PCR反應體系中加入熒光基團,利用熒光信號積累實時監測整個PCR進程,使每一個循環變得「可見」,最後通過Ct值和標准曲線對樣品中的DNA (或cDNA) 的起始濃度進行定量的方法。實時熒光定量PCR是目前確定樣品中DNA (或cDNA)拷貝數最敏感、最准確的方法。
目前市場上miRNA qPCR檢測方法主要有以下兩種:1. 兩步法; 2.三步加尾法。兩種方法的主要差別在於qPCR之前的cDNA制備過程(如圖)。其中兩步法是通過獨特設計的莖環結構引物進行反轉錄將miRNA反轉錄成cDNA。而三步法則是給miRNA序列加polyA尾,之後再利用反轉錄過程將miRNA反轉錄成cDNA並加上獨特設計的尾部序列。
兩步法的優勢在於特異性很高,但是最新的研究報道顯示在編輯過程中,miRNA 的3』序列的多樣化現象(Heterogeneity),這種現象的發生使得目前市場上qPCR兩步檢測法的准確性受到影響(如圖)。而三步法則不受這一現象的影響,而且隨著科學家們的不斷摸索創新,三步法的特異性如今已經可以和兩步法媲美。更重要的是低廉的價格也是三步檢測法越來越受到廣大研發人員喜愛的重要原因。
❺ RNA質量怎樣檢測與鑒定
檢測RNA溶液的吸光度
280、320、230、260nm下的吸光度分別代表了核酸、背景(溶液渾濁度)、鹽濃度和蛋白等有機物的值。一般的,我們只看OD260/OD280(Ratio,R)。1.82.0時,我們認為RNA中蛋白或者時其他有機物的污染是可以容忍的,不過要注意,當你用Tris作為緩沖液檢測吸光度時,R值可能會大於2(一般應該是<2.2的)。當R<1.8時,溶液中蛋白或者時其他有機物的污染比較明顯,你可以根據自己的需要決定這份RNA的命運。當R>2.2時,說明RNA已經水解成單核酸了。
生物幫有相關方面的介紹, http://www.bio1000.com/zt/cell/221848.html 細胞周期,細胞周期蛋白,檢測步驟方法,結果分析,細胞周期調控點,細胞周期的調控機制,細周期蛋白激酶,間期分裂期,時間,細胞周期試劑盒 。
❻ 細胞內DNA、RNA、蛋白質常用的分子生物學檢測方法shi
細胞內DNA用甲基綠檢測,而rna用吡羅紅檢測,蛋白質則用雙縮脲試劑檢測。