分子分型檢測方法

『壹』 丙肝的分子分型檢查是什麼

就是病毒的基因分慎坦型，根據基因分型能確定治療的方法，所以這個必寬蘆桐須要做，當然，如果你選擇用西葯的話是可以不做的，我聽出國看病交流平台的丙友說，嘩攔現在有個西葯吉3對丙肝所有分型的病毒都有用，不知道真的假的，你可以問問他們看。

『貳』 基因型分型的方法

基於分子雜交→基於DNA擴增→基於DNA測序

將DNA轉移到硝酸纖維素膜上，利用DNA-DNA雜交檢測特定DNA片段的方法。

通過設計不同的備埋指DNA探針可實現不同等位基因類型的區分。
探針設計是Southern Blot最為重要的環節之一。

又稱DNA chip/DNA微矩陣（DNA microarray）
將一系列已知序列的DNA探針分子以高密度固定於支持物上，通過與標記的DNA樣品分子進行雜交實現仿配DNA的序列分析。

優點：高通量、大規模、平行液塌化、集約化。
缺點：非特異性高。

以上內容參考中國大學MOOC網站復旦大學遺傳學。

『叄』 做基因分型檢測能檢查出來什麼嗎

基因檢測是通過血液隱純漏、其他體液或細胞對DNA進行檢測的技術。基因檢測可以診斷疾病，也可以用於疾病風險的預測。疾病診斷是用基因檢測技術檢測引起遺傳性疾病的突變基因。

目前應用最廣泛的基因檢測是新生兒遺傳性疾病的檢測、遺傳疾病的診斷和某些常見病的輔助診斷。目前有1000多種遺傳性疾病可以通過基因檢測技術做出診斷。

(3)分子分型檢測方法擴展閱讀：

主要方法：

1、TaqMan探針法

針對染色體褲碰上的不同SNP位點分別設計PCR引物和TaqMan探針，進行實時熒光PCR擴增。探針的5』-端和3』-端分別標記一個報告熒光基團和一個淬滅熒光基團。

當溶液中存在PCR產物時，該探針與模板退火，即產生了適合於核酸外切酶活性的底物，從而將探針5』-端連接的熒光分子從探針上切割下來，破壞兩熒光分子間的PRET，發出熒光。通常用於少量SNP位點分析。

2、SNaPshot法

該技術由美國應用生物公司（ABI）開發，是基於熒游標記單鹼基延伸原理的分型技術，也稱小測序，主要針對中等通量的SNP分型項目。在一個含有測序酶、四種熒游標記ddNTP、緊臨多態位點5』-端的不同長度延伸引物和PCR產物模板的反應體系中。

引物延伸一個鹼基即終止，經ABI測序儀檢測後，根據峰的移動位置確定該延伸產物對應的SNP位點，根據峰的顏色可得知摻入的鹼基種類，從而確定該樣本的基因型。對於PCR產物模板可通過多重PCR反應體系來獲得。通常用於10-30個SNP位點分析。

3、HRM法

高解析度熔解曲線分析（HRM）是近幾年興起的SNP研究工具，它通過實時監測升溫過程中雙鏈DNA熒光染料與PCR擴增產物的結合情況，來判斷是否存在SNP，而且不同SNP位點、是否是雜合子等都會影響熔解曲線的峰形，因此HRM分析能夠有效區分不同SNP位點與不同基因型。

這種檢測方法不受突變鹼基位點與類型的局限，無需序列特異性探針，在PCR結束後直接運行高解析度熔解，即可完成對樣品基因型的分析。該方法無需設計探針，操作簡便、快速，成本低，結果准確，並且實現了真正的閉管操作。

4、Mass Array法

MassARRAY分子量陣列技術是Sequenom公司推出的世界上領先的基因分析工具，通過引物延伸或切割反應與靈敏、可靠的MALDI-TOF-MS技術相結合，實現基因分型檢測。基於MassARRAY平台的iPLEX GOLD技術可以設計最高達40重的PCR反應和基因型檢測，分型結果准確性高。

根據應用需要，對數十到數百個SNP位點進行數百至數千份樣本檢測時，MassARRAY具有最佳的性價比，特別適合於對全基因組研究發現的結果進行驗證，或者是有限數量的研究位點已經確定的情況。

5、Illumina BeadXpress法

採用Illumina公司的BeadXpress系統進行批量SNP位點檢測，可以同時檢測1-384個SNP位點，往往用於基因組晶元結果確認，適合高通量檢測。

微珠晶元具有高密度、高重復性、高靈敏度、低上樣量、定製靈活等特點，極高的集成密度，從而獲得極高的檢測篩選速度，在高通量篩選時可顯著降低成本。灶爛

參考資料來源：網路-基因檢測

參考資料來源：網路-基因分型

『肆』 snp 分子標記的檢測技術

基因分型：是指利用資料庫中已有的SNP進行特定人群的序列和發生頻率的研究，主要包括因晶元技術，Taqman技術，分子信標技術和焦磷酸測序法等。
（一）、基因晶元技術
基因晶元技術：是在固相支持介質上進行分子雜交和原位熒光檢測的一種高通量SNP分析方法。
優缺點：
優點是高通量，一次可對多個SNP進行規模性篩選，被撿起始材料也很少，操作步驟簡單。缺點是晶元設計成本高，由於DNA樣品的復雜性，有些SNP不能被撿起。
（二）、Taqman技術
在pcr反應系統中加入2種不同熒游標記的探針，他們分別與兩個等位基因完全配對。探針運用了熒光共振能量轉換技術，探針的5』端和3』端分別用特殊染料標記，稱為供體-受體染料對或爆-猝滅燃料對。
（三）、分子信標技術
與Taqman技術相似，分子信標技術也是在PCR反應體系種加入熒游標記的探針與靶序列雜交，通過儀器檢測熒光值的變化，進行基因分型。
優缺點：
分子信法在選擇熒光染料時，不必像Taqman法那樣考慮染料之間光譜的重疊性，一次可以使用4種或4種以上染料，同時對多個SNP進行分析。Taqman法和分子信標法優點都是簡單操作，可以自動化；缺點是不能達到高通量分析，熒光探針費用高。
（四）、焦磷酸測序法
焦磷酸測序法是一種不依賴平板膠或毛細管電泳，不依賴DNA的熒游標記/激發/檢測體系的序列分析技術，適用於已知SNP的序列驗證及基因分型。焦磷酸測序法主要是由4種酶催化同一反應體系中的酶級聯反應，包括DNA聚合酶、硫酸化酶、熒光素酶和雙磷酸酶，反應底物為adenosine5』phosphosulfate 和熒光素

『伍』 乳腺癌患者該做哪些分子檢測

ER 、 PR 檢測

ER、PR是雌、孕激素受體。如果您的乳腺癌攜帶激素受體細胞過多，就被稱為激素受體陽性，否則為陰性。ER、PR陽性的乳腺癌一般分化較好，發展較慢，惡性程度低，緩解率好，復發少；陰性的乳腺癌一般分化較差，侵襲性強，發展較快，惡性程度高，通常易伴有淋巴結轉移；ER、PR中只有一項為陽性的病人，預後也好於均陰性者。

HER-2 檢測

HER-2是乳腺細胞膜內HER-2基因的受體。HER-2通過激活下游信號通路參與細胞增殖分化，這個過程會促使腫瘤的發生發展，是乳腺癌預後不良的獨立危險因素。

乳腺癌檢測中，如存在過多HER-2受體或基因，就被稱為HER-2陽性。需指出的是，HER-2檢測僅針對新診斷的浸潤性乳腺癌，原位癌患雀碧搭者進行此項檢測屬於過度檢測。另外，對初次檢測為三陰性乳腺癌的患頃拿者，建議慧隱可重新復核免疫組化指標。

Ki-67 檢測

Ki-67是一種核蛋白，可以提示細胞的增殖活躍程度。雖然檢測可靠性較差，但仍可以用作腫瘤增殖程度的替代標志物。

綜合ER、PR、HER-2、Ki-67的不同表達，目前公認的乳腺癌分子分型主要形成了四種臨床分型：管腔A（LuminalA）型乳腺癌、管腔B（LuminalB）型乳腺癌、人表皮生長因子受體2（HER-2）過表達型乳腺癌和三陰性乳腺癌。根據這四種分型會產生不同的治療方案。

『陸』 子宮內膜癌TCGA分子分型

我們對373例子宮內膜癌樣本進行了全方位的全外顯子測序，對 基因 的突變圖譜進行了全方位描述，基於晶元對 腫瘤拷貝數 變化進行全方位描述，基於 RNA測序 對基因表達進行全方位描述，基於 甲基化 晶元和 蛋白質 晶元對重要的蛋白質通路進行多層次描述。

之後我們發現在突變層面上， 第一組是超高突變 ，引起超高突變的主要原因是聚合酶epsilon（POLE）突變， 第二組是由微衛星高度不穩定（MSI-H）造成的高突變組 ，另外兩個類型差別在於拷貝數，一組拷貝數低，另一組拷貝數高。通過這樣的一些特徵，就可以把子宮內膜癌分成這樣四類：

註：

1.POLE基因主要編碼DNA多聚酶的主要催化和校正亞基，與核DNA的復制與修復相關。POLE亞型的主要特點是：體細胞超高突變率（233*10^6mutatuons/Mb）、POLE外切酶結構域（EDM）突變，高鹼基替換（C—A）和微衛星穩定。因POLE突變型的預後較好，與組織學的侵襲性的表現不一致，因此，該突變的篩選有助於判斷有生育要求保守治療的子宮內膜癌患者。

2.微衛星不穩定性（MSI）DNA錯配修復酶功能的喪失導致DNA鹼基錯配校正異常，從而引起具有微衛星重復序列的基因發生突變。

3.CNH是四個亞型中異質性最明顯的一組，包括97%的漿液性癌、75%混合性癌、19.6%高級別子宮內膜樣癌及5%G1-G2級子宮內膜樣癌。擾慶銀

進行這樣的分組後，由於在基緩宴因表達和蛋白質通路表達層面都有非常明確的通路激活或者抑制，也就為DNA層面的分型提供了更加有利的支持。

因為TCGA分型檢測費用高，術前診斷標本的結果與術中切除大體標本的診斷存在不一致性，往往以術中為准，但這無法指導手術必要性及范圍，故出現經濟、簡便、一致性好的替代檢測方案。

首先檢測POLE基因（單獨對POLE基因9和13號外顯子進行一代測序，分析其突變狀態），如果存在POLE的熱點突變即屬於超高突變型；若無這樣的突變，則繼續使用免疫組化檢測錯配修復蛋白（MMR），如果存在錯配修復蛋白表達缺失就可以劃為MSI-H型；而如果保有蛋白表達，再進行TP53的免疫組差野化檢測，檢測結果若是正常或者野生型的，就是低拷貝數型，如果有異常或者為突變型，就是高拷貝數型，這種類型也大致上對應於傳統的漿液亞型。

2021年4月13日

『柒』 肺癌怎麼治療

肺癌是最常見的惡性腫瘤之一，近年來在我國發病率呈上升趨勢，我國男性腫瘤患者中肺癌發病率、死亡率均居首位，女性患者中肺癌發病率占第二位。

臨床肺癌發現是多屬晚期，需要採取包括手術、放化療、中醫葯在內的多種治療方法綜合治療；隨著近幾年體檢發現早期肺癌的增多，肺癌早期手術治療比例相應增多，結合術後包括中醫葯治療，也明顯改善了肺癌患者的生存質量或生存時間。在肺癌治療的多個不同階段，中醫葯治療都發揮了積極的作用。

中醫辨證治療：應以溫化為法，排出濁毒之氣。同時要注重調節失調的臟腑功能，使五臟六腑調達疏泄功能恢復。最終達到消瘤的目的。

『捌』 SNP基因分型的常見方法有哪些

SNP基因分型的常見方法有如下幾種：

1. TaqMan探針法針對染色體上的不同SNP位點分別設計PCR引物和TaqMan探針，進行實時熒光PCR擴增。探針的5』-端和3』-端分別標記一個報告熒光基團和一個淬滅熒光基團。當溶液中存在PCR產物時，該探針與模板退火，即產生了適合於核酸外切酶活性的底物，從而將探針5』-端連接的熒光分子從探針上切割下來核清，破壞兩熒光分子間的PRET，發出熒光。通常用於少量SNP位點分析。

2.SNaPshot法該技術由美國應用生物公司（ABI）開發，是基於熒游標記單鹼基延伸原理的分型技術，也稱小測序，主要針對中等通量的SNP分型項目。在一個含有測序酶、四種熒游標記ddNTP、緊臨多態位點5』-端的不同長度延伸引物和PCR產物模板的反應體系中，引物延伸一個鹼基即終止，經ABI測序儀檢測後，根據峰的移動位置確定該延伸產物對應的SNP位點，根據峰的顏色可得知摻入的鹼基種類，從而確定該樣本的基因型。對於PCR產物模板可通過多重PCR反應體系前凳來獲得。通常用於10-30個SNP位點分析。

3.HRM法高解析度熔解曲線分析（HRM）是近幾年興起的SNP研究工具，它通過實時監測升溫過程中雙鏈DNA熒光染料與PCR擴增產物的結合情況，來判斷是否存在SNP，而且不同SNP位點、是否是雜合子等都會影響熔解曲線的峰形，因此HRM分析能夠有效區分不同SNP位點與不同基因型。這種檢測方法不受突變鹼基位點與類型的局限，無需序列特異性探針，在PCR結束後直接運行高解析度熔解，即可完成對樣品基因型的分析。該方法無需設計探針，操作簡便、快速，成本低，結果准確，並且實現了真正的閉管操作。

4.Mass Array法MassARRAY分子量陣列技術是Sequenom公司推出的世界上領先的基因分析工具，通過引物延伸或切割反應與靈敏、可靠的MALDI-TOF-MS技術相結合，實現基因分型檢測。基於MassARRAY平台的iPLEX GOLD技術可以設計最高達40重的改悔前PCR反應和基因型檢測，實驗設計靈活，分型結果准確性高。根據應用需要，對數十到數百個SNP位點進行數百至數千份樣本檢測時，MassARRAY具有最佳的性價比，特別適合於對全基因組研究發現的結果進行驗證，或者是有限數量的研究位點已經確定的情況。

5.Illumina BeadXpress法採用Illumina公司的BeadXpress系統進行批量SNP位點檢測，可以同時檢測1-384個SNP位點，往往用於基因組晶元結果確認，適合高通量檢測。微珠晶元具有高密度、高重復性、高靈敏度、低上樣量、定製靈活等特點，極高的集成密度，從而獲得極高的檢測篩選速度，在高通量篩選時可顯著降低成本。

『玖』 沙門氏菌的檢測標准

太多，DB標准設有列出，只列了國標和部分部標
GB/T 13091-2018 飼料中沙門氏菌的測定
GB/T 14926.1-2001 實驗動物 沙門菌檢測方法
GB/T 17999.8-2008 SPF雞 微生物學監測 第8部分：SPF雞 雞白痢沙門氏菌檢驗
GB/T 22429-2008 食品中沙門氏菌、腸出血性大腸埃希氏菌O157及單核細胞增生李斯特氏菌的快速篩選檢驗 酶聯免疫法
GB/T 28642-2012 飼料中沙門氏菌的快速檢測方法 聚合酶鏈式反應（PCR）法
GB 4789.31-2013 食品安全國家標准 食品微生物學檢驗 沙門氏菌、志賀氏菌和致瀉大腸埃希氏菌的腸桿菌科噬菌體診斷檢驗
GB 4789.4-2016 食品安全國家標准 食品微生物學檢驗 沙門氏菌檢驗
GSB 11-2275-2017 奶粉中沙門氏菌定性標准樣品
GSB 11-3354-2016 腸沙門氏菌腸亞種標准樣品
NY/T 550-2002 動物和動物產品沙門氏菌檢測方法
SN/T 1059.6-2016 出口食品中沙門氏菌屬檢測方法 第6部分：垂直膜過濾法
SN/T 1059.7-2010 進出口食品中沙門氏菌檢測方法 實時熒光PCR法
SN/T 1169-2002 猴沙門氏菌檢驗操作規程
SN/T 1382-2011 馬流產沙門氏菌凝集試驗方法
SN/T 2206.1-2016 化妝品微生物檢驗方法 第1部分：沙門氏菌
SN/T 3306.15-2018 國境口岸環介導恆溫擴增（LAMP）檢測方法 第15部分：沙門氏菌
SN/T 4274-2015 國境口岸沙門氏菌、志賀氏菌、大腸桿菌O157:H7的三重熒光PCR檢測方法
SN/T 4525.1-2016 出口食品中致病菌的分子分型 MLST方法 第1部分：沙門氏菌
SN/T 4545.1-2016 商品化試劑盒檢測方法 沙門氏菌 方法一
SN/T 4545.2-2016 商品化試劑盒檢測方法 沙門氏菌 方法二
SN/T 4624.7-2016 入境環保用微生物菌劑檢測方法 第7部分：沙門氏菌