基因多態性檢測方法

『壹』 孕期mthfr基因多態性檢測15.87ng/ml

Mthfr c677基因具有多態性，包括: cc，ct，tt。Cc 是正常的 tt 是最弱的。Ct 呈雜合性，功能中等，約占正常功能的60% 。亞甲基四氫葉酸還原酶，幫助體內葉酸的新陳代謝，發揮作用，如果這種基因問題，葉酸利用率低。孕婦或准備懷孕的夫婦可能導致胎兒先天性畸形，中老年人可能導致中風的高發病率。建議你咨詢醫生，根據自己的情況服用葉酸補充劑。

『貳』 多態性的基因多態性

基因多態性（gene polymorphism）是指處於隨機婚配的群體中，同一基因位點可存在2種以上的基因型。在人群中，個體間基因的核苷酸序列存在著差異性稱為DNA基因多態性(gene polymorphism)。這種多態性可以分為兩類，即DNA位點多態性(site polymorphism)和長度多態性 (longth polymorphism)。
1.位點多態性：
位點多態性是由於等位基因之間在特定的位點上DNA序列存在差異，也就是基因組中散在的鹼基的不同，包括點突變（轉換和顛換），單個鹼基的置換、缺失和插入。突變是基因多態性的一種特殊形式，單個鹼基的置換又稱為單核苷酸多態性(single nucleotide polymorphism, SNP), SNP通常是一種二等位基因（biallelic）或二態的變異。據估計，單鹼基變異的頻率在1/1000-2/1000。SNP在基因組中數量巨大，分布頻密，檢測易於自動化和批量化，被認為是新一代的遺傳標記。
2. 長度多態性：
長度多態性一類為可變數目***重復序列（variable number of tandem repeats, VNTRS），它是由於相同的重復順序重復次數不同所致，它決定了小衛星DNA（minisatellite）長度的多態性。小衛星是由15-65 bp的基本單位***而成，總長通常不超過20bp，重復次數在人群中是高度變異的。另一類長度多態性是由於基因的某一片段的缺失或插入所致，如微衛星DNA（microsatellite），它們是由重復序列***構成，基本序列只有1-8bp,如(TA)n及(CGG)n等，通常重復10-60次。長度多態性是按照孟德爾方式遺傳的，它們在基因定位、DNA指紋分析，遺傳病的分析和診斷中廣泛地應用。
基因具有高度多態性和變異性。DNA分子在鹼基排列、空間結構等方面有各種各樣的形式。DNA有不同的形態，比如最普通的是雙螺旋結構，但在分裂時是兩條單鏈。 1、等位基因
復等位基因（multiple allele）是指位於一對同源染色體上對應位置的一對基因。
由於群體中的突變，同一座位的基因系列稱為復等位基因。某些復合體基因的每一座位都存在為數眾多的復等位基因，這是某些復合體（HLA）高度多態性的最主要原因。
2、共顯性
共顯性（condominance）是指一對等位基因同為顯性。
某些復合體中，如HLA每一對等位基因勻為共顯性。共顯性大大增加了人群中某些基因表型的多樣化。基因的多態性顯示了遺傳背景的多樣性和復雜性。它可能是人類在進化過程中抵禦不良環境因素的一種適應性表現，對維持種群的生存與延續具有重要的生物學意義。 基因多態性在人群中的基因型分布頻率符合Hardy-Wenberg平衡，其可以使基因的轉錄水平或活性的增強或降低、改變遺傳密碼、啟動子的突變及非轉錄區的突變、導致蛋白質肽鏈中的片段缺失等。
如果基因多態性的鹼基的取代、缺失、插入引編碼序列的核苷酸順序改變，在轉錄和翻譯合成蛋白質的過程中，有的對多肽鏈中氨基酸的排列順序產生影響，有的不產生影響。可分為：
錯義突變(missense mutation)指DNA分子中鹼基對的取代，使得mRNA的某一密碼子發生變化，由他所編碼的氨基酸就變成另一種不同的氨基酸，使得多肽鏈中氨基酸的順序也相應地發生改變。
無義突變(nonsense mutation)指由於鹼基取代使原來可翻譯某種氨基酸的密碼子變成了終止密碼子。例如UAU（氨酸）顛換成UAA（終止密碼子）使多肽鏈的合成到此終止，形成一條不完整的多肽鏈，使蛋白質的生物活性和功能改變。轉換也可引起無義突變。
無義突變和DNA片段的缺失都可以導致肽鏈中的片段缺失，致使基因編碼的蛋白質失去原有的功能。
同義突變(same sense mutation)指鹼基的取代並不都是引起錯義突變和翻譯終止，也就是雖然鹼基被取代了，但蛋白質水平上沒有引起變化，氨基酸沒有被取代。
移碼突變 (frame-shifting mutation)指在編碼序列中單個鹼基、數個鹼基的缺失或插入，片段的缺失或插入可使突變位點之後的三聯體密碼子閱讀框發生改變，不能編碼原來的正常蛋白質。
移碼突變不僅翻譯後的肽鏈中氨基酸序列發生改變，而且也導致肽鏈中的大片段缺失。
影響mRNA剪接：如果點突變發生內含子的剪切位點，可以產生兩種影響：一是原有的剪接位點消失，二是產生新的剪切位點。無論是那一種形式，都可以導致mRNA的錯誤剪接，產生異常的mRNA，最終產生異常的表達產物，數個鹼基的缺失、片段缺失等勻有可能造成剪接位點的缺失。 通過對基因多態性與疾病的易感性的聯系研究，可闡明人體對疾病、毒物和應激的易感性，為臨床醫學、遺傳病學、預防醫學的發展開拓了新的研究領域。
臨床醫學方面
人類基因多態性在闡明人體對疾病、毒物的易感性與耐受性，疾病臨床表現的多樣性（clinical phenotype diversity），以及對葯物治療的反應性上都起著重要的作用。
早期臨床上有關基因多態性的研究是從HLA基因開始的，分析基因型在疾病發生易感性方面的作用，如HLA-B27等位基因與強直性脊椎炎發生率的密切關聯，可作為診斷的依據。通過基因多態性的研究，可從基因水平揭示人類不同個體間生物活性物質的功能及效應存在著差異的本質。
疾病基因多態性與臨床表型多樣性的聯系已受到重視，如腫瘤等多基因病的臨床表型往往多樣化，闡明基因型（genotype ）與表型(phenotype)之間的聯系在認識疾病的發生機理、預測疾病的轉歸等方面也有重要的作用。
葯物代謝酶、轉運蛋白和受體的遺傳多態性是導致葯物反應個體和群體差異的重要原因。葯物代謝酶的表型表現為催化代謝的活性大小，可通過測定其底物的代謝率確定。表型是個體間葯物代謝和反應差異的表現，而基因型則是反應差異的根本原因。
葯物代謝基因多態性可以影響葯物的代謝過程及清除率，從而影響治療效果。致病基因的多態性使同一疾病不同個體其體內生物活性物質的功能及效應出現差異，導致治療反應性上懸殊，按照基因多態性的特點用葯，將會使臨床治療符合個體化的要求。在疾病基因多態性研究的引導下，臨床醫生將有可能預斷不同的個體在同樣的致病條件下會出現什麼樣的病理反應和臨床表現，即臨床表型。如高血壓的治療將根據基因多態性的研究選擇更具針對性的葯物，調整其劑量，而不是不加選擇地使用ACEI、鈣拮抗劑或交感神經受體阻斷劑。合並症的防治也會更個體化，更具針對性。
遺傳病學方面
基因的有害突變導致基因多態性，經典的突變和動態突變本身可能是遺傳病的病因；同時，眾多的多態性位點又是很好的遺傳標記，可以在遺傳病的研究和臨床診斷中發揮重要的作用。
1.多態性作為遺傳病的病因：點突變引起的疾病：從鐮刀狀細胞貧血開始，突變引起各種遺傳病的例子愈來愈多，遺傳性腫瘤也逐漸被認識。重復序列多態性作為遺傳病的病因：如CCG，CTG和CAG這樣的三核苷酸重復序列，當其拷貝數過度增高時可以引起強直性肌營養不良等。三核苷酸拷貝數的擴增或突變發生在世代傳遞過程中，由於拷貝數在世代間的改變，它被稱為動態突變。目前動態突變疾病大多是些神經系統的退行性疾病，也有少數腫瘤。動態突變疾病的發現提示序列拷貝數的多態性能夠成為遺傳病的病因。
2.多態性作為遺傳標記的應用：絕大多數DNA多態性並不引起遺傳病，但可作為遺傳標記來使用。例如：上述提到的各種多態性標記，包括RFLP位點，微衛星和小衛星DNA標記都已廣泛用於遺傳病的連鎖診斷。利用各條染色體上位置已知的眾多的多態性標記，通過患病家系的連鎖分析，可以找到多基因病的致病基因或相關基因的位置，並為他們的分離克隆提供依據。此外，在疾病的關聯分析和病因學研究方面，通過比較患病群體和正常群體，可以發現兩組間多態性位點的特定等位基因頻率有顯著差別，則表明該位點與該疾病相關聯。使用多態性標記的關聯分析既可以提示相關基因存在的位置，也有助於發病機理的闡明。基因多態性還可以用於疾病的分型與治療，即根據患者疾病多態性的基因型來解釋疾病的病因和臨床表現。
預防醫學方面
在預防醫學方面，基因多態性的研究涉及的范圍廣泛，包括基因多態性與病因未知的疾病關系的研究，也包括對已知特定環境因素致病易感基因的篩選。由於基因多態性有明顯的種族差異，因此在基因-環境交互作用模式上，不同的種族之間有可能不同。所以，開展我國人群的基因多態性與環境的作用關系的研究具有重要的意義。
基因多態性的研究在職業病醫學中則更具有實際的意義。對易感基因和易感性生物標志物的分析，將某些攜帶敏感基因型的人甄別開來，採取針對性預防措施，提高預防職業性危害工作的效率。對特定的污染物易感人群和耐受人群的基因多態性研究，有助於闡明環境因素的致病機制，也推動了遺傳易感性標志物的研究。 1．限制性片段長度多態性（Restriction Fragment Length Polymorphism，RFLP）：由DNA 的多態性，致使DNA 分子的限制酶切位點及數目發生改變，用限制酶切割基因組時，所產生的片段數目和每個片段的長度就不同，即所謂的限制性片段長度多態性，導致限製片段長度發生改變的酶切位點，又稱為多態性位點。最早是用Southern Blot/RFLP方法檢測，後來採用聚合酶鏈反應（PCR）與限制酶酶切相結合的方法。現在多採用PCR-RFLP法進行研究基因的限制性片段長度多態性。
2．單鏈構象多態性（SSCP）：是一種基於單鏈DNA構象差別的點突變檢測方法。相同長度的單鏈DNA如果順序不同，甚至單個鹼基不同，就會形成不同的構象。在電泳時泳動的速度不同。將PCR產物經變性後，進行單鏈DNA凝膠電泳時，靶DNA中若發生單個鹼基替換等改變時，就會出現泳動變位（mobility shift），多用於鑒定是否存在突變及診斷未知突變。
3．PCR-ASO探針法（PCR-allele specific oligonucleotide, ASO）：即等位基因特異性寡核苷酸探針法。在PCR擴增DNA片段後，直接與相應的寡核苷酸探雜交，即可明確診斷是否有突變及突變是純合子還是雜合子。其原理是：用PCR擴增後，產物進行斑點雜交或狹縫雜交，針對每種突變分別合成一對寡核苷酸片段作為探針，其中一個具有正常序列，另一個則具有突變鹼基。突變鹼基及對應的正常鹼基勻位於寡核苷酸片段的中央，嚴格控制雜交及洗脫條件，使只有與探針序列完全互補的等位基因片段才顯示雜交信號，而與探針中央鹼基不同的等位基因片段不顯示雜交信號，如果正常和突變探針都可雜交，說明突變基因是雜合子，如只有突變探針可以雜交，說明突變基因為純合子，若不能與含有突變序列的寡核苷探針雜交，但能與相應的正常的寡核苷探針雜交，則表示受檢者不存在這種突變基因。若與已知的突變基因的寡核苷探針勻不能雜交，提示可能為一種新的突變類型。
4. PCR-SSO法：SSO技術即是順序特異寡核苷酸法（Sequence Specific Oligonucleotide, SSO）。原理是PCR基因片段擴增後利用序列特異性寡核苷酸探針，通過雜交的方法進行擴增片段的分析鑒定。探針與PCR產物在一定條件下雜交具有高度的特異性，嚴格遵循鹼基互補的原則。探針可用放射性同位素標記，通過放射自顯影的方法檢測，也可以用非放射性標記如地高辛、生物素、過氧化物酶等進行相應的標記物檢測。
5. PCR-SSP法：序列特異性引物分析即根據各等位基因的核苷酸序列，設計出一套針對每一等位基因特異性的（allele-specific）、或組特異性 (group-specific)的引物，此即為序列特異性引物（SSP）。SSP只能與某一等位基因特異性片段的鹼基序列互補性結合，通過PCR特異性地擴增該基因片段，從而達到分析基因多態性的目的。
6. PCR-熒光法：用熒游標記PCR引物的5』端，熒光染料FAM和JOE呈綠色熒光，TAMRA呈紅色熒光，COUM 呈蘭色熒光，不同熒游標記的多種引物同時參加反應，PCR擴增待檢測的DNA，合成的產物分別帶有引物5』端的染料，很容易發現目的基因存在與否。
7. PCR-DNA測序：是診斷未知突變基因最直接的方法，由於PCR技術的應用，使得DNA 測序技術從過去的分子克隆後測序進入PCR直接測序。PCR產物在自動測序儀上電泳後測序。常用方法有：Sanger雙脫氧末端終止法;Maxam-Gilbert化學裂解法；DNA測序的自動化。目前DNA順序全自動激光測定法是最先進的方法。
8. PCR指紋圖法（PCR-fingerprints）：實用於快速的同種異型DR/Dw配型。在DR/DW純合子及雜合子個體中，每種DR單倍型及每種單倍型組合所產生的單鏈環狀結構的大小、數目和位置各異，由於同質雙鏈和異質雙鏈之間的分子構象不同。因此，在非變性聚丙烯醯胺凝膠電泳時，它們的遷移率各不相同，從而獲得單倍型特異的電泳帶格局即PCR指紋。也有人用人工合成的短寡核苷酸片段作為探針，同經過酶切的人體DNA作Southern blot，可以得出長度不等的雜交帶，雜交帶的數目和分子量的大小具有個體特異性，除非同卵雙生，幾乎沒有兩個人是完全相同的，就象人的指紋一樣，人們把這種雜交帶圖形稱為基因指紋(gene finger-printing)。
9. 基因晶元法：又稱為DNA 微探針陣列（Micro array）。它是集成了大量的密集排列的大量已知的序列探針，通過與被標記的若干靶核酸序列互補匹配，與晶元特定位點上的探針雜交，利用基因晶元雜交圖象，確定雜交探針的位置，便可根據鹼基互補匹配的原理確定靶基因的序列。這一技術已用於基因多態性的檢測。對多態性和突變檢測型基因晶元採用多色熒光探針雜交技術可以大大提高晶元的准確性、定量及檢測范圍。應用高密度基因晶元檢測單鹼基多態性，為分析SNPs提供了便捷的方法。

『叄』 mthfr基因多態性檢測報告單怎麼看

• 這個mthfr基因檢測一般在孕檢，生殖中心，神經內科，心內科，腫瘤內科檢測的比較多，是檢測亞甲基四氫葉酸還原酶的代謝能力的，正常的MTHFR活性才能維持葉酸甲硫氨酸循環的有效性，保證DNA的合成和甲基化的正常進行。

• 若MTHFR酶活性發生變化，則導致5-甲基四氫葉酸生成障礙，引起DNA合成和甲基化異常、高同型半胱氨酸血症而導致多種遺傳性疾病的發生。其中檢測結果有三個基因型也就是CC型、CT型、TT型。CC表示酶活性100%，CT表示酶活性65%，TT表示酶活性30%，TT+表示酶活性更低。

• 當然這個都是一個幾率問題，有的檢測基因型CC，但是還是會出現相關的遺傳病，這是後來的突變導致，有的TT+但是也會出現不發病的情況。
  

『肆』 基因多態性的主要檢測方法有哪些

1．限制性片段長度多態性（Restriction
Fragment
Length
Polymorphism，RFLP）：由DNA
的多態性，致使DNA
分子的限制酶切位點及數目發生改變，用限制酶切割基因組時，所產生的片段數目和每個片段的長度就不同，即所謂的限制性片段長度多態性，導致限製片段長度發生改變的酶切位點，又稱為多態性位點。最早是用Southern
Blot/RFLP方法檢測，後來採用聚合酶鏈反應（PCR）與限制酶酶切相結合的方法。現在多採用PCR-RFLP法進行研究基因的限制性片段長度多態性。
2．單鏈構象多態性（SSCP）：是一種基於單鏈DNA構象差別的點突變檢測方法。相同長度的單鏈DNA如果順序不同，甚至單個鹼基不同，就會形成不同的構象。在電泳時泳動的速度不同。將PCR產物經變性後，進行單鏈DNA凝膠電泳時，靶DNA中若發生單個鹼基替換等改變時，就會出現泳動變位（mobility
shift），多用於鑒定是否存在突變及診斷未知突變。
生物幫上面有這方面的資料，
http://www.bio1000.com/zt/proct/millipore.html

millipore,默克密理博,,millipore公司,反滲透純水系統,millipore純水系統

『伍』 基因檢測方法有好幾種，哪一種方式比較好

需要按照實際需求去選擇，沒有哪個最好的說法，合適的就是最好的
常用基因診斷技術：
一、Southern印跡法（Southern blot）

基本原理是：硝酸纖維膜或尼龍濾膜對單鏈DNA的吸附能力很強，當電泳後凝膠經過DNA變性處理，覆以上述濾膜，再於其上方壓上多層乾燥的吸水紙，藉助它對深鹽溶液的上吸作用，凝膠上的單鏈DNA將轉移到濾膜上。轉移是原位的，即DNA片段的位置保持不變。轉移結束後，經過80℃烘烤的DNA，將原位地固定於膜上。
當含有特定基因片段已原位轉移到膜上後，即可與同位素標記了的探針進行雜交，並將雜交的信號顯示出來。雜交通常在塑料袋中進行，袋內放置上述雜交濾膜，加入含有變性後探針的雜交溶液後，在一定溫度下讓單鏈探針DNA與固定於膜上的單鏈基因DNA分子按鹼基到互補原理充分結合。結合是特異的，例如只有β珠蛋白基因DNA才能結合上β珠蛋白的探針。雜交後，洗去膜上的未組合的探針，將Ⅹ線膠片覆於膜上，在暗盒中日光進行放射自顯影。結合了同位素標記探針的DNA片段所在部位將顯示黑色的雜交帶，基因的缺失或突變則可能導致帶的缺失或位置改變。

二、聚合酶鏈反應

近年來，基因分析和基因工程技術有了革命性的突破，這主要歸功於聚合酶鏈反應（polymerase chain reaction,PCR）的發展和應用。應用PCR技術可以使特定的基因或DNA片段在短短的2－3小時內體外擴增數十萬至百萬倍。擴增的片段可以直接通過電泳觀察，也可用於進一步的分析。這樣，少量的單拷貝基因不需通過同位素提高其敏感性來觀察，而通過擴增至百萬倍後直接觀察到，而且原先需要一、二周才能作出的診斷可以縮短至數小時。

三、擴增片段長度多態性

小衛星DNA和微衛星DNA的長度多態性可以通過PCR擴增後電泳來檢出，並用於致病基因的連鎖分析，這種診斷方法稱為擴增片段長度多態性（amplified fragment length polymorphism,Amp-FLP）連鎖分析法。PCR擴增後，產物即等位片段之間的差別有時只有幾個核苷酸，故需用聚丙烯醯胺凝膠電泳分離鑒定。此法多用於突變性質不明的連鎖分析.

四、等位基因的特異寡核苷酸探針診斷法

當基因的突變部位和性質已完全明了時，可以合成等基因特異的寡核苷酸探針（allele-specific oligonucleotide,ASO）用同位素或非同位素標記進行診斷。探針通常為長20bp左右的核苷酸。用於探測點突變時一般需要合成兩種探針，與正常基因序列完全一致，能與之穩定地雜交，但不能與突變基因序列雜交；另一種與突變基因序列一致，能與突變基因序列穩定雜交，但不能與正常基因序列穩定雜交，這樣，就可以把只有一個鹼基發生了突變的基因區別開來.

PCR可結合ASO，即PCR－ASO技術，即先將含有突變點的基因有關片段進行體外擴增，然後再與ASO探針作點雜交，這樣大大簡化了方法，節約了時間，而且只要極少量的基因組DNA就可進行。

五、單鏈構象多態性診斷法

單鏈構象多態性（signle strand conformation polymorphism,SSCP）是指單鏈DNA由於鹼基序列的不同可引起構象差異，這種差異將造成相同或相近長度的單鏈DNA電泳遷移率不同，從而可用於DNA中單個鹼基的替代、微小的缺失或手稿的檢測。用SSCP法檢查基因突變時，通常在疑有突變的DNA片段附近設計一對引物進行PCR擴增，然後將擴增物用甲醯胺等變性，並在聚丙烯醯胺凝膠中電泳，突變所引起的DNA構象差異將表現為電泳帶位置的差異，從而可據之作出診斷。

『陸』 如何利用NCBI資料庫進行基因多態性分析

在NCBI 上查找基因，挺多人都在問這個。當然，對於經常泡NCBI 的人來說，查找基因是
入門的、基礎的，對高手來講根本不是個問題。但新手就不同了。
當然了，直到現在，雖說已經會了一些，但在NCBI 查找基因，雖說是基礎但也是挺復雜的
今天要講的。
今天用「苯丙氨酸解氨酶(Phenylalanine ammonia-lyase，PAL)」來作為例子，物種是豆科的。
1，打開NCBI，選擇核苷酸（Nucleotide）資料庫，填上Phenylalanine ammonia-lyase，
點擊GO，搜索
2，我們來看結果，總共有1022 個，結果太多了，有時候剛好你要的結果在第一頁的話，
那就好辦。不是的話，你慢慢的找，實在不是辦法。特別是網路不好時，上NCBI 又很慢，
的確是一種折磨。
3，這個時候我們可以再想辦法縮少范圍，比方你要找的是豆科的，我們來大豆（soybean）
來作例子。在搜索時加上soybean，結果將會大大減少。
4，這時候結果已經一目瞭然，這里需要再介紹另外一種搜索的方法。這種方法是比較精確
的。首先在taxonomy 資料庫查到soybean 的 taxonomy ID，再回到Nucleotide 資料庫，
搜索」 Phenylalanine ammonia-lyase txid3847 「，txid 是taxonomy ID 是縮寫，3847 是大豆
soybean 的taxonomy ID。這樣子，將搜索范圍鎖定在大豆。
5，看下圖，出來的結果都是大豆的，這時基本上就大功告成了。找到了大豆苯丙氨酸解氨酶的序列
6，進入序列頁面，默認是GenBank 格式，你也可以選擇Fasta 格式，一般都是保存為Fasta格式。

『柒』 基因多態性檢測是不是印跡雜交技術

A
BCD都是Southern Bloting的事,E是Northern Blotting,Western只能查蛋白質,也就是基因表達的結果.

『捌』 准備做基因多態性檢測，有基因和多態性位點rs，想請教下怎樣設計課題

只能設計和肥胖的相關性還是可以做和其他的相關性

『玖』 多態性檢測報告中的CC，CT，TT分別是什麼意思

葉酸轉化酶的基因排序吧。cc最好，tt最差。葉酸轉化率不高，有多種疾病風險，注意食物補充

『拾』 要做基因多態性分析，哪種方法提取DNA要好點

1．限制性片段度態性（Restriction Fragment Length PolymorphismRFLP）：由DNA 態性致使DNA 限制酶切位點及數目發改變用限制酶切割基組所產片段數目每片段度同即所謂限制性片段度態性導致限製片段度發改變酶切位點稱態性位點早用Southern Blot/RFLP檢測採用聚合酶鏈反應（PCR）與限制酶酶切相結合現採用PCR-RFLP進行研究基限制性片段度態性
2．單鏈構象態性（SSCP）：種基於單鏈DNA構象差別點突變檢測相同度單鏈DNA順序同甚至單鹼基同形同構象電泳泳速度同PCR產物經變性進行單鏈DNA凝膠電泳靶DNA若發單鹼基替換等改變現泳變位（mobility shift）用於鑒定否存突變及診斷未知突變