⑴ 干貨分享丨代謝組學問題集錦之進階篇
在深入理解了基礎代謝組學後，選擇合適的檢測方法、平台，以及質控和數據分析是關鍵。下面詳細解析一些進階問題：
代謝組學方法分為靶向、非靶向、擬靶向和代謝流。靶向側重特定代謝物，適用於驗證研究；非靶向全面分析，發現型研究常用；擬靶向結合兩者優點；代謝流追蹤代謝路徑。
依據研究需求，如脂蛋白亞類用NMR，脂肪酸用GC-MS，神經遞質用UPLC-QQQ-MS。非靶向研究常選NMR和QTOF-MS。
質控樣用於監控系統穩定性和問題發現，平行樣監控實驗全程穩定性。定量限（LOQ）和檢測限（LOD）是評估准確度和靈敏度的指標。
MRM針對性採集數據，基質效應源於樣品離子化過程中的干擾，可通過前處理和選擇策略來消除。
標准品是定量的必要條件，但需開發合適的方法。衍生化改善目標物響應性、穩定性和分離性。
TOF、QQQ、QTRAP和Orbitrap代表不同類型的質譜分析器，各有優缺點，適用於不同類型的代謝組學研究。
⑵ 做好代謝組學研究的關鍵在哪裡
首先明確代謝組學的核心任務。對小分子代謝物的定性、定量分析並發現差異代謝物：（1）對生物體系中的內源性代謝物及其變化規律進行表徵；（2）以差異代謝物作為核心對生命奧秘進行解析。而基於色譜/質譜聯用的分離分析技術具有靈敏度高、選擇性好、動態范圍寬、信息豐富等優點，已成為代謝組學研究的主流技術平台。
其次明確代謝組學的研究方法。對於非靶向代謝組學而言，色譜與高分辨質譜的聯用必不可少；而對於靶向代謝組學而言，基於多反應監測（MRM）模式的三重四極桿質譜被認為是質譜定量的 「金標准」。近年來，擬靶向技術由於結合了非靶向和靶向分析技術的雙重優勢，在代謝物分析的覆蓋度上與非靶向方法接近，在靈敏度上與靶向分析一樣，迅速發展成為代謝組學的主流研究方法。擬靶向代謝組學主要包括三個步驟：（1）基於四極桿飛行時間質譜的非靶向分析；（2）母離子/產物離子對的選擇及檢測參數優化；（3）使用三重四極桿或QTRAP質譜採用MRM模式（包括上述離子對）對樣品進行分析。
關鍵點有哪些？代謝組學整個研究過程可以細分為20多個步驟，若每一步准確率為70%，最終結果的准確率不足0.1%，因此必須確保每一步（尤其是關鍵步驟）都規范、准確，才能保證研究結果准確、可靠。影響代謝組學研究質量的關鍵環節包括：（1）系統科學的研究方案；（2）樣本收集、分組、儲存、前處理、質量控制；（3）數據採集與質量控制；（4）數據處理、分析；（5）差異分子篩選與鑒定；（6）分類模型構建與驗證；（7）資料庫自建、管理與使用。這些環節受制因素較多，需要參考研究論文、技術規范、注意過程式控制制，採用專業的技術和工具支持才能獲得高質量的研究結果。
為什麼關鍵？圍繞快速、有效地發現分子和標志物這一目的，精準和高通量正成為引領發展的方向。代謝組學研究需要滿足生物醫葯、食品等行業的個性化分子智能識別需求，所以需要分子智能識別檢測技術做支撐，需要自主知識產權的核心演算法，才能保證專業化的組學、質譜數據處理、數據挖掘。
總結來說，在組學研究過程中，只有做好分子特徵檢測、差異分子篩選、差異分子鑒定、分類模型構建、資料庫自建等關鍵步驟，才能得到最好的組學研究結果。
⑶ 代謝組學用色譜柱分離出的物質怎麼檢測其結構進行pca分析
靶向代謝組學新技術，區別於傳統的非定向代謝組學，具有如下優勢：
1.樣品種類多：生物流體（血液、尿、唾液、腸道微生物）、環境樣品、細胞、動植物組織、污水、葯品、食品。
2.化合物涵蓋廣：包括脂類、維生素、核苷酸、神經遞質等700種代謝產物，涵蓋所有主要代謝途徑。
3.分析時間短：我們的方法能在30min同時測定並准確鑒定出700種化合物。
4.復雜的數據處理：專業的數據處理方法和軟體，能對所得數據進行PLS-DA,PCA,ANOVA,VIP,Biomarker等分析。