㈠ 讀懂非編碼RNA(ncRNA)
揭秘非編碼RNA的奧秘：生命調控的隱形大師
在真核生物的基因寶庫中，盡管只有約1-2%的基因承擔著編碼蛋白質的重任，但它們背後隱藏的非編碼RNA（ncRNA）世界卻更為壯觀。ncRNA，這些沉默的主角，由基因組轉錄，卻以別樣的方式影響著生命的各個方面。它們大致可分為兩大類：結構型ncRNA和調控型ncRNA，以長度劃分，又可以分為小ncRNA（18-200nt）和長鏈ncRNA（>200nt）。
長鏈ncRNA：調控生命節律的秘密守護者
長鏈非編碼RNA(lncRNAs)，如超長鏈的指揮者，它們在表觀遺傳調控、細胞周期和分化過程中扮演著關鍵角色，如同生命的調色板，精準地調節著細胞的命運。
微調基因表達的小小舞者：microRNA
microRNA (miRNA) 是一支精巧的20-24nt分子舞者，源自轉錄本中的發夾結構pre-miRNA。它們通過與靶mRNA的3'端互補配對，就像指揮家調校樂團的音準，調控基因表達的無聲旋律。
piRNA：生殖細胞中的沉默仲裁者
Piwi相互作用RNA (piRNA) 是24-31nt的小分子，與Piwi蛋白結合形成復合體，尤其在哺乳動物的生殖細胞和幹細胞中發揮獨特作用，它們通過piRNA復合物(piRC)來調控基因沉默的精密路徑。
環形RNA：生命的螺旋結構與功能多樣性
環形RNA (circRNAs) 是一種獨特的非編碼分子，它們以共價鍵構成，沒有5'帽子和3'尾巴。作為miRNA海綿和轉錄調控者，circRNAs在生物學過程中的角色越來越被揭示，其功能的多樣性和復雜性令人矚目。
siRNA：雙刃劍與非編碼RNA的界限
雖然siRNA因其不編碼蛋白而被視為非編碼RNA，但其外源合成的屬性使其在定義上有所區別。盡管siRNA通過RNA干擾(RNAi)機制參與轉錄後沉默，但它們的編碼屬性可能挑戰我們對ncRNA傳統的理解。
然而，隨著對lncRNAs和circRNAs的研究深入，我們發現這些看似非編碼的RNA可能具備編碼功能，它們在生物學中的作用遠超最初的認識。這提示我們，ncRNA的分類和命名可能需要更嚴謹的標准，以適應這些復雜的生命分子。
Esteller M.揭示ncRNA在疾病中的深遠影響(Nat Rev Genet, 2011); Mattick JS, Makunin IV. 探索非編碼RNA的全貌(Hum Mol Genet, 2006); Xu JZ, Zhang JL, Zhang WG. 抗義RNA：遺傳研究中的新寵(J Zhejiang Univ Sci B, 2018)。這些研究文獻揭示了ncRNA在生物學領域的廣闊天地，等待我們進一步探索。