❶ 蛋白質多肽鏈N端測定的方法及基本原理
1 多肽鏈的拆分。由多條多肽鏈組成的蛋白質分子,必須先進行拆分。幾條多肽鏈藉助非共價鍵連接在一起,稱為寡聚蛋白質,如,血紅蛋白為四聚體,烯醇化酶為二聚體;可用8mol/L尿素或6mol/L鹽酸胍處理,即可分開多肽鏈(亞基).
2 測定蛋白質分子中多肽鏈的數目。通過測定末端氨基酸殘基的摩爾數與蛋白質分子量之間的關系,即可確定多肽鏈的數目。
3 二硫鍵的斷裂。幾條多肽鏈通過二硫鍵交聯在一起,可在8mol/L尿素或6mol/L鹽酸胍存在下,用過量的-巰基乙醇處理,使二硫鍵還原為巰基,然後用烷基化試劑保護生成的巰基,以防止它重新被氧化。
二硫鍵的切割與保護(元素後數字為下標)
a 過甲酸〔performic acid〕 不可逆
-CH2SO3H
b、還原+氧化 不可逆
[ 巰基乙醇,DTT ] + 碘乙酸等
-S-CH2-COOH
c、亞硫酸分解〔Sulfitolysis〕 可逆
-R1-S-S-R2 + HSO3-
R1-S- + R2-S-SOH3
可以通過加入鹽酸胍的方法解離多肽鏈之間的非共價力;應用過甲酸氧化法或巰基還原法拆分多肽鏈間的二硫鍵。
巰基(-SH)的保護4 測定每條多肽鏈的氨基酸組成,並計算出氨基酸成分的分子比(如右圖)
5 分析多肽鏈的N-末端和C-末端
多肽鏈端基氨基酸分為兩類:N-端氨基酸(amino-terminal)和C-端氨基酸(Carboxyl-terminal) 。在肽鏈氨基酸順序分析中,最重要的是N-端氨基酸分析法。N末端分析法(Sanger法;Edman法;DNS-Cl;酶降解法),C末端分析法(肼解法;酶降解法;硼氫化鋰法)。
6 多肽鏈斷裂成多個肽段。可採用兩種或多種不同的斷裂方法將多肽樣品斷裂成兩套或多套肽段或肽碎片,並將其分離開來。
7 測定每個肽段的氨基酸順序
8 確定肽段在多肽鏈中的次序。
利用兩套或多套肽段的氨基酸順序彼此間的交錯重疊,拼湊出整條多肽鏈的氨基酸順序。
9 確定原多肽鏈中二硫鍵的位置
一般採用胃蛋白酶處理沒有斷開二硫鍵的多肽鏈,再利用雙向電泳技術分離出各個肽段,用過甲酸處理後,將可能含有二硫鍵的肽段進行組成及順序分析,然後同其它方法分析的肽段進行比較,確定二硫鍵的位置。
❷ 常用於蛋白質多肽鏈N端.C端測定的方法有幾種
(1)N-末端測定 A.二硝基氟苯(FDNBDNFB):1945Sanger提重要貢獻DNP-氨基酸用機溶劑抽提通層析位置鑒定何種氨基酸Sanger用測定胰島素N末端別甘氨酸及苯丙氨酸B.氰酸鹽:1963Stank及Smyth介紹種測定N末端新步驟:由於乙內醯脲氨基酸帶電荷用離交換層析與游離氨基酸離所乙內醯脲氨基酸再鹽酸水解重新游離氨基酸鑒別氨基酸即解N-末端何種氨基酸C.二甲基氨基萘磺醯氯:1956Hartley等報告種測定N-末端靈敏採用1-二甲基氨基萘-5-磺醯氯簡稱丹磺醯氯與游離氨基末端作用類似於SangerDNFB產物磺醯胺衍物丹磺醯鏈酸具強烈黃色熒光優點靈敏性較高(比FDNB提高100倍品量於1毫微克)及丹磺醯氨基酸穩定性較高(酸水解穩定性較DNP氨基酸高)用紙電泳或聚醯胺薄膜層析鑒定(2)C-末端析A.肼解:測定C-末端用肽溶於水肼100℃進行反應結羧基末端氨基酸游離氨基酸狀釋放其餘肽鏈部與肼氨基酸肼羧基末端氨基酸採用抽提或離交換層析其進行析羧基末端氨基酸側鏈帶醯胺冬醯胺谷氨醯胺則肼解能產游離羧基末端氨基酸外肼解注意避免任何少量水解免釋氨基酸混淆末端析B.羧肽酶水解:羧肽酶專性水解羧基末端氨基酸根據酶解專性同區羧肽酶A、BC應用羧肽酶測定末端需要事先進行酶力實驗便選擇合適酶濃度及反應間使釋放氨基酸主要C末端氨基酸
❸ 肽鏈測續方法
短肽的序列,你應該是指氨基酸的序列吧。
有以下幾種方法:1.Edman降解法:是一種化學法對蛋白質進行測序的方法,是從多肽鏈游離的N末端測定氨基酸殘基的序列的過程。N末端氨基酸殘基被苯異硫氰酸酯修飾,然後從多肽鏈上切下修飾的殘基,再經層析鑒定,餘下的多肽鏈(少了一個殘基)被回收再進行下一輪降解循環。
2.羧肽酶法:羧肽酶是一組外肽酶,至少包括A.B.C三種。但是由於這些酶不能給出准確的氨基酸殘基順序,所以一般很少運用。
3.氨基酸順序的質譜分析法:這項原理是將肽主鏈和側鏈的極性基團用些化學試劑進行修飾,然後導入質譜儀中,在質譜儀的真空裝置中揮發,並在電子束的作用下碎裂,從而產生不同的陽離子。然後根據陽離子的質量與電荷之比進行鑒定。
實驗到此結束,但是想要知道順序 還要通過實驗中獲取的片段來重疊重構完整肽鏈的氨基酸順序。
❹ 常用於蛋白質多肽鏈N端.C端測定的方法有幾種
(1)N-末端測定
A.二硝基氟苯法(FDNB,DNFB):1945年Sanger提出此方法,是他的重要貢獻之一.
DNP-氨基酸用有機溶劑抽提遲擾後碼困旦,通過層析位置可鑒定它是何種氨基酸.Sanger用此方法測定了胰島素的N末端分別為甘氨酸及苯丙氨酸.
B.氰酸鹽法:1963年Stank及Smyth介紹了一種測定N末端的新方法,步驟如下:
由於乙內醯脲氨基酸不帶電荷,因此可用離子交換層析法將它與游離氨基酸分開,分離所得的乙內醯脲氨基酸再被鹽酸水解,重新生成游離的氨基酸,鑒別此氨基酸即可了解N-末端是何種氨基酸.
C.二甲基氨基萘磺醯氯法:1956年Hartley等報告了一種測定N-末端的靈敏方法,採用1-二甲基氨基萘-5-磺醯氯,簡稱丹磺醯氯.它與游離氨基末端作用,方法類似於Sanger的DNFB法,產物是磺醯胺衍生物.
丹尺橋磺醯鏈酸具有強烈的黃色熒光.此法優點為靈敏性較高(比FDNB法提高100倍,樣品量小於1毫微克分子)及丹磺醯氨基酸穩定性較高(對酸水解穩定性較DNP氨基酸高),可用紙電泳或聚醯胺薄膜層析鑒定.
(2)C-末端分析
A.肼解法:這是測定C-末端最常用的方法.將多肽溶於無水肼中,100℃下進行反應,結果羧基末端氨基酸以游離氨基酸狀釋放,而其餘肽鏈部分與肼生成氨基酸肼.
這樣羧基末端氨基酸可以採用抽提或離子交換層析的方法將其分出而進行分析.如果羧基末端氨基酸側鏈是帶有醯胺如天冬醯胺和谷氨醯胺,則肼解時不能產生游離的羧基末端氨基酸.此外肼解時注意避免任何少量的水解,以免釋出的氨基酸混淆末端分析.
B.羧肽酶水解法:羧肽酶可以專一性地水解羧基末端氨基酸.根據酶解的專一性不同,可區分為羧肽酶A、B和C.應用羧肽酶測定末端時,需要事先進行酶的動力學實驗,以便選擇合適的酶濃度及反應時間,使釋放出的氨基酸主要是C末端氨基酸.
❺ 肽鏈的末端可以用那四種方法測定,而和什麼法則是測定C末端氨基酸最常用的方法
常用於N-末端的測定方法:1. DNFP法(桑格反應) 2. PITC法(艾德曼反應) 3. 氨肽酶法(專一性的從氨基末端將肽鍵切斷)
常用於C-末端測定方法: 1. 肼解法 2. 還原法(硼氫化鋰) 3. 羧肽酶法(專一性的從羧基末端將肽鍵切斷)
肼解法是測定C末端氨基酸最常用的方法
❻ 常用於蛋白質多肽鏈N端.C端測定的方法有幾種
N-末端分析1、二硝基氟苯法蔽肆(FDNB法)2、二甲基宏銷轎氨基萘磺醯氯法(DNS-Cl法斗旁)3、異硫氰酸笨酯法(Edman法)C-末端分析1、肼解法2、還原法3、羧肽酶法
❼ 常用於蛋白質多肽鏈N端.C端測定的方法有幾種
常用於蛋白質多肽鏈N端測定的方法:
1、二硝基氟苯法(FDNB法)
2、二甲基氨基萘磺醯氯法(DNS-Cl法)
3、異硫氰酸笨酯法(Edman法)
常用於蛋白質多肽鏈C端測定的方法
1、肼解法
2、還原法
3、羧肽酶法
(7)肽鏈n末端分析的方法有擴展閱讀:
多肽合成是一個固相合成順序,一般從N端即氨基端向C端即羧基端合成。過去的多肽合成是在溶液中進行的稱為液相合成法。
液相合成基於將單個N-α保護氨基酸反復加到生長的氨基成份上,合成一步步地進行, 通常從合成鏈的C端氨基酸開始,接著的單個氨基酸的連接通過用DCC,混合炭酐, 或N-carboxy酐方法實現。