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多肽鏈的n端分析方法

發布時間:2023-11-18 10:32:15

1. 蛋白質多肽鏈N端測定的方法及基本原理

1 多肽鏈的拆分。由多條多肽鏈組成的蛋白質分子,必須先進行拆分。幾條多肽鏈藉助非共價鍵連接在一起,稱為寡聚蛋白質,如,血紅蛋白為四聚體,烯醇化酶為二聚體;可用8mol/L尿素或6mol/L鹽酸胍處理,即可分開多肽鏈(亞基).
2 測定蛋白質分子中多肽鏈的數目。通過測定末端氨基酸殘基的摩爾數與蛋白質分子量之間的關系,即可確定多肽鏈的數目。
3 二硫鍵的斷裂。幾條多肽鏈通過二硫鍵交聯在一起,可在8mol/L尿素或6mol/L鹽酸胍存在下,用過量的-巰基乙醇處理,使二硫鍵還原為巰基,然後用烷基化試劑保護生成的巰基,以防止它重新被氧化。
二硫鍵的切割與保護(元素後數字為下標)
a 過甲酸〔performic acid〕 不可逆
-CH2SO3H
b、還原+氧化 不可逆
[ 巰基乙醇,DTT ] + 碘乙酸等
-S-CH2-COOH
c、亞硫酸分解〔Sulfitolysis〕 可逆
-R1-S-S-R2 + HSO3-
R1-S- + R2-S-SOH3
可以通過加入鹽酸胍的方法解離多肽鏈之間的非共價力;應用過甲酸氧化法或巰基還原法拆分多肽鏈間的二硫鍵。
巰基(-SH)的保護4 測定每條多肽鏈的氨基酸組成,並計算出氨基酸成分的分子比(如右圖)
5 分析多肽鏈的N-末端和C-末端
多肽鏈端基氨基酸分為兩類:N-端氨基酸(amino-terminal)和C-端氨基酸(Carboxyl-terminal) 。在肽鏈氨基酸順序分析中,最重要的是N-端氨基酸分析法。N末端分析法(Sanger法;Edman法;DNS-Cl;酶降解法),C末端分析法(肼解法;酶降解法;硼氫化鋰法)。
6 多肽鏈斷裂成多個肽段。可採用兩種或多種不同的斷裂方法將多肽樣品斷裂成兩套或多套肽段或肽碎片,並將其分離開來。
7 測定每個肽段的氨基酸順序
8 確定肽段在多肽鏈中的次序。
利用兩套或多套肽段的氨基酸順序彼此間的交錯重疊,拼湊出整條多肽鏈的氨基酸順序。
9 確定原多肽鏈中二硫鍵的位置
一般採用胃蛋白酶處理沒有斷開二硫鍵的多肽鏈,再利用雙向電泳技術分離出各個肽段,用過甲酸處理後,將可能含有二硫鍵的肽段進行組成及順序分析,然後同其它方法分析的肽段進行比較,確定二硫鍵的位置。

2. 多肽鏈的序列分析題怎麼

直接測序列法:常用Edman降解法,在弱鹼性條件下多肽連N端氨基酸(阿爾發)與PITC反應,標記為苯氨基硫代甲醯蛋白質。

肽鏈中的第一個肽鍵變弱,在無水酸的存在下發發生降解,第一個氨基酸(AA1)經過分子重排成為PTH-AA1結合層析技術即可確定氨基酸的性質。C端氨基酸殘基分析,可用;羧基肽酶,肼解法。

多肽的生物合成

同時,游離在細胞質中的轉運RNA(tRNA)把它攜帶的特定氨基酸放在核糖體的mRNA的相應位置上,然後tRNA離開核糖體,再去搬運相應的氨基酸。

這樣,在合成開始時,總是攜帶甲硫氨酸的tRNA先進入核糖體,接著帶有第二個氨基酸的tRNA才進入,此時帶甲硫氨酸的tRNA把甲硫氨酸卸下,放在mRNA的起始密碼位置上,然後自己離開核糖體,甲硫氨酸的-COOH端與第二個氨基酸的-NH2形成肽鍵。

以上內容參考:網路-多肽鏈

3. 常用於蛋白質多肽鏈N端.C端測定的方法有幾種基本原理是什麼

(1)N-末端測定 A.二硝基氟苯法(FDNB,DNFB):1945年Sanger提出此方法,是他的重要貢獻之一。DNP-氨基酸用有機溶劑抽提後,通過層析位置可鑒定它是何種氨基酸。Sanger用此方法測定了胰島素的N末端分別為甘氨酸及苯丙氨酸。B.氰酸鹽法:1963年Stank及Smyth介紹了一種測定N末端的新方法,步驟如下:由於乙內醯脲氨基酸不帶電荷,因此可用離子交換層析法將它與游離氨基酸分開,分離所得的乙內醯脲氨基酸再被鹽酸水解,重新生成游離的氨基酸,鑒別此氨基酸即可了解N-末端是何種氨基酸。C.二甲基氨基萘磺醯氯法:1956年Hartley等報告了一種測定N-末端的靈敏方法,採用1-二甲基氨基萘-5-磺醯氯,簡稱丹磺醯氯。它與游離氨基末端作用,方法類似於Sanger的DNFB法,產物是磺醯胺衍生物。丹磺醯鏈酸具有強烈的黃色熒光。此法優點為靈敏性較高(比FDNB法提高100倍,樣品量小於1毫微克分子)及丹磺醯氨基酸穩定性較高(對酸水解穩定性較DNP氨基酸高),可用紙電泳或聚醯胺薄膜層析鑒定。(2)C-末端分析A.肼解法:這是測定C-末端最常用的方法。將多肽溶於無水肼中,100℃下進行反應,結果羧基末端氨基酸以游離氨基酸狀釋放,而其餘肽鏈部分與肼生成氨基酸肼。這樣羧基末端氨基酸可以採用抽提或離子交換層析的方法將其分出而進行分析。如果羧基末端氨基酸側鏈是帶有醯胺如天冬醯胺和谷氨醯胺,則肼解時不能產生游離的羧基末端氨基酸。此外肼解時注意避免任何少量的水解,以免釋出的氨基酸混淆末端分析。B.羧肽酶水解法:羧肽酶可以專一性地水解羧基末端氨基酸。根據酶解的專一性不同,可區分為羧肽酶A、B和C。應用羧肽酶測定末端時,需要事先進行酶的動力學實驗,以便選擇合適的酶濃度及反應時間,使釋放出的氨基酸主要是C末端氨基酸。

4. sanger 求蛋白質測序法的原理,越詳細越好!

sanger 法是指 用二硝基氟苯(DNFP)與多肽鏈上的 N端 氨基酸 的氨基反應 生成DNP-氨基酸 在酸性條件下水解 多肽鏈, DNP-氨基酸斷裂下來,其餘的是多肽鏈,然後通過紙層析DNP-氨基酸,確定是那種氨基酸.(當然某些氨基酸中的R基上氨基和羥基也可與 DNFP反應,但可通過有機溶劑除去).
ps 1953年 英國人sanger用測定了牛胰島素的氨基酸序列,聞名於世.

5. 什麼叫做n末端氨基酸殘基 詳解,能畫出化學方程式,並指出

N末端氨基酸殘基就是肽鏈中含有游離α氨基的那個氨基酸殘基。在一條多肽鏈中,氨基酸之間通過氨基與羧基脫水縮合形成的肽鍵連接成長鏈,肽鏈一端的氨基酸的α羧基沒有形成肽鍵,處於游離狀態,這一端就是肽鏈的C端,另一端的α氨基沒有形成肽鍵,這一端是肽鏈的N端。N端的含有游離α氨基的氨基酸殘基就是N末端氨基酸殘基。

6. 如何預測一段多肽鏈的氨基酸序列

如何預測一段多肽鏈的氨基酸序列
有兩種方法,一是直接測序列法,常用Edman降解法,在弱鹼性條件下多肽連N端氨基酸(阿爾發)與PITC反應,標記為苯氨基硫代甲醯蛋白質。肽鏈中的第一個肽鍵變弱,在無水酸的存在下發發生降解,第一個氨基酸(AA1)經過分子重排成為PTH-AA1結合層析技術即可確定氨基酸的性質。C端氨基酸殘基分析,可用;羧基肽酶,肼解法;二是串聯質譜測定多肽鏈氨基酸測序。

氨基酸(amino acid):含有氨基和羧基的一類有機化合物的通稱。生物功能大分子蛋白質的基本組成單位,是構成動物營養所需蛋白質的基本物質。是含有鹼性氨基和酸性羧基的有機化合物。氨基連在α-碳上的為α-氨基酸。組成蛋白質的氨基酸均為α-氨基酸。

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