全基因組關聯分析方法

Ⅰ 關聯分析的常用方法

方法如下：

1、圖標分析

將數據進行可視化處理，簡單的說就是繪制圖表。單純從數據的角度很難發現其中的趨勢和聯系，而將數據點繪製成圖表後趨勢和聯系就會變的清晰起來。對於有明顯時間維度的數據，我們選擇使用折線圖。

2、協方差及協方差矩陣分析

第二種相關分析方法是計算協方差。協方差用來衡量兩個變數的總體誤差，如果兩個變數的變化趨勢一致，協方差就是正值，說明兩個變數正相關。如果兩個變數的變化趨勢相反，協方差就是負值，說明兩個變數負相關。如果兩個變數相互獨立，那麼協方差就是0，說明兩個變數不相關。

3、相關系數分析

第三個相關分析方法是相關系數。相關系數（Correlation coefficient)是反應變數之間關系密切程度的統計指標，相關系數的取值區間在1到－1之間。1表示兩個變數完全線性相關，－1表示兩個變數完全負相關，0表示兩個變數不相關。數據越趨近於0表示相關關系越弱。

特點說明

第一，以自然群體為材料，無須構建作圖群體，極大縮短了基因定位的周期。第二，通過統計群體的多個性狀信息和基因組信息，可實現多個基因定位，而連鎖作圖只能定位某一相對性狀。第三，關聯分析作圖群體的群體結構具備豐富的遺傳多樣性，使得定位更加精確，檢測出小效應的位點。但由於群體結構的存在，關聯分析往往會出現假陽性的結果。