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腫瘤學研究方法

發布時間:2023-05-22 06:49:06

A. 2019醫學考研:腫瘤學的研究方向是什麼

以下是獵考考研小編為大家整理的「2019醫學考研:腫瘤學的研究方向是什麼?」的相關內容,希望對考研的同學有所幫助,一起來看看吧!
研究方向
目前,各大院校與腫瘤學專業相關的研究方向都略有不同的側重點。以中山大學腫瘤防治中心為例,該專業碩士研究方向主要有:
01腫瘤分子分型與個體化治療
02腫瘤葯理與個體化治療
03腫瘤信號轉導與靶向葯物
04惡性腫瘤的靶向治療的研究
05惡性腫瘤發病及轉移的分子標志
06惡性腫瘤早期診斷及發病機制
07EB病毒致癌機制的研究
08腫瘤靶向葯物
09腫瘤信號傳導和細胞周期調控
10腫瘤免疫與免疫治療
11腫瘤免疫逃逸與細胞免疫治療研究
12腫瘤相關基因的研究
13腫瘤發生和發展的分子機理
14腫瘤的分子病因學及基因治療
15腫瘤基因治療
16腫瘤病理學
17靶向治療分子機制
18肺癌靶向治療
19乳腺癌綜合治療
20食管癌的個體化治療
21肺癌分子分型研究
22炎性器官功能損害的機制與防控方法
23卵巢癌診治
24婦科腫瘤診治進展
25婦科腫瘤相關基因的研究
26頭頸腫瘤診斷治療的基礎研究
27膀胱癌動脈化療
28激素非依賴性前列腺癌新型葯物研究
29腎癌的微創外科治療
30惡性腫瘤放射生物學行為
31鼻咽癌分子指標的預後
32鼻咽癌篩查指標的評價
33腫瘤轉移機制
34腫瘤納米靶向治療機制研究
35血液腫瘤的臨床和基礎研究
36膠質瘤綜合治療基礎研究
37鼻咽癌綜合治療
38腫瘤生物標志物的分子機理及其臨床應用研究
以上是獵考考研為大家准備整理的「2019醫學考研:腫瘤學的研究方向是什麼?」的相關內容。另則模返外,獵考考研針對每一個科目要點與每年的大綱進行深入並具有針對性碼碼的指導分析,歡迎各位考生了解咨詢。同時,獵考考研一直為大家推出考研直播課堂,足不出戶就可以邊聽課邊學習,為大家的考研夢孫飢想助力!
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B. 醫學考研專業:腫瘤學專業研究方向

目前,各大院校與腫瘤學專業相關的研究方向都略有不同的側重點。以中山大學腫瘤防治中心為例,該專業碩士研究方向主要有:01腫瘤分子分型與個體化治療02腫瘤葯理與個體化治療03腫瘤信號轉導與靶向葯物04惡性腫瘤的靶向治療的研究05惡性腫瘤發病及轉移的分子標志06惡性腫瘤早期診斷及發病機制07EB病毒致癌機制的研究08腫瘤靶向葯物09腫瘤信號傳導和細胞周期調控10腫瘤免疫與免疫治療11腫瘤免疫逃逸與細胞免疫治療研究12腫瘤相關基因的研究13腫瘤嫌陵發生和發展的分子機理14腫瘤的分子病因學及基因治療15腫瘤基因治療16腫瘤病理學17靶向治療分子機制18肺癌靶向治療19乳腺癌綜合治療20食管癌的個體化治療21肺癌分子分型研究22炎性器官功能損害的機制與防控方法23卵巢癌診治24婦科腫瘤診治進展25婦科腫瘤相關基因的研究26頭頸腫瘤診斷治療的基礎研究27膀胱癌動脈化療則巧28激素非依賴性前列腺癌新型葯物研究29腎癌的微創外科治療30惡性腫瘤放射生物學行為31鼻咽癌分子指標的預孫者鍵後32鼻咽癌篩查指標的評價33腫瘤轉移機制34腫瘤納米靶向治療機制研究35血液腫瘤的臨床和基礎研究36膠質瘤綜合治療基礎研究37鼻咽癌綜合治療38腫瘤生物標志物的分子機理及其臨床應用研究

C. 請問目前腫瘤檢測的方法都有哪些

腫瘤篩查是早期發現癌症和癌前病變的重要途徑。
目前腫瘤篩查的方式主要有以下幾個方法:
1. 包括X光,B超,CT等一些影像學設備的影像檢測。但是經過影像學檢查查出的腫瘤都是比較大的腫瘤了,基本都到了中晚期。總的來說,作為早期篩查,影像學手段發現的還是比較晚的。

2. 腫瘤標志物檢查,包括癌胚抗原定量CEA、腫瘤特異性生長因子TSGF,甲胎蛋白AFP等等。在美國,腫瘤標志物通常用作檢驗癌症是否復發,而不是用在健康人身上,醫生不鼓勵健康人盲目地做血清腫瘤標志物檢查。

3. 基因檢測,腫瘤的產生源自於細胞的無限增殖。癌基因又稱轉化基因,它們一旦活化便能促使人或動物的正常細胞發生癌變。目前常見的癌基因家族src家族、ras家族、myc家族、sis家族、myb家族。抑癌基因的缺失也會導致腫瘤發生。目前基因檢測比較昂貴,且受基因樣本庫、專業解讀水平的制約,基因檢測的結果解讀難度大。

尿液檢測,惡性腫瘤患者普遍存在氨基酸代謝異常的現象,氨基酸代謝異常在腫瘤發生早期就存在,其中一個重要表現,就是尿液中對羥基苯丙氨酸(酪氨酸)的含量升高。腫瘤細胞代謝越活躍,氨基酸代謝異常越顯著,酪氨酸含量升高越明顯。通過大量實驗研究發現,幾乎所有惡性腫瘤病人尿液中的酪氨酸含量會明顯地升高50%-150%。目前市場上的好益測癌症檢測試劑可以與與尿液中的酪氨酸及其衍生物發生特異性顯色反應,定性檢測其含量,從而判斷人體內惡性腫瘤細胞的代謝活躍程度,進而進行惡性腫瘤風險評估。

D. 如何應用蛋白質組學技術進行腫瘤研究思路設計

雙向凝膠電泳 雙向凝膠電泳的原理是第一向基於蛋白質的等電點不同用等電聚焦分離,第二向則按分子量的不同用SDS-PAGE分離,把復雜蛋白混合物中的蛋白質在二維平面上分開。由於雙向電泳技術在蛋白質組與醫學研究中所處的重要位置,它可用於蛋白質轉錄及轉錄後修飾研究,蛋白質組的比較和蛋白質間的相互作用,細胞分化凋亡研究,致病機制及耐葯機制的研究,療效監測,新葯開發,癌症研究,蛋白純度檢查,小量蛋白純化,新替代疫苗的研製等許多方面。近年來經過多方面改進已成為研究蛋白質組的最有使用價值的核心方法。 等電聚焦 等電聚焦(isoelectric focusing,IEF)是60年代中期問世的一種利用有pH梯度的介質分離等電點不同的蛋白質的電泳技術。等電聚焦凝膠電泳依據蛋白質分子的靜電荷或等電點進行分離,等電聚焦中,蛋白質分子在含有載體兩性電解質形成的一個連續而穩定的線性pH梯度中電泳。載體兩性電解質是脂肪族多氨基多羧酸,在電場中形成正極為酸性,負極為鹼性的連續的pH梯度。蛋白質分子在偏離其等電點的pH條件下帶有電荷,因此可以在電場中移動;當蛋白質遷移至其等電點位置時,其靜電荷數為零,在電場中不再移動,據此將蛋白質分離。 生物質譜 生物質譜技術是蛋白質組學研究中最重要的鑒定技術,其基本原理是樣品分子離子化後,根據不同離子之間的荷質比(M/E)的差異來分離並確定分子量。對於經過雙向電泳分離的目標蛋白質用胰蛋白酶酶解(水解Lys或Arg的-C端形成的肽鍵)成肽段,對這些肽段用質譜進行鑒定與分析。目前常用的質譜包括兩種:基質輔助激光解吸電離-飛行時間質譜(MALDI-TOF-MS)和電噴霧質譜(ESI- MS)。 飛行時間質譜 MALDI 的電離方式是 Karas和Hillenkamp於1988年提出。MALDI的基本原理是將分析物分散在基質分子(尼古丁酸及其同系物)中並形成晶體,當用激光(337nm的氮激光)照射晶體時,基質分子吸收激光能量,樣品解吸附,基質-樣品之間發生電荷轉移使樣品分子電離。它從固相標本中產生離子,並在飛行管中測定其分子量,MALDI-TOF-MS一般用於肽質量指紋圖譜,非常快速(每次分析只需3~5min),靈敏(達到fmol水平),可以精確測量肽段質量,但是如果在分析前不修飾肽段,MALDI-TOF-MS不能給出肽片段的序列。 電噴霧質譜(ESI-MS) ESI- MS是利用高電場使質譜進樣端的毛細管柱流出的液滴帶電,在N2氣流的作用下,液滴溶劑蒸發,表面積縮小,表面電荷密度不斷增加,直至產生的庫侖力與液滴表面張力達到雷利極限,液滴爆裂為帶電的子液滴,這一過程不斷重復使最終的液滴非常細小呈噴霧狀,這時液滴表面的電場非常強大,使分析物離子化並以帶單電荷或多電荷的離子形式進入質量分析器。ESI-MS從液相中產生離子,一般說來,肽段的混合物經過液相色譜分離後,經過偶聯的與在線連接的離子阱質譜分析,給出肽片段的精確的氨基酸序列,但是 分析時間一般較長。 目前,許多實驗室兩種質譜方法連用,獲得有意義的蛋白質的肽段序列,設計探針或引物來獲得有意義的基因。隨著蛋白質組研究的深入,又有多種新型質譜儀出現,主要是在上述質譜儀的基礎上進行改進與重新組合。

E. 如何從腫瘤免疫應答的角度設計研究思路

在抗腫瘤免疫應答過程中,葯物的療效很大程度上取決於腫瘤特異的效應性免疫細胞的功能狀態,而效應細胞的增殖和活性受免疫檢查點共刺激和共抑制信號的共同調節。因此增加抗腫瘤免疫反應往往是通過 增強作為正向調節的共刺激信號,或阻斷負向調節的抑制信號 。但往往事情沒有我們想的那麼簡單,尤其是在異質性很強的腫瘤微環境中,各種免疫調控網路紛繁復雜,這也就促使我們採用多種免疫檢查點抑制劑聯合治療的方案。

目前發旁仿現具有可用於葯物治療的免疫檢查點分子有很多: PD-1, PD-L1, CTLA4, LAG-3, TIM-3, TIGIT, PVRIG, NKG2A 等,因為PD-1/PD-L1和CTLA4最早被發現,也研究的最多,因此目前抗CTLA-4 與抗 PD-1/PD-L1 聯合策略也被用於多種腫瘤的免疫治療中。但這種組合方式在很多腫瘤患者中的療效並不顯著,還具有很強的副作用,因此近些年科學家正不斷研究別的免疫檢查點聯合用葯方式。其中因 TIM-3 廣泛表達於T細胞、Tregs、B細胞、NK細胞、DCs、巨噬細胞和肥大細胞等各種免疫細胞,並與 Galectin9 、高遷移率組盒1( HMGB1 )和癌胚抗原相關細胞粘附分子1( CEACAM-1 )結合成為了近幾年基礎和臨床研究工作者的青睞。此外,TIM-3與PD-1在耗盡的T細胞和TILs上的共表達現胡啟或象為聯合使用抗PD-1和抗TIM-3提供了一個思路。並且一些小鼠模型的實驗為這種組合的有效性提供了直接證據,幾個I期的抗PD-1聯合抗TIM-3的研究已經在晚期和轉移性實體腫瘤中開始施行。

那麼接下來我就先通過解讀今年發表在 Nat Commun (IF:14.91)一篇名為:Galectin-9 interacts with PD-1 and TIM-3 to regulate T cell death and is a target for cancer immunotherapy的文章介紹免疫檢查點分子情侶PD-1/TIM-3以及 Galectin-9 的三角戀故事。

1.質譜分析篩選PD-1的結合蛋白

研究者首先通過IP/Western和免疫復合物的質譜分析確定了Galectin-9是PD-1的結合蛋白,且具有免疫調節活性。這里可能大家需要想到作者肯定篩選出了很多可以與PD-1結合褲伍的蛋白,然後通過實驗逐一進行功能驗證,最後發現Galectin-9蛋白具有較好的表型,因此後續都對這個蛋白進行分析。 類比這樣的方法我們還可以篩選與自己研究基因相結合的蛋白,從而縮小靶基因的范圍。 後續實驗證明了Galectin-9與PD-1的結合是高度選擇性的,並且是由多糖介導的,它不影響PD-1與其同源配體PD-L1的結合,也不影響PD-1和治療性抗體Pembrolizumab和nivolumab的結合。

Galectin-9主要有兩個CRD ( N-CRD,C-CRD )結合位點,研究者發現Galectin-9主要通過其 C-CRD 與PD-1結合,而N-CRD和C-CRD均介導其與Tim-3的結合。為了確定PD-1上與Galectin-9結合的糖基化位點,將PD1上4個可能的糖基化位點(N49、N58、N74和N116)上的天冬醯胺(N)殘基分別突變為谷氨醯胺(Q),發現 N116Q 突變在很大程度上影響了PD-1與Gal-9的結合,因此Galectin-9/PD-1的相互作用主要由Gal-9的C-CRD和PD-1的N116連接的糖鏈介導。

圖1:

2. Galectin-9可與PD-1和TIM-3交聯形成復合物

緊接著研究者通過平板蛋白結合實驗,發現在沒有Galectin-9的情況下,PD-1 ECD並不結合TIM-3 ECD,而Galectin-9促進了它們的協同結合。DuoLink實驗和IP/Western實驗的結果進一步證實了這一點。但神奇的是, 在沒有外源Galectin-9的情況下,PD-1/TIM-3相互作用也能被檢測到 ,這種相互作用並不被乳糖或PD-1 N116Q突變所抑制。這就好比PD-1/TIM-3本來是一對情侶,只是感情並不是太穩定,這時生活中出現了一個和兩人都能處得來的好友Galectin-9,表面是調節二者關系,其實是和其中一人搞曖昧。

圖2:

3. Galectin-9可作為癌症免疫治療的靶點

通過流式細胞術分析,研究者發現 Galectin-9誘導的T細胞死亡可能與抗癌免疫抑制有關 ,因此研究者評估了抑制Galectin-9在癌症治療中的潛力,並推測這可能是由於抑制Galectin-9後T細胞共刺激受損所致。接下來,通過將抗Galectin-9與 GITR (TNFRSF共刺激受體家族的一個成員)的激動型抗體DTA-1相結合驗證了這一想法,它們的組合在不同的腫瘤模型中協同抑制了腫瘤的生長和延長了總生存期。因此,這些結果表明Galectin-9是腫瘤免疫治療的靶點,並且抗Galectin-9聯合GITR激動劑可以誘導出強大的抗腫瘤活性。

圖3:

4. 質譜流式證實抗Galectin-9治療針對特定的腫瘤浸潤性T細胞亞群

只有推測,沒有動物實驗當然是不行的,研究者接下來就在荷瘤小鼠中進行體內實驗。通過分析幾組質譜流式的結果,研究者發現抑制Galectin-9可以選擇性地擴大了瘤內TIM-3+ CD8T和CD4T細胞亞群,這也包括具有免疫抑制性的Treg細胞, 並且Treg細胞在總CD45+TIL中的比例增加 ,特別是CD8T細胞中CD8T_1亞群的比例在抗Galectin-9處理後增加了兩倍以上。由於Treg可以特異性的抑制抗腫瘤免疫,因此接著通過聯合使用抗Galectin-9和抗GITR(可特異下調Treg)後,CD8T亞群的比例進一步增加,而Treg細胞幾乎完全喪失。因此,抗Galectin-9單一療法雖然擴增了具有效應潛能的CD8T細胞亞群。然而,它的治療效果可能會因為Treg細胞的共同擴增而受到影響。

圖4:

一般情況下,CD8T細胞在腫瘤抗原的不斷刺激下會逐漸失去功能,變成衰竭前體細胞。在這個階段的CD8T細胞會高表達TCF1,同時也表達PD-1,TIM-3,如果腫瘤抗原持續存在,CD8T細胞就會走向終末衰竭的T細胞,並且逐漸走向死亡。但是處在這個終末衰竭性T細胞狀態前的T細胞可以被抗Galectin-9治療給逆轉成具有較強增殖和分化能力的功能性T細胞,只不過同時擴增的還有Treg細胞。因此,聯合使用抗GITR來控制Treg細胞的擴增則解決了這一難題。

圖5:

5.單細胞數據揭示Galectin-9的表達分布

其實講到這,文章的主體研究思路都講完了,但是為了進一步解析Galectin-9在各類免疫細胞的表達情況,作者還分析了之前發表的一套單細胞數據。所以,這也進一步說明了數據挖掘的重要性。無論是多高級的研究思路,都是需要大數據作為支撐才變得更有說服力,這個數據可以來源於自己花錢測的,也可以來自已經發表的研究。這里作者就通過數據挖掘發現Galectin-9(LGALS9)在多種免疫細胞中都有表達,而且發現與對PD-1治療沒有應答的患者相比,應答患者表達更高水平的Galectin-9,這也證實了抗Galectin-9和抗PD-1聯合用葯的可能性。

圖6:

6.關於免疫應答研究可做的生信思路

好了,上面介紹了如何通過 實驗研究 免疫檢查點分子間的互作關系從而探索影響腫瘤免疫治療應答的因素,學習了一些實驗設計的研究策略。然而,為了符合我一貫寫作的氣質,下面得對應來點別的有深意的生信干貨。其實作為數據挖掘的熱點,有關腫瘤對免疫治療應答的相關生信思路有很多,下面主要列舉幾篇今年剛發表的研究免疫治療應答的文章思路:

圖7:

第一篇解讀的是發表在Mol Ther Oncolytics(IF:7.20)雜志上篇名為「Single-cell RNA-sequencing analyses identify heterogeneity of CD8 + T cell subpopulations and novel therapy targets in melanoma」的文章。作者重新分析了已經發表的黑色素瘤單細胞數據,揭示出來7群CD8 T細胞亞群,這些亞群具有不一樣的特徵。此外,作者還鑒定出了3個在衰竭性CD8 T細胞上過表達的基因(PMEL, TYRP1和EDNRB),它們與患者的不良預後顯著相關。像這種思路,只要有數據都能很容易的復現一篇,至於發到什麼樣的雜志上,就看證實的發現是否新穎。

圖8:

另一篇發表在 J Immunother Cancer (IF:13.75)篇名為:CXCL13 shapes immunoactive tumor microenvironment and enhances the efficacy of PD-1 checkpoint blockade in high-grade serous ovarian cancer的文章則是從影響免疫浸潤的趨化因子著手。這個思路主要是對明星分子在不同癌型中的功能進行探索,需要通過實驗來進行功能驗證。因為明星分子被研究的很多了,除非做泛癌分析,否則基本上很難做出太新穎的東西。但是這類實驗設計很簡單,只需要證明某個明星分子在 特定的癌型 中通過何種方式影響免疫治療反應即可。

圖9:

如果覺得明星分子沒有太多研究新意,當然還可以通過各種生信方法篩選出關鍵基因。接下來一篇發表在 Oncoimmunology (IF:8.11)的篇名為「YKT6, as a potential predictor of prognosis and immunotherapy response for oral squamous cell carcinoma, is related to cell invasion, metastasis, and CD8+ T cell infiltration」的文章就是先通過 WGCNA 的方法篩選出和免疫抑制相關的基因YKT6,進行後續的分析。對於這種新篩出的之前沒有報道過的基因就比較容易說故事,當然這個思路有一些運氣的成分,很有可能百費周折篩選出的基因要麼沒有很好的功能,要麼就已經被報道。

圖10:

如果你腫瘤免疫的生物學背景知識不強,也沒有很好的實驗平台,那麼還有最後一種選擇,那就是萬能膏葯之臨床預測模型。最後一篇發表在 Front Immunol (IF:7.56)雜志上,篇名為「9-Gene Signature Correlated With CD8 + T Cell Infiltration Activated by IFN-γ: A Biomarker of Immune Checkpoint Therapy Response in Melanoma」的文章就是通過構建和免疫治療相關的臨床預測模型。有關臨床預測模型的構建,現在已經很成熟了,如 LASSO,COX,NMF 等模型都可以套用。這個思路前提是需要找一個較為新穎切入點,且最後能被多套數據集驗證出來,那就基本可以發表一點不錯的SCI文章了。

7.小結

本文從研究腫瘤免疫治療應答的這個科學問題著手,先是通過一篇以實驗為主的研究型文章解讀了如何通過巧妙的實驗設計篩選出有潛力的免疫檢查點分子,隨後分別解讀了一些純生信和生信聯合實驗的文章思路。有關腫瘤免疫治療問題可以研究的方向有很多,但是 一般需要先了解研究癌型的免疫治療進展 ,有的問題在一些癌型中已經被研究的很通透,那就沒有必要再去浪費時間了,而同樣的科學問題在一些腫瘤中就還是一個未知,那這樣的問題就比較有研究的價值了。此外,就像開頭說的因為免疫治療應答與否牽扯的問題主要和免疫細胞的比例有關,而免疫細胞在腫瘤中的佔比不高,因此bulk測出來的高表達基因主要是腫瘤細胞自身的基因,從這個角度看基於 bulk數據差異分析找出的高表達基因需要用腫瘤細胞系去做實驗驗證 。而單細胞數據就比較利於揭示免疫細胞上表達和免疫治療的基因,但是商品化的10X平台可測得的基因不多,我的經驗是先從單細胞數據揭示各種免疫細胞的比例,找出應答和非應答的差異免疫細胞亞群,從而進一步找出高表達的基因,最後通過簡單實驗進行免疫細胞的功能驗證就基本都可以發表一篇不錯的生信文章了。

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F. 如何利用組學的方法研究腫瘤的發病機制

你好!腫瘤學是研究腫瘤的綜合治療喊陵,內科,外科,放療科等都會涉及到,腫瘤放射治療學以放射治療為主的學科。腫瘤放射治療學與腫瘤外科、腫瘤內科一樣是臨床學科。
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G. 腫瘤研究

腫瘤學
腫瘤學——醫學研究生入學考試精要叢書
圖書作者: 蔣國梁、杜祥 主編
出版社: 復旦大學出版社
ISBN: 7309046064
出版時間: 2005-10第1版
印刷時間: 2005-10第1次印刷
開 本: 16
價 格(元): 36

我國惡性腫瘤的發生率和死亡率在過去的20年中明顯上升,在我國的一些主要大城市中,惡性腫瘤已居死亡病因中的首位,已成為危害人民健康和生命的主要疾病。在全球范圍內也一樣,惡性腫瘤已成為人類的主要殺手。國內外對惡性腫瘤的研究投入了大量的握舉人力、物力和財力,包括基礎和臨床研究兩方面。近年來對惡性腫瘤的研究進展迅速,包括腫瘤的病因學、遺傳基因、分子流行病學,以及臨床方面對傳統手術、放射治療、化學治療方法的改進,特別是多學科綜合治療概念的提出和應用,新的治療手段和途徑的發明和成功的臨床實踐。然而在惡性腫瘤的預防、診斷和治療方面,還沒有出現革命性的進步,未知的領域和待解決的問題遠遠多於我們已獲得的知識和已解決的問題,因此對惡性腫瘤的研究具有極大的挑戰性和艱巨性,同時又存在巨大的發展空間和成功機遇。這也許就是近年來越來越多的醫學生和學習生命科學的學生投身於對惡性腫瘤研究的原因。為了幫助這些有志於腫瘤事業的青年人復習和參加研究生入學考試,我們編寫了這本「醫學研究生入學考試精要叢書」——《腫瘤學》供復習和參考。
本書包括了兩大部分,第一部分是內容精要,主要根據朱雄增、蔣國梁主編《腫瘤學概論》(復旦大學出版社,2005)的教材,對報考腫瘤學專業研究生的考生應掌握的主要和重點內容進行了整理,其中還包括了一些最新進展的理論和臨床實踐。書中列出的楷體文字為研究生復試可能涉及的內容,希望有助於大家復習。第二部分是真題、模擬題與答題要點,目的是讓考生了解考試的方式和方法,指明一條路徑。

【目錄】
第一部分 內遲做容精要
第一章 腫瘤的基本概念
第一節 腫瘤的定義
第二節 腫瘤的分類與命名
第三節 與腫瘤有關的病變
第四節 與腫瘤性生長有關的概念
第二章 腫瘤病因學
第一節 腫瘤病因學概述
第二節 腫瘤的環境因素
第三節 腫瘤與基因
第四節 腫瘤的組織學發生
第三章 腫瘤流行病學
第一節 臨床流行病學的發展簡史和基礎概念
第二節 腫瘤流行病學的主要研究內容
第三節 腫瘤流行病學的主要研究成果
第四節 腫瘤流行病學發展的前沿——分子流行病學
第五節 癌症的遺傳流行病學
第六節 腫瘤流行病學採用的一些統計方法
第四章 腫瘤病理學
第一節 腫瘤的大體形態
第二節 腫瘤的組織形態特點
第三節 非腫瘤性增生和腫瘤性增生的區別
第四節 良性和惡性腫瘤的區別
第五節 惡性腫瘤的病理分級和分期
第六節 腫瘤的病理學診斷
第七節 腫瘤病理診斷的應用技術
第五章 腫瘤的播散
第一節 腫瘤侵襲和轉移的基本過程
第二節 腫瘤侵襲和轉移的分子機制
第三節 血管形成與腫瘤轉移
第四節 淋巴管形成與腫瘤轉移
第五節 腫瘤侵襲轉移防治研究現狀及展望
第六章 循證醫學與腫瘤學
第一節 循證醫學的概念
第二節 最佳證據
第三節 系統綜述
第四節 臨床實踐指南
第五節 循證醫學在腫瘤學中的應用
第七章 腫瘤多學科綜合治療
第一節 腫瘤治療方法的發展過程
第二節 腫瘤多學科治療的概念
第三節 腫瘤多學科治療的原則
第四節 腫瘤多學科治療的模式
第五節 腫瘤多學科治療的發展方向
第八章 腫瘤外科治療
第一節 總論
第二節 各論
第九章 腫瘤葯物治療
第一節 化學治療簡史
第二節 制定合理的化學治療方案
第三節 化學治療癌症的水平
第四節 細胞增殖動力學概念
第五節 抗腫瘤化學治療葯物的分類
第六節 抗腫瘤葯物的代謝動力學
第七節 腫瘤化學治療的不良反應及其防治
第八節 聯合化學治療原則
第九節 劑量強度
第十節 劑量調整
第十一節 實體瘤療效段旦碧評價標准
第十二節 化學治療的適應證
第十三節 化學治療的禁忌證
第十四節 輔助化學治療
第十五節 新輔助化學治療
第十六節 腔內化學治療
第十七節 化學治療葯物應用中一些特殊注意點
第十八節 腫瘤化學治療的輔助葯物
第十九節 常見惡性腫瘤的化學治療
第二十節 抗腫瘤新葯臨床試驗
第二十一節 惡性腫瘤並發症的處理
第二十二節 癌症疼痛三階梯止痛療法
第十章 腫瘤放射治療
第一節 腫瘤放射治療發展的歷程
第二節 現代腫瘤放射治療科醫師的知識結構
第三節 現代腫瘤放射治療的流程
第四節 放射治療的生物學基礎
第五節 放射治療的物理學基礎
第六節 放射治療的臨床應用
第七節 放射治療的不良反應
第八節 放射治療的新技術
第九節 放射治療的質量控制和保證
第十節 提高放射治療療效的途徑
第十一節 放射治療和其他療法的綜合治療
第十二節 常見惡性腫瘤臨床放射治療學
第十一章 腫瘤免疫治療學
第一節 腫瘤抗原
第二節 腫瘤抗原的處理、加工和遞呈
第三節 抗腫瘤免疫效應機制
第四節 腫瘤免疫治療的方法
第十二章 婦科惡性腫瘤
第一節 子宮頸癌
第二節 子宮內膜癌
第三節 卵巢惡性腫瘤
第十三章 腫瘤分子生物學
第一節 腫瘤的生長生物學
第二節 癌基因和抑癌基因
第三節 腫瘤的播散
第四節 腫瘤與宿主
第五節 腫瘤基因治療
第十四章 腫瘤遺傳及遺傳性腫瘤
第一節 腫瘤發生的遺傳學基礎
第二節 腫瘤遺傳易感性
第三節 遺傳性腫瘤的特徵
第四節 常見的遺傳性腫瘤
第二部分 真題、模擬題與答題要點
真題1 復旦大學2005年碩士研究生入學考試腫瘤學試題與答題要點
模擬題1
模擬題2
模擬題3
模擬題4
模擬題5
請採納。

H. 腫瘤3大研究方向之 純粹腫瘤異質性探索

DOI: 10.1126/science.1254257

Broad研究所和麻省總醫院(MGH)於2014年6月12日發表在Science上: Single-cell RNA-seq highlights intratumoral heterogeneity in primary glioblastoma

目前將膠質母細胞瘤分為4個亞型,在單細胞水平對不同分型的腦膠質瘤細胞進行瘤內異質性檢測是本文的重點。

這是第一次對獲取膠質母細胞瘤中的單個細胞展開大規模的研究 ,當時單細胞轉錄組還是相對較新的辦法。利用流式細胞術的方法,對來自5位患者的腦膠質瘤細胞進行分選,檢測了430個細胞的基因表達模式,揭示了:每個膠質母細胞瘤都包含來自多種癌症亞型的細胞,腫瘤之間這些細胞的分布各不相同。

doi: 10.1126/science.aad0501.

Broad研究所於2016年4月8日在Science上發表: Dissecting the multicellular ecosystem of metastatic melanoma by single-cell RNA-seq

對19名黑色素瘤病人的單細胞樣本進行測序,共計4645個不同的腫瘤細胞;類型包括了惡性腫瘤細胞,免疫細胞,間質細胞和內皮細胞。發現:在同種腫瘤中的惡性細胞,其轉錄的異質性與細胞周期,空間分布和抗葯性相關。單細胞轉錄組表達矩陣:GSE72056

doi: 10.1016/j.cell.2017.10.044

2017年12月發表在CELL雜志上,題目是: Single-Cell Transcriptomic Analysis of Primary and Metastatic Tumor Ecosystems in Head and Neck Cancer 。通訊作者為Itay Tirosh 、Derrick T. Lin 、 Aviv Regev 、Bradley E. Bernstein

HNSCC 頭頸部鱗狀細胞癌是最常見的十大癌症之一,是一種與酒精和煙草暴露密切相關的具有異質性的上皮腫瘤,患者往往在晚期出現的淋巴結轉移(LN)。實驗使用 Smart-seq2 方法得到了:研究者對 18個頭頸部鱗癌(HNSCC)患者( 其中包含5對原發性腫瘤和淋巴結節轉移配對樣本)中分離得到的 6000個單細胞 進行大規模scRNA-seq分析【數據公布在 GSE103322】。實驗驗證用的是細胞系 Oral cavity HNSCC cell lines (Cal-27, SCC9, SCC4, SCC25, and JHU-006; all derived from male patients) 做了RNA-seq 數據。 創造了頭頸部腫瘤的第一個細胞圖譜,揭示了頭頸部腫瘤及其轉移的許多不同類型的細胞。

DOI: 10.1126/science.aai8478

美國麻省總院和Broad研究所合作,於2017年3月31日發表在Science上: Decoupling genetics, lineages, and microenvironment in IDH-mutant gliomas by single-cell RNA-seq

10例星形膠質瘤 樣本中的9800個細胞和 6例少突膠質瘤 樣本中的4300個細胞進行了單細胞RNA測序。再結合癌症基因組Atlas中的165例轉錄組數據。兩種腫瘤都含有3種癌症細胞:非增殖性細胞(nonproliferating cells)、類神經幹細胞(resemble neural stem)和祖細胞(progenitor cells)。結果表明兩種腦腫瘤亞型起源於神經祖細胞的相同類型,由基因突變模式和其微環境的組成分而區分開。結果重新定義了兩種密切相關膠質瘤的細胞組成,它們是以IDH基因突變為特徵的星形細胞瘤和少突膠質細胞瘤。

doi: 10.1002/hep.29778.

美國國家癌症中心Zheng H, Pomyen Y, Hernandez M O等於2018年7月發表在Hepatology上: Single‐cell analysis reveals cancer stem cell heterogeneity in hepatocellular carcinoma

肝細胞癌(HCC,hepatocellularcarcinoma)的腫瘤內分子異質性部分歸因於肝癌幹細胞(CSC,hepatic cancer stem cells)的存在。研究人員在 單細胞水平 (10X Chromium、SMART-seq)上 整合轉錄組學和功能分析 用以評估CSC的異質性程度。結果表明, CSC在單細胞水平上的表型、功能和轉錄均存在異質性,不同的CSC亞群具有不同的分子特徵 。而且不同CSC亞群內的不同基因與HCC預後相關,並且彼此相互獨立,表明 CSC異質性影響腫瘤內異質性和腫瘤進展

DOI: 10.1126/science.aat1699.

2018年8月英國劍橋大學、桑格研究所等在Science上發表: Single-cell transcriptomes from human kidneys reveal the cellular identity of renal tumors

探究了來自胎兒、兒童和成人腎臟的 72,501 個人腎腫瘤和正常組織的單細胞轉錄組,將兒童期Wilms腫瘤與特定的胎兒細胞類型相匹配,從而為Wilms腫瘤細胞是異常胎兒細胞的假設提供證據。在成人腎細胞癌中,對腫瘤組成的分析定義了癌症相關的正常細胞,並描繪了復雜的血管內皮生長因子(VEGF)信號轉導通路。結果揭示了人類腎臟腫瘤的確切細胞特徵和組成。

doi:10.1038/s41586-019-1373-2

2019年8月發表在nature上: A human liver cell atlas reveals heterogeneity and epithelial progenitors.

對來自9個人類捐贈者的正常肝臟組織內約10,000個單細胞進行了RNA測序,並構建了人類肝細胞圖譜。首次揭示了未知的內皮細胞、Kupffer細胞和肝細胞的亞型,並對其中一些群體進行了轉錄區劃分。證實了EPCAM+ 種群是異質的。EPCAM+ 種群包括肝細胞偏置種群、膽囊素種群以及具有強大雙能性肝臟類器官轉化潛力的TROP2int 祖細胞群體。單細胞轉錄組表達矩陣,數據公布在 GSE124395

doi: 10.1016/j.cell.2019.06.024

哈佛醫學院、博得研究所2019年8月8日 發表在cell上,題目是: An Integrative Model of Cellular States, Plasticity, and Genetics for Glioblastoma.

採用了包括 28個腫瘤的單細胞RNA測序 401個腫瘤基因組圖譜(TCGA) 標本的大量遺傳和表達分析、功能方法和單細胞譜系追蹤的整合方法獲得了膠質母細胞瘤細胞狀態和遺傳多樣性的統一模型。發現膠質母細胞瘤中的惡性細胞 以四種主要的細胞狀態存在 ,這些細胞狀態概括了不同的神經細胞類型,受腫瘤微環境的影響。膠質母細胞瘤不同狀態下細胞的相對頻率不同,受CDK 4、EGFR和PDGFRA基因拷貝數擴增和NF1位點突變的影響。作者整合了膠質母細胞瘤惡性細胞程序,其可塑性以及其通過遺傳驅動因素的調節,為膠質母細胞瘤研究提供了一個模型。

doi: 10.1158/2159-8290.CD-19-0094

2019年7月13日冷泉港實驗室發表在Cancer Discov: Cross-species single-cell analysis of pancreatic ctal adenocarcinoma reveals antigen-presenting cancer-associated fibroblasts

癌症相關的成纖維細胞(CAFs)是胰腺導管腺癌(PDAC)進展和耐葯的主要因素。文章對人和小鼠使用單細胞RNA測序(scRNA-seq)將CAFs分為三個不同的亞群(myCAFs、iCAFs、apCAFs),確定每個亞群的特定功能和特徵。證實了肌纖維母細胞CAFs(myCAFs)和炎症性CAFs(iCAFs)的存在,並定義了它們在體內的獨特基因特徵。描述了一種表達MHCⅡ類基因和CD 74基因、但不表達經典的共刺激分子的新的CAFs(抗原呈遞CAFs),在模型系統中以抗原特異性方式激活CD4 + T細胞,證實了它們被推測的免疫調節能力。

DOI:10.1038/s41422-019-0195-y

Chinese Academy of Medical Science & Peking Union Medical College於2019年7月4日發表在Cell Research: Single-cell RNA-seq highlights intra-tumoral heterogeneity and malignant progression in pancreatic ctal adenocarcinoma

使用10× scRNA技術測序:【Case】 24例胰腺導管腺癌 (PDAC)(41986個細胞);【Control】 膽管腫瘤和十二指腸腫瘤共3例,8例非惡性胰腺腫瘤患者 (15444個細胞),揭示了導管腺癌腫瘤微環境圖譜特徵;比較了實驗組和對照組之間以及不同細胞類型之間細胞CNV水平的差異,發現相對於1型導管來說,2型導管是惡化程度較高的導管細胞;另外對兩種導管細胞的marker進行免疫組化,發現通過單細胞測序鑒定出的marker基因可以作為臨床中導管腺癌進程的分子標志物;伴隨著導管的惡性化進程,導管高表達細胞增殖和細胞遷移相關的基因;基於上述挖掘到的惡性導管細胞的marker基因,作者進行TCGA數據挖掘,將178個PAAD病人分為4種類型;通過不同的靶點抑制劑作用實驗發現CDK1可以作為一個比較好的潛在治療靶點;增殖性導管細胞伴隨著T細胞活化的缺失預示著較差的預後

doi: 10.1038/s41586-019-1434-6

美國聖猶大兒童研究醫院和麻省總醫院於2019年7月25日在Nature上發表: Resolving melloblastoma cellular architechture by single-cell genomics

髓母細胞瘤是最為常見的惡性兒童腦瘤。2012年,國際上將髓母細胞瘤分為4種分子亞型:WNT型、SHH型、三型和四型。WNT和SHH的腫瘤也有較為確定的細胞起源,但是三型和四型的細胞起源卻仍是個未知之謎。從目前的存活率來看,WNT亞型患者存活期較長,而三型和四型的存活期卻明顯偏短。通過將腫瘤細胞和發表的成熟腦細胞單細胞圖譜進行比較,作者發現SHH型腫瘤和其已知的起源細胞,小腦顆粒神經祖細胞(GNP )最為類似,而四型腫瘤和單極刷細胞(UBC)最為類似。

單細胞轉錄組測序技術檢測了25個兒童髓母細胞瘤樣品。 發現三型和四型的主要差異在於不同類型的細胞比例,並通過計算推測出三型和四型腫瘤的可能起源和致癌通路。

doi: 10.1038/s41467-019-11738-0.

美國杜克大學醫學院的Jason W. Locasale、Ziwei Dai和Zhengtao Xiao於2019年8月21日發表在Nature Communications上: Metabolic landscape of the tumor microenvironment at single cell resolution

分析了來自兩種代表性人類腫瘤的 9000多個單細胞 的代謝基因表達譜,包括 黑色素瘤和頭頸癌 ,然後為評估該研究中單個腫瘤細胞的轉錄組圖譜是否與常用組織樣本的轉錄組圖譜一致,研究人員將測序數據 與來自TCGA的RNA-seq數據進行了比較 。研究發現,該單細胞RNA-seq研究中的腫瘤樣本與TCGA中的腫瘤樣本大致相當。

首次在單細胞水平解析了腫瘤微環境中的細胞代謝基因表達譜,揭示了腫瘤代謝異質性在單細胞和組織水平上的顯著差異 。在腫瘤微環境中, 不同患者來源的腫瘤細胞擁有不同的代謝基因表達特徵,但不同類型非腫瘤細胞的代謝基因表達並不受患者來源的影響 ,且不同細胞類型具有各自獨特的基因表達特徵。

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