『壹』 土壤微生物的新方法
用生物化學技術能快速地檢測土壤酶活性,使土壤酶學研究在60年代後期至80年代比較熱門,其中尿酶、磷酸酶、脫氫酶在土壤中的含量和變化規律研究較多。但土壤酶測定方法用於土壤微生物研究的一個致命弱點是不能直接的反映土壤實際微生物狀況。Visser等對酶檢測用於土壤微生物群落和土壤質量評價提出了懷疑。Skujins(1978)認為脫氫酶本身的生物化學特徵決定了它不可能以胞外酶狀態存在於土壤中。為了解決土壤酶測定中的評判問題,Beck(1984)提出了土壤微生物如微生物量(microbialbiomass)、還原酶(rectase)、水解酶(hydrolase)的適宜指標,然而,這些指標從來沒有被廣泛採用。Beck(1984)和Trasar-Cepedaetal.(1998)認為把酶用於土壤質量評價指標是值得懷疑的,而且缺乏常規可行的酶測定手段,存在葯品昂貴等問題[7,8]。
Community-levelphysiologicalprofiling(CLPP)是由GarlandandMills(1991)提出的另一種酶分析方法,微生物群落降解95種不同單一碳源的能力可一次分析,其中BIOLOGGN微平板較多應用於研究土壤和環境微生物區系。作者採用BIOLOGGN微平板培養分析施用生態有機肥對土壤微生物多樣性和番茄青枯病的影響,結果表明,連作地施用生態有機肥後,番茄青枯病顯著降低,土壤微生物多樣性顯著提高。由於真菌、放線菌的代謝反應不能分解四氮疊茂,此方法只能檢測微生物群落細菌(主要是革蘭氏陰性菌)中快速生長的那部分微生物信息。不同的微生物對同一碳源的利用能力是有差異的,微生物對不同單一碳源的代謝指紋差異並不能簡單地歸納為微生物群落數量和結構的差異,而且土壤微生物在BIOLOG系統中生長時,由於溫育環境的改變引起微生物對野輪搜碳底物實際利用能力的改變,同時在溫育過程中存在適應性問題如代謝補償、代謝適應等。但CLPP方法因快速、簡便而受到人們的歡迎,因而有專用於土壤和環境微生物生態研究的生態微平板(EcoPlates)(Insam,1997)。土壤酶測定方法至今沒有一個標準的參數和測頌歷定標准,不能對土壤微生物生態功能一個准確的答案,若要充分分析土壤特徵,了解不同土壤之間的差異,一定要與其他的方法相配合。 土壤微生物是土壤生態系統桐漏中庫(pool)和流的一個巨大的原動力。土壤酶測定一般要在適宜的條件下測定,不能作為土壤物流的原位評價。庫和流的計算對土壤微生物學家來說很重要,測定土壤微生物呼吸(CO2的釋放量),是較好的微生物群落總代謝活性指標。
N、NO3輸入引起土壤酸化,甚至引起地下水的N污染。氮的分配(N2O、NO等)對氣候變化和臭氧層破壞有極大影響,生物固氮對緩解矛盾有重要的意義,同時也提高農作物產量和減少人類飢餓。從1970年以來,共生和非共生固氮研究很熱烈。土壤微生物學家應用分子生物學技術在轉基因作物和轉基因工程菌方面研究,大大提高了生物固氮效果。許多傳統方法,如N礦化測定,硝化潛力或用於反硝化測定的乙炔抑制方法仍然廣泛使用。應用15N放射性標記方法可詳細地了解土壤中或土壤微生物群落中的N分配和去向。
土壤具有復雜的空間異質性,大多數養分流測定方法不適於田間測定,局限於實驗室模擬,目前有較好的地理信息系統軟體來統計和分析這些數據。Bruckner等(1999)測定土壤理化和生物指標,研究了溫帶松果類森林土壤的的空間差異,發現土壤中某些養分轉化過程需要在一定的生態點進行,如僅在一定團粒粒級范圍內進行。Rasiah等(1999)研究發現不同農業措施會引起土壤緊實度、質地和有機質特性變化。Stenberg等(1998)研究26種不同性質土壤的微生物狀況,也證明土壤有巨大的異質性。
『貳』 微生物分析法特點是什麼
微生物分析法特點
1.准確度高 近50年來,微生物法被廣泛地納入各類標准方法中,如AOAC,AACC,GB以及其他國家的標准方法。以AOAC為例,每種微生物方法的建立,都需要經過全球20家以上的實驗室進行方法驗證,因此微生物法准確性是被廣泛公認的。
2.先期投入少,見效快 該方法的先期投入少,當實驗室具備超凈台、培養箱、分光光度計、醫用滅菌器和一些實驗室常用玻璃器皿即可開展微生物法,不需要大量額外的人力和物力,適於在任何水平的實驗室快速建立。
3.微生物法的測定結果反映了樣品中具有生物活性的被測物含量。 由於微生物法是通過觀察微生物的生長繁殖速度來間接測定維生素的含量,並且微生物本身就是一種生物體,所以採用微生物法測定出的維生素均是能夠被生物體所利用的。例如,在測定螺旋藻中的維生素B12時,微生物法的測定結果遠小於其它方法的測定結果,Herbert 等人的研究證明,雖然螺旋藻含有豐富的維生素B12,但不具有生物活性,在人體內不能發揮其應有的生理作用。 可見,微生物法的測定結果反映了具有生物活性的維生素含量。
通常來說,當實驗室目前尚沒有準確可靠的其他方法,如維生素B12、葉酸、生物素、泛酸等;或者為了大量降低分析實驗的費用;或者為了快速建立分析方法,獲得數據;或者為了最大限度的利用實驗室有限的空間。
存在問題
雖然微生物具有以上優勢,但它仍舊逐漸被其他方法所取代,這是由於它固有的一些致命的缺點,主要包括以下幾點:
1.分析周期長 一般在4-6天,而其它方法(HPLC法)一般在1-2天內即可完成。
2.實驗步驟煩瑣 通常來說,微生物法要包括樣品前處理、菌種液的制備、測試管的制備、接種、測定、計算等步驟,與儀器分析方法相比,步驟繁多。
以上兩點與目前分析方法簡便、快速、高效的發展方向不符,這也正是微生物逐漸被其他方法替代的主要原因。
『叄』 微生物群落有哪些分析方法吖
微生物分離、純培養,核酸序列分析,PCR,基因克隆文庫分析法,熒光原位雜交法等等
『肆』 目前的生物樣品分析方法主要有哪些及運用范圍
在分離分析特別是蛋白質分離分析中,層析是相當重要、且相當常見的一種技術,其原理較為復雜,對人員的要求相對較高,這里只能做一個相對簡單的介紹。 一、 吸附層析 1、 吸附柱層析 吸附柱層析是以固體吸附劑為固定相,以有機溶劑或緩沖液為流動相構成柱的一種層析方法。 2、 薄層層析 薄層層析是以塗布於玻板或滌綸片等載體上的基質為固定相,以液體為流動相的一種層析方法。這種層析方法是把吸附劑等物質塗布於載體上形成薄層,然後按紙層析操作進行展層。 3、 聚醯胺薄膜層析 聚醯胺對極性物質的吸附作用是由於它能和被分離物之間形成氫鍵。這種氫鍵的強弱就決定了被分離物與聚醯胺薄膜之間吸附能力的大小。層析時,展層劑與被分離物在聚醯胺膜表面競爭形成氫鍵。因此選擇適當的展層劑使分離在聚醯胺膜表面發生吸附、解吸附、再吸附、再解吸附的連續過程,就能導致分離物質達到分離目的。 二、 離子交換層析 離子交換層析是在以離子交換劑為固定相,液體為流動相的系統中進行的。離子交換劑是由基質、電荷基團和反離子構成的。離子交換劑與水溶液中離子或離子化合物的反應主要以離子交換方式進行,或藉助離子交換劑上電荷基團對溶液中離子或離子化合物的吸附作用進行。` 三、 凝膠過濾 凝膠過濾又叫分子篩層析,其原因是凝膠具有網狀結構,小分子物質能進入其內部,而大分子物質卻被排除在外部。當一混合溶液通過凝膠過濾層析柱時,溶液中的物質就按不同分子量篩分開了。
『伍』 生物樣品分析方法一般從那幾個方面進行考察
那要看是哪一類的生物樣品,主要風險控制在於的方向。
一般要根據樣品的種類,所要測定的成份,來確定使用什麼葯品什麼測定方法。
對於植物主要是重金屬和農殘,鉛砷鉻鎘銅和DDt,666等。
對於動物主要是抗生素、寄生蟲葯等獸葯殘留和激素等。
一個生物分析方法的主要特徵包括:選擇性、定量下限、響應函數和校正范圍(標准曲線性能)、准確度、精密度、基質效應、分析物在生物基質以及溶液中儲存和處理全過程中的穩定性。
有時可能需要測定多個分析物。這可能涉及兩種不同的葯物,也可能涉及一個母體葯物及其代謝物,或一個葯物的對映體或異構體。在這些情況下,驗證和分析的原則適用於所有涉及的分析物。
(5)新型生物分析方法擴展閱讀:
在生物樣品的測定中,根據測定項目的不同,首先要經過消解 (或灰化),或提取和分離等處理工作,然後才能進行待檢組分含量的測定。處理生物樣品的方法有消解法 (又稱濕法氧化或消化法,主要有硝酸-硫酸消解法、硝酸-高氯酸消解法、硫酸-過氧化氫消解法)、灰化法 (又稱燃燒法或高溫分解法)、提取法(包括振盪提取、組織搗碎、索氏提取器提取)、分離法和濃縮法。
動物一般多用耳緣靜脈取血,先去毛,要去凈毛,不傷皮膚,用體積分數為75%的酒精擦動物耳朵,例如兔耳朵,用燈泡照射加熱使其血管充血,用大頭針刺破靜脈放血 (先從遠心端刺),將血液放人抗凝杯中,邊收集邊搖勻,以防凝固。
『陸』 生物活性物質常用的分析方法有哪些
生物活性物質,是指來自生物體內的對生命現象具體做法有影響的微量或少量物質。
這種物質的檢測只能依靠醫學檢驗相關的分析方法。
『柒』 在現代微生物分類中應用了哪些新技術和新方法
經典分類、鑒定指標主要包括形則盯滲態學指標,生理、生化反應指標,生態特性指標等。
在現代微生物分類中應用了一下幾種新方法、新技術(有些是方法,有些是思路或技術):
1、通過核酸分析鑒定微生物的遺傳型;
(1)、DNA鹼基比孫脊例的測定。即:(G+C)mol%值。
(2)、核酸分子雜交法。
(3)、rRNA寡核苷酸編目分析。
(4)、對微生物全基因組序列進行測定。
2、細胞化學成分用作鑒定指標;
(1)、分析細胞壁的化學成分;
(2)、分析全細胞水解液的糖型;
(3)、分析磷酸類脂成分;
(4)、分析則耐枝菌酸;
(5)、分析醌類;
(6)、用氣相色譜分析
3、數值分類法(又稱統計分類法)。
每一方法或技術更詳細的闡明可以在專業網站或書籍上查詢。
『捌』 目前常用生物信息學分析方法有哪些
現在比較熱門的資料庫包括GEO、TCGA
GEO分析主要是晶元做差異分析,得到差異基因,差異基因可以做GO、KEGG功能富集分析
TCGA資料庫是癌症分析的利器,可以做差異基因,差異miRNA,差異lncRNA,下載和整理臨床數據,做生存分析,高難度的COX分析
這兩個資料庫可以發到不錯的文章