❶ 怎樣研究il-6-stat3這條信號通路
STAT3是一類由750~800個氨基酸組成的DNA結合蛋白,有αβγ三種亞型,它因可介導細胞的惡性轉化而被確認為癌基因,STAT3在早期胚胎發育和骨髓細胞的分化中發揮著不可缺少的重要作用,此外它還參與了腫瘤的增殖、分化、血管生成、侵襲轉移和免疫逃避等生理功能的調控。與STAT3相關的幾條信號轉導通路特別是Jak-STAT3信號轉導通路在多種腫瘤細胞中均有激活,體內外阻斷或抑制腫瘤細胞中STAT3的信號通路可抑制細胞惡性增殖和存活,並誘導細胞凋亡,而對正常細胞卻無影響。
❷ 細胞內的信號通路是怎麼發現的大致給個科普思路就行,不要大段抄
這個主要依靠蛋白質組學和基因組學,信號通路中的分子在外界刺激下一般會發生一些變化,一般來說,這些分子應該包括膜受體,細胞質中的級聯放大信號分子核受體以及細胞核內的一些因子。在你將配體作用於細胞後,如果你對這個通路一無所知的話,你可以首先做一個蛋白質組的研究,檢測一下陽性組和對照組之間蛋白表達的差異,蛋白磷酸化的差異等等,找出差異之後,在單個驗證,利用敲出等技術。
很籠統,希望能幫你
❸ western blot 研究未知的信號通路的大致步驟 或者給篇信號通路研究的經典文獻也行,fxw0110/ 163.com
有人的歌哈特
❹ 【求助/交流】信號通路如何研究
不過信號通路最好還是從蛋白層面進行,分析可能的4條信號通路,做相關蛋白的western blot,檢測下游蛋白常見的如磷酸化修飾silicare(站內聯系TA)信號通路太復雜了,還是文獻吧,當然是 diea了livee(站內聯系TA):tiger07:xuec(站內聯系TA)多看些英文文獻吧,很多有關報道的 看多了你就有思路了 所以還是勤奮點兒吧tongyanna(站內聯系TA)我還真不明白啊xp198766(站內聯系TA)幫LZ頂,最近我想也知道類似問題的答案,不知道有沒有高手會KEGG的,能不能寫一點總結出來啊……期待啊……lwiaanngg(站內聯系TA)如果你知道大概的途徑,可以用上面說的RT-PCR等手段 如果你不知道,你可以使用蛋白microarray/DNA microarray來測定相對變換量sqhnsd(站內聯系TA)先做相關的表型觀察,看看錶型符合那個通路相關的現象,然後做WB、蛋白質相互作用等試驗進一步去檢測具體的機制如何。但是如何去做,還必須通過看文獻才能幫助你解決問題。charlie9(站內聯系TA)信號通路的變化,一般與mRNA的變化關系不大。它一般通過關鍵蛋白分子的修飾有關,因此RT-PCR一般不能說明問題。Western-blots檢測被修飾的蛋白分子為好。
❺ 如何通過分子生物學找下游的信號通路
您的問題太籠統了,代謝通路,信號傳導通路等等研究方法完全的不一樣;一般先經過生物信息學的方法確定您所研究物種中已經過驗證的通路,設計實驗思路後,然後再通過測序、轉染、蛋白質組等手段驗證假設。、
❻ 如何確定某種因子在信號傳導通路的上游或下游
鈣離子導致P38mapk的增高,如果某種損傷可以通過鈣離子導致P38mapk的增高,那麼你就建立起了一個損傷模型。這時,對P38做個RNA干擾,使其表達下降,再來損傷刺激,如果這時損傷刺激不會導致損傷,那麼可以說P38mapk的增高會導致損傷。
這里最好不要用P38的抑制劑SB來處理,因為這個抑制劑是針對P38活性的抑制劑,抑制的是P38的磷酸化,而不是表達量。
如果說明的問題是p38磷酸化水平增加而導致損傷,那麼我建議用抑制劑。這時還可以用Dominant-negative。抑制劑的實驗證實該葯物不影響P38表達,而影響其活化。(應該首先考慮選用抑制劑,因為目前一些葯物的作用機制不是抑制靶點的表達,而是抑制靶點的激活。如果在此應用RNAi的話,很可能會漏掉這個機制或增加實驗步驟。)
其次,要證明你的葯物存在保護作用。
當然就是用你的葯物先處理一下,再來損傷刺激,如果這時損傷刺激不會導致損傷,那麼可以說你的葯物存在保護作用。
再次,證明你的葯物可以抑制P38表達。
用你的葯物先處理一下,再來損傷刺激,再檢測P38表達,如果用葯組相對於沒有用葯組P38表達下降,那麼可以說你的葯物可以抑制P38表達。
❼ 如何研究信號傳導通路請問研究某種受體或蛋白的下游信號傳導通路,實驗設計的一般方法,都有哪些謝謝
在KEGG或BioCarta這些pathway資料庫里找到你感興趣的通路,在pathway圖上找到你感興趣的蛋白後就能確認它的下游。實驗方法大體上就是上調(瞬時表達、mimics)或下調(Knockout、RNAi)你的Gene of Interest,再檢測下游的蛋白發生了上調還是下調,看看你的GOI和它們什麼聯系。
❽ 如何研究細胞內兩個信號通路的交互作用
通過實驗研究
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另外如果你覺得我的回答對你有所幫助,請千萬別忘記採納喲!
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❾ 如何對一組基因做信號通路分析
般的轉錄組測序可以得到大量差異表達基因和調控代謝通路,但由於基因與表型難以直接關聯,導致關鍵信號通路難以確定,因此往往達不到預期研究目的。相信很多做過轉錄組測序的老師都深有體會。總感覺中間缺少了一步?沒錯,就是代謝物!代謝物是基因型與表型之間的橋梁,代謝物的變化更能直接揭示基因的功能,因此能夠更有效地揭示生物學及其生化、分子機理。在植物研究中,目前代謝組+轉錄組的策略已經被廣泛運用於植物生理、生長發育、及逆境脅迫研究中。
那麼如何進行代謝組與轉錄組的關聯分析?總的來說,是基於「參與同一生物過程中的基因或代謝物具有相同或相似的變化規律」這一原理進行分析的。舉個例子,研究不同顏色品種的菊花顏色差異的原因,首先通過代謝物檢測,發現不同顏色品種的菊花積累的花青素類型和含量並不一致;然後進行轉錄組測序,在眾多差異基因及代謝通路中,我們可以重點研究與花青素合成相關的代謝通路上的基因,從而一方面快狠准地找到導致顏色差異的功能基因,另一方面代謝組的結果也相當於是對轉錄組結果的驗證。
❿ 如何研究基因調控信號通路
代謝通路:目前在通路資料庫(PATHWAY database) 中代謝通路是建立得最好的,有大約90個參考代謝途徑的圖形。每個參考代謝途徑是一個由酶或EC號組成的網路。
利用如下方法可通過計算機構建出生物體特有 的代謝通路:
先根據基因的序列相似性和位置相關性確定基因組中酶的基因。
然後合理地安排EC號。
最後將基因組中的基因和參照通路中用EC號編號的基因產物 結合起來。