重慶宏基因組分析方法

① 什麼是宏基因分析什麼是全基因組關聯分析什麼是全外顯子測序

宏基因組分析就是分析某一環境中所有生物的核酸信息 全基因組關聯分析就是測序數據比對 分析出某種疾病與哪些基因具有相關性分析 比如說GWAS分析 外顯子組測序就是通過基因晶元捕獲外顯子區域的序列 或者採用引物擴增的方式捕獲外顯子序列 利用二代測序對靶標外顯子測序並分析

② 如何用宏基因組測序

宏基因組學這一概念最早是在1998年由威斯康辛大學植物病理學部門的JoHandelsman等提出的，是源於將來自環境中基因集可以在某種程度上當成一個單個基因組研究分析的想法，而宏的英文是「meta-」，具有更高層組織結構和動態變化的含義。後來伯克利分校的研究人員KevinChen和LiorPachter將宏基因組定義為「應用現代基因組學的技術直接研究自然狀態下的微生物的有機群落，而不需要在實驗室中分離單一的菌株」的科學。

③ 什麼是宏基因組宏基因組的目的如何簡述其關鍵技術要點。

宏基因組是指即在一個生境中所有微小生物（多指微生物）遺傳物質的總和。宏基因組研究將揭示更高更復雜層次上的生命運動規律。細菌宏基因組細菌人工染色體文庫篩選和基因系統學分析使研究者能更有效地開發細菌基因資源，更深入地洞察細菌多樣性。 PS：歡迎您 和 非常檸檬 選擇 【生科聯】大家有關生物的問題可以盡管交流。

④ 宏基因組和宏病毒組的區別是什麼

①.
宏基因組是研究所有微生物，病毒佔比很少，在宏基因組中研究病毒組就像是大海撈針。宏病毒組的方法就像是用吸鐵石，把宏基因組中病毒組部分吸出來，只看病毒就能避免宿主、細菌序列的影響。另外，宏病毒組分析流程和宏基因組有很大區別。
②.
病毒宏基因組測序又稱宏病毒組，是在宏基因組學理論的基礎上，結合現有的病毒分子生物學檢測技術而興起的一個新的學科分支。 宏病毒組直接以環境中所有病毒的遺傳物質為研究對象，鑒定環境中的病毒組成， 是一種發現新病毒、 病毒感染預警和控制的手段， 在病毒的起源和進化模式、遺傳多樣性和地理分布等研究方面也具有重要意義。
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⑤ 如何從宏基因組序列中預測出特定的基因序列

宏基因組是指特定環境中全部生物（微生物）遺傳物質的總和。宏基因組測序是利用高通量測序技術對環境樣品中全部微生物的基因組進行測定，以獲得單個樣品的飽和數據量，可進行微生物群體的基因組成及功能注釋，微生物群體的物種分類，多樣性分析，群落結構分析，樣品間的物種或基因差異以及物種間的代謝網路研究，探索微生物與環境及宿主之間的關系，發掘和研究新的具有特定功能的基因等。與傳統方法相比，基於高通量測序的宏基因組研究無需構建克隆文庫，這避免了文庫構建過程中利用宿主菌對樣品進行克隆而引起的系統偏差，簡化了實驗操作，提高了測序效率。此外，宏基因組測序研究擺脫了微生物分離純培養的限制，擴展了微生物資源的利用空間，為環境微生物群落的研究提供了有效工具。通過宏基因組深度測序可以揭示或估計環境中真實的物種多樣性和遺傳多樣性，挖掘具有應用價值的基因資源，應用於開發新的微生物活性物質，為研究和開發新的微生物活性物質提供有力支持。

⑥ 宏基因組測序方法

焦磷酸測序是454高通量測序平台的測序原理,宏基因組測序是高通量測序的服務項目中的一種,就是對環境樣本中提取的總DNA直接進行測序,可以採用454或者Hiseq 2000 測序平台進行測序.454讀長長,拼接效果比較好,但是費用比較高；Hiseq2000 讀長較短,但是通量非常高,費用比較低.你可以根據自己的科研目的和經費進行選擇.

⑦ 宏基因組的介紹

宏基因組 ( Metagenome)（也稱微生物環境基因組 Microbial Environmental Genome, 或元基因組） 。是由 Handelsman 等 1998 年提出的新名詞， 其定義為「the genomes of the total microbiota found in nature」 , 即生境中全部微小生物遺傳物質的總和。它包含了可培養的和未可培養的微生物的基因， 目前主要指環境樣品中的細菌和真菌的基因組總和。而所謂宏基因組學 (或元基因組學， metagenomics) 就是一種以環境樣品中的微生物群體基因組為研究對象， 以功能基因篩選和/或測序分析為研究手段， 以微生物多樣性、 種群結構、 進化關系、 功能活性、 相互協作關系及與環境之間的關系為研究目的的新的微生物研究方法。一般包括從環境樣品中提取基因組 DNA, 進行高通量測序分析，或克隆DNA到合適的載體，導入宿主菌體，篩選目的轉化子等工作。

⑧ 宏基因組學的介紹

宏基因組學（Metagenomics）又叫微生物環境基因組學、元基因組學。它通過直接從環境樣品中提取全部微生物的DNA,構建宏基因組文庫，利用基因組學的研究策略研究環境樣品所包含的全部微生物的遺傳組成及其群落功能。它是在微生物基因組學的基礎上發展起來的一種研究微生物多樣性、開發新的生理活性物質（或獲得新基因）的新理念和新方法。其主要含義是： 對特定環境中全部微生物的總DNA（也稱宏基因組，metagenomic）進行克隆，並通過構建宏基因組文庫和篩選等手段獲得新的生理活性物質；或者根據rDNA資料庫設計引物，通過系統學分析獲得該環境中微生物的遺傳多樣性和分子生態學信息。

⑨ 如何用ShortBRED進行宏基因組分析

宏基因組即生境中全部微小生物遺傳物質的總和。它以環境樣品中的微生物群體基因組為研究對象, 以功能基因篩選和測序分析為研究手段, 以微生物多樣性、種群結構、進化關系、功能活性、相互協作關系及與環境之間的關系為研究目的。宏基因組學技術第一次使人類得以研究占環境中99%的不可培養的微生物種群，從而成為微生物研究的最前沿領域
對環境樣本進行DNA提取後進行16S或18S等區域擴增，再對擴增產物進行建庫、測序，然後對所得的數據進行生物信息學分析。生物信息分析主要包括OTU的生成及rank-abundance分析、取樣充足性分析、豐度和多樣性分析、菌群間差異分析、假設驗證分析、進化樹分析等。

⑩ 如何有效地對病毒宏基因組測序的數據進行分析

得出數據之後。
用dps 或者excel載入宏都可以進行分析
你們統計學的上機操作應該學過，再翻翻
那本教材