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蛋白質多肽鏈斷裂的計算方法

發布時間:2023-01-17 01:41:14

❶ 關於高一生物蛋白質中肽鏈,肽鍵等各種計算公式

假設氨基酸的平均相對分子質量為a,由n個氨基酸分別形成1條肽鏈或m條肽鏈.
形成肽鍵數=脫去水分子數=n-m
多肽相對分子質量=na-18(n-m)
(1)氨基數=肽鏈數+R基上的氨基數=各氨基酸中氨基總數-肽鍵數.
(2)羧基數=肽鏈數+R基上的羧基數=各氨基酸中羧基總數-肽鍵數.
(3)N原子數=各氨基酸中N的總數=肽鍵數+肽鏈數+R基上的N原子數.
(4)O原子數=各氨基酸中O的總數-脫去水分子數=肽鍵數+2×肽鏈數+R基上的O原子數.

❷ 有關蛋白質計算的方法和技巧

一.有關氨基酸脫水縮合形成蛋白質的計算

(一)計算形成的肽鍵數、脫去的水分子數

計算技巧1:

蛋白質中的肽鍵數=脫去的水分子數=氨基酸個數-肽鏈數

例1.免疫球蛋白IgG的結構示意圖如下.其中—s—s表示連接兩條相鄰肽鏈的二硫鏈。若該lgG由m個氨基酸構成,則該lgG有肽鍵數

A.m個 B.(m+1)個 C.(m—2)個 D.(m—4)個

點撥:由題圖可知,該蛋白IgG由4條肽鏈組成,所以該lgG有肽鍵數為(m—4)。

答案:D

注意:若由氨基酸脫水縮合形成環狀肽,則肽鍵數=氨基酸個數=脫去的水分子數

(二)計算蛋白質相對分子質量

計算技巧2:

蛋白質的相對分子質量=氨基酸分子個數×氨基酸平均相對分子質量-18×脫去的水分子數

例2、一種蛋白質由兩條肽鏈構成,共含有100個氨基酸,若每個氨基酸相對平均分子質量是120,則該蛋白質的相對分子質量約是__________

A. 12000 B。10236 C。10218 D。13764

點撥:脫去的水分子數要應用計算技巧1來求得,所以蛋白質的相對分子質量=100*120-18*(100-2)=10236。

答案:B

二.有關蛋白質結構的計算

(一)計算多肽種類

計算技巧3:

假設有n(0<n<20)種氨基酸,由這n種氨基酸形成多肽,情況如下:

(1)每種氨基酸數目無限的情況下,可形成m肽的種類為nm種;

(2)每種氨基酸數目只有一個的情況下,可形成m肽的種類為n×(n-1)×(n-2)……×(n-m+1)

例3:下列幾種物質最多可以構成幾種三肽( )

A.43 B.53 C.34 D.35

點撥:根據氨基酸結構通式判斷出前四種化合物為構成蛋白質的氨基酸,因為沒有限制氨基酸的數目,所以構成三肽的種數為43種。

答案:A

(二)計算蛋白質中氨基酸數目

計算技巧4:

(1)若已知多肽中氮原子數為m,氨基個數為n,則縮合為該多肽的氨基酸數目為 m-n+肽鏈數。

(2)若已知多肽中的氮原子數為m,則縮合成該多肽的氨基酸數目最多為m。

❸ 蛋白質的計算公式

★★規律1:有關氨基數和羧基數的計算
⑴蛋白質中氨基數=肽鏈數+R基上的氨基數=各氨基酸中氨基的總數-肽鍵數;

⑵蛋白質中羧基數=肽鏈數+R基上的羧基數=各氨基酸中羧基的總數-肽鍵數;

⑶在不考慮R基上的氨基數時,氨基酸脫水縮合形成的一條多肽鏈中,至少含有的氨基數為1,蛋白質分子由多條肽鏈構成,則至少含有的氨基數等於肽鏈數;

⑷在不考慮R基上的羧基數時,氨基酸脫水縮合形成的一條多肽鏈中,至少含有的羧基數為1,蛋白質分子由多條肽鏈構成,則至少含有的羧基數等於肽鏈數。

★★規律2:蛋白質中肽鍵數及相對分子質量的計算
⑴蛋白質中的肽鍵數=脫去的水分子數=水解消耗水分子數=氨基酸分子個數-肽鏈數;

⑵蛋白質的相對分子質量=氨基酸總質量(氨基酸分子個數×氨基酸平均相對分子質量)-失水量(18×脫去的水分子數)。

注意:有時還要考慮其他化學變化過程,如:二硫鍵(—S—S—)的形成等,在肽鏈上出現二硫鍵時,與二硫鍵結合的部位要脫去兩個H,謹防疏漏。

★★規律3:有關蛋白質中各原子數的計算
⑴C原子數=(肽鏈數+肽鍵數)×2+R基上的C原子數;
⑵H原子數=(氨基酸分子個數+肽鏈數)×2+R基上的H原子數=各氨基酸中H原子的總數-脫去的水分子數×2;

⑶O原子數=肽鏈數×2+肽鍵數+R基上的O原子數=各氨基酸中O原子的總數-脫去的水分子數;

⑷N原子數=肽鏈數+肽鍵數+R基上的N原子數=各氨基酸中N原子的總數。
注意:一個氨基酸中的各原子的數目計算:① C原子數=R基團中的C原子數+2;②H原子數=R基團中的H原子數+4;③ O原子數=R基團中的O原子數+2;④N原子數=R基團中的N原子數+1。

❹ 蛋白質序列測定的原理與方法

網路"蛋白質測序"詞條下有詳細介紹
1肽鏈的拆開和分離
●2測定蛋白質分子中多肽鏈的數目
●3二硫鍵的斷裂
●4測定每條多肽鏈的氨基酸組成,並計算出氨基酸成分的分子比
●5N端、C端的測定
●6多肽鏈斷裂
●7測定每個肽段的氨基酸順序。
●8確定肽段在多肽鏈中的次序。
●9確定原多肽鏈中二硫鍵的位置。

❺ 蛋白質多肽鏈N端測定的方法及基本原理

1 多肽鏈的拆分。由多條多肽鏈組成的蛋白質分子,必須先進行拆分。幾條多肽鏈藉助非共價鍵連接在一起,稱為寡聚蛋白質,如,血紅蛋白為四聚體,烯醇化酶為二聚體;可用8mol/L尿素或6mol/L鹽酸胍處理,即可分開多肽鏈(亞基).
2 測定蛋白質分子中多肽鏈的數目。通過測定末端氨基酸殘基的摩爾數與蛋白質分子量之間的關系,即可確定多肽鏈的數目。
3 二硫鍵的斷裂。幾條多肽鏈通過二硫鍵交聯在一起,可在8mol/L尿素或6mol/L鹽酸胍存在下,用過量的-巰基乙醇處理,使二硫鍵還原為巰基,然後用烷基化試劑保護生成的巰基,以防止它重新被氧化。
二硫鍵的切割與保護(元素後數字為下標)
a 過甲酸〔performic acid〕 不可逆
-CH2SO3H
b、還原+氧化 不可逆
[ 巰基乙醇,DTT ] + 碘乙酸等
-S-CH2-COOH
c、亞硫酸分解〔Sulfitolysis〕 可逆
-R1-S-S-R2 + HSO3-
R1-S- + R2-S-SOH3
可以通過加入鹽酸胍的方法解離多肽鏈之間的非共價力;應用過甲酸氧化法或巰基還原法拆分多肽鏈間的二硫鍵。
巰基(-SH)的保護4 測定每條多肽鏈的氨基酸組成,並計算出氨基酸成分的分子比(如右圖)
5 分析多肽鏈的N-末端和C-末端
多肽鏈端基氨基酸分為兩類:N-端氨基酸(amino-terminal)和C-端氨基酸(Carboxyl-terminal) 。在肽鏈氨基酸順序分析中,最重要的是N-端氨基酸分析法。N末端分析法(Sanger法;Edman法;DNS-Cl;酶降解法),C末端分析法(肼解法;酶降解法;硼氫化鋰法)。
6 多肽鏈斷裂成多個肽段。可採用兩種或多種不同的斷裂方法將多肽樣品斷裂成兩套或多套肽段或肽碎片,並將其分離開來。
7 測定每個肽段的氨基酸順序
8 確定肽段在多肽鏈中的次序。
利用兩套或多套肽段的氨基酸順序彼此間的交錯重疊,拼湊出整條多肽鏈的氨基酸順序。
9 確定原多肽鏈中二硫鍵的位置
一般採用胃蛋白酶處理沒有斷開二硫鍵的多肽鏈,再利用雙向電泳技術分離出各個肽段,用過甲酸處理後,將可能含有二硫鍵的肽段進行組成及順序分析,然後同其它方法分析的肽段進行比較,確定二硫鍵的位置。

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