基因計算方法視頻

㈠ 有關基因頻率的計算

基因頻率計算的方法取決於遺傳方式，不同的遺傳方式,計算方法各異
1.你的第一種情況,只能在完全顯性條件下，一對基因的基因型有三種,但表型只有兩種,這時無法區別純合顯性,與雜合顯性的表型，此時即可根據顯性或純合隱性的個體表型數量來求出基因頻率:
q=R的開方值。有某遺傳病在人群中每10000人就有一人患病，這時我們可以用aa=1/10000或0.001%來算出a的基因頻率為0.0316%.
2.你的第二種情況,已從表型區別出基因型，表明遺傳方式為無顯性或顯性不完全。這時的計算公式為:
p=D+1/2×H
q=1/2×H+R
p為顯性基因頻率;D為純合顯性基因型頻率;H為為雜合基因型頻率;R為純合隱性基因型頻率;q為隱性基因頻率。

㈡ 怎樣批量計算基因編碼區長度

有些時候我們需要知道轉錄本長度，比如在使用RNA-seq計算FPKM的時候，為了准確地評估不同基因的表達量，一般是用覆蓋該基因/轉錄本的總reads數除以基因/轉錄本的長度，有些時候我們需要知道基因編碼區的長度，比如在使用VAAST評估致病候選基因的時候，有些基因因為編碼區特別長（如TTN）總是排名靠前，如果考慮到它的編碼區長度後，排序將會更加科學。 那麼怎樣獲得基因編碼區長度呢？這個問題看起來比較簡單，只要將每個外顯子的長度加起來就可以了，對於單個轉錄本可以通過NCBI的CCDS資料庫查詢，但是基因有多個轉錄本，每個轉錄本的編碼區有重合，所以基因編碼區不是每個轉錄本編碼區的簡單相加，所以要想准確地獲得每個基因的編碼區長度並不容易，而且目前並沒有現成的資料庫，經過游俠在網上摸索後將相關方法整理如下，供大家參考。首先從sanger網站下載基因注釋文件GTF，ftp://ftp.sanger.ac.uk/pub/gencode/Gencode_human/release_19/gencode.v19.annotation.gtf.gz。然後在R中使用GenomicFeatures工具包。library(GenomicFeatures)txdb <- makeTranscriptDbFromGFF("yourFile.gtf",format="gtf")收集每個基因的編碼區編號exons.list.per.gene <-cdsBy(txdb,by="gene")通過rece函數避免重復計算重疊區exonic.gene.sizes <- lapply(exons.list.per.gene,function(x){sum(width(rece(x)))})生成的gene ID為ensemble編號，可以通過https://biodbnet-abcc.ncifcrf.gov/db/db2dbRes.php，轉換為gene symbol。另外游俠已經處理好了人類所有基因的編碼區長度，如果有需要的話，可以在微信號留言索取。
基因檢測與解讀(gh_561c4ccc5356)

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基因檢測與解讀
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㈢ 基因頻率計算公式是什麼

基因頻率=某基因的數目/全部等位基因的總數*100%

以A，a為例，基因頻率為A的頻率或a的頻率，兩者之和為1。基因型的頻率為AA或Aa或aa的頻率，三者之和為1.另外如aa的頻率為16%，則a的頻率為40%，因為aa基因型頻率即為兩次a出現的概率為40%*40%=16%。

設二倍體生物個體的某一基因座上有兩個等位基因A和a，假設種群中共有N個個體，而AA、Aa、aa三種基因型的個體數分別為n1、n2、n3，那麼種群中A基因的頻率和AA基因型的頻率分別是：

①A基因的頻率=A基因的總數/（A基因的總數+a基因的總數）=(2n1+n2)/2N 或 n1/N+n2/2N

②AA基因型的頻率=AA基因型的個體數/該二倍體群體總數=n1/N。

基因頻率與基因型頻率的計算關系，由上述①②推得：A基因的頻率=n1/N+1/2·n2/N=AA基因型的頻率+1/2·Aa基因型的頻率。

拓展資料：

基因頻率（gene frequency）是指在一個種群基因庫中，某個基因佔全部等位基因數的比率。群體中某一特定基因的頻率可以從基因型頻率（genotype frequency）來推算。如人們熟悉的人的MN血型，它是由一對共顯性等位基因M和N所決定，產生3種基因型M/M、M/N和N/N，而相應的表型是M、MN和N，而且比例是1/4M、1/2MN和1/4N。這個原理可以推廣到一般群體內婚配，如以群體中MN表型（基因型）的具體樣本數被所觀察到總數相除即可得到（轉換）相對頻率數。

㈣ 基因頻率怎麼計算

已知基因型aa的個體失去求偶的繁殖的能力，則參與隨機交配的個體，基因型aa所佔比例為1/3，aa所佔比例為2/3。由基因型頻率可計算出基因a配子頻率為2/3，基因a配子的頻率為1/3。所以子代中aa的個體所佔比例為1/3×1/3=1/9。所以隨機交配後代種可育的佔8/9

㈤ 怎樣計算基因頻率（詳細解答過程）

按照概率學的說法，假設事件a和事件b的概率分別p1和p2，事件a和b發生地概率是p1*p2，a或b發生地概率是p1+p2，前提是兩事件為互斥事件
生物子代基因重組中，由於兩代頻率不可能同時發生改變，所以算做互斥事件，子代的基因頻率又親代基因頻率和重組分布概率共同決定，因此，重組的時候兩個基因結合的概率就是他們之間相乘的概率
不懂得話直接相乘就好了
比如雜合子aa自交，親代個體只有兩個基因，所以a的頻率就是0.5，a的也是0.5，後代中出現aa的概率就是0.5*0.5，出現aa的概率就是0.5*0.5+0.5*0.5（因為第一次出現的基因可能是a或a，所以有兩種情況）進一步可以計算出aabb的概率，自己去體會一下

㈥ 基因型的種類怎麼算

1、表現型四種即AB雙顯：A顯B隱：A隱B顯：AB雙隱=9：3：3：1
2、基因型9種AABB:AaBB:AAbb:Aabb:AaBb:AABb:aaBB:aaBb:aabb=1：2：1：2：4：2：1：2：1
3、AaBb佔1/4
絕對原創請加分!

㈦ 基因頻率計算公式

基因型AA=x aa=y Aa=z
A基因頻率=該基因所在基因型的比列/所有等位基因所在基因型比列和=(2X+Z)/(2X+2Y+Z+Z)
a基因頻率=該基因所在基因型的比列/所有等位基因所在基因型比列和=(2Y+Z)/(2X+2Y+Z+Z)

基因型頻率 AA=X aa=Y A基因頻率=X開平方 a基因頻率=Y開平方

㈧ 生物基因型計算

FF的概率為1/3,Ff概率為2/3，
可知FF：Ff=1：2 F有4，f有2 共有6
F就是4/6=2/3F f就是2/6=1/3f
用棋盤法
2/3F 1/3f
1/3F 4/9FF 2/9Ff

2/3f 2/9Ff 2/9ff（死亡）
得子代基因型FF：ff=1：1
FF佔4/9 ff佔4/9
不知道會不會亂，這是今年的一道高考題目，只不過是意思一樣，題目變了一下，字母變了一下。

㈨ 如何計算生物基因頻率

1．理想狀態下種群基因頻率的計算
種群後代中出現三種基因型AA、Aa、aa,並且三種基因型出現的頻率分別為P（AA）= p×p= p2=D；P（Aa）=2p×q=2pq=H； P（aa）= q×q = q 2=R.且它們的頻率之和為p2+2pq+q2=（p+q）2=1.其基因頻率為A基因的頻率P（A）=D+1/2H= p2+ pq=p（p+q）=p；a基因的頻率P（a）= R+1/2H=q2+ pq=q（p+q）=q.可見子代基因頻率與親代基因頻率一樣.所以,在以後所有世代中,如果沒有突變、遷移和選擇等因素干擾,這個群體的遺傳成分將永遠處於p2+ 2pq+q2平衡狀態.伴性基因和多等位基因遺傳平衡的計算仍遵循上述規律.運用此規律,已知基因型頻率可求基因頻率；反之,已知基因頻率可求基因型頻率.

㈩ 怎麼計算基因型和表現性 通俗一點

基因型的計算方法和表現型的計算方法差不多，都是採用化自由組合為分離的方法來進行，一對一對的來計算，這樣更加簡單明了。以下舉例說明一些常規的演算法：
例一：基因型類型：YyRr與YyRr雜交，其後代基因型你書寫的完全正確，那麼後代基因型種類有：3乘以3=9種。
例二：表現型類型：YyRr與YyRr雜交，其後代表現型各有兩種，因此種類數有：2乘以2=4種。
為了讓你更加理解，我寫下來拍照給你看一下：