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大鼠血漿提取方法步驟

發布時間:2023-03-25 05:58:06

❶ 大鼠血漿能溶於水嗎

將血清從冷凍箱取出後,先置於2-8℃冰箱使之溶解畝碧,然後在室溫下使之全溶。旦局但必須注意的是,溶解迅遲舉過程中必須規則地搖晃均勻。

❷ 血清血漿如何提取

BIOG產品特點

◎操作簡便快速,可在30分鍾內獲得理想的DNA,適用於一次處理較多樣本的批量提取;

◎提取DNA純度高,無抑制劑,A260/A280為1.7-1.9;

◎採用自主研發的改性硅基磁珠,同樣的樣本量提取的DNA更多;

◎可用於小量(200μL)血清、血漿、胸腹水、腦脊液、滑膜液、水樣等液體樣本中游離DNA的提取。

BIOG操作步驟

1. 請自行准備:無水乙醇、異丙醇、1.5mL離心管。

2. 取出洗滌液,按70%比例加入無水乙醇,如6mL加入14 mL無水乙醇,12mL加入28 mL無水乙醇,混勻。

3. 取1.5mL離心管,尺卜加入200μL 裂解液、20μL 消化液、4μL DNA Carrier,再加入200μL樣本,振盪混勻,58℃溫育10 分鍾。

4. 取出離心管,冷卻到室溫,加入300μL異丙醇,充分混勻,再加入20μL磁珠復合蘆困鬧液(每次使用前須充分混勻),振盪混勻3min(注意不要顛倒混勻,以防磁珠粘附於管蓋內壁),靜置2min。

5. 將離心管置於磁力架上放置約20s至磁珠完全吸附,開蓋,徹底吸棄上清液(注意槍頭不要接觸磁珠)。

6. 加入800μL配製後的洗滌陪罩液,將離心管從磁力架上取下,充分振盪2min,確保磁珠完全分散。將離心管置於磁力架上放置約20s至磁珠完全吸附,開蓋,吸棄上清液(注意槍頭不要接觸磁珠)。

7. 將離心管從磁力架上取下,開蓋,乾燥約3-5min,至無明顯乙醇氣味。

8. 加入50 μL洗脫液,振盪至磁珠充分散開,室溫靜置2min,再振盪混勻1min。

9. 將離心管置於磁力架上,待磁珠完全吸附後,小心吸取上清液至一新的1.5mL離心管中,提取的核酸可直接用於下游實驗,或-20℃保存備用。

注意事項:

1. 裂解液含有刺激性化學物質,操作過程請做好防護措施,避免直接接觸皮膚,防止吸入口鼻。2. 裂解液如有白色絮狀物析出屬正常現象,置於 37℃水浴中溶解即可,洗滌液在使用前應加入無水乙醇充分混合。

❸ 如何制備血清和血漿

全血不抗凝分離的是血清,抗凝分離的血漿
相對來說抗凝收集血漿量還是比較多一點的,且不易出現溶血現象的發生

收集好的全血分離血清(漿)時一般採用低溫低速離心效果比較好,速度太大會使紅細胞壓積,造成溶血,最終影響測定

如將收集好的全血,靜置一些時間(加抗凝劑一般靜置半小時左右,不加抗凝劑一般靜置一小時左右),然後採用低溫低速離心10分鍾(人血2000rpm左右、小鼠1000rpm左右、大鼠2500rpm左右),上層黃色液體為收集的血清或血漿,如上層液體出現紅色則出現溶血,應棄用

❹ 關於提取血漿中RNA

1. 請自行准備:無水乙醇、無RNA酶1.5mL離心管。

2. 取出洗滌液,按以下操作:

a) 洗滌液A:21mL加入9mL無水乙醇;42mL加入18mL無水乙醇。

b) 洗滌液B:9mL加入21mL無水乙醇;18mL加入42mL無水乙醇。

c) 配製好的洗滌液如出現沉澱,可在37℃數枯搏溶解,搖敗枝勻後使用。

3. 取無RNA酶的1.5mL離心管,加入200μL樣本,4μLRNA Carrier混合均勻,再加入300μL 裂解液及20μL 消化液,漩渦震盪10秒,充分混勻,56℃水浴10 分鍾至完全裂解。

4. 加入1000μL無水乙醇,輕輕顛倒混勻,如有半透明懸浮物,不影響RNA的提取與後續實驗。

5. 將吸附柱放入收集管內,將760μL上述溶液轉入吸附柱內,靜置2 分鍾,12,000 rpm 4℃離心1 分鍾,棄收集管內廢液.

6. 將剩餘760μL溶液轉移至吸附柱內,重復步驟5。

7. 將吸附柱放回收集管內,加500μL 洗滌液A至吸附柱內,12,000 rpm 4℃離心1 分鍾,棄收集管內廢液。

8. 將吸附柱放回收集管內,加500μL 洗滌液B至吸附柱內,12,000 rpm 4℃離心1 分鍾,棄收集管內廢液。

9. 將吸附柱放回收集管內,12,000 rpm 4℃離心2 分鍾,離去殘留的洗滌液。

10. 薯祥取出吸附柱,放入新的無RNA酶的1.5 mL 離心管內,加入30-50μL 洗脫液,靜置3 分鍾,12,000 rpm 4℃ 離心2 分鍾,收集RNA溶液。

11. -70℃保存,或直接用於下一步實驗。

注意事項

為防RNA酶污染,實驗過程中最好戴一次性干凈手套、口罩,使用處理過的無RNA酶的容器和無RNA酶的超純水 。

洗滌液含有刺激性化學物質

❺ 要做大鼠的實驗,用elisa試劑盒來檢驗血清內毒素含量、血漿酶DAO、血漿D-乳酸這三個數值,請問應該怎麼做呢

這三個指標ELISA都是可以測的褲稿,血清胡斗孝最好,血漿理論上來說還是有一定的影響的銷帆,雙抗體夾心法;
一般有150微升就差不多了,但是現假貨較多,價格又高,也不一定做出理想的效果;可以試試化學法,DAO和D-乳酸是肯定可以測的

❻ 實驗小白鼠2怎麼生產血清

同一隻小鼠需要多次采血
由於小鼠體重限制,一次取血後需要一定的恢復期以保證下次血液樣本的質量,嚴格遵守動物福利也是操作者的基本要求。小鼠的總血量一般是占體重的6-7%,一次性取血10%不會引起造血系統過度活化及血液成分的重建。(例:若20克小鼠,它的總血量約佔1.2-1.4毫升,即每次取120ul-140ul血液不會對小鼠有太大的影響)。
小鼠只需采單次采血
但如果想取小鼠的全血,一般能取體重的4%已經很不錯了。具體的參考計算:小鼠體重*6-7%(血液占體重百分比)*70%(循環血量佔全部血盯鏈量百分比)*90%(可以取到的循環血量比例)
常用的采血的方法
眼眶後靜脈叢采血
(大鼠 0. 4~0. 6 mL,小鼠 0. 2~0. 3 mL)取內徑為1.0-1.5mm的玻璃毛細管,臨用前折斷成2~2.5cm長的毛細管段,浸入1%肝素溶液中,乾燥後用。取血時左手抓住鼠兩耳之間的頸背部皮膚以固定頭部,輕輕向下壓迫頸部兩側,引起頭部靜脈血液迴流困難使眼眶靜脈叢充血,右手持毛細管由內眥部插入結膜,再輕輕向眼底部方向推進,輕輕旋轉毛細管以劃破靜脈叢,讓血液順毛細管流出,接收入事先准備的容器中。采血後紗布輕壓眼部止血。

摘眼球采血
此法常用於鼠類大量采血。采血時,用左手固定動物,壓迫眼球,盡量使眼球突出,右手用鑷子或止血鉗迅速摘除眼球,眼眶內很快流出血液。

尾尖采血
(小鼠可每次采血約0.1ml,大鼠約0.4ml)剪斷尾巴進行取血。注意,剪下來一點就可以,小鼠1-2mm,大鼠3-5mm,流出血液基則轎收集即可。過程中可以捋尾巴。血液可以用於塗片,試紙檢測血糖等。

心臟采血
(大鼠 1~1. 5 mL,小鼠 0. 5~0. 8 mL)心臟采血為無菌采血,采血量大,此方法需在麻醉狀態下進行,操作時,選擇胸部左側心臟博動最強處進針,緩慢回抽針筒可見血液流入針管。

後肢隱靜脈采血
隱靜脈采血常用於大小鼠的少量血液採集,單次采血的搏肆安全采血量為動物體重的0. 5%,間隔一天多次采血采血量為動物體重的0. 05%,隱靜脈采血無需麻醉,待動物固定後,後腿外側區域剃毛後暴露采血點,采血針刺入采血點,即可獲得血液樣本。圖片為隱靜脈的位置。

斷頭采血
左手拇指和食指從背部抓住鼠頸部皮膚,將鼠頭朝下,右手用剪刀剪斷鼠頸部約1/2-4/5,讓血液流入試管。但有由於過於血腥加上動物福利的原因,此方法不建議使用。
血清及血漿的制備
血清分離
經上述的方法取得血液後,在EP管中室溫靜置一小時以上(或37°水浴1小時,4°冰箱靜置2小時或者過夜)以3000rpm離心10分鍾,上清即為血清。可在-80°保存

❼ 求教用ELISA方法大鼠腦組織提取步驟

樣本暫時不渣嘩頌測時負80冷凍保存,一般可以放置6個月左右,負20可放3個月,(若被檢物質見光易分解則需避光保存)
制備好的勻漿液需當天進行測定(提取液不是被檢物質的最適環境)
1 准確稱取組織重量按重量(g):體積(ml)=1:N的比例加N倍體積的生理鹽水(或PBS)(推如鄭薦N=9),冰水浴勻漿(機械式,手動等,超聲不太推薦),制備成一定濃度的勻漿液,離心(根據被檢物質的具休要求,推薦3000轉/分左右),取上清待測
2 由於勻漿(提取)過程中會產生的一定的系統誤差,需對其進行較正可根據蘆喊測其上清液中蛋白濃度進行較正

❽ 怎樣提取外周血液中的基因組DNA

提取基因組DNA和細胞核DNA是不同的方法
提取細胞核要先把細胞破碎分離出細胞核,要在甘油或其他保護劑中進行
SDS十二烷基磺酸鈉:可破壞細胞膜、核膜,並使組織蛋白與DNA分離
CATB是一種抽提液,破壞細胞膜的~具體忘了~
DNA不溶於異丙醇,異丙醇可以析出DNA,產生白色絮狀沉澱,用槍頭挑出就可以了
以下是一些具體方法,希望有用
基因組DNA提取方法

制備基因組DNA是進行基因結構和功能研究的重要步驟,通常要求得到的片段的長度不小於100-200kb。在DNA提取過程中應盡量避免使DNA斷裂和降解的各種因素,以保證DNA的完整性,為後續的實驗打下基礎。主要是CTAB方法,其他的方法還有1物理方式:玻璃珠法,超聲波法,研磨法,凍融法。2化學方式:異硫氰酸胍法,鹼裂解法3生物方式:酶法。根據核酸分離純化方式的不同有:硅質材料、陰離子交換樹脂等

試驗步驟:

1、貼壁細胞用胰酶消化,離心收集。

2、細胞重懸於冰冷的PBS漂洗一次,離心收集。試驗步驟2再重新作一邊。

3、加入5mlDNA提取緩沖液,(10mmol/LTris-cl,0.1mol/LEDTA,o.5%SDS),混勻。

4、加入25ul蛋白酶K,使終濃度達到100ug/ml,混勻,50℃水浴3h,

5、用等體積的酚抽提一次,2500rpm離心收集水相,用等體積的(酚,氯仿,異戊醇)混合物抽提一次,2500r/min離心收集水相

6、用等體積的氯仿,異戊醇抽提一次。加入等體積的5mol/L的LiCL,混勻,冰浴,10min.。

7、2500rpm離心10min.轉上清於一離心管中。加入等體積的異丙醇。室溫10min。

2500rpm,離心10min。棄上清。

8、加入0.1倍體積3mol/L乙酸鈉(PH5.2)與2倍體積-20℃預冷無水乙醇。-20℃20min。

9、12000r/min,室溫離心5min。棄上清。將DNA溶於適量TE中。

外周血DNA提取技術

分離外周血白細胞提取方法:

試驗步驟:

1、取人肘靜脈血5ml,EDTA抗凝,2500rpm離心10min。

2、小心吸取上層血漿,分裝到3個0.5ml離心管中。

3、在血細胞中加入3倍體積的溶血液,搖勻,冰浴15min。

4、2500rpm離心10min,棄上清。

5、加入10ml溶血液,搖勻,冰浴15min。

6、3000rpm離心10min,棄上清。

7、倒置離心管,去掉殘液。

8、得白細胞,-80?C凍存。

試驗要求:

血至分離白細胞之間隔時間在室溫下放置不超過2h,4℃放置不超過5h,以防白細胞自溶。

氯仿法抽提外周血白細胞基因組DNA:

試驗試劑:

Ligsisbuffer:

133mMNH4ClNHCl7.12g0.9mMNH4HCO3NH4HCO30.071g0.1mMEDTA0.5mMEDTA0.2ml;最後加滅菌去離子水至1000ml,高壓滅菌。

ACD抗凝劑:檸檬酸1.68g檸檬酸鈉4.62g葡萄糖5.15g;最後加滅菌去離子水至350ml,高壓滅菌。

提取緩沖液(Extractionbuffer):

10mMTrisCl(PH=8.0)1MTris.Cl(PH=8.0)1ml0.1mMEDTA(PH=8.0)0.5mMEDTA(PH=8.0)20ml0.5%SDS10%SDS0.5ml;最後加滅菌去離子水至100ml,高壓滅菌

試驗步驟:

1、在500μl抗凝血中加入ligsisbuffer1000μl,充分顛混至清亮。以4000rpm,離心5min。棄上清液。

2、沉澱中加入ligsisbuffer1500μl,充分勻漿。以6000rpm,離心5min。

3、徹底棄去上清,加入extractionbuffer500μl(裂解細胞),混勻置於37℃,水溶1h。

4、加入8μl的蛋白酶K,顛混,37℃過夜(或55℃,3h,但是37℃效果要好些)。

5、每管加入450μl飽和酚(取溶液下層)緩慢搖晃10min,以5500rpm,離心15min。

6、取上清,每管加入250μl飽和酚和250μl氯仿-異戊醇,搖勻10min,以5500rpm,離心15min。

7、取上清,每管加入500μl氯仿-異戊醇,搖勻10min,以5500rpm,離心15min。

8、取上清,每管加50μl的3M的NaAC+,適量無水乙醇(預冷)至滿,搖勻放入-20℃保存2h以上。

9、以12000rpm,離心20min。去上清,加入70%乙醇500μl,以12000rpm,離心5min,去上清,50-60℃乾燥。

10、加入50μl滅菌去離子水,轉彈,混勻。

NaI提取法提取外周血白細胞基因組:

實驗步驟:

1、取外周抗凝血(全血)100ul於eppendorf管中,12000rpm離心12min。

2、棄上清,加雙蒸水200ul溶解,搖勻20s。

3、混勻後加6MNaI溶液200ul,搖勻20s。

4、加入氯仿/異戊醇(24:1)400ul,邊加邊搖,搖勻20s,12000rpm離心12min。

5、取上層液350ul,加入另一新eppendorf管中,加0.6倍體積異丙醇,搖勻20s,室溫放置15min,靜置後的反應體系15000rpm離心12min,使沉澱緊貼eppendorf管壁。

6、棄異丙醇,加70%乙醇1ml(不振動),以15000rpm離心12min。

7、棄乙醇,敞開eppendorf管蓋,烘乾(37℃恆溫箱)後,加1xTE溶液30ul,溶解DNA>12h以上,製成的DNA液-20℃冰箱保存備用。

常用的外周血白細胞基因提取方法:

試驗原理:

苯酚/氯仿提取DNA是利用酚是蛋白質的變性劑,反復抽提,使蛋白質變性,SDS(十二烷基磺酸鈉)將細胞膜裂解,在蛋白酶K、EDTA的存在下消化蛋白質或多肽或小肽分子,核蛋白變性降解,使DNA從核蛋白中游離出來。DNA易溶於水,不溶於有機溶劑。蛋白質分子表面帶有親水基團,也容易進行水合作用,並在表面形成一層水化層,使蛋白質分子能順利地進入到水溶液中形成穩定的膠體溶液。當有機溶液存在時,蛋白質的這種膠體穩定性遭到破壞,變性沉澱。離心後有機溶劑在試管底層(有機相),DNA存在於上層水相中,蛋白質則沉澱於兩相之間。酚-氯仿抽提的作用是除去未消化的蛋白質。氯仿的作用是有助於水相與有機相分離和除去DNA溶液中的酚。抽提後的DNA溶液用2倍體積的無水乙醇在1/103mol/LNaCl存在下沉澱DNA,回收DNA用70%乙醇洗去DNA沉澱中的鹽,真空乾燥,用TE緩沖液溶解DNA備用。

試驗步驟:

1、將1mlEDTA抗凝貯凍血液於室溫解凍後移入5ml離心管中,加入1ml磷酸緩沖鹽溶液(PBS),混勻,3500rpm離心15min,傾去含裂解紅細胞的上清。重復一次。用0.7mlDNA提取液混懸白細胞沉澱,37℃水浴溫育1h。

2、將上述DNA提取液混懸白細胞,37℃水浴溫育1h後,加入1mg/ml蛋白酶K0.2ml,至終濃度為100-200ug/ml,上下轉動混勻,液體變粘稠。50℃水浴保溫3h,裂解細胞,消化蛋白。保溫過程中,應不時上下轉動幾次,混勻反應液。

3、反應液冷卻至室溫後,加入等體積的飽和酚溶液,溫和地上下轉動離心管5-10min,直至水相與酚相混勻成乳狀液。5000rpm離心15min,用大口吸管小心吸取上層粘稠水相,移至另一離心管中。重復酚抽提一次。加等體積的氯仿:異戊醇(24:1),上下轉動混勻,5000rpm離心15min,用大口吸管小心吸取上層粘稠水相,移至另一離心管中。重復一次。

4、加入1/5體積的3mol/LNaAc及2倍體積的預冷的無水乙醇,室溫下慢慢搖動離心管,即有乳白色雲絮狀DNA出現。用玻璃棒小心挑取雲絮狀的DNA,轉入另一1.5ml離心管中,加70%乙醇0.2ml,以5000rpm離心5min。洗滌DNA,棄上清,去除殘留的鹽。重復一次。室溫揮發殘留的乙醇,但不要讓DNA完全乾燥。加TE液20ul溶解DNA,置於搖床平台緩慢搖動,DNA完全溶解通常需12-24h。製成的DNA液-20℃冰箱保存備用。

真核細胞DNA的制備

一般真核細胞基因組DNA有107-9bp,可以從新鮮組織、培養細胞或低溫保存的組織細胞中提取,常是採用在EDTA以及SDS等試劑存在下用蛋白酶K消化細胞,隨後用酚抽提而實現的。這一方法獲得的DNA不僅經酶切後可用於Southern分析,還可用於PCR的模板、文庫構建等實驗。

根據材料來源不同,採取不同的材料處理方法,而後的DNA提取方法大體類似,但都應考慮以下兩個原則:

1、防止和抑制DNase對DNA的降解。

2、盡量減少對溶液中DNA的機械剪切破壞。

試劑准備:

1、TE:10mMTris-HCl(pH7.8);1mMEDTA(pH8.0)。

2、TBS:25mMTris-HCl(pH7.4);200mMNaCl;5mMKCl。

3、裂解緩沖液:250mMSDS;使用前加入蛋白酶K至100mg/ml。

4、20%SDS

5、2mg/ml蛋白酶K

6、Tris飽和酚(pH8.0)、酚/氯仿(酚∶氯仿=1∶1)、氯仿

7、無水乙醇、75%乙醇

試驗步驟:

材料處理:

1、新鮮或冰凍組織處理:

1)取組織塊0.3-0.5cm3,剪碎,加TE0.5ml,轉移到勻漿器中勻漿。

2)將勻漿液轉移到1.5ml離心管中。

3)加20%SDS25ml,蛋白酶K(2mg/ml)25ml,混勻。

4)60°C水浴1-3hr。

2、培養細胞處理:

1)將培養細胞懸浮後,用TBS洗滌一次。

2)離心4000g×5min,去除上清液。

3)加10倍體積的裂解緩沖液。

4)50-55°C水浴1-2hr。

DNA提取:

1、加等體積飽和酚至上述樣品處理液中,溫和、充分混勻3min。

2、離心5000g×10min,取上層水相到另一1.5ml離心管中。

3、加等體積飽和酚,混勻,離心5000g×10min,取上層水相到另一管中。

4、加等體積酚/氯仿,輕輕混勻,離心5000g×10min,取上層水相到另一管中。如水相仍不澄清,可重復此步驟數次。

5、加等體積氯仿,輕輕混勻,離心5000g×10min,取上層水相到另一管中。

6、加1/10體積的3M醋酸鈉(pH5.2)和2.5倍體積的無水乙醇,輕輕倒置混勻。

7、待絮狀物出現後,離心5000g×5min,棄上清液。

8、沉澱用75%乙醇洗滌,離心5000g×3min,棄上清液。

9、室溫下揮發乙醇,待沉澱將近透明後加50-100mlTE溶解過夜。

植物組織中DNA的提取

試驗原理:

脫氧核糖核酸(deoxribonucleicacid,DNA)是一切生物細胞的重要組成成分,主要存在於細胞核中,鹽溶法是提取DNA的常規技術之一。從細胞中分離得到的DNA是與蛋白質結合的DNA,其中還含有大量RNA,即核糖核蛋白。如何有效地將這兩種核蛋白分開是技術的關鍵。DNA不溶於0.14mol/L的NaCl溶液中,而RNA則能溶於0.14mol/L的NaCl溶液之中,利用這一性質就可以將二者從破碎細胞漿液中分開。制備過程中,細胞破碎的同時就有Dnase釋放到提取液中,使DNA因被降解而影響得率,在提取緩沖液中加入適量的檸檬酸鹽和EDTA,既可抑制酶的活性又可使蛋白質變性而與核酸分離,再加入陰離子去垢劑0.15%的SDS,經過2h攪拌,或用氯仿-異醇除去蛋白,通過離心使蛋白質沉澱而除去,得到的是含有核酸的上清液。然後用95%的預冷乙醇即可把DNA從除去蛋白質的提取液中沉澱出來。

植物DNA的SDS提取法:

試驗試劑:

1、研磨緩沖液:稱取59.63gNaCl,13.25g檸檬酸三鈉,37.2gEDTA-Na分別溶解後合並為一,用0.2mol/L的NaOH調至pH7.0,並定容至1000ml。

2、10×SSC溶液:稱取87.66gNaCl和44.12g檸檬酸三鈉,分別溶解,一起定容至1000ml。

3、1×SSC溶液:用10×SSC溶液稀釋10倍。

4、0.1×SSC溶液:用1×SSC溶液稀釋10倍。

5、Rnase溶液:用0.14mol/LNaCl溶液配製成25mg/ml的酶液,用1mol/LHCl,pH至5.0,使用前經80℃水浴處理5min(以破壞可能存在的Dnase)。

6、氯仿-異戊醇:按24ml氯仿和1ml異戊醇混合。

7、5mol/L高氯酸鈉溶液:稱取NaClO4.H2O70.23g,先加入少量蒸餾水溶解再容至100ml。

8、SDS(十二烷基硫酸鈉)化學試劑的重結晶:將SDS放入無水酒精中達到飽和為止,然後在70~80℃的水浴中溶解,趁熱過濾,冷卻之後即將濾液放入冰箱,待結晶出現再置室溫下涼干待用。

9、1mol/LHCl。

10、0.2mol/LNaOH。

11、二苯胺乙醛試劑:1.5g二苯胺溶於100ml冰醋酸中,添加1.5ml濃硫酸,裝入棕色瓶,貯存暗處,使用時加0.1ml乙醛液〔濃乙醛:H2O=1:50(V/V)〕。

12、1.0mol/L高酸溶液(HClO4)。

13、0.05mol/LNaOH。

14、DNA標准液:取標准DNA25mg溶於少量0.05mol.L-1NaOH中,再用0.05mol/LNaOH定容至25ml,後用移溶管吸取此液5ml至50ml容量瓶中,加5.0ml1mol/LHClO4,混合冷卻後用0.5mol/LHClO4定容至刻度,則得100μg/ml的標准溶液。

實驗步驟:

1、稱取植物幼嫩組織10g剪碎置研缽中,加10ml預冷研磨緩沖液並加入0.1g左右的SDS,置冰浴上研磨成糊狀。

2、將勻漿無損轉入25ml刻度試管中加入等體積的氯仿-異戊醇混合液,加上塞子,劇烈振盪30s,轉入離心管,靜置片刻以脫除組織蛋白質。以4000rpm離心5min。

3、離心形成三層,小心地吸取上層清液至刻度試管中,棄去中間層的細胞碎片、變性蛋白質及下層的氯仿。

4、將試管置72℃水浴中保溫3min(不超過4min),以滅活組織的DNA酶,然後迅速取出試管置冰水浴中冷卻到室溫,加5mol/L高氯酸鈉溶液〔提取液:高氯酸鈉溶液=4:1(V/V)〕,使溶液中高氯酸鈉的最終濃度為1mol/L。

5、再次加入等體積氯仿-異戊醇混合液至大試管中,振盪1min,靜置後在室溫下離心(4000rpm)5min,取上清液置小燒杯中。

6、用滴管吸95%的預冷乙醇,慢慢地加入燒杯中上清液的表面上,直至乙醇的體積為上清液的兩倍,用玻璃棒輕輕攪動。此時核酸迅速以纖維狀沉澱纏繞在玻璃棒上。

7、然後加入0.5ml左右的10×SSC,使最終濃度為1×SSC。

8、重復第6步驟和第7步驟即得到DNA的粗製品。

9、加入已處理的Rnase溶液,使其最後的作用濃度為50~70μg/ml,並在37℃水浴中保溫30min,以除去RNA。

10、加入等體積的氯仿-異戊醇混合液,在三角瓶中振盪1min,再除去殘留蛋白質及所加Rnase蛋白,室溫下以4000rpm離心5min,收集上層水溶液。

11、再按6、7步驟處理即可得到純化的DNA液。

植物DNA的CTAB提取法:

試驗步驟:

1、稱取新鮮葉片2-3g,剪碎放入研缽中,在液氮中研磨成粉末。

2、將粉末轉移到加有7ml經預熱的15×CTAB提取緩沖液15ml離心管中,迅速混勻後置於65℃水浴中,溫育30min。

3、取出離心管,冷卻至室溫,加入氯仿/異戊醇(24:1),充分混勻,室溫下2300轉離心20min。

4、將上清轉移至另一新的15ml離心管中,加入1/10體積10%的CTAB和等體積的氯仿/異戊醇。充分混勻,2300rpm離心20min。

5、轉移上清至另一新的15ml離心管中,加入等體積1%的CTAB沉澱緩沖液,輕輕搖晃至形成DNA絮狀沉澱。1000rpm離心10min,使DNA沉澱於管底。

6、加入1.5-2ml的1mol/LNaCl及5μlRNase置於56℃水浴中過夜。

7、待DNA完全溶解後,加2-3ml4℃預冷的95%的冰乙醇使DNA沉澱,挑出DNA,置於15ml離心管中,用70%乙醇清洗30min。

8、離心機甩5s,倒出70%乙醇,再用95%乙醇浸泡5min,倒出95%乙醇,在超凈工作台上吹乾。

9、將風乾的DNA直接在4℃保存備用或溶於100μlTE溶液中於-20℃保存。

細菌DNA的提取方法

針對一些不易於提取的細菌的方法:

試驗試劑:

抽提緩沖液:2%CTAB(W/V)2%PVPK25(w/v)(去色素)100mMTris-HCl(pH8.0)

25mMEDTA(pH8.0)2.0MNaCl

10MLiCl

2MLiCl

DEPC-water(抑制RNA酶活性)

3MNaAc(pH5.2)

96%乙醇

70%乙醇

試驗步驟:

1、抽提緩沖液65℃預熱。

2、加菌體到已經預熱的緩沖液(700ul)中混勻,65℃,10min。

3、加酚/氯仿/異戊醇(25:24:1),振盪,以12,000rpm,離心10min。

4、取上清,加氯仿/異戊醇(24:1)振盪,以12,000rpm,離心10min。

5、重復再作一次步驟4。

6、加入1/10體積的3M醋酸鈉和1.5倍體積的乙醇(或加入等體積的異丙醇),-20C下沉澱。

7、以2,000rpm,離心10min。

8、棄上清,以70%乙醇條洗沉澱,也可以再用100%乙醇洗,然後溶解於100ml水中。

較為常用的細菌DNA提取方法:

實驗步驟:

1、將菌株接種於液體LB培養基,37℃震盪培養過夜。

2、取1.5ml培養物12000rpm離心2min。

3、沉澱中加入567ul的TE緩沖液,反復吹打使之重新懸浮,加入30ul10%SDS和15ul的蛋白酶K,混勻,於37℃溫育1h.

4、加入100ul5mol/LNaCl,充分混勻,再加入80ulCTAB/NaCl溶液,混勻後再65℃溫育10min。

5、加入等體積的酚/氯仿/異戊醇混勻,離心4-5min,將上清轉入一隻新管中,加入0.6-0.8倍體積的異丙醇,輕輕混合直到DNA沉澱下來,沉澱可稍加離心。

6、沉澱用1ml的70%乙醇洗滌後,離心棄乙醇.

真菌DNA提取總結的兩種方法:

第一種方法:

試驗步驟:

1、取真菌菌絲0.5g,在液氮中迅速研磨成粉。

2、加入4mL提取液,快速振盪混勻。

3、加入等體積的4mL的氯仿:異戊醇(24:1),渦旋3~5min(此處是粗提沒有加酚)。

4、以4℃,1000rpm,離心5min。

5、上清再用等體積的氯仿:異戊醇(24:1)抽提一次。以4℃,10,000rpm,離心5min。

6、取上清,加入2/3倍體積的-20℃預冷的異丙醇或2.5倍體積的無水乙醇沉澱,混勻,靜置約30min。

7、用毛細玻棒挑出絮狀沉澱,用75%乙醇反復漂洗數次,再用無水乙醇漂洗1次,吹乾,重懸於500ulTE中。

8、加入1ulRNaseA(10mg/mL),37℃下處理1h。

9、用酚(pH8.0):氯仿:異戊醇(25:24:1)和氯仿:異戊醇(24:1)各抽提1次。以4℃,10,000rpm,離心5min。

10、取上清,加入1/10倍體積的3MNaAc,2.5倍體積的無水乙醇,-70℃沉澱30min以上。

11、沉澱用75%乙醇漂洗,風干,溶於200ulTE中,-20℃保存備用。

DNA提取液:0.2MTris-HCl(pH7.5),0.5MNaCl,0.01MEDTA,1%SDS,3MNaAc。

第二種方法:

試驗步驟:

1、真菌菌絲0.5-1g,在液氮中迅速研磨成粉。

2、加入3mL65℃預熱的DNA提取緩沖液,快速振盪混勻65℃水浴30min,期間混勻2-3次。

3、加入1mL5MKAc,冰浴20min。

4、等體積的氯仿:異戊醇(24:1)抽提1次(10,000rpm,4℃離心5min)。

5、取上清,加入2/3倍體積的-20℃預冷異丙醇,混勻,靜置約30min。

6、用毛細玻棒挑出絮狀沉澱,用75%乙醇反復漂洗數次,再用無水乙醇漂洗1次,吹乾,重懸於500ulTE中。

7、加入1ulRNaseA(10mg/mL),37℃處理1h。

8、用酚(pH8.0):氯仿:異戊醇(25:24:1)和氯仿:異戊醇(24:1)各抽提1次。以4℃,10,000rpm,離心5min。

9、取上清,1/10V3MNaAc,2.5V體積的無水乙醇,-70℃沉澱30min以上。

10、沉澱用75%乙醇漂洗,風干,溶於200ulTE中,-20℃保存備用。
植物基因組提取(CATB法)
作者: 時間:2008-05-13 14:26:27 來源: 生物谷 瀏覽評論

一、實驗目的
掌握植物總DNA的抽提方法和基本原理。學習根據不同的植物和實驗要求設計和改良植物總DNA抽提方法。
二、實驗原理
通常採用機械研磨的方法破碎植物的組織和細胞,由於植物細胞勻漿含有多種酶類(尤其是氧化酶類)對DNA的抽提產生不利的影響,在抽提緩沖液中需加入抗氧化劑或強還原劑(如巰基乙醇)以降低這些酶類的活性。在液氮中研磨,材料易於破碎,並減少研磨過程中各種酶類的作用。
十二烷基肌酸鈉(sarkosyl)、十六烷基三甲基溴化銨(hexadyltrimethyl ammomum bromide,簡稱為CTAB)、十二烷基硫酸鈉(sodium dodecyl sulfate,簡稱SDS)等離子型表面活性劑,能溶解細胞膜和核膜蛋白,使核蛋白解聚,從而使DNA得以游離出來。再加入苯酚和氯仿等有機溶劑,能使蛋白質變性,並使抽提液分相,因核酸(DNA、RNA)水溶性很強,經離心後即可從抽提液中除去細胞碎片和大部分蛋白質。上清液中加入無水乙醇使DNA沉澱,沉澱DNA溶於TE溶液中,即得植物總DNA溶液。
三、實驗材料
水稻幼葉
四、主要配方
2% CTAB抽提緩沖溶液: CTAB 4g NaCl 16.364 g 1M Tris-HCl 20ml( PH8.0) 0.5M EDTA 8ml,先用70ml ddH2O溶解, 再定容至200ml滅菌, 冷卻後0.2-1% 2-巰基乙醇 (400ul) 氯仿-異戊醇(24:1):先加96ml氯仿,再加4ml異戊醇,搖勻即可。
五、實驗步驟
1. DNA的提取
(1) 2%CTAB抽提緩沖液在65℃水浴中預熱。
(2)取少量葉片(約1g)置於研缽中,用液氮磨至粉狀;
(3) 加入700ul的2%CTAB抽提緩沖液,輕輕攪動;
(4) 將磨碎液分倒入1.5 ml的滅菌中,磨碎液的高度約占管的三分之二;
(5)置於65℃的水浴槽或恆溫箱中,每隔10 min輕輕搖動,40 min後取出;
(6)冷卻2 min後,加入氯仿-異戊醇(24:1)至滿管,劇烈振盪2~3 min,使兩者混合均勻;
(7)放入離心機中10 000 rpm離心10 min,與此同時,將600 µl的異丙醇加入另一新的滅菌中;
(8) 10 000 rpm離心1 min後,移液器輕輕地吸取上清夜,轉入含有異丙醇的內,將離心管慢慢上下搖動30 sec,使異丙醇與水層充分混合至能見到DNA絮狀物;
(9)10000 rpm離心1 min後,立即倒掉液體,注意勿將白色DNA沉澱倒出,將離心管倒立於鋪開的紙巾上; (10)60 sec後,直立離心管,加入720 µl的75%乙醇及80 µl 5 M的醋酸鈉,輕輕轉動,用手指彈管尖,使沉澱與管底的DNA塊狀物浮游於液體中;
(11)放置30 min,使DNA塊狀物的不純物溶解;
(12)10000 rpm離心1 min後,倒掉液體,再加入800 µl 75%的乙醇,將DNA再洗 30 min;
(13)10000 rpm離心30 sec後,立即倒掉液體,將離心管倒立於鋪開的紙巾上;數分鍾後,直立離心管,乾燥DNA(自然風干或用風筒吹乾);
(14)加入50 µl 0.5 × TE(含RNase)緩沖液,使DNA溶解,置於37℃恆溫箱約15 h,使RNA消解;
(15)置於-20℃保存、備用。
2. DNA質量檢測
瓊脂糖電泳檢測,原理和方法見實驗二。
六、 注意事項
(1)葉片磨得越細越好。
(2)移液器的使用。
(3)由於植物細胞中含有大量的DNA酶,因此,除在抽提液中加入EDTA抑制酶的活性外,第一步的操作應迅速,以免組織解凍,導致細胞裂解,釋放出DNA酶,使DNA降解。

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