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准確測量dna質量方法

發布時間:2023-01-01 11:53:51

① DNA質量檢測相關方法,及效果

對於基因組DNA質量檢測主要包括:基因組DNA片段大小的確定,基因組DNA濃度的測定,基因組DNA純度的測定三方面。
用到的技術方法有:瓊脂糖凝膠電泳(確定片段大小),使用紫外分光光度計測定基因組DNA溶液的OD值(濃度和純度的測定,OD260/OD280應該在1.8左右,高了表明有RNA污染,低了表明有蛋白質污染)
再看看別人怎麼說的。

② dna測量方法

DNA檢測
技術有很多,主要分為定性和定量方法。給你舉幾個:1,分子雜交技術,(包括southern雜交,northern雜交,基因晶元等)分子雜交分析的基本原理是基於DNA探針檢測變性而且固定在硝酸纖維素膜上的宿主細胞DNA。這些探針可以不依賴宿主細胞DNA來制備,例如用隨機引物制備探針。探針上標記酶﹑生物素﹑放射性同位素﹑地高辛(Dig)等。由於地高辛標記核酸探針,操作方便、靈敏度高,已標記的探針在4℃貯存可達兩年之久,方便隨時應用,所以現在常採用地高辛標記核酸探針,用游標記法將光敏Dig標記到探針上,製成光敏-Dig-核酸探針,再與固定在硝酸膜上的靶核酸進行靶DNA分子雜交,使之與抗Dig-鹼性磷酸酶結合,最後可用不同的檢測方式進行檢測,
發光檢測
和顯色檢測均可,靈敏度可達10pg以下2,基於DNA結合蛋白的方法Threshold®
Immunoassay分析系統是基於兩種DNA序列非特異性蛋白,單鏈DNA(ssDNA)結合蛋白(SSB)和抗ssDNA
的單抗。檢測的基本過程是當生物素—DNA單鏈結合蛋白和尿素酶—抗ssDNA
的單抗與變性的宿主細胞DNA結合最終形成復合物,通過親合素將此復合物連接到生物素—硝酸纖維素膜,在通過洗滌所有非特異性的被洗脫掉,最後放於有
尿素溶液
的讀數儀,尿素酶催化尿素分解成NH3和CO2
導致PH值發生變化,讀數儀根據PH值的變化換算成DNA的量,從而達到檢測殘余DNA含量的目的。3,PCR法,其中以實時定量PCR法最為突出熒光定量
PCR是基於PCR擴增時,在加入一對引物的同時加入一個特異性的熒光探針,產物的增加可以通過熒光信號指示,通過實時監控PCR體系中的熒光信號,對樣本中初始模板進行定量分析。定量PCR可實時檢測產物量,通過加入已知濃度的
標准樣品
繪制標准曲線,然後根據待測樣品在標准曲線中的位置推算初始模板的濃度,從而達到檢測殘余DNA含量的目的。此外,對DNA的定量技術也有很多,可以看下這篇文章《核酸定量技術及其在生物檢測中的應用》

③ 實驗室中常用的DNA分子量的測定方法有哪些

第一種方法最常用
1)紫外吸收法也就是測量OD(260)和OD(280)的吸收值,這樣的方法其它的雜質對測量結果影響大一點,因為其它雜質在這兩個吸收波長也有吸收.
(2)熒光法,用PicoGreen熒光染料,測定DNA,RNA濃度比較靈敏,並且適合測量低濃度和微量DNA和RNA,並且受其它雜質的影響不大,缺點要有專門的熒光檢測儀器,試劑比較昂貴.
純化DNA可以買試劑盒,主要有膜吸附法,磁珠分離法,都很方便.
RNA與DNA最重要的區別一是RNA只有一條鏈,二是它的鹼基組成與DNA的不同,RNA沒有鹼基T(胸腺嘧啶),而有鹼基U(尿嘧啶).所以導致他們有以下性質上的不同.
1.兩性解離:DNA無,只有酸解離,鹼基被屏蔽(在分子內部形成了H鍵).RNA有,有PI.
2.粘度大:DNA;RNA,粘度由分子長度/直徑決定,DNA為線狀分子,RNA為線團.
3.鹼的作用:DNA耐鹼RNA易被鹼水解.
4.顯色反應:
鑒別DNA和RNA+濃HCl RNA ------→ 綠色化合物
DNA ------→ 藍紫色化合物苔黑酚
二苯胺啡啶溴紅(熒光染料)和溴嘧啶都可對DNA染色,原理是卡在分子中,DNA的離心和電泳顯色可用它們.
DNA和RNA的鑒別染色
利用吖啶橙的變色特性可鑒別DNA和RNA.吖啶橙作為一種熒光染料已被用於染色固定,非固定細胞核酸,或作溶酶體的一種標記.觀察死亡細胞熒光變色性變化以及區別分裂細胞和靜止細胞群體.雖然測定DNA和RNA含量時較難獲得好的重復性結果,但該方法已被許多實驗室廣泛採用.
5.溶解性:都溶於水而不溶於乙醇,因此,常用乙醇來沉澱溶液中的DNA和RNA.DNA溶於苯酚而RNA不溶,故可用苯酚來沉澱RNA.
6.紫外吸收:核酸的λm=260nm,鹼基展開程度越大,紫外吸收就越厲害.當A=1時,DNA:50ug/ml,RNA和單鏈DNA:40ug/ml,寡核苷酸:20ug/ml.用A260/A280還可來表示核酸的純度.
7.沉降速度:對於拓撲異構體(核苷酸數目相同的核酸),其沉降速度從達到小依次為:RNA ; 超螺旋DNA > 解鏈環狀DNA ; 鬆弛環狀DNA ; 線形DNA也就是在離心管中最上層是線形DNA,最下面是RNA.
8.電泳:核苷酸、核酸均可以進行電泳,泳動速度主要由分子大小來決定,因此,電泳是測定核酸分子量的好方法.
9.DNA分子量測定最直接的方法:用適當濃度的EB(溴嘧啶)染色DNA,可以將其他形式的DNA變成線形DNA,用電鏡測出其長度,按B-DNA模型算出bp數,根據核苷酸的平均分子量就可計算出DNA的分子量.

④ DNA質量檢測相關方法,及效果

DNA質量檢測的方法有:基因組DNA片段大小的確定,基因組DNA濃度的測定,基因組DNA純度的測定三方面。
檢測的效果分析如下:
當OD260/OD280<
1.8,表示蛋白質含量較高;
當OD260/OD280>
2.0,表示RNA含量較高;
當OD260/OD280=1.8~2.0,表示DNA較純。

如何鑒定提取質粒DNA的質量和含量

紫外分光光度計定量。

方法用大腸桿菌DH5α感受態細胞克隆豐量的pMD-18T重組質粒,紫外分光光度計定量後,根據重組質粒分子量計算其拷貝數,稀釋成梯度濃度的熒光實時定量PCR的標准品,取1.0×106、1.0×104和1.0×102拷貝/μl高中低3個濃度的標准品,反復凍融1、6、11、15次和21次後,以凍融後的質粒標准品為模板同時進行real-time PCR擴增定量,比較量值變化。

高中值穩定,低濃度波動相對較大,高濃度質粒最大變化量為0.06個數量級;中濃度質粒最大變化量為0.18個數量級;低濃度質粒最大變化量為0.34個數量級。

(5)准確測量dna質量方法擴展閱讀:

質粒DNA提取的要求規定:

1、以CaCl2沉澱法去除大分子RNA,Q-Sepharose和SOURCE兩步離子交換層析法去除染色體DNA、小分子RNA、蛋白質等雜質。

2、有效去除質粒DNA制備過程中產生的雜質,可應用於葯劑水平質粒DNA的制備。

3、L.P.Elwell的實驗條件稍作改進,溫和地制備清亮裂解液並抽提質粒DNA,應用Sephacryl S-1000作凝膠過濾,獲得了純度高、產量大,無染色體DNA。

⑥ DNA製品可用哪幾種方法測定其含量,試從原理,准確性方面加以比較

測定DNA濃度的方法有兩種,即利用分光光度計法測定DNA的紫外光吸收值;另一種方法是測定樣品中溴化乙錠發射的熒光的強度來計算核酸的含量.
紫外光吸收法:因為組成核酸的鹼基(G,A,T,C)在260nm處具有強吸收峰,所以通過測定260nm的吸收峰即可對DNA進行定量.但有時也會因為所處溶液的pH值不同而導致吸光系數的不同.因此,一般在中性pH值左右的環境中進行測定.這種方法常用於測定比較純的樣品.
溴化乙錠熒光強度法:當DNA含量很低以及樣品中雜質含量高時,會影響紫外光吸收值的測定,這時,可以採用測定嵌入DNA中溴化乙錠分子受紫外光激發而發射出的熒光強度,因為這種熒光的強度與DNA總質量數成正比.

⑦ 如何測dna

紫外分光光度計測
首先,分光光度計測量的樣品必須是均一的,搖勻後再測量結果會准確些。它是利用分光光度法對物質進行定量定性分析的儀器。
核酸的定量是分光光度計使用頻率最高的功能。可以定量溶於緩沖液的寡核苷酸,單鏈、雙鏈DNA,以及RNA。核酸的最高吸收峰的吸收波長260 nm。每種核酸的分子構成不一,因此其換算系數不同。定量不同類型的核酸,事先要選擇對應的系數。如:1OD 的吸光值分別相當於50μg/ml的dsDNA,37μg/ml的ssDNA,40μg/ml的RNA,30μg/ml的Olig。測試後的吸光值經過上述系數的換算,從而得出相應的樣品濃度。測試前,選擇正確的程序,輸入原液和稀釋液的體積,爾後測試空白液和樣品液。然而,實驗並非一帆風順。讀數不穩定可能是實驗者最頭痛的問題。靈敏度越高的儀器,表現出的吸光值漂移越大。
事實上,分光光度計的設計原理和工作原理,允許吸光值在一定范圍內變化,即儀器有一定的准確度和精確度。如Eppendorf Biophotometer的准確度≤1.0%(1A)。這樣多次測試的結果在均值1.0%左右之間變動,都是正常的。另外,還需考慮核酸本身物化性質和溶解核酸的緩沖液的pH值,離子濃度等:在測試時,離子濃度太高,也會導致讀數漂移,因此建議使用pH值一定、離子濃度較低的緩沖液,如TE,可大大穩定讀數。樣品的稀釋濃度同樣是不可忽視的因素:由於樣品中不可避免存在一些細小的顆粒,尤其是核酸樣品。這些小顆粒的存在干擾測試效果。為了最大程度減少顆粒對測試結果的影響,要求核酸吸光值至少大於0.1A,吸光值最好在0.1-1.5A。在此范圍內,顆粒的干擾相對較小,結果穩定。從而意味著樣品的濃度不能過低,或者過高(超過光度計的測試范圍)。最後是操作因素,如混合要充分,否則吸光值太低,甚至出現負值;混合液不能存在氣泡,空白液無懸浮物,否則讀數漂移劇烈;必須使用相同的比色杯測試空白液和樣品,否則濃度差異太大;換算系數和樣品濃度單位選擇一致;不能採用窗口磨損的比色杯;樣品的體積必須達到比色杯要求的最小體積等多個操作事項。
除了核酸濃度,分光光度計同時顯示幾個非常重要的比值表示樣品的純度,如A260/A280的比值,用於評估樣品的純度,因為蛋白的吸收峰是280nm。純凈的樣品,比值大於1.8(DNA)或者2.0(RNA)。如果比值低於1.8 或者2.0,表示存在蛋白質或者酚類物質的影響。A230表示樣品中存在一些污染物,如碳水化合物,多肽,苯酚等,較純凈的核酸A260/A230的比值大於2.0。A320檢測溶液的混濁度和其他干擾因子。純樣品,A320一般是0。
分光光度計的重要配件—— 比色杯
比色杯按照材質大致分為石英杯、玻璃杯以及塑料杯。根據不同的測量體積,有比色杯和毛細比色杯等。一般測試核酸和紫外定量蛋白,均採用石英杯或者玻璃杯,但是不適合比色法測定。因為反應中的染料(如考馬斯亮蘭)能讓石英和玻璃著色,所以必須採用一次性的塑料杯。而塑料杯一般不適合用於在紫外范圍內測試樣品。
由於另外測試的樣品量不同,所以一般分光光度計廠家提供不同容積的比色杯以滿足用戶不同的需求。目前市場已經存在一種既可用於核酸、紫外蛋白質定量,亦可用於蛋白比色法測定的塑料杯,樣品用量僅需50μl,比色杯單個無菌包裝,可以回收樣品。如Eppendorf UVette®塑料比色杯,是目前比色杯市場上一個革新。隨著生命科學以及相關學科發展,對此類科學的實驗研究提出更高的要求,分光光度計將是分子生物學實驗室不可缺少的儀器,也成為微生物、食品、制葯等相關實驗室的必備設備之一。
當然, 隨著科技的發展,現在比色杯已經不是使用分光光度計時的必備物品。目前國外Nanodrop公司(現已被Thermo Fisher公司收購)生產的ND1000分光光度計與舊式分光光度計相比,已經可以做到無需稀釋樣品,無需使用比色杯,每次測量僅需1-2μl樣品即可完成測量

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