內含子測量方法

⑴ 怎麼確定一個基因有多少內含子多少外顯子

在NCBI上的OMIM資料庫輸入基因名，在TITLE上就會顯示它的學名。

用學名檢索基因是比較靠譜的。建議用ENSEMBL找基因，顯示其外顯子和內含子。進入ENSEMBL的方法有兩種，1.NCBI上進入基因的檢索條以後，summary里會有相應的ENSEMBL的鏈接（see related）；2.直接進入ENSEMBL主頁檢索該基因。進入基因的檢索條以後，點左側的CDNA和EXONS就能相應地看到轉錄本的注釋信息，包括外顯子和內含子的注釋，5『和3』UTR的注釋，和密碼子的注釋。

⑵ 如何確定一個基因所含有的內含子的數目和大小

將該基因的基因組DNA與成熟的mRNA進行比較，在成熟mRNA中不存在的片段就是內含子。

第一個轉酯反應由一個游離的鳥苷或鳥苷酸（GTP、GMP或GDP）介導，其3『-OH作為親核基團攻擊內含子5』端的磷酸二酯鍵，從上游切開RNA鏈。

在第二個轉酯反應中，上游外顯子的自由3『-OH作為親核基團攻擊內含子3』位核苷酸上的磷酸二酯鍵，使內含子完全被切開，上下游兩個外顯子通過新的磷酸二酯鍵重新連接。

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相位：

內含子可以在轉錄抄本的任何位置，甚至在以後成為密碼子的三核苷酸之間。若內含子位於一密碼子的第三位核苷酸和另一密碼子的第一位核苷酸，則被稱為0位內含子。相應地，位於一密碼子第一第二位核苷酸之間的內含子被稱為1位內含子。

位於第二和第三位之間時，則被稱為2位內含子。這在外顯子復制中很重要，處於兩同相位內含子的外顯子被稱為對稱外顯子，其核苷酸數為3的整數倍，它可以被成功復制，不會造成閱讀框的推移。相反，非對稱外顯子是不可復制的。

⑶ 生物高手救我~如何鑒定內含子

雜交法是較簡單的方法，由於mRNA不含內含子，DNA與mRNA雜交後會可形成環，見圖解

⑷ 怎麼測外顯子和內含子的總長

內含子序列一般可以佔到一個基因總長的60%以上真核生物中。也就是說，一個基因中，大部分的序列都是內含子

⑸ 觀察研究外顯子和內含子的主要方法有哪些

同組成.c-myc基因由個外顯子及個內含子組成，第一個外顯子不編碼，只起調節作 用，只有外顯子和與v-myc相對應，發現這些突變不能自身抑制，說明了亮氨酸拉鏈區在自身抑制中的重要 性.stone等研究認為，c-myc分子的中間/以及n-

⑹ 觀察研究外顯子和內含子的主要方法有哪些

高通量，外顯子測序，算一個吧。

⑺ 我現在有了一個基因的cDNA序列，現在想找到這個基因的內含子序列，怎麼辦

為具有與某RNA鏈呈互補的鹼基序列的單鏈DNA即complementary DNA之縮寫，或此DNA鏈與具有與之互補的鹼基序列的DNA鏈所形成的DNA雙鏈。與RNA鏈互補的單鏈DNA，以其RNA為模板，在適當引物的存在下，由依賴RNA的DNA聚合酶（反轉錄酶）的作用而合成，並且在合成單鏈cDNA後，在用鹼處理除去與其對應的RNA以後，以單鏈cDNA為模板，由依賴DNA的DNA聚合酶或依賴RNA的DNA聚合酶的作用合成雙鏈cDNA。真核生物的信使RNA或其他RNA的cDNA，在遺傳工程方面廣為應用。在這種情況下，mRNA的cDNA，與原來基因的DNA（基因組DNA，genomic DNA）不同而無內含子；相反地對應於在原來基因中沒有的而在mRNA存在的3′末端的多A序列等的核苷序列上，與exon序列、先導序列以及後續序列等一起反映出mRNA結構。cDNA同樣可以被克隆。

⑻ 在NCBI上怎麼找到一個基因的外顯子和內含子

事實上，在NCBI有很多種辦法可以確定某個基因的外顯子或者內含子，當然還有UTR區域。今天我們來介紹NCBI的其中一個使用軟體Splign來在NCBI上找到一個基因的外顯子和內含子。操作步驟如下：

1.在Gene資料庫，填入基因名HNF-4，我一般的話習慣叫Symbol，每個基因都有個Symbol，即基因名。

⑼ 已知一段真菌序列，如何預測內含子

一般而言，我們根據RNA剪接位點（內含子/外顯子）來預測內含子和外顯子區間。該生物信息學推斷是基於剪接的保守性序列「GU－AG」規則，即內含子5』端序列一般是GU，而3』端一般是AG，當然它們附近的序列也是有一定規律的，但不是很保守。根據這一特點並結合ORF, Blast等數據就可以對未知基因的成熟mRNA序列進行預測。
經典的內含子預測網站有Augustus，SplicePort，GeneSplicer，NetGene2，MaxEntScan。但考慮到你是真菌序列，所有隻能選擇前兩個網站進行運算。

⑽ 什麼叫做間隔子如何測定一段基因中的間隔子

間隔子就是內含子.可以通過這段基因表達的蛋白質的氨基酸序列倒推出外顯子序列,用該基因序列減去外顯子序列就是內含子序列